🟣 Lec 4 ( The Citric Acid Cycle: The Central Pathway of Carbohydrate, Lipid & Amino Acid Metabolism )

البايوكمستري النظري { المحاضرة الرابعة }
" المحاضرات الموحدة "
▪️مُـترجمة

#ترجمة_بايو_نظري

https://t.me/PH_UOM

💡بالنسبة للتفاعلات اهم شي نحفظ
-المادة الي يبلش بيها التفاعل
-المادة الي ينتهي بيها التفاعل
-المحفز الي يحفز هذا التفاعل انو يصير
-التفاعل انعكاسي او غير انعكاسي
-نوع العملية اذا كان مذكور مثلا تحلل، تكاثف وغيرها.

1⃣التفاعل الاول

⛔️ المواد المتفاعله
Acetyl-COA + Oxaloacetate

⛔️ المادة الناتجة
Citrate

⛔️ الانزيم المحفز للتفاعل
Citrate synthase

⛔️ العملية الي تحصل
Hydrolyzed

⛔️ التفاعل يكون irreversible

2⃣التفاعل الثاني

⛔️المواد المتفاعله
Citrate

⛔️ المادة الناتجة
Isocitrate

⛔️ الانزيم المحفز للتفاعل
Aconitase

⛔️ العملية الي تحصل
Isomerized

⛔️ التفاعل reversible



⏺هنا التفاعل يتم بخطوتين

⛔️ dehydration
-حيث يتحول الcitrate الى Cis-Acontitate

⛔️ rehydration
حيث يتحول الCis-Aconitate الى isocitrate

نجي هسه على شي جداااااااا مهم

احنه مو كلنه راح ينتج عدنه citrate هذا راح يروح وينتقل من المايتوكوندريا الى ال cytosol.. زين ليش يصير هل انتقال شنو يستفاد منه الجسم؟؟
هل انتقال يحفز fatty acid synthesis


⛔️الانزيم الي يحفز التفاعل الثاني الي هو Aconitase شنو الي يثبطه؟؟
Acummulation of It product (isocitrate)

Flourinated compound used
-anticancer
-pesticides

⛔️ يكون لها تأثر سام... ليش؟؟
-لان flouroAcetyl-CoA يجي يتفاعل مع Oxaloacetate وينطي fluoroacetate الي يجي يثبط Aconitase ومن يتثبط هذا الانزيم التفاعل الثاني يتوقف مراح يصير فتبقى الCitrate تتراكم بدون تفاعل

3⃣التفاعل الثالث

⛔️ المواد المتفاعله
Isocitrate

⛔️ المواد الناتجة
Alpha-ketoglutrate

⛔️ الانزيم المحفز
Isocitrate dehydrogenase

⛔️ العملية الي تحصل
Dehydrogenation

⛔️ التفاعل irreversible

هذا التفاعل يتم فيه استخدام
3 isoenzyme
-NAD+ in mitochondria
-2NADP+ in cytosol and mitochondria

4⃣التفاعل الرابع

⛔️ المواد المتفاعله
Alpha-ketoglutrate

⛔️ المواد الناتجة
Succinyl-CoA

⛔️ الانزيم المحفز
Alpha-ketoglutrate dehydrogenase

⛔️ العملية الي تحصل
Oxidation decarboxylation reaction


⛔️ التفاعل irreversible

⭕️ بهذا التفاعل يستخدم فيها COfactors الي تتمثل بلاتي
-Thiamin Diphosphate
-Lipoate
-NAD+
-FAD
-COA


⛔️الي يثبط انزيم Alpha-ketoglutrate dehydrogenase هو التركيز العالي للامونيا

5⃣التفاعل الخامس

⛔️ المواد المتفاعله
Succinyl-CoA

⛔️ المواد الناتجة
Succinate

⛔️ الانزيم المحفز
Succinate thiokinase
واسم لخ اله
Succinyl-CoA synyhetase


⛔️ العملية الي تحصل
Phoshorylation

⛔️ التفاعل reversible


⛔️ الانسجة الي يصير فيها تخليق للكلكوز الكبد والكلى تحوي
2 isoenzyme

1⃣ GDP
2⃣ADP


⛔️ الOxaloacetate وبوجود GTP تصيرله عملية Decarboxylation وينطي phosphoenolpyruvate
" وهذا يتم بعملية Glucoengensis "

⛔️اما اذا
Non-gluconeogenic tissues
راح يستخدم ADP بعملية الفسفرة

6⃣التفاعل السادس

⛔️ المواد المتفاعله
Succinate

⛔️ المواد الناتجة
Fumarate

⛔️ الانزيم المحفز
Succinate dehydrogenase

⛔️ العملية الي تحصل
Dehydrogenation


⛔️ التفاعل reversible

⛔️ الي يثبط انزيم Succinate dehydrogenase هو Malonate

7⃣التفاعل السابع

⛔️المواد المتفاعله
Fumarate

⛔️ المواد الناتجة
L-Malate

⛔️ الانزيم المحفز
Fumrase

⛔️ العملية الي تحصل
Hydrate

⛔️ التفاعل reversible

8⃣التفاعل الثامن والاخير

⛔️ المواد المتفاعله
Malate

⛔️ المواد الناتجة
Oxaloacetate

⛔️ الانزيم المحفز
Malate dehydrogenase

⛔️ العملية الي تحصل
Dehydrogenation

⛔️ التفاعل reversible

بعد مخلصنه هسه التفاعلات التابعه لدورة كربس نلاحظ احنه بلشنه بتفاعل Acetyl-COA مع Oxaloacetate وخلصناها بتكوين Oxaloacetate
زين شنو هاي.... شنو معناها..؟؟
-عزيزي المشاهد روح للسلايد الرابع وتابع دورة كربس نلاحظ اخر خطوة ترجع تتفاعل وتبلش دورة كربس من جديد

⛔️ يعني Oxaloacetate الي نتج بالخطوة الاخيرة يرجع يتفاعل مع Acetyl-COA الجديد الي يوفره الجسم ويرجع يسوي دورة كربس 🦦

🥴الاوكسجين ما يشارك بشكل مباشر بدورة كربس لكن ايضاً دورة كربس ماتتم الا بوجود الاوكسجين..... زين ليش هيج؟؟
-لان الNAD و الFAD الي ناتجين من NADH وFADH2 يحتاجون انتقال الالكترونات الي لا يتم الا بوجود الO2




⛔️ على عكس GLYCOLYSIS الي يصير بكل الحالات سواء موجود او ما موجود الاوكسجين

1NADH=2.5 ATP
1FADH2=1.5 5

⛔️ وبدورة كربس مثل منلاحظ ينطي
3NADH=3x2.5= 7.5 ATP
1FADH2 =1x1.5=1.5 ATP


بالتالي ينطي 9ATP نجمعها مع 1ATP جايتنه من فسفرة
GTP ::::::> ATP


⭕️ يعني الزبدة بلاخير تنطية الدورة الوحدة من كربس 10ATP

بالسلايد الخامس موضح بالضبط دورة كربس بكل تفاعلاته

يكون عدنه اربعة انواع من فيتامين B اساسية بدورة كربس

⛔️ نحفظ كل نوع منين اجانه واي تفاعل يحفزه

Anaplerotic reaction

💡يعني التفاعل يتضمن هدم وبناء

⭕️ شنو نستفاد من هذا النوع من التفاعلات
-اكسدة كاربونتين من Acetyl-COA
-مسار رئيسي لتحولات الاحماض الامينية
-توفير substrates
-توليد او تكوين الاحماض الامينية
-glucoengensis
-fatty acid synthesis
- synthesis many biological molecules


⛔️ عدنه جملة مهمة
Anaplerosis act of replenishing citric acid cycle
يعني هل تفاعلات تجدد دورة كربس

Regulation of citric acid cycle

⛔️ شلون ننضم دورة كربس؟
1⃣ Regulation Acetyl-COA formation
ننضم تكوينها الي تكون ناتجة من pyruvate dehydrogenase


2⃣Regulation of the reactions of cycle itself
يعني ننضم تفاعلات دورة كربس نفسها


العديد من تفاعلات دورة كربس تكون
Non equilibrium reactions

تفاعلات متوازنه تحتاج محفز الا يصير التفاعل ومثل مشفنه كل تفاعل اله انزيم معين
-Citrate synthase
-isocitrate dehydrogenase
-Alpha-ketoglutrate dehydrogenase


⭕️ الطاقة الي متوفر همات ونسبة ATP الى ADP و نسبة NADH الى NAD ايضاً راح تأثر على نشاط الانزيم نفسه بالتالي تأثر على التفاعل وتأثر على نضام دورة كربس بالكامل

⛔️ دورة كربس خلنعتبرها مثل السلسلة اذا صار خلل بوحدة من الحلقات تتخربط بقية السلسلة

واخر شي عدنه هل بارت اني موضحته الكم بالملزمة بشكل مخططات