AI для Всех
14.5K subscribers
1.26K photos
171 videos
11 files
1.46K links
Канал, в котором мы говорим про искусственный интеллект простыми словами

Главный редактор и по рекламе: @crimeacs

Иногда пишут в канал: @GingerSpacetail, @innovationitsme
Download Telegram
November 5, 2021
November 6, 2021
Forwarded from Sberloga (Alexander C)
November 7, 2021
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
November 9, 2021
November 10, 2021
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
November 11, 2021
November 12, 2021
November 12, 2021
Awesome ML-ops. Нашёл репо со ссылками на (примерно) все инструменты существующие в этой области.
November 13, 2021
November 14, 2021
November 14, 2021
November 15, 2021
November 15, 2021
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
November 16, 2021
November 17, 2021
Forwarded from Denis Sexy IT 🤖
Похоже, опенсорсное ПО по изучению структуры белков начинает приносить свои плоды — коллаборация учёных получила данные о том, как трёхмерные структуры белков собираются вместе, образуя многобелковый комплекс. Дальше будет сложно, но мне кажется один фиг интересно.

Вот тут можете освежить в памяти инфу, я писал об нейронке AlphaFold2 от DeepMind, которая достаточно точно предсказывает структур молекулы белка, исходя из определенного набора аминокислот. Новое же исследование как бы немного переступает этот шаг и говорит сразу о том, как эти молекулы объединяются в сложные структуры, что очень круто.

Например, комплекс, создающий копии наших хромосом обычно состоит из более чем десятка белков, объединенные структуры которых требуют тщательной координации их химических изменений. А для того чтобы собрать эти и другие комплексы вместе, необходимо правильно сложить составляющие их белки в нужные трехмерные формы. AlphaFold и RoseTTAFold как раз этим и занимаются, но после того, как складывание завершено, белки должны взаимодействовать друг с другом, правильно соединяться (например «+» заряд на одном белке соответствует «-» заряду на его партнёре).

Метод нейронок оказался полезным при сборке многобелковых структур — RoseTTAFold, например, частично разбивает аминокислотную последовательность белка на более мелкие части и считает каждую из них, прежде чем собрать конструктор. При этом обнаружили, что если подать RoseTTAFold кусочки двух разных белков, она с радостью скушает инфу и соберет оба белка, учитывая их ориентацию и расстояние между ними.

Еще крутой особенностью алгоритмов является то, что их прогнозы опираются на эволюцию — например мутации, когда «+» в белке А мутирует и не может взаимодействовать с «-» в белке Б, алгоритм просчитывает даже варианты, если «-» белка Б тоже будет мутировать и компенсирует проблему, потому что не все аминокислоты могут образовывать спиральные структуры.

Круто осознавать, что вот только в июле появившиеся нейронки уже дают какие-то полезные данные, а ведь прошло меньше чем пол года. И это еще один шаг навстречу лечения разных серьезных заболеваний с помощью таких вот моделей 🧬
November 17, 2021
November 18, 2021
Forwarded from Sberloga (Alexander C)
🚀 @SBERLOGA онлайн семинар по биоинформатике:
👨‍🔬 Всеволод Макеев (ИОГен РАН): «Различные задачи геномики, решающиеся с помощью задачи разладки»
⌚️ Пятница 19 Ноября, 18.00 (Moscow time)

Абстракт будет позднее.

О докладчике:
Всеволод Юрьевич Макеев - член-корреспондент РАН, заведующий отделом ИОГен РАН

Ссылка на зум будет доступна в чате: https://t.me/sberlogabio ближе к началу доклада.
November 18, 2021
November 18, 2021
November 19, 2021