AI Для Всех
Biological structure and function emerge from scaling unsupervised learning to 250 million protein sequences Alexander Rives, Joshua Meier, View ORCID ProfileTom Sercu, Siddharth Goyal, Zeming Lin, Jason Liu, Demi Guo, Myle Ott, C. Lawrence Zitnick, Jerry…
как верно заметили мои коллеги, к сожалению, практическое применение статьи - 0. Она не может побить даже HMM, в которых параметров в разы меньше. Потому в "примеры в биологии" включать не стоит. Но можно - как область-где-еще-не-смогли-но-может-быть-вы-сможете
Большая статья о том как учить GAN.
По сути конечно многое из этого только в индивидуальных случаях работает, но все же
#gan #training
По сути конечно многое из этого только в индивидуальных случаях работает, но все же
#gan #training
Сегодня доклад был неплохой. Там нет прям вау идей, но информацию об области и ссылку на два датасета (DAVIS, KIBA) на задачки дает.
Forwarded from Sberloga (Alexander C)
🚀 @SBERLOGA - представляет два онлайн эвента за один раз
⌚️ Вторник 6 июля, 19.00 и 19.30 по Москве
⌚️ В 19.00 мы продолжим просмотр и обсуждение Лекция 7 "Knowledge Graph Embeddings" курса М.Галкина
👨🔬 В 19.30 доклад по граф-мл: Илья Сенаторов (Helmholtz Institute) "Предсказания взаимодействий молекул и белков с помощью глубокого обучения и графовых нейросетей"
Предсказание взаимодействия между белком и молекулой - нетривиальная задача, которая активно решается последние 5 лет. Множество подходов комбинируют машинное обучение с теорией графов для решение этой задачи. Однако датасеты, используемые для сравнения разных моделей сильно отличаются от датасетов которые встречаются в реальной жизни - они гораздо более полные и сбалансированые. В этой лекции я расскажу о проблемах, которые встречаются при попытке применить модели, натренированые на стандартных датасетах KIBA и Davis и способах их решения - weighted loss, biologically relevant protein graph augmentation и graph-level pre-training.
PS
Ссылка на зум будет доступна через тг чат https://t.me/sberlogawithgraphs ближе к началу доклада.
Видео записи докладов доступны на ютуб канале SBERLOGA https://www.youtube.com/c/sberloga
⌚️ Вторник 6 июля, 19.00 и 19.30 по Москве
⌚️ В 19.00 мы продолжим просмотр и обсуждение Лекция 7 "Knowledge Graph Embeddings" курса М.Галкина
👨🔬 В 19.30 доклад по граф-мл: Илья Сенаторов (Helmholtz Institute) "Предсказания взаимодействий молекул и белков с помощью глубокого обучения и графовых нейросетей"
Предсказание взаимодействия между белком и молекулой - нетривиальная задача, которая активно решается последние 5 лет. Множество подходов комбинируют машинное обучение с теорией графов для решение этой задачи. Однако датасеты, используемые для сравнения разных моделей сильно отличаются от датасетов которые встречаются в реальной жизни - они гораздо более полные и сбалансированые. В этой лекции я расскажу о проблемах, которые встречаются при попытке применить модели, натренированые на стандартных датасетах KIBA и Davis и способах их решения - weighted loss, biologically relevant protein graph augmentation и graph-level pre-training.
PS
Ссылка на зум будет доступна через тг чат https://t.me/sberlogawithgraphs ближе к началу доклада.
Видео записи докладов доступны на ютуб канале SBERLOGA https://www.youtube.com/c/sberloga
Telegram
Sberloga in Graphs
Data Сообщество
По всем вопросам обращаться @SberlogaHelperBot
По всем вопросам обращаться @SberlogaHelperBot
Статья с U-Net, но теперь на трансформерах.
Качество по дов. интервалам не отличается от обычного U-Net. Но идея интересная.
Практическая реализация и то же тексты (без доверительных интервалов ))
#transformer #segmentation
Качество по дов. интервалам не отличается от обычного U-Net. Но идея интересная.
Практическая реализация и то же тексты (без доверительных интервалов ))
#transformer #segmentation
Прикольная статья на медиум. У многих естественников (как минимум) задача ставится таким образом, что качество 1.0 на ROC недостижимо. Например, наследственные заболевания не всегда проявляются (пенетрантность). Потому полезно им про это рассказывать
#metrics
#metrics
Medium
What’s the Maximum ROC You Can Achieve? (No, the Answer Is Not 1)
Intuitively, it’s obvious that not all problems are equally hard. For instance, classifying MNIST digits is not as hard as predicting tomorrow’s stock market. In other words, every problem has an…
А вот про это я уже пару лет рассказываю, но они сделали.
Audiovisual self-supervised representation learning
#SSL #audio #video
Audiovisual self-supervised representation learning
#SSL #audio #video
Meta
Audiovisual self-supervised representation learning
We’re sharing new research on using the natural association between video & sound to teach machines to better understand the world. Our self-supervised approach, which is a #CVPR21 best paper candidate, learns directly from sounds & images in videos.
Forwarded from эйай ньюз
DeepMind опубликовал статью, где они представляют новую архитектуру - Perceiver.
Главная идея и мотивация — учиться на данных любой модальности (картинки, аудио, видео, точки, и т.д.) без использования каких-либо предположений о структуре этих данных знаний, таких как, например, локально гладкая 2D-структура картинок, которая повсеместно эксплойтится конволюционными нейронными сетями.
Предлагаемая модель Perceiver — это хитрый трансформер, который имеет несколько преимуществ перед существующими архитектурами:
➞ 1) Он может работать со входными последовательностями огромной длины (> 100k входов). Это достигается за счет использования Cross Atention блока, который принимает входные данные как ключи (K) и как значения (V), а вместо запросов (Q) использует гораздо меньшее число (512, если быть точным) скрытых векторов. Интуитивно это можно представить как этакий ботлнек на основе self-attention. На вход N векторов (где N может быть очень большим), а на выходе получаем ровно 512 (что является гиперпараметром).
➞ 2) Из-за описанного выше Cross Atention блока, который выступает в роли ботлнека, мы можем сделать Perceiver очень глубоким. Все потому что каждый последующий self-attention блок будет работать со входами длины 512, а не N. Поэтому даже квадратичная по сложности от длины входа наивная реализация self-attention'а будет быстро работать и не будет выжирать всю память.
➞ 3) Архитектура не опирается ни на какие структурные предположения о данных. Она настолько универсальная, что может применяться к различным модальностям почти без изменений (если не считать positional encoding). Можно запускать на картинках - Perciever бьет базовый ViT-B, хотя вообще не содержит ни одной конволюции и на вход берет тупо 50 тыщ пикселей (для картинки 224x224). Также Perciever отлично работает на аудио, видео, на комбинации аудио+видео, и на облаках 3D точек.
Сама статья довольно хорошо написана, можете в ней почитать подробности.
Главная идея и мотивация — учиться на данных любой модальности (картинки, аудио, видео, точки, и т.д.) без использования каких-либо предположений о структуре этих данных знаний, таких как, например, локально гладкая 2D-структура картинок, которая повсеместно эксплойтится конволюционными нейронными сетями.
Предлагаемая модель Perceiver — это хитрый трансформер, который имеет несколько преимуществ перед существующими архитектурами:
➞ 1) Он может работать со входными последовательностями огромной длины (> 100k входов). Это достигается за счет использования Cross Atention блока, который принимает входные данные как ключи (K) и как значения (V), а вместо запросов (Q) использует гораздо меньшее число (512, если быть точным) скрытых векторов. Интуитивно это можно представить как этакий ботлнек на основе self-attention. На вход N векторов (где N может быть очень большим), а на выходе получаем ровно 512 (что является гиперпараметром).
➞ 2) Из-за описанного выше Cross Atention блока, который выступает в роли ботлнека, мы можем сделать Perceiver очень глубоким. Все потому что каждый последующий self-attention блок будет работать со входами длины 512, а не N. Поэтому даже квадратичная по сложности от длины входа наивная реализация self-attention'а будет быстро работать и не будет выжирать всю память.
➞ 3) Архитектура не опирается ни на какие структурные предположения о данных. Она настолько универсальная, что может применяться к различным модальностям почти без изменений (если не считать positional encoding). Можно запускать на картинках - Perciever бьет базовый ViT-B, хотя вообще не содержит ни одной конволюции и на вход берет тупо 50 тыщ пикселей (для картинки 224x224). Также Perciever отлично работает на аудио, видео, на комбинации аудио+видео, и на облаках 3D точек.
Сама статья довольно хорошо написана, можете в ней почитать подробности.
интересная штука про аутлайеры и разные способы понижения размерности
Kaggle
Брать целиком не полуучится, но вырезать чего-нить интересное можно
#outliers #dimensionality
Kaggle
Брать целиком не полуучится, но вырезать чего-нить интересное можно
#outliers #dimensionality
Kaggle
Applied Unsupervised Learning
Explore and run machine learning code with Kaggle Notebooks | Using data from multiple data sources