FTP-сервер компании Complete Genomics Inc.

В директории /ScoreCalibrationFiles присутствует файл с кратким описанием технологий и программного обеспечения для работы с файлами.

На сервер так же удалось найти адрес ExpeDat сервера:

SERVER: 74.119.220.66
PORT: 51000
ENCRYPTION: Enabled

но соединение не проверялось.

Самое интересное лежит в директории /pub (по классике) - там можно найти секвенсированные геномы различных растений (/pub/data/) и даже X-хромосомы человека. Некоторые данные неходятся не на самом FTP, но ссылки на них лежат в /pub/RNAseq_protocol/README. В директории /pub/interns можно найти, видимо, скрипты учеников, стажирующихся в лаборатории.

Забавно, что многое считается perl/python/bash скриптами.

Тематика: #генетика #биология

Broad Institute - занимаются вычислительной биологий. Им принадлежит авторство программы GenePattern (OpenSource, github)

На сервере большое количество датасетов под этот пакет в различных директориях.

Тематика: #технологии #генетика #биология