Серия лекций по органической химии от Khan Academy: https://www.khanacademy.org/science/organic-chemistry

#лекция

Quartzy - платформа для организации работы лаборатории: https://www.quartzy.com/

#мокрая_биология

База данных флуоресцентных белков: https://www.fpbase.org/table/

AlphaFold - AI система, предсказывающая 3D структуру белков.
База данных: https://alphafold.ebi.ac.uk/
GitHub: https://github.com/deepmind/alphafold

#биоинформатика

🧬 Что вы делаете завтра? Меняем мир через исследования и эксперименты!

Можно самому искать реагенты и оборудование, сравнивать цены и выбирать, кто привозит эксклюзивные бренды. Но реальность не только это, но еще и характеристики продуктов, наличие на складе и наличие надежного партнера-поставщика.

SkyGen поможет подобрать тот продукт, который необходим для экспериментов в лаборатории. У нас более 6000 наименований реагентов, реактивов и оборудования для науки на складе в Москве. И 60 специалистов оказывают квалифицированную помощь при подборе, доставке и сервисе.
Подписывайтесь на канал @skygen_official и будьте в курсе вебинаров, акций и новостях от мировых брендов.

SkyGen – вдохновляем на научные открытия!

https://www.physicsworldjobs.com/job/7086/fully-funded-phd-places/

Fully Funded PhD Places

EPSRC Centre for Doctoral Training in Molecules to Product

Uni of Leeds, UK
Stipend of £17,668 (2022/23 rate)
3 May 2023

Nobel lecture: The Structural Basis of G Protein Coupled Receptor Signaling

APC/C degron repository - база данных белков потенциальных мишеней Anaphase-promoting complex/Cyclosome комплекса, содержащих D box, KEN box или ABBA motif: http://slim.icr.ac.uk/apc/index.php

#биоинформатика

Две лекции, посвященные анализу пролиферации клеток с помощью проточной цитометрии:
1. https://www.youtube.com/watch?v=PcfqkUtOHeA
2. https://www.youtube.com/watch?v=iSZCMx7hxng

#мокрая_биология
#лекция

17 мая в 19:00 (мск) пройдет первый вебинар «Сбор данных и биобанка: клинический этап» из мини-курса по анализу микробиома человека методом секвенирования 16S рРНК бактерий.

Спикером выступит Владимир Романов, менеджер клинических исследований компании Nobias Technologies.

На занятии вы узнаете:

🧫Чем отличается микробиомный проект от обычного клинического исследования
🧬Какое место в структуре проекта должна занимать метагеномика
📝Каким образом должны выглядеть результаты клинической части исследования микробиоты

А также научитесь:

🦠Правильно планировать микробиомное исследование
🏥Собирать клинические данные, чтобы ничего не потерять
🔬Оформлять биобанк микробиома для дальнейшего изучения в лаборатории

✅Вход свободный. Записаться на вебинар можно по ссылке: https://bit.ly/3I9VgDT
Всем, кто будет онлайн, подарим шаблон синопсиса клинического исследования!

🎓Подборка PhD-позиций за рубежом!

🇸🇪PhD-позиция в структурной биоинформатике (Швеция)
Линчепингский университет приглашает аспирантов для работы в области структурной биоинформатики и изучения биомолекулярных структур с помощью ИИ. Необходимо знание методов искусственного интеллекта и машинного обучения, а также опыт их применения в структурной биоинформатике или смежных областях, знакомство с AlphaFold, знание Python и/или C++, опыт работы с BASH и командной строкой.
Дедлайн: 26 мая
Подробнее: bit.ly/42LBJll

🇩🇪PhD-позиции в протеомику и масс-спектрометрию (Германия)
Приглашаются докторанты и постдоки в лабораторию Тензера в Университетский медицинский центр Майнцского университета для работы по клинической протеомике. Требуется опыт в ЖХ/МС, интерес к биомедицине и биомаркерам, приветствуются знания Python, R, матмоделирования.
Дедлайн: 29 мая
Подробнее: bit.ly/3Igpbu8

🇩🇰PhD-стипендиальная программа в биоинформатику и анализ данных (Дания)
На кафедру биотехнологии и биомедицины Технического университета в Копенгагене нужен PhD-студент для исследования механизмов клеточной дифференцировки. Предстоит заниматься геномикой одиночных клеток (scRNA-seq, scATAC-seq, пространственная транскриптомика) и массовых наборов данных (РНК-/ATAC-/ChIP-seq). Нужна магистерская степень в области биоинформатики, биостатистики, подтвержденный опыт анализа и интерпретации данных секвенирования отдельных клеток, настройки Nextflow, Snakemake, знание Python или R. Длительность 3 года.
Дедлайн: 2 июня
Подробнее: bit.ly/3pIUx69

🇩🇪PhD-студент в Институт физиологии (Германия)
Университетская клиника Карла Густава Каруса в Дрездене приглашает в аспирантуру в проект по изучению роли бета-клеток в гомеостазе глюкозы. Предстоит работать с животными и клеточными моделями, использовать гистологические, биохимические методы и визуализацию. От соискателей требуется степень магистра, опыт работы с животными моделями.
Дедлайн: 15 июня
Подробнее: bit.ly/3MbPzXq

🇧🇪PhD-студент в центр системной биологии растений (Бельгия)
Лаборатория Алена Гуссенса приглашает выпускников магистратуры изучать фосфопротеом при стресс-индуцируемом жасмонатном сигналинге растений. Предстоит применять передовые методы изучения белок-белковых взаимодействий, подходы метаболомики, редактирования генов и микроскопии.
Подробнее: bit.ly/3M5ZLR6

#бластим_вакансии

Продвинутый курс по анализу NGS данных от учебного центра biomedschool — старт уже 3 июня!

Если у вас есть опыт работы с данными секвенирования, но нет возможности отработать теорию и закрепить знания на практике, то этот курс вам подходит!

На курсе вы научитесь самостоятельно создавать автоматизированные пайплайны на Python и Bash, собирать геномы, делать филогенетический анализ, анализировать данные single-cell RNA-seq и начнёте пополнять своё портфолио реальными кейсами!

Для прохождения этого курса необходимы знания о типах данных NGS, а также небольшой опыт работы в Linux и Python|R — перед началом высылается тест, благодаря которому вы сможете оценить свои навыки.

После успешного прохождения курса выдаётся сертификат государственного образца о повышении квалификации.

Регистрация тут 👉🏻biomedschool.ru

#вакансии #биоинформатик

ФГБУ «ЦСП» ФМБА России приглашает биоинформатиков с хорошей математической и IT подготовкой в отдел медицинской геномики. У Центра есть собственная лабораторная и техническая вычислительная базы, позволяющие проводить геномные исследования и компьютерную обработку данных на самом высоком и современном уровне.

Биоинформатик в ФГБУ «ЦСП» ФМБА России
 
З/п: от 150 000 до 250 000 рублей после вычета налогов.
 
Что нужно будет делать:
— Выполнение фундаментальных и прикладных научных проектов по геномной медицине;
— Анализ больших данных;
— Разработка программных продуктов и математических/Machine Learning моделей;
— Визуализация данных;
— Написание научных статей и отчетов.
Что мы ждем от вас:
— Опыт работы от 2-х лет;
— Образование (биоинформатика, IT, математика, техническое);
— Знание Python, R, Linux, Bash, SQL;
— Работа с Github, Spark, MLOps, Tensorflow/Pytorch, с библиотеками визуализации данных (Matplotlib, ggplot, ComplexHeatmap и др);
— Работа хотя бы в одной области биоинформатики (геномика, транскриптомика, эпигенетика, молекулярная эволюция).
 
Преимуществом будет:
— Знание Spark, MongoDB, Scala, Tensorflow/ Pytorch, NLP
— Свободное владение английским языком.

Что мы предлагаем:
— Решение амбициозных и интересных задач;
— Возможность участвовать в научных программах, публиковать результаты деятельности;
— Бесплатная парковка рядом с офисом;
— Прикрепление к корпоративной поликлинике;
— Возможность профессионального развития;
— Плавающее начало рабочего дня, гибридный график работы;
— График работы 5/2.
 
TG: @EGSKV
Контакты: HR@cspfmba.ru
Ссылка на вакансию: https://blastim.ru/job/4856/
Другие вакансии у нас:
https://blastim.ru/job/4857/
https://blastim.ru/job/4855/

Ph.D. positions 🇫🇮
Active Matter group at Aalto University
•Bacterial biophysics, motility, and active turbulence (advised by Dr. Kazusa Beppu, kazusa.beppu@aalto.fi)
•Advanced imaging and scattering for non-equilibrium systems & photonics (advised by Dr. Johannes Haataja, johannes.haataja@aalto.fi)
•Mechanical properties and motility of cellular aggregates (advised by Dr. Grégory Beaune, gregory.beaune@aalto.fi)
The deadline for applications is June 30, 2023.
https://www.aalto.fi/en/open-positions/doctoral-researchers-in-non-equilibrium-soft-matter-physics

I. Серия вводных лекций по световой микроскопии: https://www.ibiology.org/online-biology-courses/microscopy-series/

#мокрая_биология

II. И еще один цикл вводных лекций по микроскопии: https://andor.oxinst.com/complete-microscopy-training-course

#мокрая_биология

III. В продолжении темы еще один курс вводных лекций по микроскопии с объяснением базовых понятий: https://www.youtube.com/@Microcourses

#мокрая_биология