В продолжении темы прикрепляю статью про постановку qPCR, где вы найдете информацию об: основных этапах валидации и оптимизации, включении контролей, примеров "сырых" данных.

#мокрая_биология
#статья

Статья, заметка и tutorial про High Resolution Melting (HRM):

📌 BioRad, заметка: https://www.bio-rad.com/ru-ru/applications-technologies/what-high-resolution-melting-hrm?ID=LUSOIH97Q

📌 HRM Tutorial, BioRad: https://www.youtube.com/watch?v=y567YuJhSek

#мокрая_биология
#статья
#пособие

Хорошая статья про Melting curve analysis

#мокрая_биология
#статья

Лекторий «Диаэм» объявляет лабораторный марафон вебинаров
https://pcr.news/novosti/lektoriy-diaem-obyavlyaet-laboratornyy-marafon-vebinarov/

🚀 @SBERLOGACOMPETE webinar on Kaggle competition:
⌚️ Monday 03 October, 19.00 (Moscow Time)
👨‍🔬 Liza Geraseva "Around MAGIC" (https://github.com/KrishnaswamyLab/MAGIC)

Single cell RNA sequencing data suffer from special kind of noise - zeroes - which appear on positions which are not expected to be zero. (So-called "dropout"). Several methods have been proposed to cure that. "MAGIC" is one of them. During the webinar we will discuss it, its practical applications and possible use in Kaggle competition.

Add to Google Calendar

How to use example: https://www.kaggle.com/datasets/geraseva/citeseq-denoised

See discussion:
https://www.kaggle.com/competitions/open-problems-multimodal/discussion/350856
Notebooks:
https://www.kaggle.com/code/geraseva/magic-feature-selection
https://www.kaggle.com/alexandervc/magic-features-load-example-and-cell-cycle

Zoom link will be available at
https://t.me/sberlogacompete shortly before the start.

Статья про кинетическую модель qPCR.

#статья
#мокрая_биология

Copy number variation (CNV) анализ с помощью qPCR.

#статья
#мокрая_биология

Добрый день!
7 октября в 16:00 выступит Владислав Циперсон, PhD из Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York City, NY с семинаром, посвящённый двум темам:
1. Разработка подходов (методов) для определения эффективности применения
лекарственных препаратов для лечения пациентов с раком молочной железы.
2. Применение shRNAs скрининга для идентификации генов-мишеней, вовлеченных
в активную пролиферацию раковых клеток соединительной ткани.
Трансляция будет доступна по ссылке

Лекция врача лучевой диагностики, младшего научного сотрудника Центра диагностики и телемедицины, заместителя главного редактора портала neuronovosti.ru Анны Хоружей на тему: «Мозг против COVID-19: что такое постковидный синдром и как с ним бороться».

Вторгается ли вирус в мозг? Какой спектр нарушений исследователи выделяют в постковидный синдром со стороны мозга? Почему портится обоняние? Что говорят неврология и нейровизуализация? Правда ли повышается риск нейродегенеративных заболеваний? Какие есть меры, чтобы сгладить последствия? На некоторые из этих вопросов наука уже может дать ответ, разберемся с ними на лекции.

📍Встречаемся 9 октября в 16:00 в Шуваловском корпусе МГУ по адресу: Ломоносовский просп., 27, корп. 4.

❗️❗️❗️ Внимание, коллеги ! Если Вы знаете Питон/R и/или молекулярную биологию, хотите "спасти мир", получить фан от нетворкинга, поупражняться в Дата Сайнс и/или Биоинформатике по сингл-селл данным, написать научную статью, то есть отличная возможность:

Присоединяйтесь к нашей активности вокруг Каггл соревнования по мультимодальным данным !
Требования достаточно минимальны - Питон/R или мол.био (одно из двух - и то и другое - НЕ обязательно) и некоторое свободное время.
Наша цель - провести некоторый дата-сайнс анализ этих данных и вместе с биологами проинтерпретировать его и написать статью. Занимать топ места в сореве - не обязательно, (но не помешает). Это НЕ "приват шаринг" - все что делается - вначале выкладывается в публичный доступ на Каггл, только потом обсуждается. Часть задач/вопросов - описано там же на Каггл: линк.

Присоединяйтесь !
Пишите @zabis13 (Юрий Барамыков - ДС, Питон, R) , @alexander_v_c (Александр Червов - биологи) или отметьтесь в голосовалке:
https://t.me/sberlogacompete/2548

‼️ Поисковики для студентов которые специализируются на книгах, науке, другой "умной" информации:

www.refseek.com – поисковик по академическим ресурсам. Более миллиарда источников: энциклопедии, монографии, журналы.

www.worldcat.org – поиск по содержимому 20 тысяч мировых библиотек. Узнаете, где лежит ближайшая нужная вам редкая книга.

https://link.springer.com – доступ к более чем 10 миллионам научных документов: книги, статьи, протоколы исследований.

www.bioline.org.br – библиотека научных журналов по bioscience, издаваемых в развивающихся странах.

http://repec.org – почти 4 миллиона публикаций по экономике и смежным наукам.

www.science.gov – американский государственный поисковик по 2200+ научным сайтам.

www.pdfdrive.com – крупнейший сайт для бесплатного скачивания книг в формате PDF.

www.base-search.net – один из мощнейших поисковиков по текстам академических исследований. Более 100 миллионов научных документов, 70% из них бесплатны.

Stay tuned! 👨🏻‍🏫 #пашагарвард

* Кто автор, к сожалению, не знаю.

Открыт набор на практический курс от PCR.NEWS!

Введение в технологии NGS. Работа с данными секвенирования

6 учебных дней, 7 опытных преподавателей, 15 лекций и ежедневная практика!

Даты проведения: с 27 января — по 1 февраля 2023 года
Формат: очно (Москва) / онлайн

Успейте зарегистрироваться со скидкой 20% до 1 декабря

Курсы от PCR.NEWS - это понятные и интересные лекции, много практики, вспомогательные материалы, отзывчивость лекторов и полное техническое сопровождение.

В программе:
• Обзор технологий секвенирования
• Введение в Linux и анализ данных NGS
• Анализ NGS данных, поиск и аннотация точечных мутаций
• Метагеномика и полногеномное секвенирование, особенности пробоподготовки и анализ данных
• Применение результатов NGS секвенирования в онкологии. Анализ альтернативного сплайсинга
• Анализ экспрессии генов

Курс специально разработан для тех, кто только погружается в сферу NGS. По окончании выдается документ о переквалификации

>> Зарегистрироваться

Обзорная #статья про эукариотические промоторы.

Как не пропустить все самые важные новости из мира фармацевтики?

Канал «Инновации в фармацевтике» публикует самые последние новости фармы в России и в мире, следит за важнейшими открытиями в отрасли, разбирается в новых трендах по био- и нейротехнологиям, развенчивает мифы о болезнях и методах их лечения, рассказывает о громких успехах и сокрушительных провалах препаратов ведущих производителей.

Подписчики канала уже узнали:
• Можно ли лечить тревожность парацетамолом;
• Удастся ли получить доступ к новой терапии болезни Альцгеймера уже через год;
• Как COVID-19 отразился на борьбе с ВИЧ;
• Какой показатель указывает на преждевременное старение клеток;
• Как витамин D в мозге влияет на когнитивные функции

Подписывайтесь на канал Chemrarpharma и будьте в курсе самых свежих новостей в индустрии!

Летняя школа Венского биоцентра в Австрии 2023

Приемлемые страны : все страны.
Продолжительность: 9 недель.

Биоцентр известен своим высококвалифицированным преподавательским составом. Например, Ким Насмит получил Премию за прорыв в области наук о жизни за свою революционную работу по сегрегации хромосом. Точно так же Эммануэль Шарпантье и Джанифер Дуанда получили Нобелевскую премию по химии 2020 года. Список длинный; благодаря этой международной летней возможности перспективные студенты получат возможность учиться у таких влиятельных умов и личностей.

Венский биоцентр представляет собой агломерацию пяти ведущих европейских исследовательских центров. Эта программа дает выдающимся студентам бакалавриата возможность начать свой практический опыт в этих ведущих исследовательских учреждениях. Все эти исследовательские проекты, которые продолжаются в Биоцентре, связаны с актуальными вопросами молекулярной биологии, нейронауки, иммунологии, биоинформатики, РНК, стволовых клеток, биохимии и т. д.

Финансовое покрытие:
-Все расходы на проезд в Вену и обратно будут возмещены.
-Каждый участник получит девятинедельную стипендию в размере 1400 евро.
-Медицинская страховка будет полностью покрыта.
-Каждому студенту будет выдан бесплатный проездной на период действия стипендии.
-Студенты будут наслаждаться ужином в честь открытия, посещением мест в Вене, поездкой в ​​Хойриген и выпускными летними школьными праздниками, а также регулярными пятничными вечерними социальными часами.

Крайний срок подачи заявок: 31 января 2023 года.

Подробнее: https://training.vbc.ac.at/summer-school/

QuillBot помогает в написании текстов на английском языке. В его функционал входит проверка грамматики и исправление ошибок, поиск синонимов, проверка стилистики текста. Есть расширение для Chrome и Word.