​High-throughput LC-MS analysis to systematically map gut microbiome drug metabolism

🗓 21 July, 2021
⏰ 8AM PDT, 11AM EDT, 4PM BST, 5PM CEST

To systematically map the drug metabolizing capacity of the gut microbiota and assess its potential contribution to drug metabolism, the speaker measured the ability of 76 diverse human gut bacteria to metabolize each of 271 oral drugs. They found that two thirds of these drugs are chemically modified by at least one of the tested microbes.

Through combination of high-throughput bacterial genetics with mass spectrometry-based metabolomics, the speaker systematically identified drug-metabolizing microbial enzymes. These proteins better explain the drug metabolizing capacity of bacterial strains than their phylogenetic classification.

📍 The speaker further demonstrated that the abundance of homologs of these proteins predict the capacity of complete human gut communities to metabolize the targeted drugs. These causal links between microbiota gene content and metabolic activities connect inter-individual microbiome variability to interpersonal differences in drug metabolism, which has translatable potential on medical therapy and drug development across multiple disease indications.

Learn how to:
🔹 Employ high-throughput LC-MS analysis to map gut microbial metabolism
🔹 Combine bacterial genetics with high-throughput LC-MS analysis to identify metabolic enzymes in the gut microbiome
🔹 Integrate in vitro drug metabolism of gut bacteria, genomic information, and metagenomic data.

🌐 REGISTER

Unable to join the live event? Watch on-demand. Register now to ensure that you receive information on how to gain access after the live event.

#AgilentTechnologies #webcasts

🚀 @SBERLOGA начинает серию онлайн докладов посвященных Альфафолд (революционному достижению от Гугл ДипМайнд на стыке датасайнс и биологии)
👨‍🔬 проф. О. Калинина (Helmholtz Institute), к.б.н А. Залевский (ИБХ РАН): "Предсказание трехмерной пространственной структуры белков: классические подходы и методы глубокого обучения"
⌚️ Пятница 23 июля, 18.00 по Москве

AlphaFold – программа для предсказания пространственной структуры белков с помощью глубоких нейронных сетей, созданная компанией DeepMind, которая уже отметилась значительными успехами в создании программ, играющих в шахматы и го. AlphaFold наделала много шума осенью 2020 года, когда ей удалось с большим отрывом выиграть соревнования по предсказанию трехмерных структур белков CASP. 15 июля этого года была опубликована статья в Nature с описанием метода (https://www.nature.com/articles/s41586-021-03819-2) и код на GitHub (https://github.com/deepmind/alphafold). Прежде чем разбираться в деталях реализации нейросети, мы хотим рассказать про классические методы предсказания пространственной структуры и историю CASP. Также мы обсудим особенности локального развертывания AlphaFold и покажем результаты первых бенчмарков на собственных научных задачах.

Подробнее о докладчиках:
Ольга Калинина, профессор drug bioinformatics, Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research Saarland and Saarland University (https://www.helmholtz-hips.de/en/research/people/person/prof-dr-olga-kalinina/), Артур Залевский, кандидат биологических наук, младший научный сотрудник, Институт биоорганической химии РАН (http://www.ibch.ru/structure/groups/lbaccb/1510)

PS
Ссылка на зум будет доступна через тг чат https://t.me/sberlogabio ближе к началу доклада.
Видео записи докладов доступны на ютуб канале SBERLOGA https://www.youtube.com/c/sberloga

🧬 Если вы давно искали качественный информационный ресурс для ученых, то рекомендуем подписаться на BiotechClub. Несколько раз в неделю выходят статьи о достижениях в области биотехнологий, создании современных препаратов и новых научных открытиях.
Подписывайтесь на 👉🏻 BiotechClub и станьте частью научного сообщества!

https://bit.ly/biotech_club5

Telegram
BiotechClub
Канал научного портала и одноименной ежегодной конференции: https://biotechclub.ru/

Дорогие друзья, следующую лекцию в цикле Next Generation Medicine представит Алексей Абызов - руководитель научной лаборатории Mayo Clinic и приглашенный профессор в Yale University. Подключайтесь, чтобы узнать о последних данных, полученных с использованием современных технологий и подходов к изучению соматических мутаций в отдельных клетках, а также об использовании мутаций для отслеживания клеточных линий, начиная с дробления зиготы.

Ссылка на регистрацию: https://forms.gle/hr8bmz5fkmbtBkC59

🧫🧬🔬 Предлагаю вашему вниманию список телеграм-каналов и чатов, посвященных биологии, химии, биотехнологиям:

@medicalksu Канал о цифровой трансформации здравоохранения. Новости о телемедицине, технологиях AI/ML, девайсах для врачей и пациентов и проектах биг фармы в digital.

@polyjuice "Зельеваренье Адвансд" лучший канал в тг о химии. (Иван Сорокин, к.х.н., доцент химфака МГУ)

@smart_lab_news Новости нанобиотеха: различные научные события, конкурсы, конференции и канал

@ibcp_ras_news Новостной канал Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук

@rfmolbiol Интересные статьи, лекции, ссылки, софт, стажировки, учеба зарубежом, учебники, научные пособия, информация о различных мероприятиях (конференции, воркшопы, школы).

@liza_loves_biology Всякая интересная всячина из мира биологии

@sciclub_fbb_msu Чат научного клуба факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ

@dl_bio Семинары про нейросети в биологии от факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ

@sberlogabio Обсуждение биоинформатики и датасайнс

@darthbiology Интересно обо всём, что относится к биологии и медицине. Просто о сложном.

@Bio_Tech_Beats Канал посвящен биотехнологиям: здесь вы найдете учебники, пособия, объявления о PhD

@pcr_news Информационный портал о молекулярной диагностике и смежных областях науки и медицины

@ngmedicine Лекции от топовых мировых биологов, медиков и аналитиков о том, чем будут диагностировать, от чего и как будут лечить людей уже совсем скоро

@ITMO_bioinf_seminar Семинары лаборатории "Компьютерные технологии" Университета ИТМО по биоинформатике

@neuroscience_plus Статьи, учебники и лекции по нейробиологии

@neuronovosti Научно-популярный канал о новостях в области нейробиологии и нейротехнологий

@biomolecula Научно-популярный канал портала "Биомолекула" о молекулярной биологии, генетике, медицине и т.п.

@sno_biospbu Научное сообщество студентов биологического факультета СПбГУ

Факультет биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ продолжает набор на новую магистерскую программу «Биоэкономика»!

Программа готовит специалистов, с разноплановыми компетенциями в области биотехнологий и управления современными биотехнологическими производствами. Также выпускники будут обладать навыками коммерциализации научных разработок и технологического предпринимательства.
Подробнее: http://amp.gs/j8xEc

Подать документы можно до 16 августа.

В случае возникновения вопросов по поступлению есть запись на индивидуальную консультацию по ссылке: http://amp.gs/j8xE6

#бластим_рекомендации

Отличный обзор про использование 3D клеточных культур в доклинических исследованиях рака.

#лекция 20 августа 17:00 онлайн-трансляция. Всеволод Макеев "Индивидуальные варианты и переключения генов": https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeQ6TM0Owm_od2seXggTleNog3yHGMR3pVU5RY5z-xK5LfWhA/viewform

8-10 сентября в Москве состоится офлайн школа для молодых учёных, посвященная нейротехнологиям и биоэлектронной медицине. Участие бесплатное. Количество мест ограничено. Организатор Сколтех. Прием заявок до 25 августа: http://cnbr.skoltech.ru/neuroschool

Эта неделя богата на анонсы — сегодня приглашаем вас принять участие в образовательном воркшопе по перспективам генной и клеточной терапии, который состоится в формате онлайн с 30.08 по 10.09.

Вас ждут 10 лекций от 10 спикеров! Ученые и врачи-исследователи расскажут, как создаются и работают новые методы лечения, какие лекарства уже используются в медицине и какие новые открытия ждут нас в будущем.

Мероприятие бесплатное, необходима регистрация по ссылке.

(Methods in Molecular Biology 2157) Beatrice Bodega, Chiara Lanzuolo - Capturing Chromosome Conformation_ Methods and Protocols-Springer US_Humana (2021)

Intelligent analytics for successful pharmaceutical formulations

🗓 September 08, 2021
⏰ 09:30 - 15:00 (CET)
🗣 English

Join this interactive workshop to see our experts explain how, using real-life examples, the best – and worst – decisions in pharmaceutical development and manufacture are made, and offer their top tips for success. Take the opportunity to collaborate, share ideas and develop an effective strategy for the development and analytical characterization of pharmaceutical formulations.

🔹 Morning Session: Intelligent application of analytics to speed drug candidate selection;
🔹 Afternoon Session: Deploying appropriate methods for solid form or particle size measurement.

🌐 More information and registration on the website.

#обучение #вебинар #webinar #MalvernPanalytical

Открыт набор на курс по Python и Linux для биоинформатики и биологии!

Даты проведения: 27 сентября — 2 октября 2021 (6 дней).
Учиться можно очно в Москве или онлайн на выбор.

В программу входит:
- 20 часов практики с преподавателями- биоинформатиками с разбором примеров из молекулярной и структурной биологии
- 20 часов самостоятельных тренировок с код-ревью
- Практика по bash в реальном окружении на сервере
- Ежедневные лекционные материалы и готовые питоновские тетради с примерами кода + видеозаписи трансляций день в день
- Домашний проект по окончании интенсива для закрепления навыков
- Живое общение и Telegram-чат с преподавателями и однокурсниками
- Отличная атмосфера👍🏻

Успейте зарегистрироваться: https://clck.ru/WtNpJ
Количество мест ограничено.

​🧬Построй свою карьеру в R&D

Открыты вакансии для научных сотрудников в международной биотехнологической компании BIOCAD в Санкт-Петербурге:

⁃ Научный сотрудник (функция Downstream)
⁃ Научный сотрудник (функция Upstream)

Наши преимущества:
⁃ Одна команда — один проект. Никакого разрыва между культивированием и очисткой, между клеточной линией и составом готовой формы.
⁃ Современное оборудование: ВЭЖХ, масс-спектрометры, роботизированные системы, препаративные хроматографы, сотни аналитических приборов от спектрофотометра до NGS-секвенатора.
⁃ Мы работаем по системе Agile: такой подход к проектной работе обеспечивает высокую скорость разработки, прозрачность принятых решений и минимум бюрократии.
⁃ Возможность участия в зарубежных конференциях. Сотрудники компании непрерывно развиваются и расширяют области своих знаний. Компания предоставляет возможность для обучения, а также для посещения различных российских и зарубежных конференций.

Мы ведем разработку в продуктовых командах. Каждая команда — небольшое подразделение из 4−8 экспертов в своей области. Их задачи варьируются от получения клеточных линий до разработки состава и технологии получения готовых форм.
Вы станете частью команды, создающей сложные биотехнологические лекарственные средства, в основе которых лежат белки или вирусные векторы.

📌Переходите по ссылке, узнайте больше о вакансиях и отправляйте свое резюме: https://bit.ly/3h24btH

Сайт с рейтингом научных журналов: https://www.scimagojr.com/journalrank.php

Есть вакансия на позицию постдока в лаборатории в солнечном Сан Диего. Предыдущий опыт в митохондриальной биологии или биоэнергетике приветствуется, но не обязателен.

VI Всероссийская Конференция по молекулярной онкологии с международным участием

🗓 22-24 декабря 2021 г.
🚏 г. Москва, Каширское шоссе, 24, НИИ канцерогенеза ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России
💰 Участие бесплатное
❗️Прием тезисов: до 1 октября 2021

К участию приглашаются ведущие специалисты в области онкологии, вирусологии, цитологии, иммунологии, эндокринологии, генетики и прочих медико-биологических специальностей.

Конференция включает следующие основные направления:
🔹 Геномика и эпигеномика злокачественных новообразований: фундаментальные и прикладные аспекты
🔹 Молекулярные механизмы прогрессии и метастазирования опухолей
🔹 Молекулярная диагностика опухолей
🔹 Молекулярно-биологические подходы к противоопухолевой терапии

Виды участия:
▪️ Публикация в сборнике
▪️ Устный доклад
▪️ Постерная сессия

✅ Все отобранные тезисы будут опубликованы в спецвыпуске журнала «Успехи молекулярной онкологии».
Подробная информация: http://www.mol-oncol.com/