Если вам интересна биоинформатика и дата сайнс, а тем более их пересечение -
рекомендуем вам заглянуть в группу @sberlogabio - чат для общения дата и био людей.
Коллеги также огранизуют еженедельные семинары, совместное прохождение курсов по дата-сайнс
- @sberloga - канал, где отобржаются их активности - подписывайтесь.
Видео записи докладов выклдываются на ютуб, например, доклады об использование дата-сайнс в драг дизайне:
https://www.youtube.com/watch?v=xgT28kR-Sck
или для анализа SNP мутаций:
https://youtu.be/urTLCscw63w возможно будут вам интересны.
Eсли вам интересны вакансии по дс - загляните в @sberlogajobs

Информация про заражение клеточных культур микоплазмой: источники заражения, способы детекции и деконтаминации: https://www.itwreagents.com/italy/en/cb-cc-mycoplasma-and-decontamination #мокрая_биология

Статья об эволюционной функции депрессии: почему психические заболевания, такие как депрессия, не исчезли в процессе эволюции? Можно ли депрессию рассматривать в качестве адаптации к условиям среды? #научпоп

Как сделать красивые фотографии для публикации в ImageJ: 3 способа как убрать фон

Новый семинар НИК «Нанобиотехнологии» СПбПУ!
В пятницу 12 марта с 13.00 до 14.30 Ольга Мушарова (ИМГ, Сколтех) и Дмитрий Сутормин (Сколтех) расскажут о своих исследованиях адаптации (встраивания новых спейсеров) в CRISPR кассету систем I-E типа, а также о разнообразии ферментов-топоизомераз и картировании сайтов их активности с помощью метода Topo-Seq.
Приглашаем всех присоединиться к семинару! Для этого пожалуйста заполните гугл-форму: https://forms.gle/UiTxtZYDnu95ha7C9
За несколько дней до семинара Вы получите письмо с ссылкой на Zoom конференцию.

16.03 в 16.00 онлайн #лекция про сон: http://cnbr.skoltech.ru/openeducation/mystery_of_sleep

Русскоязычный портал о молекулярной биологии, генной инженерии и смежных дисциплинах: https://pcr.news/?utm_source=blastim&utm_medium=banner&utm_campaign=pcr

Курс "Основы нейронауки"

Институт высшей нервной деятельности и нейрофизиологии РАН начинает теоретический курс "Основы нейронауки" в рамках проекта iBrain (http://ibrain.eu)

Курс будет полезным для аспирантов не биологических специальностей. Лекции проходят по вторникам в 10.00-12.00 по мск, язык лекций: русский и английский.

Дата начала курса: 9 февраля 2021

Лекции открыты для всех. Для регистрации на лекцию необходимо заполнить регистрационную форму по ссылке: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSe93qcHZjISWpNka-2EBWC-ahqYqnfjtBWdfnVKxFbO9FoN-A/viewform
Внимание! Регистрация на лекцию заканчивается в 18:00 в понедельник перед очередной лекцией.

Формат лекций: онлайн (ссылка на zoom-встречу будет приходить на почту, указанную при регистрации).

Подробнее о программе можно узнать здесь: https://www.ihna.ru/graduate_school/index.php

Привет!
Нужен совет коллективного разума.

Наша лаба (лаб.клеточной нейрофизиологии человека, ФИЦ ХФ РАН, Москва) выиграла конкурс на очень приличную аспирантскую стипендию (80 тыр. ежемесячно, не считая того, что платят в аспирантуре) – и теперь мы ищем будущего аспиранта, которому было бы интересно с нами, а нам было бы легко и приятно с ним.

Вопрос – где бы разместить объявление, чтобы его увидело побольше студентов-магистрантов, которым интересна нейробиология и электрофизилогия. Объявление на всякий случай прикладываю

Как обрабатывать биологические изображения в Питоне? Пакет PyImageJ - позволит интегрировать ImageJ и Python: https://pypi.org/project/pyimagej/

Здесь есть ноутбуки: https://nbviewer.jupyter.org/github/imagej/tutorials/blob/master/notebooks/ImageJ-Tutorials-and-Demo.ipynb

Форум для тех, кто занимается обработкой изображений: https://forum.image.sc/c/image-analysis/6

#биоинформатика

Фонд "Интеллект" объявил гранты на позиции аспирантов и постдоков в МГУ. Если у вас есть проекты по биоинформатике (+ биология, медицина) свяжитесь с Артуром Залевским ( @aozalevsky )

Вот официальное письмо:
Фондом развития науки и образования «Интеллект» ведется работа по запуску грантового конкурса в МГУ имени М.В. Ломоносова на получение финансирования позиций «PhD Student» (аспирант) и «Junior PostDoc» (молодой кандидат наук) по направлениям «Искусственный интеллект, когнитивные системы, мозг»

Финансирование:
С победителями грантового конкурса заключаются соглашения с
обеспечением финансирования за счет средств фонда на следующих условиях:
— «PhD Student»: 100 000 рублей в месяц (на руки) на срок 3 года;
— «Junior PostDoc»: 150 000 рублей в месяц (на руки) на срок 2 года (с
возможностью продления на 1 год).

Сроки подачи заявки: до 26 марта 2021 г.

Контакты:
E-mail: grant@Intellect-foundation.ru
Тел.: +7 (903) 719 37 46

#пособие по обработке биологических изображений

Что нужно знать о PhD прежде чем подавать документы: https://www.elsevier.com/connect/9-things-you-should-consider-before-embarking-on-a-phd #карьера

МФТИ и ФГБУ «НМИЦ эндокринологии» в рамках проведения Года науки и технологий проводят открытый курс онлайн-лекций по проблемам медицины будущего Next Generation Medicine.

📅 25 марта в 18:00 цикл встреч с молодыми учеными откроет Петр Харченко с лекцией «Изучение заболеваний в сложных тканях методами одноклеточной транскриптомики». Петр на примере онкологических заболеваний расскажет о вычислительных и статистических методах, используемых для сравнительного анализа и интерпретации коллекций scRNA-seq данных, полученных из патологически измененных тканей.

🔥 Петр Харченко — профессор Harvard Medical School, один из мировых лидеров в создании алгоритмов и уникального программного обеспечения для анализа данных секвенирования отдельных клеток. Работа лаборатории, которой руководит Петр сфокусирована на исследованиях гетерогенности клеток опухоли при различных подтипах рака и взаимодействии опухолевых клеток и их окружения.
https://vk.com/video-932_456239696?list=3751844753b8a..

‼Чтобы получить анонсы следующих лекций цикла, зарегистрируйтесь, пожалуйста, по ссылке:
https://forms.gle/YtUzdvg3mWVR4h5q8

Мероприятие проходит в рамках Года науки и технологий при поддержке кластера "Красный Октябрь".
Подобнее о ФГБУ НМИЦ эндокринологии на сайте endocrincentr.ru

Цикл онлайн лекций от МГУ «Молекулярные технологии живых систем и синтетическая биология»: https://www.msu.ru/ad/lektsii-nosh-molekulyarnye-tekhnologii-zhivykh-sistem-i-sinteticheskaya-biologiya.html #лекция

25 марта 11:00 Москва, вебинар Luminex xMAP: высокопроизводительные исследования биомаркеров.

Компания Хеликон приглашает на вебинар посвященный мультиплексной технологии для изучения биомаркеров, разработанной компанией Luminex.

На этом вебинаре рассмотрим:
• технологии, основанные на магнитных шариках: xMAP ® и xTAG ®; их основы;
• приборы, подходящие для работы с ними;
• исследовательские инструменты и реактивы, используемые для создания самостоятельно разработанных панелей.

Язык - английский.

Докладчики:

1. Marianne Vruwink, Голландия, Университет Гронингена. Марианна является представителем Luminex в Европе ответственным за РФ.

2. Tomasz Zborowski, Польша. Томас является ведущим аппликационистом Luminex в Европе.

https://events.webinar.ru/HeliconCompany/8348793

26 марта 11:00–12:00 (MSK) вебинар от компании Хеликон, посвященный работе с амплификатором роторного типа Rotor-Gene Q 5plex, который предназначен для RT-PCR и HRM-анализа.

На вебинаре Вы:

1. изучите все этапы работы с программным обеспечением, в том числе создание новой постановки, редактирование шаблонов тестов, температурного профиля;
2. познакомитесь с меню образцов;
потренируетесь в проведении анализа уже завершенной постановки и формировании отчетов.

Докладчик: Барков Александр, ведущий менеджер по продажам отдела клинической диагностики, к.б.н., ООО «Компания Хеликон»

Ссылка на предыдущий вебинар, посвященный обзору прибора: https://events.webinar.ru/HeliconCompany/8306159/record-new/8473591

Пособие от BioRad по HRM-анализу: http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_6004.pdf