Methods_in_Molecular_Biology_695.pdf
9.8 MB
3D cell culture #пособие #мокрая_биология
Computational_Biology_10_Jeremy_Ramsden_auth__.pdf
2 MB
Введение в биоинформатику #учебник #биоинформатика
13 февраля в 19:40 (корпус R, аудитория R 506) пройдет семинар «Методы машинного обучения в биоинформатике» (Современные приложения машинного обучения к анализу геномных данных). Семинар доцента департамента больших данных и информационного поиска факультета компьютерных наук, заведующей научно-учебной лабораторией биоинформатики Попцова Мария Сергеевна.
Тема: Улучшение предсказание структуры белков на основе потенциалов методами глубинного обучения.
Докладчик: Дарья Афентьева, студентка физического факультета МГУ, стажер-исследователь НУЛ биоинформатики
Cовместная работа компании DeepMind, Университетского колледжа Лондона и Института Фрэнсиса Крика, Лондон, Англия (“Improved protein structure prediction using potentials from deep learning”, Senior et al.). Публикация в журнале Nature, 2020 г. Проблема предсказания трехмерной структуры белка по последовательности представляет собой сложную задачу. Авторы предлагают метод AlphaFold, который представляет собой нейронную сеть, предсказывающую расстояния между парами оснований. Используя эту информацию, авторы восстанавливают потенциал средней силы, которая может аккуратно предсказать форму белка. Авторы обнаружили, что результирующий потенциал может быть оптимизирован простым алгоритмом градиентного спуска для генерации структуры без сложного сэмплирования. Метод AlphaFold достиг высокой точности для 24 из 43 структурных доменов, в то время как лучший до этого метод, основанный на информации о контактных взаимодействиях и сэмплировании, имел точность 14 из 43.
Адрес: Покровский бульвар, 11, корпус R, аудитория R 506.
Время проведения: 19:40-21:00.
Студентам, преподавателям и сотрудникам вход свободный.
Для заказа разовых пропусков просьба обращаться к менеджеру Жеребцовой Ксении по адресу kzherebczova@hse.ru
Тема: Улучшение предсказание структуры белков на основе потенциалов методами глубинного обучения.
Докладчик: Дарья Афентьева, студентка физического факультета МГУ, стажер-исследователь НУЛ биоинформатики
Cовместная работа компании DeepMind, Университетского колледжа Лондона и Института Фрэнсиса Крика, Лондон, Англия (“Improved protein structure prediction using potentials from deep learning”, Senior et al.). Публикация в журнале Nature, 2020 г. Проблема предсказания трехмерной структуры белка по последовательности представляет собой сложную задачу. Авторы предлагают метод AlphaFold, который представляет собой нейронную сеть, предсказывающую расстояния между парами оснований. Используя эту информацию, авторы восстанавливают потенциал средней силы, которая может аккуратно предсказать форму белка. Авторы обнаружили, что результирующий потенциал может быть оптимизирован простым алгоритмом градиентного спуска для генерации структуры без сложного сэмплирования. Метод AlphaFold достиг высокой точности для 24 из 43 структурных доменов, в то время как лучший до этого метод, основанный на информации о контактных взаимодействиях и сэмплировании, имел точность 14 из 43.
Адрес: Покровский бульвар, 11, корпус R, аудитория R 506.
Время проведения: 19:40-21:00.
Студентам, преподавателям и сотрудникам вход свободный.
Для заказа разовых пропусков просьба обращаться к менеджеру Жеребцовой Ксении по адресу kzherebczova@hse.ru
Чат для подписчиков канала "Молбиол, биотех, биохимия, биоинформатика": https://t.me/joinchat/HxH2nlEZsSOvDpnnuL0qNw
Молбиол, биоинформатика, life science pinned «Чат для подписчиков канала "Молбиол, биотех, биохимия, биоинформатика": https://t.me/joinchat/HxH2nlEZsSOvDpnnuL0qNw»
Basic_Neurochemistry_Molecular,.pdf
15.7 MB
#учебник Basic Neurochemistry
Manfred_Schwab_eds_Encyclopedia.pdf
141.5 MB
Энциклопедия рака #учебник
Forwarded from Бластим: курсы и работа в биотехе
Приглашаем на самую крупную в России конференцию по молекулярной диагностике!
http://amp.gs/JvZ2
Программа конференции «Молекулярная диагностика 2020» (14-16 апреля, ГК «Космос», Москва): http://amp.gs/JvZw
Статистика МД-2020:
219 докладов в научной программе
42 иностранных спикера
14 сателлитных симпозиумов
Мероприятие заявлено к аккредитации координационным советом НМО Минздрава России
38 компаний-экспонентов
Более 2500 делегатов из всех регионов России (уже зарегистрировано 1676 делегатов)
18 стран-участников.
http://amp.gs/JvZ2
Программа конференции «Молекулярная диагностика 2020» (14-16 апреля, ГК «Космос», Москва): http://amp.gs/JvZw
Статистика МД-2020:
219 докладов в научной программе
42 иностранных спикера
14 сателлитных симпозиумов
Мероприятие заявлено к аккредитации координационным советом НМО Минздрава России
38 компаний-экспонентов
Более 2500 делегатов из всех регионов России (уже зарегистрировано 1676 делегатов)
18 стран-участников.
Школа по анализу данных Rna seq Москва, 17-18 апреля: http://rsmu.ru/20985.html
27 – 29 марта 2020, Санкт-Петербург хакатон по биоинформатике BioHack'2020: https://biohack.ru/
BioHack — хакатон команд биологов и программистов по решению прикладных задач в области биоинформатики. К участию приглашаются все, кто умеет программировать или имеет знания в области биологии. Чтобы участвовать в BioHack, необходимо заполнить заявку на сайте и написать мотивационное письмо. Команды-победители разделят призовой фонд в размере 370 000 рублей.
BioHack — хакатон команд биологов и программистов по решению прикладных задач в области биоинформатики. К участию приглашаются все, кто умеет программировать или имеет знания в области биологии. Чтобы участвовать в BioHack, необходимо заполнить заявку на сайте и написать мотивационное письмо. Команды-победители разделят призовой фонд в размере 370 000 рублей.
Altogen Labs - лаборатория, на сайте которой можно найти много протоколов преклинических испытаний препаратов (цитотоксичность, работа с ксенографтными моделями, получение нокаутов/нокдаунов, ELISA, работа со стволовыми клетками и т.д.): http://altogenlabs.com/ #мокрая_биология
Российское фотобиологическое общество совместно с ИФПБ РАН и Московским государственным университетом им. М.В. Ломоносова проводит IX СЪЕЗД РОССИЙСКОГО ФОТОБИОЛОГИЧЕСКОГО ОБЩЕСТВА
и конференцию "Современные проблемы фотобиологии" 6-11 сентября 2020 г. Пансионат «Маяк», пос. Шепси, Краснодарский край. Регистрация до 1 июня 2020 г.: http://www.photobiology.ru/web9/9rsp_index.htm
и конференцию "Современные проблемы фотобиологии" 6-11 сентября 2020 г. Пансионат «Маяк», пос. Шепси, Краснодарский край. Регистрация до 1 июня 2020 г.: http://www.photobiology.ru/web9/9rsp_index.htm
Курс Andrew Ng (Standford) по машинному обучению: видеолекции, транскрипты, конспекты, задания + решения. Курс будет интересен для тех, кто интересуется компьютерной биологией: https://see.stanford.edu/Course/CS229 #программирование
see.stanford.edu
Stanford Engineering Everywhere | CS229 - Machine Learning
This course provides a broad introduction to machine learning and statistical pattern recognition.
Topics include: supervised learning (generative/discriminative learning, parametric/non-parametric learning, neural networks, support vector machines);…
Topics include: supervised learning (generative/discriminative learning, parametric/non-parametric learning, neural networks, support vector machines);…
Methods_in_Molecular_Biology_946_Cord_C_Uphoff_Hans_G_Drexler_auth.pdf
8.5 MB
Basic cell culture protocols #пособие #мокрая_биология
Сейчас в научных журналах появилась масса статей про злополучный коронавирус. Однако на эту проблему можно посмотреть и с другой точки зрения. Марк Мэнсон (автор бестселлера Тонкое искусство пофигизма) написал несколько статей по поводу когнитивных ошибок людей при оценки опасности эпидемии и ее последствий: https://markmanson.net/coronavirus-risks-and-biases