#статья, посвященная workflow анализа данных проточной цитометрии #биоинформатика

Genomics data analysis : gene expression, miRNA expression, RNA and DNA sequencing, Chip sequensing: http://www.sthda.com/english/wiki/genomics #биоинформатика

Визуализация данных в R: https://www.r-graph-gallery.com/index.html #программирование

Компания BostonGene открывает вакансию Биоинформатик-биолог (м.Павелецкая)

BostonGene разрабатывает уникальную IT платформу для поддержки онкологов в принятии персонализированных решений о применении новейших классов противоопухолевых терапий и глубокого анализа молекулярного и генетического профиля опухоли.

Мы оцифровываем микроокружение и генетические состояния опухоли пациента, интегрируя NGS данные -WES, RNAseq, данные single cell RNAseq, CYTOF, мультиплексные флуоресцентные изображений опухоли (MxIF) в сочетании с клинической информацией о болезни и пациенте.

Задача платформы интегрировать все новейшие исследования в области онкологии со всего мира, создавая интерактивную базу знаний. BostonGene опирается на анализ генетического профиля опухоли, ее молекулярного состава и микроокружения.

Обязанности:

разработка алгоритмов и биоинформатический анализ NGS данных (WES, WGS, RNAseq, scRNAseq, Methyl-seq);
изучение основ онкогенеза опухоли, участие в проектах по поиску персонализированных биомаркеров эффективности терапий;
аналитика биологии опухоли;
анализ научной литературы и наполнение базы знаний BostonGene молекулярно-биологической информацией по онкогенезу опухоли / молекулярным и клеточным характеристикам;

Требования:

Наличие опыта в одном или более направлениях:
получение из данных геномного секвенирования соматических мутаций;
в получении из данных геномного секвенирования оценок изменения копийности элементов генома и их структурных перестроек;
в получении из данных секвенирования транскриптома экспрессии генов в различных метриках и их нормализации;
в анализе и интерпретации дифференциальной экспрессии генов;
в анализе представленности и поиске молекулярных путей по молекулярным данным различных типов;
уверенный опыт работы с python/pandas, R, GNU coreutils
знание фундаментальных основ иммунологии/клеточной биологии;
знание молекулярной биологии и внутриклеточного сигналлинга;
приветствуется знание молекулярных основ современных таргетных и иммунных противоопухолевых терапий;
опыт работы с научной литературой и научными базами данных;
владение английским языком на хорошем уровне, достаточном для свободного чтения и понимания научных статей. Резюме можно направить на ekaterina.titova@bostongene.com

Презентации и лекции по статистике: http://www.compbio.dundee.ac.uk/user/mgierlinski/statalk.html

Personal statements - секреты успеха: https://mitcommlab.mit.edu/be/commkit/graduate-school-personal-statement/

Таблица размеров различных клеток млекопитающих в микрометрах: https://bionumbers.hms.harvard.edu/files/Sizes%20of%20various%20cells.pdf #мокрая_биология

Дорогие друзья! С радостью сообщаем, что сезон наших заседаний наконец-то открывается :) В эту пятницу, 11 октября, в 19:00 кандидат биологических наук и старший научный сотрудник отдела электронной микроскопии НИИ ФХБ им. А. Н. Белозерского Сергей Александрович Голышев прочитает лекцию по микроскопии всехвысокого разрешения «Оптическая микроскопия с супер-разрешением: что за этим стоит, как это работает и чего от этого ожидать?». Встречаемся в корпусе Б, как обычно, аудиторию сообщим позднее. Если вы уверены, что пойдёте или собираетесь пойти, пожалуйста, отмечайтесь в опросике в посте в ВК https://vk.com/science_club_fbb?w=wall-171654991_1166

Секреты работы в лаборатории в другой стране: https://www.nature.com/articles/d41586-019-02539-y

Каталог научных конференций: http://konferencii.ru/

​​⚡ Как поступить в магистратуру за границей: пошаговая инструкция

16 октября в 19:30 (московское время) Саша Оленина, основатель StudyQA, проведет бесплатный вебинар. Что будет на вебинаре?
✔ инструкция, как поступить в магистратуру за рубежом;
✔ как выбрать страну и университет;
✔ какие документы нужны и как их подготовить;
✔ как получить стипендию;
✔ сколько времени займёт поступление и когда начать подготовку.
📌 Во время вебинара ты сможешь задать все интересующие вопросы и получить ответы бесплатно! Количество мест ограничено. Успей забрать свое: https://is.gd/3dzrlD

Курс лекций от МФТИ Биоинформатика, системная биология и иммунология рака: https://lectoriy.mipt.ru/course/System_biology_2018/lectures #биоинформатика

#лекция https://t.me/sciclub_fbb_msu/584

#учебник по эпигенетике (на русском)

Два #учебник по клеточному сигналингу

Два #учебник по клеточному сигналингу

Sample preparation for flow
cytometry #пособие #мокрая_биология

14.10 Ярмарка вакансий: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeLMTPnyK65roHMnqKyxk3YSynL3eChdnMWu9L7VVVNZ_4BEA/viewform

Cover letter, CV, personal statement: отличия https://apps.weber.edu/wsuimages/WritingCenter/Documents/LetterResumeTipsStatementFall2012.pdf http://athletictraining.msu.edu/pdf/E-Stimjobsearch.pdf

Профессор Стэнфордского университета Джон Иоаннидис — один из самых известных и цитируемых исследователей современной науки, в первую очередь, медицинской. Именно благодаря его публикациям, таким как «Why Most Published Research Findings Are False» и другим, мы пришли к пониманию масштабов проблем с клиническими и эпидемиологическими исследованиями, а кризис воспроизводимости стал одной из самых обсуждаемых тем.

На публичной лекции в университете ИТМО Джон расскажет:
— Почему большинство выводов биомедицинских исследований ошибочны;
— Что мы, в том числе и в России, можем сделать, чтобы исправить ситуацию.

Когда: 25 октября, 18:30
Где: Санкт-Петербург, ул. Ломоносова, д. 9 (университет ИТМО, актовый зал)

Вход свободный, но нужна регистрация: http://amp.gs/qIWQ