Преподобный Исаакий жил в IV столетии, приняв монашество он вел подвижническую жизнь в пустыне. Во времена правления римского императора Валента (364–378 г.), ревностного сторонника арианской ереси, началось гонение на православных христиан — закрывались и уничтожались церкви

Услышав о происходящих событиях, святой оставил свое отшельничество и отправился в Константинополь, чтобы поддерживать верующих духом и укреплять их веру. В тот период племена готов двинулись войной против империи, захватив Фракию и угрожая Константинополю. Когда отправляясь навстречу готским войскам, император Валент проходил мимо Исаакия, святой обратился к правителю: "Царь, открой храмы православным, и Господь поможет тебе!". Однако Валент пренебрег словами монаха и гордо продолжил поход. Преподобный Исаакий повторил трижды свою просьбу и пророчество. Рассерженный император приказал бросить монаха в большой и глубокий овраг заросший кустарниками, на дне которого было непроходимое болото. Благодаря помощи Господа Исаакий чудесным образом спасся, и выбравшись снова предстал перед императором и сказал: "Ты хотел погубить меня, но святые Ангелы вывели меня из пропасти. Послушай меня, открой храмы православным и победишь врагов своих. Если же не послушаешь меня. то не возвратишься живым, но погибнешь в огне". Император, впечатленный дерзостью и чудом спасения монаха, поручил своим приближенным, Сатурнину и Виктору взять и держать святого до своего возвращения

Вскоре произошло именно то, о чём говорил Исаакий: готы разгромили римские силы, и сам император вместе с одним из командиров погибли, заживо сгорев в пожаре в амбаре с сеном. Одержавший победу новый правитель Феодосий Великий, придя к власти в 379 году, следуя совету Сатурнина и Виктора, пригласил святого старца ко двору, оказывая ему великое уважение и прислушиваясь к его советам: удалил арианских сторонников из города и восстановил права православных храмов

Исаакий пожелал вернуться обратно в пустынное уединение, но приближенные императора упросили его не уходить из города и ограждать его молитвами. В предместье Константинополя они построили для святого жилище, куда к нему собрались иноки. Так возник монастырь, игуменом и духовным наставником в котором был преподобный Исаакий, он вёл духовное руководство братией и окружающими людьми, проявляя внимание к нуждающимся и больным. Перед своей кончиной он назначил новым настоятелем монастыря ученика Далмата, по имени которого впоследствии стал называться монастырь. Преподобный Исаакий скончался около 383 года