На этой неделе пандемия достигла нового рекорда скорости распространения: 100000 случаев в день, за счет подключения новых и новых стран Африки, Азии, Ближнего Востока и Латинской Америки. Вакцины нет, лечения нет – и вот в этом контексте сразу несколько лабораторий в мире публикуют данные сложных исследований и вскрывают совершенно новую картину того, как работает наш иммунитет при столкновении с этим новым вирусом. Как выясняется, в игру вступает еще одна крупная сила: т-клеточный иммунитет, и об этом – новый выпуск подкаста «Голый землекоп».
Честно скажу, будет больно, но я терпел, разбираясь с тем, как работает Т-клеточный иммунитет, и вам велел: ведь без этого нельзя понять, почему некоторые люди живут с больными и не заражаются, и почему некоторые люди болеют тяжелее других, почему новые т-клеточные тесты скоро начнут играть важную роль в нашей жизни и дадут новые критерии для создания вакцин. Спойлер: у доноров осени 2019 года нашли Т-клетки, готовые для борьбы с ковидом, и дело не в конспирологии, а, возможно, в простудных коронавирусах из 6го выпуска нашего подкаста. Особый гость нового выпуска – беременный морской конёк с причудливым иммунитетом.
Повторю здесь еще раз, что лаборатория Гриши Ефимова ищет добровольцев для продолжения исследования: людей, которые живут с заболевшими, но которые не болеют сами. Пишите на мейл: covid_donor@blood.ru
Вот препринт его исследования
Вот еще интервью с ним
Web
Apple Podcasts
Google Podcasts
Overcast
Pocket Casts
Castro
Castbox
Radio Public
RSS
Yandex Music
Spotify
YouTube
PS: сегодня утром мы перезалили исправленную версию подкаста. В прошлую версию вкралась адская чушь на 4й и на 7й минуте, где автор, изумляясь сам себе, почему-то сообщал слушателям об антителах размером с вирус. Большое спасибо бдительному слушателю Алексею Комарову, просьба сжечь предыдущую версию и слушать правильную, и вообще почаще нам писать - необязательно про ошибки, но и просто пообщаться, записывайте вопросы (лучше голосом, тогда мы сможем использовать их в подкасте) по адресу @larkinvalley
Честно скажу, будет больно, но я терпел, разбираясь с тем, как работает Т-клеточный иммунитет, и вам велел: ведь без этого нельзя понять, почему некоторые люди живут с больными и не заражаются, и почему некоторые люди болеют тяжелее других, почему новые т-клеточные тесты скоро начнут играть важную роль в нашей жизни и дадут новые критерии для создания вакцин. Спойлер: у доноров осени 2019 года нашли Т-клетки, готовые для борьбы с ковидом, и дело не в конспирологии, а, возможно, в простудных коронавирусах из 6го выпуска нашего подкаста. Особый гость нового выпуска – беременный морской конёк с причудливым иммунитетом.
Повторю здесь еще раз, что лаборатория Гриши Ефимова ищет добровольцев для продолжения исследования: людей, которые живут с заболевшими, но которые не болеют сами. Пишите на мейл: covid_donor@blood.ru
Вот препринт его исследования
Вот еще интервью с ним
Web
Apple Podcasts
Google Podcasts
Overcast
Pocket Casts
Castro
Castbox
Radio Public
RSS
Yandex Music
Spotify
YouTube
PS: сегодня утром мы перезалили исправленную версию подкаста. В прошлую версию вкралась адская чушь на 4й и на 7й минуте, где автор, изумляясь сам себе, почему-то сообщал слушателям об антителах размером с вирус. Большое спасибо бдительному слушателю Алексею Комарову, просьба сжечь предыдущую версию и слушать правильную, и вообще почаще нам писать - необязательно про ошибки, но и просто пообщаться, записывайте вопросы (лучше голосом, тогда мы сможем использовать их в подкасте) по адресу @larkinvalley
Libsyn
Голый землекоп: 9. Клетки специального назначения. Сложный и важный выпуск
Почему некоторые люди не заболевают ковидом, даже если живут с больными? Похоже, дело в наборе счастливых генов и прошлых встречах с простудными коронавирусами. Наш иммунитет — это сложная система из антител и т-клеток, чья работа находить не сам вирус, а…
В последнем выпуске мы обсуждаем новые наблюдения, появившиеся одновременно в нескольких клиниках в мире: у тяжелых больных заметно снижено число т-клеток. Гипотеза, которая не вошла в подкаст: в этом виноват интерлейкин-6, основной агент цитокинового шторма. Новое клиническое исследование в UK ставит целью подхлестнуть производство т-клеток и получить т-клеточный ответ на Covid19: на группе тяжелых пациентов пытаются применять в качестве лекарства интерлейкин-7, который уже показал эффективность в похожей ситуации, а именно при сепсисе.
BioSpectrum
China reports reduction of T cells in COVID-19 patients
The number of total T cells, CD4+ and CD8+ T cells were dramatically reduced in COVID-19 patients, especially in patients requiring Intensive Care Unit (ICU) care
Сегодня привычного выпуска подкаста "Голый Землекоп" не будет, зато во вторник 16 июня в 18:30 мск мы устраиваем открытую запись очередного выпуска. Незадолго до встречи я запощу ссылку на встречу в zoom сюда: если вы успеете зайти (всего сто мест), вы сможете подключиться к нашему разговору и задать свои вопросы голосом. А всех остальных мы зовем присоединиться к онлайн-трансляции на Youtube!
Мы поговорим о том, как ученые играют с прозрачностью, цветом и светом: например, они превращают обычные организмы в светящиеся и работают над созданием прозрачного человека (ок, человеческих клеток). Гостем этого выпуска будет профессор Федор Кондрашов из Австрийского Института Науки и Технологий, который совместно с коллабораторами создал светящийся в темноте табак. Мы обсудим также секреты прозрачных лягушек и еще несколько тем. А во второй части вы сможете задать нам свои вопросы.
Итак, открытая запись во вторник 16 июня начнется в 18.30. Подписывайтесь на наш телеграм-канал, чтобы не пропустить событие!
Мы поговорим о том, как ученые играют с прозрачностью, цветом и светом: например, они превращают обычные организмы в светящиеся и работают над созданием прозрачного человека (ок, человеческих клеток). Гостем этого выпуска будет профессор Федор Кондрашов из Австрийского Института Науки и Технологий, который совместно с коллабораторами создал светящийся в темноте табак. Мы обсудим также секреты прозрачных лягушек и еще несколько тем. А во второй части вы сможете задать нам свои вопросы.
Итак, открытая запись во вторник 16 июня начнется в 18.30. Подписывайтесь на наш телеграм-канал, чтобы не пропустить событие!
Кстати, насчет пропущенного выпуска этой недели: это не совсем так) Голый землекоп отправился в гости в замечательный подкаст про физику и космос, Big Beard Theory. Послушайте обязательно этот бородокаст: я боялся, что придется говорить о космических экспериментах, в которых я ничего не понимаю, но в итоге разговор пошел о том, должен ли журналист рассказывать об интересных исследованиях, если это может привести к запрету на них – и других этических коллизиях научной журналистики
Бородокаст
Научная журналистика и этические дилеммы в ней — Бородокаст
Что такое научная журналистика, чем она отличается от популяризации науки и какие этические и моральные вопросы с этим связаны.
Привет! Это ваш Голый землекоп и студия Либо/либо. Я хочу напомнить про наше приглашение: сегодня, во вторник 16 июня в 18:30 по мск (23:30 Сингапур, 16:30 Лондон, 11:30 NY) все желающие приглашаются в zoom для участия в открытой записи юбилейного, десятого эпизода подкаста. Ссылка появится здесь отдельным сообщением ровно в это время, всего 100 мест, 10 минут на регистрацию. Участие бесплатно. Если вы не успеете, или если вам так удобнее, смотрите в трансляции на YouTube канале студии Либо/либо; там тоже можно задавать вопросы в чате, если вам не хватит мест в zoom. А если вы вообще всё пропустите, то слушайте в пятницу в готовом варианте выпуска на всех площадках.
Гость нашего выпуска профессор IST в Вене, эволюционный биолог Федор Кондрашов. Федя расскажет, зачем он и его коллеги запрограммировали в геном табака гены светящихся грибов, и получил растения, при свете которых можно читать – а также несколько других историй из своей богатой приключениями жизни.
Потом я расскажу о том, как ученые пытаются создать прозрачного человека (ок, почку человека), и как другие ученые, наоборот, делают огромные постройки из слизи жителей глубин – непрозрачными при помощи лазера. Ну еще разное, что накопилось. Ждем!
Гость нашего выпуска профессор IST в Вене, эволюционный биолог Федор Кондрашов. Федя расскажет, зачем он и его коллеги запрограммировали в геном табака гены светящихся грибов, и получил растения, при свете которых можно читать – а также несколько других историй из своей богатой приключениями жизни.
Потом я расскажу о том, как ученые пытаются создать прозрачного человека (ок, почку человека), и как другие ученые, наоборот, делают огромные постройки из слизи жителей глубин – непрозрачными при помощи лазера. Ну еще разное, что накопилось. Ждем!
YouTube
Светящийся табак и редкая птица. Онлайн-запись подкаста «Голый землекоп» | S01E10
#ГолыйЗемлекоп #ЛибоЛибо #Подкаст
Это трансляция открытой онлайн-записи подкаста «Голый землекоп». В первой части Илья Колмановский расскажет про опыты ученых с прозрачностью и люминесценцией. Вместе с биологом Федором Кондрашевым, который создал светящиеся…
Это трансляция открытой онлайн-записи подкаста «Голый землекоп». В первой части Илья Колмановский расскажет про опыты ученых с прозрачностью и люминесценцией. Вместе с биологом Федором Кондрашевым, который создал светящиеся…
Привет! Это ваш Голый землекоп и студия Либо/либо. Мы начинаем запись, все желающие приглашаются в zoom для участия в открытой записи юбилейного, десятого эпизода подкаста. Вот ссылка:
https://us02web.zoom.us/j/84581288055
Всего 100 мест, 10 минут на регистрацию. Участие бесплатно. Если вы не успеете, или если вам так удобнее, смотрите в трансляции на YouTube
канале студии Либо/либо: ссылка в первом комментарии; там тоже можно задавать вопросы в чате, если вам не хватит мест в zoom. А если вы вообще всё пропустите, то слушайте в пятницу в готовом варианте выпуска на всех площадках.
https://us02web.zoom.us/j/84581288055
Всего 100 мест, 10 минут на регистрацию. Участие бесплатно. Если вы не успеете, или если вам так удобнее, смотрите в трансляции на YouTube
канале студии Либо/либо: ссылка в первом комментарии; там тоже можно задавать вопросы в чате, если вам не хватит мест в zoom. А если вы вообще всё пропустите, то слушайте в пятницу в готовом варианте выпуска на всех площадках.
Zoom Video
Join our Cloud HD Video Meeting
Zoom is the leader in modern enterprise video communications, with an easy, reliable cloud platform for video and audio conferencing, chat, and webinars across mobile, desktop, and room systems. Zoom Rooms is the original software-based conference room solution…
Послушайте десятый выпуск подкаста «Голый землекоп», в котором приняли участие наши слушатели. Гость выпуска, профессор Федор Кондрашов рассказывает, как ученые заставили обычный табак светиться в темноте – нужные гены взяли у грибов, а я рассказываю, как ученые сделали прозрачными крошечные человеческие почки – нужные гены взяли у каракатицы. И еще мы обсуждаем Федино хобби: поездки на Чукотку в попытке спасти одну из самых редких птиц на планете, кулика-лопатня.
Web
Apple Podcasts
Google Podcasts
Overcast
Pocket Casts
Castro
Castbox
Radio Public
RSS
Yandex Music
Spotify
Web
Apple Podcasts
Google Podcasts
Overcast
Pocket Casts
Castro
Castbox
Radio Public
RSS
Yandex Music
Spotify
Libsyn
Голый землекоп: 10. Светящийся табак и редкая птица. Открытая запись
Этой весной научные и не только издания во всем мире писали о светящемся табаке. Один из его создателей — профессор из Австрийского Института Науки и Технологий Федор Кондрашов. В этом выпуске он рассказывает Илье Колмановскому, зачем он и его коллеги запрограммировали…
В выпуске Федор Кондрашов рассказывает о том, как детская школа молекулярной и теоретической биологии перестала работать в России. В последние годы дети летали в Барселону, а этом году школа будет проходить онлайн, и для ее работы нужно меньше средств, так что давайте поможем! Вот линк для сбора средств.
Табак, о котором мы говорим в выпуске, светится пока не очень сильно: такая красивая картинка получена при помощи длинной выдержки на фотоаппарате. Ученые планируют усилить свечение в тысячу раз, и перейти на другие виды растений, например, петунию. Одна из проблем, которую им придется решить: сделать так, чтобы побеги не поникали – пока что это оказалось платой за свечение.
К последнему выпуску: история про фейк, который запустил Леонардо да Винчи, бычьи мозги и то, как информация затекает из глаза в мозг.
Федя Кондрашов, пока мы обсуждали прозрачных людей, светящиеся растения и прочие трюки современной науки сказал: это не просто для красоты, это то, как работает голова у биологов. Вот физики устроены иначе: они охотно и успешно думают про вещи, которые невозможно ни увидеть, ни нарисовать. У их объектов, всех этих бозонов и 15ти-мерных пространств нет геометрии; и она им не нужна.
А биологу очень важно увидеть ту штуку, которую он пытается изучать. Так проще думать про нее: про хромосомы (в переводе с греческого: окрашенные тельца, так их собственно и открыли в 19 веке, они хорошо красились), про клетки и ядра, про шипы в короне у коронавируса с их сложной формой. Правда, иногда эта наглядность может сослужить скверную шутку.
Да Винчи придумал, как увидеть вещь, которую плохо видно. Ему хотелось получше понять, как устроен мозг – очевидно, что это хранилище информации, которая поступает извне через органы чувств, например, через глаза. Если вынимать из черепа мозг быка, то можно успеть понять, прежде чем это сероватое желе расползется под ножом, что в центре мозга есть какие-то полости, со сложной и красивой геометрией, какие-то симметричные камеры. Но какой они формы – понять нельзя.
Да Винчи разработал и применил метод: заливать в эти камеры жидкий парафин через отверстие в затылке ДО извлечения мозга из черепа. Парафин застыл, и Да Винчи увидел, что в мозге есть желудочки и водопроводы; он решил, что это и есть самое главное свойство мозга. В его время все были под впечатлением от открытия кровообращения, системы насосов в сердце, и он решил, что мозг работает похожим образом. Поскольку у глаза внутри тоже есть полость, ученый предположил, что существует какая-то информационная жидкость, которая перетекает из глаза в желудочки мозга по зрительному нерву (он похож на трубку из-за очень толстой оболочки).
Сегодня мы знаем, что эта, слишком наглядная вещь оказалась ловушкой для ума да Винчи. Информация передается нервными импульсами с сетчатки. А что же желудочки? Эти полости в мозге нужны, чтобы омывать нервную ткань, уносить продукты сжигания из этой самой метаболически активной ткани в организме. Кстати, работу этой системы ученые из Бостонского университета впервые визуализировали в прошлом году, показав, что именно во время сна мозговой водопровод работает активнее всего. Недосып – калечит, потому что мы не даем нервной ткани очищаться от метаболитов и нейроны гибнут.
Федя Кондрашов, пока мы обсуждали прозрачных людей, светящиеся растения и прочие трюки современной науки сказал: это не просто для красоты, это то, как работает голова у биологов. Вот физики устроены иначе: они охотно и успешно думают про вещи, которые невозможно ни увидеть, ни нарисовать. У их объектов, всех этих бозонов и 15ти-мерных пространств нет геометрии; и она им не нужна.
А биологу очень важно увидеть ту штуку, которую он пытается изучать. Так проще думать про нее: про хромосомы (в переводе с греческого: окрашенные тельца, так их собственно и открыли в 19 веке, они хорошо красились), про клетки и ядра, про шипы в короне у коронавируса с их сложной формой. Правда, иногда эта наглядность может сослужить скверную шутку.
Да Винчи придумал, как увидеть вещь, которую плохо видно. Ему хотелось получше понять, как устроен мозг – очевидно, что это хранилище информации, которая поступает извне через органы чувств, например, через глаза. Если вынимать из черепа мозг быка, то можно успеть понять, прежде чем это сероватое желе расползется под ножом, что в центре мозга есть какие-то полости, со сложной и красивой геометрией, какие-то симметричные камеры. Но какой они формы – понять нельзя.
Да Винчи разработал и применил метод: заливать в эти камеры жидкий парафин через отверстие в затылке ДО извлечения мозга из черепа. Парафин застыл, и Да Винчи увидел, что в мозге есть желудочки и водопроводы; он решил, что это и есть самое главное свойство мозга. В его время все были под впечатлением от открытия кровообращения, системы насосов в сердце, и он решил, что мозг работает похожим образом. Поскольку у глаза внутри тоже есть полость, ученый предположил, что существует какая-то информационная жидкость, которая перетекает из глаза в желудочки мозга по зрительному нерву (он похож на трубку из-за очень толстой оболочки).
Сегодня мы знаем, что эта, слишком наглядная вещь оказалась ловушкой для ума да Винчи. Информация передается нервными импульсами с сетчатки. А что же желудочки? Эти полости в мозге нужны, чтобы омывать нервную ткань, уносить продукты сжигания из этой самой метаболически активной ткани в организме. Кстати, работу этой системы ученые из Бостонского университета впервые визуализировали в прошлом году, показав, что именно во время сна мозговой водопровод работает активнее всего. Недосып – калечит, потому что мы не даем нервной ткани очищаться от метаболитов и нейроны гибнут.
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Пульсация мозгового водопровода во время сна (синие вспышки внизу) - в ответ на ритмичные импульсы, охватывающие всю кору (красные). Истинная правда! и не только в глазах смотрящего.
Если вы пропустили: корь - это тоже кара за урбанизацию. Ученые реконструировали эволюцию вируса кори, и установили, что вирус перешел к нам от скота, когда в 6 веке до нашей эры в Азии стали формироваться городские центры и кочевники в них осели. Больше плотность населения=больше контактов со скотом и между собой=больше шансов для вируса перейти в нового хозяина.
(На фотографии - заформалиненные легкие девочки, умершей от кори 100 лет назад. Образцы из музеев помогают изучать эволюцию вирусов, потому что они сильнее всего отличаются от всех сегодяшних, и так можно получить лучший диапазон для компьютерных вычислений, например сравнивая нашу корь и близкого родственника кори в скоте - чуму крупного рогатого скота)
(На фотографии - заформалиненные легкие девочки, умершей от кори 100 лет назад. Образцы из музеев помогают изучать эволюцию вирусов, потому что они сильнее всего отличаются от всех сегодяшних, и так можно получить лучший диапазон для компьютерных вычислений, например сравнивая нашу корь и близкого родственника кори в скоте - чуму крупного рогатого скота)
Science
Measles virus and rinderpest virus divergence dated to the sixth century BCE
Animal domestication by humans is thought to have given many pathogens an opportunity to invade a new host, and measles is one example of this. However, there is controversy about when measles emerged in humans, because the historical descriptions of measles…
У меня два сообщения. Во-первых, в летнее время подкаст «Голый землекоп» выходит раз в две недели. Следующий, одиннадцатый выпуск сейчас в работе и выйдет в пятницу, третьего июля на всех площадках.
Во-вторых, душераздирающие новости с передовой борьбы с ковидом: ученые смогли заразить в лабораторных условиях печени, кишечники и легкие живых людей. Правда, сами люди в это время гуляли на свободе: вивисекции подвергались крошечные модели их органов, так называемые органоиды.
В последние годы ученые вовсю растят в лаборатории крошечные человеческие печени, желудки, сетчатки, мозги, груди и кишечнички. Это не полноценные органы, они размером лишь с рисовое зерно, но с ними можно делать эксперименты. Органоиды делают из комка клеток, взятых, например, из молочных зубов, или из кожи, перепрограммируют, и заставляют расти, превращаясь в кусочек нужного органа, на заказ.
Органоиды -- это прекрасный инструмент, так можно вырастить в пробирке кусочек мозга человека с аутизмом и сравнить с обычным мозгом, а можно запрограммировать в него гены неандертальца, и посмотреть, как он работал. Можно взять маленький образец ткани, и вырастить из него 1000 кусочков кишечника и в каждом – рак. Тогда робот будет капать в 1000 лунок с мини-моделью рака тысячу разных лекарств, скринируя и разыскивая терапию для конкретного пациента, пока он болеет и ждет лекарства.
В эпоху пандемии ученые из всех областей переключились на изучение нового вируса. Не остались в стороне и органоид-«фермеры»: они принялись тиранить в пробирках крошечные печенки и другие органоиды, заражая их вирусом. Вышло несколько исследований из разных университетов. Результат неутешительный: выяснилось, что новый коронавирус заражает и разрушает клетки и в печени, и в кишечнике, и в легких. Раньше значительную часть этих повреждений относили на счет цитокинового шторма (мы говорим об этом подробно в седьмом выпуске), а теперь видна роль и самого вируса в разрушении тканей.
Эксперимент с большим количеством органоидов легкого, зараженных вирусом и скринингом помог найти еще одно лекарство, которое может работать при Covid19: существующий препарат, иматиниб, обычно применяемый при раке легкого.
Во-вторых, душераздирающие новости с передовой борьбы с ковидом: ученые смогли заразить в лабораторных условиях печени, кишечники и легкие живых людей. Правда, сами люди в это время гуляли на свободе: вивисекции подвергались крошечные модели их органов, так называемые органоиды.
В последние годы ученые вовсю растят в лаборатории крошечные человеческие печени, желудки, сетчатки, мозги, груди и кишечнички. Это не полноценные органы, они размером лишь с рисовое зерно, но с ними можно делать эксперименты. Органоиды делают из комка клеток, взятых, например, из молочных зубов, или из кожи, перепрограммируют, и заставляют расти, превращаясь в кусочек нужного органа, на заказ.
Органоиды -- это прекрасный инструмент, так можно вырастить в пробирке кусочек мозга человека с аутизмом и сравнить с обычным мозгом, а можно запрограммировать в него гены неандертальца, и посмотреть, как он работал. Можно взять маленький образец ткани, и вырастить из него 1000 кусочков кишечника и в каждом – рак. Тогда робот будет капать в 1000 лунок с мини-моделью рака тысячу разных лекарств, скринируя и разыскивая терапию для конкретного пациента, пока он болеет и ждет лекарства.
В эпоху пандемии ученые из всех областей переключились на изучение нового вируса. Не остались в стороне и органоид-«фермеры»: они принялись тиранить в пробирках крошечные печенки и другие органоиды, заражая их вирусом. Вышло несколько исследований из разных университетов. Результат неутешительный: выяснилось, что новый коронавирус заражает и разрушает клетки и в печени, и в кишечнике, и в легких. Раньше значительную часть этих повреждений относили на счет цитокинового шторма (мы говорим об этом подробно в седьмом выпуске), а теперь видна роль и самого вируса в разрушении тканей.
Эксперимент с большим количеством органоидов легкого, зараженных вирусом и скринингом помог найти еще одно лекарство, которое может работать при Covid19: существующий препарат, иматиниб, обычно применяемый при раке легкого.
Nature News & Comment
The boom in mini stomachs, brains, breasts, kidneys and more
Biologists are building banks of 'organoids', and learning a lot about human development on the way.