انجمن سلول‌هاى بنيادى و مهندسى بافت
3.46K subscribers
1.6K photos
98 videos
39 files
1.22K links
🔸كانال انجمن علمى سلول هاى بنيادى و مهندسی بافت دانشگاه خوارزمى

🔸انجمن در فضای مجازی:
https://zil.ink/khustemcell

🔸 نشریه بنیان:
@Bonyan_Magazine

🔸ارتباط با ادمین تبادلات:
@Stemcell_Public_Relations

🔸ارتباط با دبیر:
@Mohammadg124
Download Telegram
🔶ساترن بلات(Southern blotting)

🔸ساترن بلات یکی از سه نوع بلاتینگ است كه توسط دانشمند زیست شیمی اهل انگلستان به نام ادوین ساوترن(Edwin Southern) در سال ۱۹۷۵ معرفی شد.

🔸این تکنیک به عنوان یک
روش برای تشخیص توالی‌های خاص  DNA در نمونه‌های زیستی مورد استفاده قرار می‌گیرد.از این تکنیک می‌توان برای ردیابی یک ژن خاص در کل ژنوم استفاده کرد.


🔸در  ساترن ‌بلات، قطعات DNA  باید برای انجام هیبریداسیون دناتوره (تک رشته ای) شوند.بنابراین زمانی که قطعات DNA  تک رشته‌ای به غشا منتقل می‌شوند، می‌توانند با پروب هیبرید شوند.DNA تک‌رشته‌ای در غشا در معرض پروب‌های نشان‌دار ‌شده قرار می‌گیرد.
اگر این پروب مکمل هر یک از قطعات DNA تک رشته‌ای باشد، هیبرید تشکیل می‌دهد و پروب در محل‌های قطعات مکمل به غشا متصل می‌شود.وجود هیبریداسیون‌ها با ردیابی پروب‌های نشان‌دار روی غشا قابل شناسایی است. غشاها توسط تکنیک X-ray مورد بررسی قرار می‌گیرند و به این ترتیب وجود هیبریدها قابل مشاهده است.


🔸مراحل انجام ساترن بلات:


• در مرحله اول، DNA با وزن زیاد با استفاده از آنزیم‌های اندونوکلئاز محدود کننده به قطعات کوچک شکسته می‌شوند.

• سپس این قطعات بر روی ژل جداکننده الکتروفورز قرار داده می‌شوند تا با توجه به اندازه آن‌ها از یکدیگر جدا شوند.

• اگر قطعات DNA از نظر اندازه بسیار بزرگ باشند (بزرگتر از ۱۵ کیلوباز)، در مرحله اول ژل را باید با هیدروکلراید تیمار کرد که این امر باعث می‌شود قطعات DNA به قطعات کوچک‌تر تقسیم شوند و از این طریق امکان انتقال رشته‌های DNA به صورت دقیق‌تری از ژل به غشا فراهم می‌شود.

• بعد از جدا شدن قطعات DNA بر روی ژل، یک ورقه نیتروسلولوز به عنوان غشا روی ژل جداکننده قرار داده می‌شود و با اعمال فشار بر روی غشا و ژل تعامل مناسب بین این دو ایجاد می‌شود.

• پس از آن غشا در معرض اشعه ماوراء بنفش قرار می‌گیرد یا در خلا یا آون با دمای ۸۰ درجه سانتی‌گراد به مدت ۲ساعت حرارت داده می‌شود تا قطعات به طور دائم به غشا متصل شوند.

• سپس غشا در معرض پروب هیبریداسیون قرار می‌گیرد. در این زمان این مولکول با یک رنگ کروموژنیک برچسب زده می‌شود، پروب DNA به گونه‌ای برچسب گذاری می‌شود که می‌تواند به راحتی آن را تشخیص دهد.

• پس از فرآیند هیبریداسیون، پروب‌های اضافی با استفاده از بافر SSC از بین می‌روند و می‌توان آن را با استفاده از Autoradiography در فیلم اشعه ایکس مشاهده کرد و قطعاتی که با پروب‌های نشان‌دار هیبرید شده‌اند را مورد شناسایی قرار داد.



🔸کاربرد ها:

• برای شناسایی DNA در نمونه‌ها

• انگشت نگاری DNA (DNA finger printing)

• کاربرد در پزشکی قانونی، آزمایش تعیین والدین، شناسایی مجرم

• برای جداسازی و شناسایی ژن‌های مورد نظر در نمونه

• در پلی مورفیسم قطعه محدودکننده یا تکنیک RFLP

• برای شناسایی جهش یا تنظیمات ژن در توالی DNA

• در تشخیص بیماری ناشی از نقایص ژنتیکی

• برای شناسایی عوامل عفونی


#تكنيك

🆔@khustemcell

▫️منابع:

https://www.genome.gov/genetics-glossary/Southern-Blot

https://www.genome.gov/genetics-glossary/Southern-Blot
🔷انکوباتور

در این قسمت #ابزاردان توضیحی در رابطه با انکوباتور كه در آزمایشگاه زیستی استفاده ميشه، خواهيم داد🤩

🔹انکوباتور ها از دسته ابزار هاى آزمایشگاهی هستند که دمای مشخصی را در یک محفظه بوجود می آورند.این سیستم در کلاس های مختلف بسته به نیاز ساخته می شوند که وظیفه اصلی آن ها ایجاد یک دمای مشخص با دقت بالا داخل خود می باشند.

🔹در آزمایشگاه های زیست شناسی، انکوباتور عموما به جهت کشت و نگهداری سلول ها به کار گرفته می شوند. به عنوان مثال همانطور که مشخص است سلول های جانوری در رده پستانداران، درون بدن در دمای 37 درجه رشد می کنند. همچنین بخش زیادی از باکتری های پاتوژن رشد بهینه در دمای 37 درجه دارند. لذا جهت کشت و نگه داری رده های سلولی ذکر شده، نیاز به محفظه ای که دمای 37 درجه را تأمین کند مورد نیاز می باشد و این اهمیت انکوباتور را نشان می دهد. علاوه بر این انکوباتور ها می توانند کاربری ضد عفونی کننده نیز داشته باشند. بدین شکل که ابزار و وسایلی که نیاز به ضد عفونی دارند را می توان با توجه به پروتکل های موجود که دما و زمان مورد نیاز جهت ضد عفونی کردن را مشخص می کند، درون انکوباتور قرار داده و به استریلیزه کردن آن ها پرداخت.
همانطور که گفته شد انکوباتور ها بسته به نیاز و کاربری آن، در انواع مختلف ساخته می شوند.

در هفته بعدی ابزاردان درباره انواع انکوباتور ها توضیح خواهیم داد😊



🔻منتظر ادامه مطلب باشین☺️

#ابزاردان

🆔@khustemcell

▫️منابع:

https://www.britannica.com/technology/incubator

https://www.geniranlab.ir/vtour/geniran/
🔷اثر منفی التهاب های عفونی بر روی سلول های بنیادی مغز

🔹بافت های بدن دائما به وسیله سلول هاى بنیادی بازسازی می شن.این سلول های بنیادی در مکان های خاصی از بافت های مختلف قرار دارن که اون رو اصطلاحا ریز محیط یا نیچ می نامن و در اون جا این سلول های بنیادی با سایر انواع سلول ها برهمکنش می کنن.

🔹یافته های این مطالعه جدید نشون میده که سلول های بنیادی مغزی به تغییراتی که در خارج از مغز رخ میده پاسخ میدن.

🔹در مطالعه ای که روی موش ها صورت گرفته، ثابت شده که التهاب تولید شده به وسیله عفونت های باکتریایی در هر بخشی از بدن می تونه به طور موقت سلول های بنیادی مغزی را فعال و آماده ى عملکرد كنه.

زمانی که التهاب فروکش می کنه، این سلول ها به مرحله خاموشی خود بر می گردن.

🔹این مطالعه موجب شده تا محققین درک بهتری از ارتباط بین سلول های بنیادی و محیط سیستمیک (بقیه بدن) داشته باشن.

تاالان این انتظار وجود
داشت که سلول های بنیادی با محیط نزدیک خودشون برهمکنش داشته باشن اما این اولین بارِ که مشخص می شه سلول های بنیادی تحت تاثیر محیط های با فواصل دورتر نیز قرار دارن.

#سلول_درمانى

🆔@khustemcell

▫️منبع:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1934590920305105?via%3Dihub
🔴انجمن علمی دانشجویی سلول های بنیادی و مهندسی بافت دانشگاه خوارزمی برگزار می کند:

⚪️ چگونه یک موضوع پایان نامه انتخاب کنیم؟

👩‍🏫 سخنران: سرکار خانم دکتر هانیه جلالی

🔹 استادیار و عضو هیات علمی گروه علوم جانوری دانشگاه خوارزمی

🗓 تاریخ: سه شنبه ٢٨ بهمن ماه ساعت ١٢ الی ١٣

🔴 شرکت در وبینار رایگان می‌باشد.

⚠️ لطفا و حتما به عنوان *مهمان* وارد لینک شوید

📬 راه‌ ارتباطی:
برای ثبت نام و دریافت لینک حضور در وبینار به آیدی تلگرام @KhuSC مراجعه کنید.

🧫 @khustemcell
🔶روش فلوریمتری(Fluorimeter)

🔸فلورسانس اسپکتروسکوپی (اسپکتروفلوریمتری یا فلوریمتری)نوعی اسپکتروسکوپی الکترومغناطیسی ست که خاصیت فلورسانس رو در نمونه های مورد مطالعه، بررسی می كنه.

👈🏻تو این تکنیک از یک اشعه نورانی با شدت مشخص، برای تحریک الکترون ها استفاده می شه. در نتیجه الکترون ها به سطوح بالاتر انرژی منتقل می شن.


🔸اسپکتروفتومتری: در روش های اسپکتروفتومتری (طیف سنجی)، تأثیر محلول ها بر امواج الكترومغناطیسی مورد مطالعه قرار می گیره. محدوده طیف الكترومغناطیس می تونه از اشعه ماوراء بنفش تا امواج رادیویی باشه.

👈🏻مقدار نور جذب شده توسط محلول، تابع قوانین Beer و Lambert است و از رابطه  A=e lc محاسبه میشه.


🔸فلیم فتومتری: فلیم به معنی شعله ست. اتم های هر عنصر در اثر تحریک با انرژی حرارتی رنگ خاصی رو در شعله ایجاد می کنن. یعنی طول موج خاصی ایجاد می کنن که رنگ حاصل شده نیز ناشی از اونه. دستگاه فیلم فوتومتر هم که یکی از ابزارهای مهم آزمایشگاه های پزشکی ست، بر همین اساس ایجاد شده.

👈🏻دو نوع اساسی از فلوریمتر ها وجود دارن که عبارت اند از :
فلوریمتر فیلتری و اسپکترو فلوریمتر

تفاوت بین این دو نحوه ی انتخاب طول موج نور تابشی ست.

فلوریمتر فیلتری از  فیلتر استفاده می کنه در حالی که یک اسپکترو فلوریمتر  از  مونوکروماتورهای گریتینگ استفاده می کنه.

فیلتر فلوریمتر ها اغلب در هزینه های پایین با حساسيت کمتر از اسپکتروفلوریمترها خریداری شده / ساخته شده ان.


🔸اجزاء و قسمت های مختلف دستگاه فلوریمتری:

1- منبع نور: لامپ مورد استفاده باید طول موج های یکنواخت در ناحیهUV-Vis ایجاد کنه که معمولا از لامپ گزنون استفاده می کنن که طول موج های 600-200 نانومتر رو ایجاد می کنه.

شدت فلورسانس بستگی به شدت نور تابیده شده دارد. پس هر چقدر كه لامپ مستهلک تر ، شدت فلورسانس کمتر.
برای این منظور از یک تایمر استفاده می کنن که عمر لامپ رو نشون میده و با گذشت 500 ساعت از عمر لامپ، اون رو تعویض می کنیم.

2- منوکروماتور اولیه ست که نور تابیده شده از منبع رو تک رنگ می کنه.بعد از عبور از منوکروماتور اولیه جسم رو در یک طول موج خاص تحریک می کنه.

3- سل نمونه: از جنس کوارتزِ و نباید ایجاد فلورسانس کنه. چهار طرف سل هم شفافِ و در محل تقاطع دو محور قرار داره.

4- منوکروماتور ثانویه: که برای منوکروماتیک کردن نور فلورسانسِ و عمود بر منوکروماتور اولیه.و طول موج EM رو از خودش عبور میده (منوکروماتورها از نوع گریتینگ هستن) که طول موج بالاتر و انرژی کمتری از EX داره.

5- دتکتور: که برای اندازه گیری شدت نور فلورسانسِ و برای جلوگیری از تداخل، ردیاب رو هم عمود بر مسیر نور اولیه قرار میده. ردیاب، یا دتکتور یا فتوسل معمولا از نوع فتومولتی پلایرِ.

6- ثبات (رکوردر): گالوانومتر، یا شکل دیژیتال که آخرین قسمت دستگاه است. و جریان رو ثبت و طیف فلورسانس جسم رو رسم می کنه.

#تكنيك

🆔@khustemcell

▫️منابع:

http://www.jenway.com/faq_Fluorimeters.asp

https://www.york.ac.uk/biology/technology-facility/molecular-interactions/mi-equipment/mi-fluorometer/

https://www.moleculardevices.com/technology/fluorescence#gref
🔷 انواع انکوباتور


🔹در این هفته از #ابزاردان به ادامه مطلب هفته گذشته درباره انکوباتور ها می پردازیم😊


🔷همانطور که در قسمت قبل گفته شد انکوباتور ها بسته به نیاز و کاربری آن، در انواع مختلف ساخته می شوند:


انکوباتور ساده:

🔹این نوع انکوباتور فقط قابلیت تنظیم دما را دارد. در این نوع دما بسته به نیاز تنظیم شده و عموما جهت کشت میکروب ها در محیط های کشت جامد مورد استفاده قرار می گیرد.

شیکر انکوباتور:

🔹این نوع انکوباتور علاوه بر تنظیم دما، قابلیت لرزاندن نمونه در دور های مختلف و زمان مورد نظر را نیز داراست. به عنوان مثال ممکن است نمونه سلولی ما هوازی بوده و در محیط کشت مایع کشت داده شده است. لذا این سیستم با لرزاندن نمونه بسته به دور در دقیقه و زمان تعریف شده به دستگاه، با لرزاندن نمونه هوا را به بخش های تحتانی محیط کشت برساند و موجب رشد یکنواخت نمونه در سرتاسر محیط کشت شود.

انکوباتور CO2 :

🔹این نوع انکوباتور بیشتر در زمینه کشت سلول های جانوری کاربرد دارد. این سیستم علاوه بر تأمین دمای مورد نیاز که عموما 37 درجه سانتی گراد است، به کپسول CO2 نیز متصل شده و میزان کربن دی اکسید درون محفظه خود را در مقدار مشخصی نگه می دارد. حضور کربن دی اکسید در محیط های کشت سلول های جانوری، امری ضروریست چرا که هیدروژن حاصل از متابولیسم سلولی می تواند محیط را اسیدی کرده و موجب مرگ سلول ها شود. لذا محیط های کشت دارای یک سیستم بافری از بیکربنات سدیم می باشند و محتوای داخل فلاسک را در pH فیزیولوژیک و مناسب کشت سلول نگه می دارند. حضور کربن دی اکسید در یک درصد مشخص درون محفظه انکوباتور موجب شکل گرفتن و پایداری سیستم بافری بیکربنات می شود و این نشان دهنده اهمیت وجود CO2 درون محفظه ای که سلول های جانوری کشت داده می شوند، می باشد.

#ابزاردان

🆔@khustemcell

▫️منابع:

https://www.britannica.com/technology/incubator

https://www.geniranlab.ir/vtour/geniran/
🔴سلسله وبینارهای مصاحبه ای

«رتبه های برتر کنکور ارشد وزارت بهداشت»

_با مشارکت انجمن های علمی زیست شناسی دانشگاه های کشور برگزار میگردد

💥قسمت اول: بیوشیمی بالینی

محمد رضا طالب زاده
«رتبه 10 بیوشیمی بالینی و رتبه 15 بیوتک پزشکی»
.
🔻محورهای گفتگو:

✔️معرفی گرایش و بازار کار بیوشیمی بالینی
✔️موفقیت در کنکور ارشد
✔️معرفی بهترین منابع کنکور ارشد
✔️برنامه ریزی و نحوه مطالعه
✔️خصوصیات منحصر به فرد هر درس
✔️آشنایی با رمزهای موفقیت رتبه های برتر
✔️پاسخ به سوالات متداول
و...
.
🔹در بستر ادوب کانکت
.
_زمان برگزاری: 7 اسفند ماه ساعت 16
.
✔️هزینه رویداد: رایگان
.
🔻لینک ثبت نام:
https://eseminar.tv/wb23395
.
_طبق درخواست دانشجویان با پنج گرایش برتر وزارت بهداشت گفتگوهایی خواهیم داشت.

🔬@biology_uma📚
🔷بن ماری water bath


🔹در این هفته از #ابزاردان قراره که با یک دستگاه پرکاربرد آشنا شیم 🤩

🔹بن ماری یا حمام آب گرم

بن ماری از واژه فرانسوی bain marie به معنی حمام آب که معادل انگلیسیِ اون water bath هست گرفته شده.

👈🏻این دستگاه برای گرم کردن تدریجی و یکنواخت محلول در یک بازه زمانی خاص استفاده میشه.

👈🏻محدوده دمایی بن‌ماری‌ ها كه به طور طبیعی و بیشتر مورد استفاده قرار می‌گیره از دمای اتاق تا 100 درجه سانتی گرادِ.
چرا كه در بالاتر از 100 درجه سانتی گراد آب تبخیر میشه.

🔹این دستگاه، اولين بار توسط شیمی دانان به دلیل نیاز به داشتن منبعی برای حرارت دادن تدریجی به مواد شیمیایی تولید شد.

🔹بن‌ماری در انواع، اشكال و سایزهای مختلفی وجود داره.
اكثرا محفظه ای فلزی دارن كه از سه یا چهار بخش پایه تشكیل شده و شامل:

👈🏻یك دستگیره، یك محفظه بیرونی (یا زیرین) روكش دار كه دربرگیرنده مایع داخل حمامِ، یك محفظه كوچك تر داخلی (یا فوقانی) كه درون محفظه بیرونی قرار گرفته و مواد مورد آزمایش كه قرارِ دمای اون تنظیم شه رو دربر می گیره.

🔸این محفظه معمولا تا نیمه در مایع فرو میره و زیر محفظه خارجی نیز منبع حرارتی قرار داره.

🔸محفظه بن ماری باید همیشه حاوی مقدار کافی آب مقطر تمیز باشه. بنابراین قبل از روشن كردن اون بايد از کافی بودن حجم آب مطمئن بشيد.خصوصا زمانی که قراره شبانه یا برای مدت طولانی دستگاه رو روی دمای بالایی روشن بذارید.
بدیهی ست که کم شدن آب باعث بروز آسیب در دستگاه و آتش سوزی خواهد شد.

برای پر کردن بن ماری،از آب یک بار تقطیر استفاده كنيد و مراقب باشید که نمونه های شما به آب نفوذ نکنه😉


#ابزاردان

🆔@khustemcell

▫️منبع:


https://www.google.com/amp/s/www.labrotovap.com/what-is-the-function-of-laboratory-water-bath-2/amp/