Karachay-Balkar DNA
2.76K subscribers
887 photos
6 videos
2 files
335 links
По всем вопросам: @shamaguta
Download Telegram
Forwarded from AHISKA DNA Project
Анализ субкладов Y-DNA по языковым группам с использованием метода Faith’s PD (филогенетического разнообразия) и его результаты

💢 В популяционной генетике определение языковой принадлежности древних субкладов в исторической перспективе представляет собой серьезную методологическую сложность из-за отсутствия письменных источников. В данном контексте анализ с использованием биоинформатического инструмента — индекса филогенетического разнообразия Фейта (Faith’s Phylogenetic Diversity / Faith’s PD) — обеспечивает строгое статистическое и математическое обоснование, выводящее дискуссию за рамки субъективных оценок.

Методологическая база, преимущества и ограничения:

💢 Исключение повторов (Фильтр избыточного тестирования): Главное преимущество метода Faith’s PD заключается в устранении искусственного завышения выборки (близкое родство, повторные тесты внутри одной семьи или высокая плотность коммерческого тестирования в отдельных регионах). Поскольку метод фокусируется не просто на количестве образцов ($n$), а на суммарной длине ветвей, недавние демографические взрывы в популяциях не могут манипулировать общей статистикой.

💢 Точность YFull и терминальных SNP: Анализ выполнен на основе самых глубоких/терминальных SNP (конечных ветвей) на древе YFull. Это позволяет зафиксировать наиболее точные филогенетические разветвления древних линий, дошедшие до наших дней.

💢 Проблема языковых лейблов и ее решение: Наиболее чувствительным ограничением данного метода является то, что лингвистические или этнические маркеры (labels) в базах данных не всегда указаны на 100% корректно или полно. Однако эта структурная трудность успешно преодолевается благодаря тщательной фильтрации и ручной верификации (кураторству) филогенетического и географического происхождения образцов.

Основные результаты:

Во всех изученных вышестоящих и нижестоящих кладах (R-M478, R-Z93, R-Z2124 и R-Y934) тюркоязычные популяции демонстрируют наивысший уровень филогенетического разнообразия и наибольшую глубину возраста расхождения ветвей (PD ybp):

💢 R-M478: Тюркские языки являются абсолютным лидером с долей разнообразия 28.8%.

💢 R-Z93: В этом корневом макрокладе, который традиционно связывают исключительно с индоиранским миром, тюркские языки с долей 9.3% опережают как индоарийские (7.4%), так и иранские (7.2%) ветви.

💢 R-Z2124 и R-Y934: По мере спуска к более глубоким субкладам вес тюркских ветвей становится еще более выраженным; в частности, в R-Y934 тюркские языки показывают долю в 21.6%, что более чем в два раза превышает показатели ближайшего преследователя.

💢 Тот факт, что вариации в индоиранской, абхазо-адыгской (северо-западной кавказской) и сино-тибетской языковых группах имеют более низкие значения PD, указывает на то, что данные группы в историческом процессе выступали в роли «реципиентов» для этих генетических линий, а сами линии распространялись в этой среде в более поздние периоды за счет эффекта основателя (founder effect).

Вывод:

Представленные количественные данные — с учетом очевидного превосходства тюркских ветвей по глубине расхождения (PD ybp) — показывают, что гипотеза, согласно которой эти генетические линии изначально эволюционировали в среде пратюркского континуума или в близком к нему евразийском/степном пространстве, является математически наиболее последовательной, обоснованной и сильной.

Литература и методологические источники / References:
- Теоретическая основа метода (Статья): Faith, D. P. (1992).Conservation evaluation and phylogenetic diversity. Biological Conservation, 61(1), 1-10. https://doi.org/10.1016/0006-3207(92)91201-3
- Биоинформатическое приложение и библиотека кода (scikit-bio):
skbio.diversity.alpha.faith_pd API Reference. https://scikit-bio.org/docs/dev/generated/skbio.diversity.alpha.faith_pd.html

Источник: расчеты выполнены и графики предоставлены администраторами Карачаево-Балкарского, Абхазского и Грузинского DNA-проектов.
🔥15887💯2🐳1
Forwarded from AHISKA DNA Project
Если попробовать оспорить этот вывод, насколько логически и математически верным будет заявить, что все индо-иранцы в степи просто отюречились, поэтому "наполнили" своими линиями тюркскую семью, или например посчитать, что у тюрок разнобразие большое, но их TMRCA молодое?

Вот детальный разбор каждого контраргумента:

Контраргумент 1: «Все индоиранцы в степи просто отюречились, поэтому наполнили своими линиями тюркскую семью».

Этот аргумент звучит просто и привлекательно для историков гуманитарного толка, но он полностью противоречит математической сути метода Faith's PD.

Как работает ассимиляция (смена языка) на графиках:

Если бы большая, разнообразная индоиранская популяция в какой-то момент (например, в эпоху раннего средневековья) просто «поменяла язык» на тюркский, то они перенесли бы в тюркскую среду все свое накопленное веками филогенетическое разнообразие.

Что бы мы видели в результатах: В таком случае у современных индоиранцев и у тюрков показатели Faith's PD были бы либо примерно равны, либо у индоиранцев остаток разнообразия был бы выше (так как «ушедшая» к тюркам часть — это лишь подмножество). Более того, у индоиранцев обнаруживались бы глубокие, уникальные «не-тюркские» ветви субклада Y934, которых нет у тюрков.

Что мы видим на самом деле: На графиках мы наблюдаем картину, когда индоиранские ветви имеют низкий PD ybp и низкую долю (share %). Это означает, что индоиранские образцы сидят на молодых, единичных ветвях, которые ответвились от глубокого тюркского (степного) ствола.

Вывод по первому пункту: Сказать, что «индоиранцы отюречились», нельзя. Если бы они массово отюречились, они бы забрали свое высокое разнообразие с собой, и оно бы отображалось у тюрков как массивный пласт, параллельный индоиранскому. Но графики показывают обратное: индоиранские ветви выглядят как поздние боковые ответвления от мощного евразийского/тюркского древа.


Контраргумент 2: «У тюрков хоть разнообразие и большое, но их TMRCA (Время до общего предка) молодое»


Этот аргумент демонстрирует полное непонимание того, как вычисляется Faith's PD. Это классическая попытка подменить понятия.

Почему это статистически неверно: Показатель PD (ybp) — это Phylogenetic Diversity, выраженная в годах (years before present). Это сумма длин всех неперекрывающихся ветвей внутри конкретной группы.

Математическое противоречие: Невозможно получить гигантское суммарное значение PD (~171 тыс. лет для тюркских ветвей в Y934 против ~78 тыс. лет у индо-иранцев), если бы все тюркские ветви сходились к какому-то молодому предку (эффекту основателя).

Если бы TMRCA тюркских ветвей был молодым, то их суммарная длина ветвей (PD) была бы ничтожно малой, даже при огромном количестве участников ($n=144$).

Большое значение PD при большом $n$ как раз доказывает, что эти 144 образца распределены по множеству древних, глубоко разошедшихся параллельных линий, чьи собственные TMRCA уходят глубоко в бронзовый и железный века.

Вывод по второму пункту: Высокий Faith's PD математически исключает «молодость» общего предка внутри группы. Если ветви «молодые», у них короткие линии на дереве, а значит, сумма длин (PD) физически не может быть большой. Заявление о «молодом TMRCA» при таких графиках — это математический абсурд.


Резюме:

Про ассимиляцию: Метод Фейта оценивает архитектонику дерева. «Обкрадывание» разнообразия привело бы к равенству или преобладанию индоиранских базальных ветвей. Здесь же мы видим, что индоиранские линии филогенетически «беднее» и моложе.

Про TMRCA: Метод Faith's PD специально разработан для того, чтобы отличать «молодой демографический взрыв одной линии» от «древнего сохранения множества линий». Тюркский результат — это именно древнее сохранение множества параллельных линий, а не молодое размножение одного предка.
1410🔥86💯3
Дуслар, наконец-то публикую работу, над которой трудился долгое время.

Это исследование посвящено истории и генофонду гребенских татар — одной из самых малоизученных групп татарского народа, проживающей преимущественно на территории Чеченской Республики. В статье я постарался комплексно рассмотреть архивные источники и результаты современных генетических исследований, сопоставив их между собой.

🧬 Ссылка на статью:
https://m.dzen.ru/a/akEjIeXOCilSC3a0
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍199🔥6
В Грузинском ДНК проекте был опубликован новый Y37 результат свана Гоштелиани.

По фамильному преданию, этот род выводит себя из Чегема, и считается балкарского происхождения. Интересно, что об этом помнят не только представители рода, но также и сами балкарцы.

И. Иванюков и М. Ковалевский в своей работе «У подошвы Эльборуса» (1886 г.) писали: «Число дворян стало возрастать, по мере поселения в обществе новых пришлых родов, в том числе рода Куштельяни, выходцев из Чегема».

По результатам теста определена гаплогруппа G2a1, реликтовый субклад Y36036.

Ближайшими на 37 маркерах оказались, с расстоянием в 2 шага, карачаевец Узденов и балкарец Келеметов (Чегем). Вероятно, попадет в ветвь FGC65318, характерную для карачаево-балкарцев и мегрелов.

Из нашего проекта к субкладу Y36036 также относятся карачаевец Герюков балкарцы Каракизов (Чегем), Отаров (Басхан) и Табаксоев (Малкъар).

Вероятно, предание о балкарском (чегемском) происхождении сванского рода Гоштелиани можно считать подтвержденным.
👍279🔥854🤔1🌚1
СТАТИСТИКА «СВАНО-КАРАЧАЕВСКОГО» СУБКЛАДА Z31459

Название «свано-карачаевский» в отношении субклада Z31459 стало использоваться довольно давно – ещё когда появились первые результаты карачаевцев (балкарцев) и сванов, и которые начали кластеризоваться между собой.

Время шло, ветвь росла, и некоторые люди задавались вопросом – а насколько вообще актуально это название?

Сегодня можно услышать даже более критические утверждения – что ветвь надо переименовать в «свано-кабардинскую», и что карачаевцев и балкарцев там якобы даже меньше, чем чеченцев и кабардинцев.

Подобные утверждения обычно ничем не подкрепляются и держатся на «честном слове», поэтому сейчас хотелось бы проверить эти заявления на реальных цифрах, с помощью встроенного инструмента в YFull Finder.

Сначала по количеству (Фото 1): как мы видим, больше всего в ветви именно карачаево-балкарских образцов (14, 22%), которые показывают почти полный паритет со сванскими (13, 20%). Впрочем, если считать все картвельские образцы вместе, то здесь они берут безусловное лидерство (19, 30%) (Фото 2).

Далее, разнообразие (Фото 3): и снова лидируют карачаево-балкарские образцы (29%), за которыми также следуют сванские (23%). В то же время, общекартвельское разнообразие (Фото 4) безусловно выше – 34%. Но, что интересно, немного уступает общетюркскому (35%).

Таким образом, анализ субклада Z31459 показал, что название «свано-карачаевский» для него до сих пор актуально.
1615💯13🔥87🤔1
СТАТИСТИКА САРМАТСКОГО СУБКЛАДА Y57

Среди многочисленных ветвей R1a-Z93, одна представляет особый интерес тем, что чаще всего встречается среди древних результатов разного рода сарматов. Речь идёт о субкладе Y57.

Таким образом, анализ этой ветви должен предоставить некоторую информацию о вероятной этнической принадлежности самих сарматов.

Наибольшее разнообразие (5, 14%) ожидаемого пришлось на тюркские языки, затем более чем в два раза уступают германские (2, 5%) и сино-тибетские (2, 5%) языки. И на последнем месте со значением в 5 раз ниже находятся адыго-абхазские языки (1, 3%).

К сожалению, большое влияние на расчет имеют такие факторы, что некоторые образцы не загружены на древо YFull, либо не выставили себе язык, однако общую тенденцию можно увидеть и в таком состоянии ветви.

Интересно отметить полное отсутствие индо-иранских образцов, при этом известны маркерные образцы среди турков, татар, узбеков, и ещё две неисследованные ветви у карачаево-балкарцев.

При распределении по отдельным языкам, первое место ожидаемо занимают карачаево-балкарские образцы, занимая 22% всего разнообразия ветви, тогда как остальные занимают по 7%.

Таким образом, сарматский субклад Y57 демонстрирует очевидный тюркский характер и наиболее характерен для карачаевцев и балкарцев.
3313🔥126
АБАЕВ (ЧЕГЕМ) R1a (FTH68800)

Пришел результат Big Y700 теста балкарца Абаева. Определена гаплогруппа R1a, субклад YP451.

Попадает в реликтовое ответвление FTH68393 на уровне ветви YP457, где группируется с результатом балкарца Болатова (Малкъар, Кюнлюм). На древе TimeTree от FTDNA выставлен возраст в 200 лет, что указывает на близкое родство этих двух фамилий, тогда как возраст на древе YFull пока не рассчитан.

В этой же ветви находится некий анонимный образец балкарца из села Новая Балкария. Ввиду наличия в этом поселении нескольких семей Абаевых, стоит предположить, что данный анонимный результат также принадлежит Абаеву.

Субклад YP451 характерен для карачаевцев и балкарцев, у которых достигает 20% всего генофонда. Также встречается в заметно меньших количествах у их ближайших соседей – кабардинцев (7%), абхазо-абазин (4%) и осетин (1%), что является следствием контактов с карачаево-балкарцами и их прямыми предками. Из тюркских народов, представлен среди кумыков, татар, ногайцев, башкир, турков и уйгуров.

Из древних образцов, субклад представлен у двух сарматов, двух ранних аланов, а также у двух представителей позднесредневекового населения Карачаево-Черкесии из могильника Красногорский XII (Усть-Джегутинский район). Был найден у элитного венгра из королевской базилики Секешфехервара.

Смотреть древние образцы субклада YP451
21🔥15123
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🤣2110😁42🫡2👍1😱1😢1😍1
Forwarded from Yfull Finder (ru)
🚀 Релиз автономной веб-версии Ajwla Tree (YTree)!

Друзья, мы рады представить вам полноценный сайт нашего древа Ajwla! 🎉

В чём главная суть Ajwla Tree? Наше древо создано специально для тех образцов, которых НЕТ на официальном древе YFull.
Что это за образцы?
🔵 BigY / WGS тесты, которые люди по каким-то причинам просто не загрузили на YFull.
🔵 Неполные тесты, которые технически невозможно добавить на YFull (например, аутосомные, STR-маркерные тесты или точечные SNP-панели).

Зачем нужен отдельный сайт? Раньше весь этот функционал был доступен только внутри нашего браузерного расширения. Теперь сайт полностью дублирует встроенное древо расширения, но делает работу с ним максимально удобной и доступной с любого устройства! 🤖📱😭👩‍💻

🔗 Попробовать древо прямо сейчас можно по ссылке: ytree.apsny.dev

Спасибо, что помогаете проекту развиваться. Дальше - больше! 🌱
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
10🔥665👏5👍4
ТЕМИРОВ (КЪАРАЧАЙ, КЪАРТ-ДЖУРТ → ОГЪАРЫ МАРА) G2a2b 14 24 14 11 13-14 11 12 11 13 11 30 15 9-9 11 11 23 16 19 29 13-13-13-14 11 11 20-20 14 13 17 18 35-37 11 10

Пришел результат Y37 теста карачаевца Темирова. Определена гаплогруппа G2a2b, субклад L1264.

Здесь попадает в большой абхазо-абазинский кластер FT239194, известный также как «кластер династии Аносидов», объединяющий как древние абхазские владетельные (аҭауад) и дворянские (аамсҭа) рода Ачба, Чугба, а также абхазы Абухба, Амичба, Ардзинба, Басариа; так и абазинские княжеские (аха) и дворянские (агмиста-ду) фамилии – Ашба, Бибердовы, Лоовы, Айсановы, Лафишевы, Лиевы, Дударуковы, Джантемировы, Шереметовы, Клычевы.

Ближайшим для Темирова на расстоянии 1-го шага оказался абхаз Чугба. Это первый карачаево-балкарский результат из данной интереснейшей абхазо-абазинской аристократической ветви, если не учитывать Бибердова и Лиева, которые сегодня являются частью карачаевского народа.

Не совпал с результатом Темирова из научной выборки, который показал гаплогруппу G2a1 (P16).
20🔥11👍864
Тюрки «лир» и «шаз» – проблемы одной теории, и причем тут «Core Xiongnu» [1]

Первая часть разбора нашумевшей истории про лир-тюрков, шаз-тюрков и булан-кобинскую археологическую культуры.

Ссылка на статью: https://telegra.ph/Tyurki-lir-i-shaz--problemy-odnoj-teorii-i-pri-chem-tut-Core-Xiongnu-1-07-11
🔥1198👍33😢1🐳1
ГЕРЮГОВ (КЪАРАЧАЙ) G2a1 (FT151211)

Пришёл результат Big Y700 теста карачаевца Герюгова. Определена гаплогруппа G2a1, субклад Z31459, также известный как «свано-карачаевский». Субклад распространён (по степени убывания) у сванов, карачаевцев, балкарцев, кабардинцев, абхазов и абазин. Обнаруживается также у множества других народов Кавказа и мира, но в гораздо меньших масштабах.

Попадает в наиболее массовую для карачаевцев и балкарцев ветвь Z45053, где разбивает уровень подветви Z45052 и образует новый уровень FT151211.

Таким образом, результат Герюгова вносит в субклад большое разнообразие, будучи параллельным большой подветви Z45052.

Ветвь Z45052 известна тем, что в нее попадают несколько родов из кабардинской аристократии – пши (князья) Ахловы и уздени 1-й степени Анзоровы, Муртазовы и Инароковы, образуя единый кластер FTB89221. Сюда же попадает кабардинец Кулатов.

Также внутри подветви можно выделить: кластер FTH15033, объединяющий результаты балкарца Жилкибаева и кабардинца Агоева; кластер Y655461, объединяющий кабардинцев Гетажеева и Гедуева, и параллельный ему результат чеченца из тейпа Биттой; кластер Z45048, характерный для чеченцев из тейпа Вашиндарой.

Впрочем, никому из них Герюгов не близок и отдалён от них на расстоянии более 2000 лет.

Древние образцы:

CGG017685 Late Sarmatian, Marvele, Kaunas, Lithuania M 76 – 206 CE G2a1-FT246696 | U1a1b2

RKO005 Hun-Sarmatian, Rákóczifalva–Bagi, Szolnok, Hungary M 200 – 250 CE G2a1-Z31459 | H2

S4B113 Late Alan, Krasnogorsky XII, Karachay-Cherkes Republic, Russia M 1100 – 1200 CE G2a1-Z31461

S6B155 Late Alan, Krasnogorsky XII, Karachay-Cherkes Republic, Russia M 1100 – 1200 CE G2a1-Z31461
14👍8🔥754🌚2