Forwarded from Библиотека ИОГен
#личностьвгенетике
Уважаемые читатели!
20 января 2025 года исполняется 130 лет со дня рождения выдающегося генетика и знатока пшеницы Тениса Карловича Лепина. Этот учёный внёс значительный вклад в изучение изменчивости и наследования качественных и количественных характеристик пшеницы, одной из важнейших зерновых культур.
Будучи увлечённым наукой, трудолюбивый студент Лепин был замечен Ю. А. Филипченко, который вовлёк его в исследовательскую работу по изменчивости организмов. По предложению Филипченко Лепин был зачислен научным сотрудником в Бюро по евгенике и генетике. В 1934 году он защитил диссертацию и получил степень доктора наук за исследования в области генетики пшеницы.
С 1935 года Лепин начал тесное сотрудничество с Николаем Вавиловым, который привлекал его в помощь сотрудникам ВИРа, проводившим в Гандже широкомасштабные работы по гибридизации пшеницы. Теннис Карлович сосредоточился на изучении изменчивости пшеницы, исследуя влияние различных факторов на урожайность и качество зерна.
Исследовательская работа Лепина сочеталась с педагогической деятельностью на кафедре генетики Ленинградского университета. Владея в совершенстве вариационно-статистическим методом анализа в применении к явлениям изменчивости и наследственности, он передавал свои знания студентам кафедры генетики.
Лепин был одним из тех учёных, кто противостоял антинаучным подходам, таким как идеи Трофима Лысенко, отрицавшие классическую генетику. Его исследования способствовали сохранению научного подхода к селекции растений и пониманию наследственности.
📌 Авруцкая, Т. Б. Лепин Тенис Карлович / Т.Б. Авруцкая // Соратники Николая Ивановича Вавилова: исследователи генофонда растений / Федер. исслед. центр Всерос. ин-т генет. ресурсов растений им. Н.И. Вавилова; Дзюбенко Н.И. [и др.] (редкол.). — 2-е изд., знач. перераб. и доп. — Санкт-Петербург: ВИР, 2017. — С. 300-303. https://www.vir.nw.ru/wp-content/uploads/2022/11/Lepin-Tenis-Karlovich.pdf?ysclid=m5wdaxg5h1118770864
📌Любимова-Лепина, В. Ф. Памяти Тениса Карловича Лепина / В. Ф. Любимова-Лепина // Генетика. - 1995. - Т. 31, № 4. - С. 588–589. https://viewer.benran.ru/ru/ben01000389696?page=158&rotate=0&theme=white
📌 Лепин, Т.К. Действительные члены Академии наук за последние 80 лет (1846-1924) / Т. К. Лепин, Я. Я. Лус, Ю. А. Филипченко // Родословная гениальности: Из истории отечественной науки 1920-х гг. / Составление Е. В. Пчелова; Вступит. статья Е. В. Пчелова; Комментарии Е. В. Пчелова; Предисловиe Н. П. Бочкова. – М.: Старая Басманная, 2008. – 247-293. https://disk.yandex.ru/i/fJnb9w9Zjif-JA
📌 Филипченко Ю.А. К вопросу о наследовании цвета глаз и волос / Ю.А Филипченко, Т.К. Лепин // Известия Бюро по евгенике. – 1922. - № 1. – С. 39-63. https://disk.yandex.ru/i/WxTxqdSXx-vhgA
Уважаемые читатели!
20 января 2025 года исполняется 130 лет со дня рождения выдающегося генетика и знатока пшеницы Тениса Карловича Лепина. Этот учёный внёс значительный вклад в изучение изменчивости и наследования качественных и количественных характеристик пшеницы, одной из важнейших зерновых культур.
Будучи увлечённым наукой, трудолюбивый студент Лепин был замечен Ю. А. Филипченко, который вовлёк его в исследовательскую работу по изменчивости организмов. По предложению Филипченко Лепин был зачислен научным сотрудником в Бюро по евгенике и генетике. В 1934 году он защитил диссертацию и получил степень доктора наук за исследования в области генетики пшеницы.
С 1935 года Лепин начал тесное сотрудничество с Николаем Вавиловым, который привлекал его в помощь сотрудникам ВИРа, проводившим в Гандже широкомасштабные работы по гибридизации пшеницы. Теннис Карлович сосредоточился на изучении изменчивости пшеницы, исследуя влияние различных факторов на урожайность и качество зерна.
Исследовательская работа Лепина сочеталась с педагогической деятельностью на кафедре генетики Ленинградского университета. Владея в совершенстве вариационно-статистическим методом анализа в применении к явлениям изменчивости и наследственности, он передавал свои знания студентам кафедры генетики.
Лепин был одним из тех учёных, кто противостоял антинаучным подходам, таким как идеи Трофима Лысенко, отрицавшие классическую генетику. Его исследования способствовали сохранению научного подхода к селекции растений и пониманию наследственности.
📌 Авруцкая, Т. Б. Лепин Тенис Карлович / Т.Б. Авруцкая // Соратники Николая Ивановича Вавилова: исследователи генофонда растений / Федер. исслед. центр Всерос. ин-т генет. ресурсов растений им. Н.И. Вавилова; Дзюбенко Н.И. [и др.] (редкол.). — 2-е изд., знач. перераб. и доп. — Санкт-Петербург: ВИР, 2017. — С. 300-303. https://www.vir.nw.ru/wp-content/uploads/2022/11/Lepin-Tenis-Karlovich.pdf?ysclid=m5wdaxg5h1118770864
📌Любимова-Лепина, В. Ф. Памяти Тениса Карловича Лепина / В. Ф. Любимова-Лепина // Генетика. - 1995. - Т. 31, № 4. - С. 588–589. https://viewer.benran.ru/ru/ben01000389696?page=158&rotate=0&theme=white
📌 Лепин, Т.К. Действительные члены Академии наук за последние 80 лет (1846-1924) / Т. К. Лепин, Я. Я. Лус, Ю. А. Филипченко // Родословная гениальности: Из истории отечественной науки 1920-х гг. / Составление Е. В. Пчелова; Вступит. статья Е. В. Пчелова; Комментарии Е. В. Пчелова; Предисловиe Н. П. Бочкова. – М.: Старая Басманная, 2008. – 247-293. https://disk.yandex.ru/i/fJnb9w9Zjif-JA
📌 Филипченко Ю.А. К вопросу о наследовании цвета глаз и волос / Ю.А Филипченко, Т.К. Лепин // Известия Бюро по евгенике. – 1922. - № 1. – С. 39-63. https://disk.yandex.ru/i/WxTxqdSXx-vhgA
#новостинауки
Опубликовано на PCR.NEWS https://pcr.news/novosti/transpozony-igrayut-rol-alternativnykh-promotorov-vo-vremya-rannego-embriogeneza-mlekopitayushchikh/
Транспозоны играют роль альтернативных промоторов во время раннего эмбриогенеза млекопитающих
Исследование, опубликованное в журнале Cell, выявило ключевую роль транспозонов в регуляции генов на ранних стадиях развития млекопитающих. Ученые разработали метод анализа инициации транскрипции и с его помощью показали, что транспозоны запускают транскрипцию генов, действуя как альтернативные промоторы. Анализ эмбрионов пяти видов млекопитающих выявил активную транскрипцию как эволюционно древних, так и молодых транспозонов, демонстрирующих общие и видоспецифичные паттерны.
Источник
Oomen, M. E et al. An atlas of transcription initiation reveals regulatory principles of gene and transposable element expression in early mammalian development. // Cell (2025), published online 20 January 2025. DOI: 10.1016/j.cell.2024.12.013
Опубликовано на PCR.NEWS https://pcr.news/novosti/transpozony-igrayut-rol-alternativnykh-promotorov-vo-vremya-rannego-embriogeneza-mlekopitayushchikh/
Транспозоны играют роль альтернативных промоторов во время раннего эмбриогенеза млекопитающих
Исследование, опубликованное в журнале Cell, выявило ключевую роль транспозонов в регуляции генов на ранних стадиях развития млекопитающих. Ученые разработали метод анализа инициации транскрипции и с его помощью показали, что транспозоны запускают транскрипцию генов, действуя как альтернативные промоторы. Анализ эмбрионов пяти видов млекопитающих выявил активную транскрипцию как эволюционно древних, так и молодых транспозонов, демонстрирующих общие и видоспецифичные паттерны.
Источник
Oomen, M. E et al. An atlas of transcription initiation reveals regulatory principles of gene and transposable element expression in early mammalian development. // Cell (2025), published online 20 January 2025. DOI: 10.1016/j.cell.2024.12.013
pcr.news
Транспозоны играют роль альтернативных промоторов во время раннего эмбриогенеза млекопитающих
👍2
Forwarded from Библиотека ИОГен
#книжнаявыставка #личностьвгенетике
Уважаемые читатели!
Представляю вашему вниманию виртуальную книжную выставку «Генетик-эволюционист Феодосий Григорьевич Добржанский» к 125-летию со дня рождения ученого.
🧬 Ф.Г. Добржанский (1900-1975) – один из наиболее выдающихся генетиков-эволюционистов XX в., значение вклада которого в популяционную генетику и современную эволюционную теорию, а также влияние на современные исследования актуальных эволюционно-генетических проблем не раз подчеркивалось зарубежными и отечественными биологами и историками науки.
🧬 Ф.Г. Добржанский – один из основных создателей современной эволюционной теории. Его знаменитая монография «Генетика и происхождение видов», которая написана на основе джесуповских лекций, прочитанных Добржанским в 1936 г. в Колумбийском университете, и опубликованая в 1937 г., открыла ряд фундаментальных работ в этой области, каждая из которых как бы дополняла остальные, а все вместе взятые составили основу современных эволюционных представлений. При этом книга Добржанского послужила своеобразным катализатором и помогла тем ученым, эволюционные идеи которых еще только формировались.
🧬 Огромная заслуга Добржанского состоит в интеграции теоретических положений дарвинизма и данных генетики. Собрав эмпирические доказательства правильности предложенных ранее теоретических моделей действия генетических факторов и отбора в эволюции, он показал роль генетики в важнейших для эволюционной теории проблемах, в частности в явлении органического разнообразия и прерывистости.
🧬 В лаборатории Добржанского прошли подготовку многие ныне выдающиеся генетики со всех концов света, в том числе Б. Уоллес, Дж. Мур, Р. Левонтин, Ф. Айала. Сыграв большую роль в становлении генетики в Ленинградском университете в двадцатые годы, Добржанский имел учеников и среди советских генетиков: Ю.Я. Керкиса, Я.Я. Луса, Н. Н. Медведева, Ю.Л. Горощенко и других.
🧬 Будучи автором и соавтором целого ряда работ по генетике и эволюции человека, философским и гуманитарным аспектам эволюционной теории, Добржанский оказал значительное влияние на развитие соответствующих областей научного и философского знания, общечеловеческой культуры.
Несмотря на его преданность науке, она не была для него самоцелью. Он часто говорил, что знание биологии и эволюции необходимо для того, чтобы человек лучше понимал себя и свое место во Вселенной.
https://disk.yandex.ru/i/3RbpMZJrmpbdcQ
Уважаемые читатели!
Представляю вашему вниманию виртуальную книжную выставку «Генетик-эволюционист Феодосий Григорьевич Добржанский» к 125-летию со дня рождения ученого.
🧬 Ф.Г. Добржанский (1900-1975) – один из наиболее выдающихся генетиков-эволюционистов XX в., значение вклада которого в популяционную генетику и современную эволюционную теорию, а также влияние на современные исследования актуальных эволюционно-генетических проблем не раз подчеркивалось зарубежными и отечественными биологами и историками науки.
🧬 Ф.Г. Добржанский – один из основных создателей современной эволюционной теории. Его знаменитая монография «Генетика и происхождение видов», которая написана на основе джесуповских лекций, прочитанных Добржанским в 1936 г. в Колумбийском университете, и опубликованая в 1937 г., открыла ряд фундаментальных работ в этой области, каждая из которых как бы дополняла остальные, а все вместе взятые составили основу современных эволюционных представлений. При этом книга Добржанского послужила своеобразным катализатором и помогла тем ученым, эволюционные идеи которых еще только формировались.
🧬 Огромная заслуга Добржанского состоит в интеграции теоретических положений дарвинизма и данных генетики. Собрав эмпирические доказательства правильности предложенных ранее теоретических моделей действия генетических факторов и отбора в эволюции, он показал роль генетики в важнейших для эволюционной теории проблемах, в частности в явлении органического разнообразия и прерывистости.
🧬 В лаборатории Добржанского прошли подготовку многие ныне выдающиеся генетики со всех концов света, в том числе Б. Уоллес, Дж. Мур, Р. Левонтин, Ф. Айала. Сыграв большую роль в становлении генетики в Ленинградском университете в двадцатые годы, Добржанский имел учеников и среди советских генетиков: Ю.Я. Керкиса, Я.Я. Луса, Н. Н. Медведева, Ю.Л. Горощенко и других.
🧬 Будучи автором и соавтором целого ряда работ по генетике и эволюции человека, философским и гуманитарным аспектам эволюционной теории, Добржанский оказал значительное влияние на развитие соответствующих областей научного и философского знания, общечеловеческой культуры.
Несмотря на его преданность науке, она не была для него самоцелью. Он часто говорил, что знание биологии и эволюции необходимо для того, чтобы человек лучше понимал себя и свое место во Вселенной.
https://disk.yandex.ru/i/3RbpMZJrmpbdcQ
Яндекс Диск
Генетик-эволюционист Феодосий Добржанский.pdf
Посмотреть и скачать с Яндекс Диска
👍5❤1
#семинары Семинар в ИОГен РАН (29 января 2025 г. 15-00)
Нуклеопротеидный мир: возникновение жизни на основе гипотезы прогенов
А.Д.Альтштейн
Аннотация
Прогены (progenes) – это аминоацилированные неслучайной аминокислотой
олигонуклеотиды с общей формулой 5'NpNpNp~pN~aa (N – нуклеозид, p – фосфат,
аа – аминокислота, ~ - макроэргическая связь). В докладе будет обсуждаться
вопрос о механизме образования прогенов, который позволяет решить проблему
возникновения генетического кода,
формирования первой бимолекулярной нуклеопротеидной генетической системы на
основе прогенов. Эта система, репродуцирующаяся путем репликации, транскрипции и трансляции, может рассматриваться как
первый живой организм (Protoviroidum primum)
– прародитель современного живого мира
на Земле.
Гипотеза прогенов – это
альтернатива общепринятой гипотезы «РНК-мира».
Aльтштейн
А.Д.- Происхождение
генетической системы: гипотеза прогенов. Мол. Биол., 1987, 21, 309-322.
Altstein AD - The progene hypothesis: the nucleoprotein world
and how life began. Biology Direct, 2015, 10:67 Уважаемые коллеги, желающие посетить семинар, просьба для прохода в ИОГен оставить свои ФИО в комментарии к этому посту
Нуклеопротеидный мир: возникновение жизни на основе гипотезы прогенов
А.Д.Альтштейн
Аннотация
Прогены (progenes) – это аминоацилированные неслучайной аминокислотой
олигонуклеотиды с общей формулой 5'NpNpNp~pN~aa (N – нуклеозид, p – фосфат,
аа – аминокислота, ~ - макроэргическая связь). В докладе будет обсуждаться
вопрос о механизме образования прогенов, который позволяет решить проблему
возникновения генетического кода,
формирования первой бимолекулярной нуклеопротеидной генетической системы на
основе прогенов. Эта система, репродуцирующаяся путем репликации, транскрипции и трансляции, может рассматриваться как
первый живой организм (Protoviroidum primum)
– прародитель современного живого мира
на Земле.
Гипотеза прогенов – это
альтернатива общепринятой гипотезы «РНК-мира».
Aльтштейн
А.Д.- Происхождение
генетической системы: гипотеза прогенов. Мол. Биол., 1987, 21, 309-322.
Altstein AD - The progene hypothesis: the nucleoprotein world
and how life began. Biology Direct, 2015, 10:67 Уважаемые коллеги, желающие посетить семинар, просьба для прохода в ИОГен оставить свои ФИО в комментарии к этому посту
Forwarded from Библиотека ИОГен
#деньпамяти
Уважаемые читатели!
🗓 26 января – день памяти Николая Ивановича Вавилова
Его арестовали 6 августа 1940 года по сфабрикованному обвинению в шпионаже и контрреволюционной деятельности. Все попытки освобождения, предпринятые академиками Д.Н. Прянишниковым и С.И. Вавиловым, не увенчались успехом.
9 июня 1941 года Н.И. Вавилов был приговорён к высшей мере наказания, из Москвы его доставили в Саратов, где он провёл в камере смертников тюрьмы № 1 до 4 июня 1942 года. В порядке помилования, расстрел был заменён на 20 лет лишения свободы. Вавилова должны были отправить в исправительно-трудовой лагерь НКВД, но он заболел дизентерией и попал в тюремную больницу.
Н.И. Вавилов умер 26 января 1943 года и был похоронен в общей могиле для заключённых на Воскресенском кладбище в Саратове. В августе 1955 года Военная коллегия Верховного Суда СССР полностью реабилитировала учёного. Имя Николая Ивановича навсегда вошло в историю мировой науки как национальная гордость России.
*Источник
Уважаемые читатели!
🗓 26 января – день памяти Николая Ивановича Вавилова
Его арестовали 6 августа 1940 года по сфабрикованному обвинению в шпионаже и контрреволюционной деятельности. Все попытки освобождения, предпринятые академиками Д.Н. Прянишниковым и С.И. Вавиловым, не увенчались успехом.
9 июня 1941 года Н.И. Вавилов был приговорён к высшей мере наказания, из Москвы его доставили в Саратов, где он провёл в камере смертников тюрьмы № 1 до 4 июня 1942 года. В порядке помилования, расстрел был заменён на 20 лет лишения свободы. Вавилова должны были отправить в исправительно-трудовой лагерь НКВД, но он заболел дизентерией и попал в тюремную больницу.
Н.И. Вавилов умер 26 января 1943 года и был похоронен в общей могиле для заключённых на Воскресенском кладбище в Саратове. В августе 1955 года Военная коллегия Верховного Суда СССР полностью реабилитировала учёного. Имя Николая Ивановича навсегда вошло в историю мировой науки как национальная гордость России.
*Источник
💔12👍1
Forwarded from Библиотека ИОГен
#мирнауки #молодойученый
🧬 Drosophila melanogaster, или плодовая мушка, на протяжении более чем ста лет является важнейшим модельным объектом в генетических исследованиях.
Ее использование в научных целях началось с работ Томаса Ханта Моргана, который в 1910 году открыл сцепленную с полом мутацию «белые глаза». Это открытие стало поворотным моментом в развитии генетики.
🧬 В 1926 году Герман Джозеф Мёллер изучал воздействие на живой организм рентгеновского излучения, в качестве лабораторного объекта выступала дрозофила. Несколькими годами раньше русский биолог, генетик-эволюционист, Четвериков Сергей Сергеевич начал изучение наследственных свойств у природных популяций дрозофил и других животных. Работы Четверикова и его последователей положили основу новой дисциплины — популяционной генетики.
🧬 В наши дни дрозофила является наиболее изученным видом живых организмов, полностью прочитаны геномы более двух десятков её видов. Учёные используют её в исследованиях генетики развития, взаимодействия генов, эффектов от использования новых медицинских препаратов, устанавливают причины наследственных заболеваний, моделируют на мушках некоторые заболевания человека, влияние на организм наркотической и алкогольной зависимости и многое другое.
🧬 На планете насчитывается около 1500 разновидностей мушек. И все они обладают удивительными свойствами.
✅ Дрозофила бесшумно осуществляет 220 взмахов крыльями (в секунду) при полете за счет своеобразной формы крыльев. Это максимальный показатель среди всех членистоногих животных. Конструкторы позаимствовали у дрозофилы геометрическую пропорцию крыльев для создания лопастей пропеллера.
✅ Также самец исполняет самке серенаду посредством высокочастотных колебаний крыльев.
✅ Поражает сходство мушек с человеком. Примерно 61% человеческих болезней имеют соответствие в геноме животного. Благодаря насекомому производят генетическое моделирование заболеваний человека.
✅ Интересные выводы при изучении насекомых сделали американские биологи. Они изучали брачное поведение самцов плодовой мушки: предлагали на выбор две кормушки. В одной был обычный сахарный сироп, в другой — сахарный сироп со спиртом. Выяснилось, что отвергнутые самкой ухажёры прикладывались намного чаще к сиропу с алкоголем. Таким образом, они восполняли дефицит белка нейропептида F, действующего на центры удовольствия.
🧬 Шесть научных групп в разное время получили Нобелевские премии за свои работы, в которых плодовые мушки использовались для раскрытия секретов человеческой физиологии и биологии в целом.
📌 Читаем больше:
➡️ Six Nobel prizes – what’s the fascination with the fruit fly?
➡️ Данилевская Ольга Н. Мобильные генетические элементы дрозофилы: история открытия и судьба первооткрывателей // Историко-биологические исследования. 2011. №4.
➡️ Медведев Н.Н. Законы наследственности в опытах с дрозофилой. – Москва-Ленинград, 1935.
➡️ Нефедова, Л. Н. Drosophila melanogaster как модель генетики развития: современные подходы и перспективы / Л. Н. Нефедова // Онтогенез. – 2020. – Т. 51, № 4. – С. 243-253. – DOI 10.31857/S0475145020040059. – EDN LERSHC.
➡️ Юрченко Н.Н., Иванников А.В., Захаров И.К. История открытий на дрозофиле – этапы развития генетики. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2015;19(1):39-49.
🧬 Drosophila melanogaster, или плодовая мушка, на протяжении более чем ста лет является важнейшим модельным объектом в генетических исследованиях.
Ее использование в научных целях началось с работ Томаса Ханта Моргана, который в 1910 году открыл сцепленную с полом мутацию «белые глаза». Это открытие стало поворотным моментом в развитии генетики.
🧬 В 1926 году Герман Джозеф Мёллер изучал воздействие на живой организм рентгеновского излучения, в качестве лабораторного объекта выступала дрозофила. Несколькими годами раньше русский биолог, генетик-эволюционист, Четвериков Сергей Сергеевич начал изучение наследственных свойств у природных популяций дрозофил и других животных. Работы Четверикова и его последователей положили основу новой дисциплины — популяционной генетики.
🧬 В наши дни дрозофила является наиболее изученным видом живых организмов, полностью прочитаны геномы более двух десятков её видов. Учёные используют её в исследованиях генетики развития, взаимодействия генов, эффектов от использования новых медицинских препаратов, устанавливают причины наследственных заболеваний, моделируют на мушках некоторые заболевания человека, влияние на организм наркотической и алкогольной зависимости и многое другое.
🧬 На планете насчитывается около 1500 разновидностей мушек. И все они обладают удивительными свойствами.
✅ Дрозофила бесшумно осуществляет 220 взмахов крыльями (в секунду) при полете за счет своеобразной формы крыльев. Это максимальный показатель среди всех членистоногих животных. Конструкторы позаимствовали у дрозофилы геометрическую пропорцию крыльев для создания лопастей пропеллера.
✅ Также самец исполняет самке серенаду посредством высокочастотных колебаний крыльев.
✅ Поражает сходство мушек с человеком. Примерно 61% человеческих болезней имеют соответствие в геноме животного. Благодаря насекомому производят генетическое моделирование заболеваний человека.
✅ Интересные выводы при изучении насекомых сделали американские биологи. Они изучали брачное поведение самцов плодовой мушки: предлагали на выбор две кормушки. В одной был обычный сахарный сироп, в другой — сахарный сироп со спиртом. Выяснилось, что отвергнутые самкой ухажёры прикладывались намного чаще к сиропу с алкоголем. Таким образом, они восполняли дефицит белка нейропептида F, действующего на центры удовольствия.
🧬 Шесть научных групп в разное время получили Нобелевские премии за свои работы, в которых плодовые мушки использовались для раскрытия секретов человеческой физиологии и биологии в целом.
📌 Читаем больше:
➡️ Six Nobel prizes – what’s the fascination with the fruit fly?
➡️ Данилевская Ольга Н. Мобильные генетические элементы дрозофилы: история открытия и судьба первооткрывателей // Историко-биологические исследования. 2011. №4.
➡️ Медведев Н.Н. Законы наследственности в опытах с дрозофилой. – Москва-Ленинград, 1935.
➡️ Нефедова, Л. Н. Drosophila melanogaster как модель генетики развития: современные подходы и перспективы / Л. Н. Нефедова // Онтогенез. – 2020. – Т. 51, № 4. – С. 243-253. – DOI 10.31857/S0475145020040059. – EDN LERSHC.
➡️ Юрченко Н.Н., Иванников А.В., Захаров И.К. История открытий на дрозофиле – этапы развития генетики. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2015;19(1):39-49.
the Guardian
Six Nobel prizes – what’s the fascination with the fruit fly?
Drosophila share 60 per cent of human DNA, making them perfect for research that has led to vital strides in treating cancer, autism, diabetes and many other ills. Now scientists in the field have won yet another Nobel
👍7👏1
#наукаИОГен
Для определения породной принадлежности животных применили машинное обучение
Статья группы специалистов лаборатории сравнительной генетики животных Института общей генетики (ИОГен) РАН, вышедшая в журнале «Генетика» и его англоязычной версии Russian Journal of Genetics, посвящена использованию искусственного интеллекта в популяционной генетике животных в сравнении с классическими методами.
В последнее время в области генетики и селекции наблюдается переход от традиционных методов к современным технологиям, таким как машинное обучение и глубокое обучение. Этот сдвиг обусловлен необходимостью обработки больших объемов данных, с которыми сегодня работают специалисты. Современная селекционная работа требует анализа разнообразных массивов информации: от хозяйственно полезных признаков животных, включая их экстерьер и интерьер, до количественных и качественных показателей продуктивности. Важными компонентами этого процесса также являются генетические маркеры и данные о секвенировании геномов. Внедрение новых технологий в практику животноводства позволяет не только ускорить процесс анализа, но и значительно повысить его точность.
Машинное обучение и нейросети играют ключевую роль в автоматизации обработки и анализа больших данных, позволяя находить закономерности и взаимосвязи, которые могут быть неочевидны при традиционном подходе. Эти технологии делают процесс селекции более эффективным и открывают новые возможности для развития животноводства. Развитие цифровых технологий позволяет ввести анализ больших данных в современную генетику и селекцию. Обучение искусственного интеллекта позволяет отойти от классических стандартов применения математических моделей.
Одна из насущных проблем в генетике животных — это идентификация породной принадлежности, которую не всегда можно определить по фенотипу. Сотрудники лаборатории сравнительной генетики животных ИОГен РАН оценили возможности использования моделей машинного обучения для определения классификации пород и популяций животных по данным анализа микросателлитных локусов. Основным объектом для классификации пород послужила лошадь (Equus caballus), в исследовании применяли стандартную панель из 17 микросателлитных локусов. Эти данные были использованы для машинного обучения. В качестве обучаемой модели была выбрана модель CatBoostClassifier из библиотеки CatBoost от Yandex.
Обучение проводилось по данным 14 отечественных и зарубежных пород. Полученная модель идентифицирует со 100% точностью следующие породы: одичавшие лошади острова Водный (на озере Маныч-Гудило, Ростовская обл.), ахалтекинская, русская тяжеловозная, фризская, фьордская, нью форест, андалузская, донская и арабская.
В остальном, по выборке точность определения породы варьируется в диапазоне от 73 до 100%. При идентификации советской тяжеловозной породы модель не совершала ошибок при сравнении с другими упряжными и тяжеловозными лошадьми, поэтому может использоваться для оценки уровня межпородной гибридизации. В целом обучение модели можно считать успешным, средневзвешенная метрика Accuracy составляет 0.96, заключают авторы.
Ученые подчеркивают, что методы машинного обучения в генетике и селекции в ближайшем будущем станут основой для решения разнообразных научных и практических задач, таких как оценка племенной и генофондной ценности животных, адаптивности, жизнеспособности, психотипа, генетического потенциала, меж- и внутрипородное скрещивание и создание новых пород.
Источник:
А. Д. Солошенков, Э. А. Солошенкова, М. Т. Семина, Н. Н. Спасская, В. Н. Воронкова, Ю. А. Столповский. ИСКУССТВЕННЫЙ ИНТЕЛЛЕКТ И КЛАССИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ В ГЕНЕТИКЕ И СЕЛЕКЦИИ ЖИВОТНЫХ // ГЕНЕТИКА, 2024, том 60, № 7, с. 3–16 DOI: 10.31857/S0016675824070017
Для определения породной принадлежности животных применили машинное обучение
Статья группы специалистов лаборатории сравнительной генетики животных Института общей генетики (ИОГен) РАН, вышедшая в журнале «Генетика» и его англоязычной версии Russian Journal of Genetics, посвящена использованию искусственного интеллекта в популяционной генетике животных в сравнении с классическими методами.
В последнее время в области генетики и селекции наблюдается переход от традиционных методов к современным технологиям, таким как машинное обучение и глубокое обучение. Этот сдвиг обусловлен необходимостью обработки больших объемов данных, с которыми сегодня работают специалисты. Современная селекционная работа требует анализа разнообразных массивов информации: от хозяйственно полезных признаков животных, включая их экстерьер и интерьер, до количественных и качественных показателей продуктивности. Важными компонентами этого процесса также являются генетические маркеры и данные о секвенировании геномов. Внедрение новых технологий в практику животноводства позволяет не только ускорить процесс анализа, но и значительно повысить его точность.
Машинное обучение и нейросети играют ключевую роль в автоматизации обработки и анализа больших данных, позволяя находить закономерности и взаимосвязи, которые могут быть неочевидны при традиционном подходе. Эти технологии делают процесс селекции более эффективным и открывают новые возможности для развития животноводства. Развитие цифровых технологий позволяет ввести анализ больших данных в современную генетику и селекцию. Обучение искусственного интеллекта позволяет отойти от классических стандартов применения математических моделей.
Одна из насущных проблем в генетике животных — это идентификация породной принадлежности, которую не всегда можно определить по фенотипу. Сотрудники лаборатории сравнительной генетики животных ИОГен РАН оценили возможности использования моделей машинного обучения для определения классификации пород и популяций животных по данным анализа микросателлитных локусов. Основным объектом для классификации пород послужила лошадь (Equus caballus), в исследовании применяли стандартную панель из 17 микросателлитных локусов. Эти данные были использованы для машинного обучения. В качестве обучаемой модели была выбрана модель CatBoostClassifier из библиотеки CatBoost от Yandex.
Обучение проводилось по данным 14 отечественных и зарубежных пород. Полученная модель идентифицирует со 100% точностью следующие породы: одичавшие лошади острова Водный (на озере Маныч-Гудило, Ростовская обл.), ахалтекинская, русская тяжеловозная, фризская, фьордская, нью форест, андалузская, донская и арабская.
В остальном, по выборке точность определения породы варьируется в диапазоне от 73 до 100%. При идентификации советской тяжеловозной породы модель не совершала ошибок при сравнении с другими упряжными и тяжеловозными лошадьми, поэтому может использоваться для оценки уровня межпородной гибридизации. В целом обучение модели можно считать успешным, средневзвешенная метрика Accuracy составляет 0.96, заключают авторы.
Ученые подчеркивают, что методы машинного обучения в генетике и селекции в ближайшем будущем станут основой для решения разнообразных научных и практических задач, таких как оценка племенной и генофондной ценности животных, адаптивности, жизнеспособности, психотипа, генетического потенциала, меж- и внутрипородное скрещивание и создание новых пород.
Источник:
А. Д. Солошенков, Э. А. Солошенкова, М. Т. Семина, Н. Н. Спасская, В. Н. Воронкова, Ю. А. Столповский. ИСКУССТВЕННЫЙ ИНТЕЛЛЕКТ И КЛАССИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ В ГЕНЕТИКЕ И СЕЛЕКЦИИ ЖИВОТНЫХ // ГЕНЕТИКА, 2024, том 60, № 7, с. 3–16 DOI: 10.31857/S0016675824070017
👍3❤2
Орловская рысистая (фото https://vk.com/orlovtrotterbase?z=photo-43074484_457250351%2F28f0f7e4ffc706b2d6)
❤5👍2
Одичавшие лошади о-ва Водный (фото: Игорь Шпиленок. http://shpilenok.livejournal.com/182339.html, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=27188228)
👍5❤4
#наукашкольники
Секреты наследственности: участник акции «Ёлка желаний» познакомился с работой Института общей генетики РАН
материал от пресс-службы РАН https://new.ras.ru/activities/news/sekrety-nasledstvennosti-uchastnik-aktsii-yelka-zhelaniy-poznakomilsya-s-rabotoy-instituta-obshchey-/
Тринадцатилетний Владислав вместе с семьёй приехал из Краснодарского края в Москву, чтобы познакомиться сотрудниками Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН — старейшего генетического учреждения в системе Российской академии наук — и побольше узнать о работе учёных. В будущем мальчик мечтает стать генетиком. В декабре прошлого года шарик с желанием Владислава снял с ёлки президент РАН Геннадий Красников.
«Надеюсь, что выбранная профессия принесёт много пользы не только для тебя, но и для всего общества», — обратился к мальчику глава Академии наук.
Секреты наследственности: участник акции «Ёлка желаний» познакомился с работой Института общей генетики РАН
материал от пресс-службы РАН https://new.ras.ru/activities/news/sekrety-nasledstvennosti-uchastnik-aktsii-yelka-zhelaniy-poznakomilsya-s-rabotoy-instituta-obshchey-/
Тринадцатилетний Владислав вместе с семьёй приехал из Краснодарского края в Москву, чтобы познакомиться сотрудниками Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН — старейшего генетического учреждения в системе Российской академии наук — и побольше узнать о работе учёных. В будущем мальчик мечтает стать генетиком. В декабре прошлого года шарик с желанием Владислава снял с ёлки президент РАН Геннадий Красников.
«Надеюсь, что выбранная профессия принесёт много пользы не только для тебя, но и для всего общества», — обратился к мальчику глава Академии наук.
❤13
Долгожданная экскурсия началась в лаборатории эволюционной геномики, где Владислав увидел бессмертных медуз Turritopsis dohrnii. Мальчику рассказали, что на основе этих модельных объектов изучают молекулярную генетику обратного развития медуз — при определённых условиях они могут превращаться обратно в полип, приобретая биологическое «бессмертие». Мама Владислава рассказала, что мальчик мечтает изобрести «элексир молодости», поэтому к исследованиям этих уникальных созданий он проявил особый интерес.
Кроме того, сотрудники лаборатории занимаются изучением древней ДНК людей и животных, например, исследуют генетическую историю населения России или ДНК вымерших животных — морских коров и мамонтов. Владислав увидел костные останки, найденные в ходе археологических раскопок, и поинтересовался, можно ли воссоздать мамонта.
Кроме того, сотрудники лаборатории занимаются изучением древней ДНК людей и животных, например, исследуют генетическую историю населения России или ДНК вымерших животных — морских коров и мамонтов. Владислав увидел костные останки, найденные в ходе археологических раскопок, и поинтересовался, можно ли воссоздать мамонта.
❤10
Сегодня Институт общей генетики РАН носит имя своего основателя и первого директора — академика Николая Ивановича Вавилова. К столетию учёного в 1987 году в институте был открыт мемориальный кабинет-музей. Старший научный сотрудник и хранитель мемориального кабинета Н.И. Вавилова Татьяна Авруцкая провела экскурсию по научному наследию Николая Ивановича — показала научные труды, материалы экспедиций и личные вещи академика. В коллекции также представлена литература известнейших натуралистов, биологов и генетиков России и мира, раскрывающая ключевые вехи зарождения науки.
«Меня очень приятно удивило, что желания детей от предметов перешли к профессиональной мечте. Раньше они просили велосипед, а теперь мечтают о чём-то настоящем», — заметила Татьяна Авруцкая.
«Меня очень приятно удивило, что желания детей от предметов перешли к профессиональной мечте. Раньше они просили велосипед, а теперь мечтают о чём-то настоящем», — заметила Татьяна Авруцкая.
❤10
Очередной точкой экскурсионного маршрута стало знакомство с заведующим отделом генетических основ биотехнологии Валерием Даниленко. Профессор прочитал гостям лекцию про микробиом — совокупность микробов, населяющих живой организм, которые отвечают за взаимодействие с факторами внешней среды и регулируют гомеостаз всего организма. Именно поэтому микробиом часто называют «вторым мозгом» человека.
«Микробиота — совокупность тысяч бактерий, живущих в нашем кишечнике и определяющих здоровье и развитие человека. Она — источник фармакологически активных лекарств для лечения различных заболеваний, таких как артрит, аутизм, паркинсонизм и депрессия», — рассказал учёный.
«Микробиота — совокупность тысяч бактерий, живущих в нашем кишечнике и определяющих здоровье и развитие человека. Она — источник фармакологически активных лекарств для лечения различных заболеваний, таких как артрит, аутизм, паркинсонизм и депрессия», — рассказал учёный.
❤6