О том, как с помощью генетики можно изучать историю, рассказала Александра Борисовна Малярчук, сотрудник лаборатории эволюционной геномики. Она представила особенности и трудности работы с древней ДНК, рассказала об истории палеогеномики, которая началась в 1984 году с выделения ДНК вымершей зебры квагги, а сегодня специалисты уже могут секвенировать фрагменты ДНК мамонта возрастом 2 млн лет. Обратившись к собственным исследованиям лаборатории, А.Б. Малярчук рассказала про секвенирование генома мамонта, про идентификацию по ДНК останков царской семьи Романовых, про анализ ДНК из волос царевича Алексея, приложенных к его портрету в музее, про экспертизу костных останков из Мезмайской пещеры, в которых предполагалось найти неандертальца, а нашли… зубра. Но также и про анализ неандертальской ДНК, впервые проведенный в нашей стране. Она также рассказала про генетический анализ древнерусских останков, который позволяет решать некоторые исторические вопросы. Например, анализ генома древнего ярославца, которого по одежде считали средневековым монголом, показал, что это европеец, как по митохондриальной ДНК, так и по генетическим маркерам внешности. А исследование останков из кургана вятичей в Подмосковье продемонстрировало генетическую преемственность древнерусского и современного населения.

Татьяна Борисовна Авруцкая, хранитель Мемориального музея Н.И. Вавилова, рассказала про Николая Ивановича Вавилова, который в 1934 году создал Институт генетики, ныне Институт общей генетики, носящий его имя. Этому человеку, который прожил мало, а сделал невероятно много, больше всего подходит слово — естествоиспытатель, сказала она. Обратившись к истории генетики, Т.Б. Авруцкая упомянула основные ее вехи — открытие законов Менделя в 1865 году, затем забвение и переоткрытие лишь в 1900 году; введение Уильямом Бэтсоном понятия «генетика» в 1906 году. В России в 1920-х годах происходит всплеск в науке, совпадающий с «серебряным веком» в литературе и искусстве. И в это время, в период гражданской войны, разрухи, голода, интенсивные научные исследования ведет Вавилов.

Татьяна Борисовна рассказала об экспедициях Н.И. Вавилова — он объездил 60 стран на пяти континентах, исследуя мировое разнообразие культурных растений, собирая уникальные коллекции. Остановилась на одной из самых тяжелых — в Афганистан в 1924 году, за которую Русское географическое общество присудило ученому Золотую премию; одним из результатов этой экспедиции стало открытие происхождения культурной ржи из сорняков. Очень трудной была экспедиция 1927 года в Абиссинию, когда за 4 месяца было пройдено 2 тысячи километров, в тяжелейших условиях, без всякой поддержки; были изучены абиссинские пшеницы и найдена уникальная черная пшеница. Итогом этих полевых изысканий стала теория Н.И. Вавилова о Центрах происхождения культурных растений, которая стала основой для последующих исследований биоразнообразия, для выявления регионов, где человек впервые стал выращивать ту или иную культуру, и путей миграций людей, неразрывно связанных с передачей навыков земледелия. Итогом стала уникальная коллекция семян культурных растений, хранящаяся во Всероссийском институте растениеводства (ВИР), во времена Вавилова в ней содержалось 200 тысяч образцов, которые сотрудники героически сохранили даже во время блокады Ленинграда.

Под конец встречи школьникам показали короткий фильм о Вавилове, озаглавленный его знаменитой фразой «Жизнь коротка, надо спешить». И познакомили с экспозицией Мемориального музея Н.И. Вавилова в ИОГен РАН.

#ИОГенвСМИ Интервью д.б.н. Сергея Львовича Киселева, заведующего лабораторией эпигенетики ИОГен РАН, изданию "Нож"
https://knife.media/kiselev-biology/

"Внушения совести в связи с раскаянием и чувством долга являются важнейшими различиями между человеком и животным". Чарлз Дарвин #цитатадня

Дорогие друзья!

#наукаИОГен В ИОГен РАН появилась новая научная структура — лаборатория геномики растений. Решение о ее создании единогласно принято на Ученом совете, который состоялся 17 сентября 2024 г.

Как рассказал руководитель лаборатории Алексей Пенин, основной целью коллектива является проведение полного цикла исследований растений, начиная от получения исходных данных и создания алгоритмов для их обработки до экспериментальной проверки выдвинутых гипотез, в том числе с использованием методов геномного редактирования. Для этого в состав создаваемой лаборатории вошли специалисты очень разного профиля, от ботаников до биоинформатиков, от генетиков до биотехнологов.

Руководитель лаборатории выступил с докладом: «Эволюция геномов растений: подходы и перспективы», в котором дал краткий обзор планируемых направлений деятельности. Как известно, геномы растений намного больше по размеру и сложнее устроены, чем геномы животных. Так например, у многих видов общие для всех его представителей гены («коровые» - core - гены), составляют лишь 30-35 % от общего видового разнообразия генов, а большая часть генов присутствует только в ряде индивидуумов. Это следствие высокой пластичности геномов растений. Одно из ярких и наиболее интересных проявлений этой пластичности - полиплоидизация (кратное увеличение числа хромосом). Полиплоидизация – основной источник нового генетического материала в геномах растений, который служит субстратом для последующих эволюционных процессов.

А.А.Пенин рассказал про исследование пастушьей сумки, одного из самых распространенных на планете растений. Пастушья сумка обыкновенная (Capsella bursa-pastoris) образовалась в результате недавней гибридизации двух родительских видов, что обеспечило взрывной рост приспособленности. Это, а также ее близкое родство с модельным объектом генетики растений Arabidopsis thaliana делает ее идеальным объектом для изучения ранних процессов, происходящих в геномах при полиплоидизации. Более общие механизмы эволюции растительных геномов будут исследоваться на примере 16 видов цветковых растений, представляющих все основные таксономические группы. Для этого были разработаны специальные инструменты, основанные на методах машинного обучения, для функционального сравнения генов у разных видов. Основной задачей является понимание как механизмов, определяющих сохранение консервативности функции, так и механизмов, которые обеспечивают появление у генов новых функций.

Другим важным направлением исследований новой лаборатории станет изучение эволюции геномов злаков, в том числе ржи. Эта группа интересна не только тем, что включает в себя хозяйственно ценные виды, изучение которых будет полезно для выведения новых сортов, но и тем, что она прошла через несколько независимых циклов полиплоидизации за последние 20 миллионов лет. Это делает семейство хорошей моделью для изучения последствий полиплоидизации на средних эволюционных дистанциях.

В докладе были упомянуты и другие исследования лаборатории, такие как определение полной последовательности генома борщевика. В ходе этой работы ученые показали, что у борщевика произошло существенное увеличение числа генов, прежде всего из-за тандемных дупликаций. Дальнейшие исследования помогут определить возможные пути распространения этого инвазивного вида. Одни из самых необычных объектов, исследуемых в лаборатории - нефотосинтезирующие растения, такие как петров крест и подъельник. Анализ их геномов позволит понять изменения, происходящие в геноме при потере важнейшего физиологического процесса – фотосинтеза.

Сообщение от Библиотеки ИОГен РАН

#книжнаявыставка
Уважаемые читатели!
19 сентября 2024 г. исполняется 125 лет Николаю Константиновичу Беляеву (1899-1937) – известному советскому генетику четвериковской школы, специалисту в области общей и эволюционной генетики, феногенетики, цитогенетики, селекции. Он был среди первых отечественных исследователей, выполнивших работы по генетике природных популяций дрозофил. Его приход в шелководство оказал определяющее влияние на генетико-селекционные достижения в советском шелководстве.
Представляем вашему вниманию виртуальную книжную выставку «Николай Константинович Беляев», посвященную юбилею ученого.

"Я до сих пор завидую людям, которые либо по небрежности, либо по глупости, либо по необразованности еще не прочли массу интересных книг, которые я прочитал. Я им завидую! Им же предстоит такое наслаждение!" (Н.В. Тимофеев-Ресовский) #цитатадня

#книжнаявыставка #новыекниги
Уважаемые читатели! В фонд библиотеки поступили книги. Ознакомиться с литературой можно на виртуальной книжной выставке Новое поступление книг Вып. 2

#новыежурналы
Уважаемые читатели! В фонд библиотеки поступили новые выпуски журналов:
- Гены & клетки. - 2024. Т. 19, вып. 2 .
- Медицинская генетика. - 2024. Т. 23, вып. 4 .
- Медицинская генетика. - 2024. Т. 23, вып. 3 .
- Медицинская генетика. - 2024. Т. 23, вып. 5 .
- Молекулярная медицина. - 2024. Т. 22, вып. 3 .
- Молекулярная генетика, микробиология и вирусология : научно-теоретический журнал. - 2024. Т. 42, вып. 2 .
- Экологическая генетика. - 2024. Т. 22, вып. 2 .
- Экология человека : ежемесячный научный рецензируемый журнал. - 2023. Т. 30, вып. 11 .

#лженаука Комиссия РАН по борьбе с лженаукой опубликовала заявление в связи с прозвучавшими недавно призывами исключить теорию Дарвина из школьной программы.

#лженаука 1. В настоящее время концепция биологической эволюции, основанная на идеях Чарльза Дарвина, является фундаментом всей современной биологической науки. Речь идет не только о происхождении человека от древних приматов, а о происхождении всего живого от единого общего предка. Человек имеет общего предка не только с шимпанзе, но и со всеми клеточными формами жизни на планете. Этот вопрос не является предметом спора среди профильных специалистов: биологов, антропологов и палеонтологов, как в России, так и в мире. Этот вопрос также не является вопросом веры.

#лженаука Принципы эволюции, сформулированные Дарвином и впоследствии дополненные исследователями XX и XXI веков, неразрывно связаны с важнейшими фундаментальными и прикладными направлениями в биологии. Эти принципы используются при разработке вакцин, антибиотиков и противораковых препаратов. Эволюционные представления играют центральную роль в борьбе с вредителями сельскохозяйственных культур, в селекции растений и животных, в генной инженерии, выявлении генов человека, ответственных за врожденные заболевания, в изучении старения. Эволюционная биология проливает свет на прошлое человека и других живых существ, в том числе на их миграции, и раскрывает адаптации, которые помогали и продолжают способствовать их выживанию. В биологии не существует более фундаментальной теории, которая связывает вместе все разделы науки о жизни от молекулярной биологии и генетики до палеонтологии, зоологии и физиологии. Как говорил генетик-эволюционист Феодосий Григорьевич Добржанский: “Ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции”.

#лженаука Разумеется, современная эволюционная биология ушла далеко вперед по отношению к идеям, сформулированным Дарвином, но основной выдвинутый им принцип, объясняющий механизм развития жизни на Земле, актуален как никогда: именно изменчивость, наследственность и естественный отбор объясняют многообразие жизни на нашей планете. С тех пор исследователи уточнили многие детали, которые не были известны во времена написания “Происхождение видов”: генетика раскрыла механизмы наследственности, а молекулярная биология объяснила причины и природу мутаций, лежащих в основе изменчивости. Тем временем палеонтология описала огромное многообразие вымерших существ, в том числе переходных форм.

Таким образом, теория Дарвина о механизмах возникновения биологического разнообразия является неотъемлемой частью современной теории эволюции, подтверждается экспериментальными наблюдениями, воспроизводится в лабораторных условиях и согласуется с данными из смежных областей.

Это можно сравнить с тем, как современная физика дополнила идеи Ньютона. И хотя физика законами Ньютона не исчерпывается, изучать ее без знания Ньютоновской механики невозможно. Так и изучение современной биологии, генетики, микробиологии, генной инженерии и биоинформатики невозможно без теории эволюции.

Если, как предлагают некоторые деятели, исключить столь важную часть научной картины мира из школьной программы, пострадает, прежде всего, будущее российской науки и образования.

#лженаука Ссылку на полный текст заявления Комиссии РАН по борьбе с лженаукой можно найти в материале RTVI https://rtvi.com/news/komissiya-ran-po-borbe-s-lzhenaukoj-otreagirovala-na-prizyvy-zapretit-teoriyu-darvina/