ИБХФ РАН. Новости
1.13K subscribers
582 photos
30 videos
7 files
1.11K links
Новостной канал Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук

Официальный сайт ИБХФ РАН: https://biochemphysics.ru/

Предложить новость: @A_V_Bychkova
Download Telegram
👨‍🔬 Идентификации вируса SARS-CoV-2 методом масс-спектрометрии

Сотрудниками ИБХФ РАН в тесном взаимодействии со Сколтехом и НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова разработан масс-спектрометрический метод обнаружения вируса SARS CoV-2 в эпителиальных мазках из носоглотки, основанный на обнаружении вирусного нуклеокапсидного белка N. Предложенный подход может использоваться для идентификации вируса SARS-CoV-2 в образцах различного биологического происхождения и решает задачу по ускорению и надежности процедуры идентификации вируса SARS-CoV-2 у пациентов COVID 19. Разработка может быть использована для экспресс-анализа различных биообразцов с целью определения содержания в них вируса как дополнение/подтверждение срочного ПЦР текста.

В рамках проведенного исследования была идентифицирована панель из 19 пептидов N белка (P0DTC9|NCAP_SARS2) коронавируса SARS-CoV-2 в эпителиальных мазках из носоглотки, полученных от 5 пациентов COVID-19.

Результаты работы опубликованы в Journal of Proteome Research и доступны по ссылке.

🖋 Nikolaev EN, Indeykina MI, Bugrova AE, Kononikhin AS et al. Mass-Spectrometric Detection of SARS-CoV-2 Virus in Scrapings of the Epithelium of the Nasopharynx of Infected Patients via Nucleocapsid N Protein. J Proteome Res. 2020 Nov 6; 19(11): 4393-4397. Published online 10 August 2020

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👨‍🔬👨‍🔬

Коллективом ученых ИБХФ РАН и МИФИ было проведено моделирование структуры и свойств новых диаманов, которые могут быть получены на основе муарового бислойного графена. Гидрирование/фторирование такого бислоя приводит к образованию межслоевых связей и открытию запрещенной зоны, величина которой превышает соответствующие значения для обычных диаманов на основе бислойного графена в АА- или АВ упаковке. Также были изучены особенности их инфракрасных и рамановских спектров, что может помочь при их экспериментальной характеризации.

Результаты работы опубликованы в Applied Surface Science и доступны по ссылке.

🖋 Chernozatonskii LA, Katin KP, Demin VA, Maslov MV. Moiré diamanes based on the hydrogenated or fluorinated twisted bigraphene: The features of atomic and electronic structures, Raman and infrared spectra. Applied Surface Science 2021 January 30; 537: 148011 Published online 30 September 2020

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬

Как сообщается на официальном сайте и в социальных медиа ИОХ РАН, сотрудники ИОХ РАН, Национального медицинского исследовательского центра детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дм. Рогачева, МГУ им. М.В. Ломоносова, РУДН, Института биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН и Технического университета Брауншвейга (Германия) опубликовали статью, в которой представили новую концепцию использования протонных ионных жидкостей в качестве реагентов тройного назначения, а именно: 1) реакционных сред, 2) кислот Бренстеда, инициирующих различные превращения за счет общего кислотного катализа, 3) нуклеофилов. Эффективность этой стратегии продемонстрирована на примере раскрытия донорно-акцепторных циклопропанов при нагревании в тиоцианате 1-метилимидазолия с образованием 5-(гет)арил-2-тиоксопирролидин-3,3-дикарбоксилатов в результате необычной атаки циклопропана атомом азота амбидентного тиоцианат-иона с образованием алкилизотиоцианата с последующей циклизацией за счет взаимодействия малонильного аниона с атомом углерода изотиоцианата. Способность тиоцианата 1-метилимидазолия выступать в качестве протонной ионной жидкости тройного назначения была также продемонстрирована на других модельных реакциях.

Результаты работы опубликованы в Angewandte Chemie International Edition и доступны по ссылке.

🖋 Andreev IA, Ratmanova NK, Augustin AU, Ivanova OA, Levina II, Khrustalev VN, Werz DB, Trushkov IV. Protic Ionic Liquid as Reagent, Catalyst, and Solvent: 1-Methylimidazolium Thiocyanate. Angew. Chem. Int. Ed. 2021, 60: 7927–7934. First published: 12 January 2021

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
🧑‍🔬

В 2020 году российскими учеными в сотрудничестве с иностранными коллегами была опубликована статья, рассматривающая перспективный материал для устройств магнитной памяти с повышенной плотностью записи. В представленной работе удалось получить новую гетероструктуру (графен/сплав Гейслера), которая, как оказалось, демонстрирует несколько удивительных особенностей, таких как квазисвободная природа графена и сохранение полуметаллической зонной структуры сплава Гейслера на границе раздела. Эта работа предлагает новый взгляд на будущее развитие передовых спинтронных устройств для хранения данных. Ранее в устройствах магнитной памяти графен не использовался.

Синтез и экспериментальное исследование проведено в сотрудничестве с National Institutes for Quantum and Radiological Science and Technology QST (Япония).

Результаты работы опубликованы в Advanced Materials и доступны по ссылке.

🖋 Li S, Larionov KV, Popov ZI, Watanabe T, Amemiya K, Entani S, Avramov PV, Sakuraba Y, Naramoto H, Sorokin PB, Sakai S. Spintronic Devices: Graphene/Half-Metallic Heusler Alloy: A Novel Heterostructure toward High-Performance Graphene Spintronic Devices. Advanced Materials 2020, 32(6): 1905734 Epub 2019 Dec 3.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👨‍🔬👩‍🔬👨‍🔬👨‍🔬👩‍🔬👩‍🔬

Одним из факторов, лимитирующих производительность перовскитных солнечных элементов (ПСЭ), является наличие рекомбинационных потерь на границе раздела между фотоэлектродом на основе мезоскопического слоя диоксида титана (TiO2) и перовскитным материалом в них. В лаборатории солнечных фотопреобразователей под руководством д.ф.-м.н. Олега Игоревича Шевалеевского было предложено модифицировать поверхность TiO2 слоя анионами SO4(2−) и катионами Cd(2+), используя метод химического осаждения (chemical bath deposition, CBD). Исследования показали, что в данном случае химическая модификация поверхности TiO2 слоя приводит к смещению максимума валентной зоны вниз, к повышению плотности электронов проводимости и к снижению сопротивления переносу зарядов на границе TiO2/перовскит. В результате, рекомбинационные потери на этой границе снижаются, а фотоэлектрические параметры ПСЭ улучшаются. Также, пассивация поверхности TiO2 фотоэлектрода предложенным методом позволила повысить стабильность ПСЭ при хранении на открытом воздухе.

Результаты работы опубликованы в Applied Surface Science и доступны по ссылке.

🖋 Tsvetkov N, Nikolskaia A, Shevaleevskiy O, Kozlov S, Vildanova M, Moon BC, Kang JK, Larina L. TiO2/halide perovskite interface: The impact of surface state passivation on energy alignment and photovoltaic performance of perovskite solar cells. Applied Surface Science 2020, 512: 145666 Available online 05 February 2020.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬

В большинстве случаев обратимое ингибирование ферментов — это очень быстрый процесс. Но существует ряд ферментов, которые отвечают на воздействие ингибиторов относительно медленно. Выделяют несколько механизмов медленного связывания, которые на атомарном уровне изучают при помощи рентгено-структурного анализа и суперкомпьютерного моделирования. Особый интерес к этим механизмам вызван важностью ингибиторов медленного связывания для фармакологии. В случае ингибиторов ацетилхолинэстеразы, это потенциальные препараты для терапии болезни Альцгеймера, миастенических синдромов и профилактики воздействия нервных ядов.

Приглашенный обзор, посвященный медленному ингибированию ацетилхолинэстеразы, опубликован в Neuropharmacology и доступен по ссылке.

🖋 Lushchekina SV, Masson P. Slow-binding inhibitors of acetylcholinesterase of medical interest. Neuropharmacology, 2020 October 15; 177: 108236. Available online 23 July 2020

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬👩‍🔬👨‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👨‍🔬👨‍🔬👨‍🔬

Фактор свертывания крови FXIII играет важнейшую роль в процессах коагуляции и фибринолиза. Анализ уязвимости фактора свертывания крови FXIII к окислению показал, что структура профермента FXIII адаптирована к окислению. Механизм адаптации обусловлен наличием в структуре каталитических и регуляторных субъединиц этого белка антиоксидантных метионинов, способных перехватывать активные формы кислорода, тем самым защищая функционально значимые сайты FXIII от окислительного повреждения.

Статья опубликована в Biomolecules и доступна по ссылке

🖋 Vasilyeva A, Yurina L, Shchegolikhin A, Indeykina M, Bugrova A, Kononikhin A, Nikolaev E, Rosenfeld M. The Structure of Blood Coagulation Factor XIII Is Adapted to Oxidation. Biomolecules, 2020 June 17, 10(6), 914.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👨‍🔬

Первые предпосылки к открытию металлопорфиринов были отмечены более 200 лет назад. За это время исследователям удалось выяснить, что металлопорфирины - отличные катализаторы, способные образовывать супрамолекулярные системы, участвовать в фотосинтезе и транспорте различных молекул. Также они могут быть использованы в качестве контрастных агентов или миметиков супероксиддисмутазы. Множество вопросов, в частности, касающиеся влияния металлопорфиринов на живые системы, остаются открытыми, в связи с чем исследование их свойств является крайне актуальной задачей для учёных.
Сотрудники лаборатории количественной онкологии ИБХФ РАН обобщили последние результаты ведущих научных групп в этой области в своем обзоре.

Обзор опубликован в научном издании ACS Applied Bio Materials и доступен по ссылке

🖋 Faustova M, Nikolskaya E, Sokol M, Fomicheva M, Petrov R, Yabbarov N. Metalloporphyrins in Medicine: From History to Recent Trends. ACS Appl. Bio Mater. 2020, 3, 12, 8146–8171. Publication Date: November 6, 2020

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
​​​👨‍🔬👩‍🔬

Нестероидные противовоспалительные препараты – это лекарственные средства, обладающие обезболивающим, жаропонижающим и противовоспалительным эффектами. В настоящее время активно ведется поиск новых препаратов, которые сочетают высокую эффективность с улучшенной переносимостью в живом организме. Широкий диапазон применения нестероидных лекарственных препаратов заставил обратить внимание на появление побочных эффектов. Наиболее часто встречаются нежелательные эффекты, связанные с пищеварительным трактом и почками, реже проявляется фотосенсибилизирующий побочный эффект, зависящий от частоты и интенсивности пребывания под солнечным излучением. Фототоксичность набуметона и напроксена связана с наличием нафталинового хромофора в молекулах. Следовательно, необходимость подобрать соответствующие условия для предотвращения нежелательных побочных эффектов является важной задачей. Так, фотогемолитические исследования показали, что применение комплекса включения напроксена с бета-циклодекстрином снижает его фототоксическое действие. Кроме того, известно, что нейтральный набуметон может образовать комплекс с сывороточным альбумином, что также приводит к уменьшению токсичности данного препарата.
В сотрудничестве с коллегами из Испании, Германии и Швеции, учёными ИБХФ РАН методом наносекундного лазерного фотолиза были изучены фотохимия, растворимость и распределение между водной и мицеллярной фазой короткоживущих промежуточных фотопродуктов набуметона. Растворимость набуметона S(NB) оценивалась UV–Vis спектроскопией. Линейная зависимость S(NB) от концентрации додецилсульфата натрия ([SDS]) выявила высокий коэффициент распределения, P (logP = 3.5), который указывает на локализацию промежуточных продуктов набуметона преимущественно в мицеллярной фазе. Квантовый выход флуоресценции набуметона (F) увеличивается в ряду [SDS] от 0.03 в воде до 0.056 при 0.2 M [SDS]. Наблюдается колоколообразная зависимость интенсивности флуоресценции при 355 нм от [SDS]. Квантовый выход флуоресценции F(335) растет в ряду 0—0.05 М [SDS], что приводит к ожидаемому значению критической концентрации мицеллообразования (ККМ = 7.9 мМ). Дальнейшее увеличение [SDS] демонстрирует 10% падение F(335), что характеризует изменение мицеллярной структуры, которое было подтверждено методами SANS и рефрактометрии. Набуметон в SDS защищён от фоторазложения. Методом HPLC/MS было доказано, что 2-(бут-2-ен-1-ил)-6-метоксинафталин является промежуточным продуктом фотолиза набуметона в водном растворе SDS, но не в водной среде. Было показано, что сольватированные электроны локализованы в водной среде, тогда как катион-радикал набуметона и триплетное состояние набуметона - в мицеллярной среде. Кинетика гибели этих промежуточных частиц отличается в гомогенной и гетерогенной среде. В работе обсуждается реакционноспособность набуметона в мицеллярном окружении SDS и в гомогенной среде.

Результаты работы опубликованы в Journal of Molecular Liquids и доступны по ссылке

🖋 Valero M, Levin PP, Sultimova NB, Houston JE. Photochemistry of nabumetone in aqueous solution of sodium dodecyl sulfate (SDS) micelles. Journal of Molecular Liquids. Volume 319, 1 December 2020, 114093. Available online 21 August 2020

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👨‍🔬👨‍🔬

В лаборатории акустической микроскопии ИБХФ РАН разработали методику послойной визуализации высокого разрешения микроструктуры армированных углепластиков. Данная методика актуальна для применения в аэрокосмической промышленности, так как позволит детально изучать механизмы разрушения углепластиков под действием механических нагрузок.

Статья опубликована в научном издании Composite Structures и доступна по ссылке

🖋 Morokov E, Levin V, Chernov A, Shanygin A. High resolution ply-by-ply ultrasound imaging of impact damage in thick CFRP laminates by high-frequency acoustic microscopy. Composite Structures, Volume 256, 15 January 2021, 113102.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👨‍🔬👨‍🔬👩‍🔬

Чтобы улучшить действие уже используемых антибиотиков или новых противомикробных агентов против различных бактерий, были разработаны эффективные комбинации антимикробных пептидов (АМП) с ферментами, которые могут подавить состояние кворума (QQ) у бактериальных клеток. Ферменты, гидролизующие N-ацилгомосерин лактоны (АГЛ) и пептиды, которые являются сигнальными молекулами грамотрицательных и грамположительных бактериальных клеток, соответственно, были оценены как «партнеры» антибиотиков и антимикробных пептидов. Молекулярный докинг шести антимикробных агентов с поверхностью 10 различных молекул ферментов QQ был проведён in silico. Это позволило выбрать среди целевых комбинаций лучшие варианты. Кроме того, бактериальная целлюлоза (БЦ) применялась в качестве носителя для таких комбинаций, являясь прототипом эффективных перевязочных материалов. Анализ антибактериальной активности приготовленных образцов БЦ in vitro подтвердил значительно улучшенную эффективность действия АМП (включая полимиксин B и колистин, которые являются антибиотиками последнего резерва) в сочетании с АГЛ-гидролизующими ферментами (пенициллинацилаза и His6-содержащая органофосфатгидролаза) как против грамотрицательных, так и грамположительных клеток.

Статья опубликована в научном издании Pharmaceutics и доступна по ссылке

🖋 Aslanli A, Lyagin I, Stepanov N, Presnov D, Efremenko E. Bacterial Cellulose Containing Combinations of Antimicrobial Peptides with Various QQ Enzymes as a Prototype of an “Enhanced Antibacterial” Dressing: In Silico and In Vitro Data. Pharmaceutics, 2020, Vol.12(12), e1155. Published: 27 November 2020.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👨‍🔬

В последние годы натуральные пищевые гидроколлоиды (белки и полисахариды) явились активным объектом научных исследований, посвященных поиску путей улучшения здоровья человека с помощью диетотерапии.

Обзорная статья, подготовленная сотрудниками ИБХФ РАН под руководством д.х.н. Семёновой М.Г., освещает новейшие достижения, связанные использованием пищевых гидроколлоидов, для создания микро- и наноразмерных частиц с целью доставки нутрицевтиков (веществ, обладающих как питательной, так и фармацевтической ценностью).

📍В статье уделяется большое внимание роли белков и полисахаридов в регулировании процессов биоусвоения нутрицевтиков в желудочно-кишечном тракте, а также их совместного влияния на кишечный микробиом.
📍Рассматривается роль липосом фосфолипидов в данных явлениях.
Отдельное внимание уделяется последним достижениям в области профилактического действия липофильных низкомолекулярных биологически активных молекул в диетотерапии, а также терапевтическому влиянию белков/пептидов.
📍Обсуждаются преимущества использования наноразмерных систем доставки на основе гидроколлоидов, в том числе, наиболее перспективные пути и механизмы инкапсулирования нутрицевтиков с целью эффективной защиты их структуры и сохранения биологической активности в условиях агрессивной окружающей среды.
📍Проведен анализ основных физико-химических факторов, оказывающих влияние на доставку и высвобождение нутрицевтиков из рассмотренных систем доставки в условиях пищеварительного тракта.

Обзор опубликован в научном издании Food Hydrocolloids и доступен по ссылке

🖋 Semenova M, Antipova A, Martirosova E, Zelikina D, Palmina N, Chebotarev S. Essential contributions of food hydrocolloids and phospholipid liposomes to the formation of carriers for controlled delivery of biologically active substances via the gastrointestinal tract. Food Hydrocolloids. 2021, Vol.120, 106890. Available online 10 May 2021.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
​​👨‍🔬👨‍🔬

В 2021 году сотрудники Лаборатории фото- и хемилюминесцентных процессов ИБХФ РАН П.Г. Пронкин и А.С. Татиколов опубликовали статью "Фотоника мезо-замещенных карбоцианиновых красителей в растворах и в комплексах с ДНК" ("Photonics of meso-substituted carbocyanine dyes in solutions and in complexes with DNA") в научном издании Spectrochimica Acta - Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy.

Статья доступна по ссылке

В работе спектрально-флуоресцентные и фотохимические свойства (фотоизомеризация и образование триплетного состояния) мезо-замещенных катионных карбоцианиновых красителей, 3,3'-ди- (β-гидроксиэтил) -5,5'-диметокси-9-этилтиакарбоцианина иодида (K1) и 3,3'-ди- (β-гидроксиэтил) -9-метилтиакарбоцианин иодида (K2) были изучены в растворах и в присутствии ДНК. В растворах при переходе от ацетонитрила к диоксану наблюдается рост флуоресценции красителей из-за смещения изомерного равновесия в сторону флуоресцирующих транс-изомерных форм. При импульсном фотолизе растворов К1, К2 в диоксане наблюдается образование и последующий распад цис-фотоизомеров красителей. В водных растворах взаимодействие с ДНК приводит к образованию нековалентных комплексов К1 и К2 с ДНК, что сопровождается значительным увеличением интенсивности флуоресценции. Молекулярный докинг показал возможность нескольких типов связывания красителей с ДНК, что подтверждено данными, полученными в других экспериментах. Изучено влияние температуры и добавок NaCl на стабильность комплексов краситель – ДНК. На основе спектрально-флуоресцентных данных оценены значения констант связывания красителей с ДНК и других характеристики важные для использования красителей в качестве спектрально-флуоресцентных зондов. При импульсном фотолизе К1, К2 в комплексах с ДНК фотоизомеризация не наблюдается, квантовый выход интеркомбинационной конверсии в триплетное состояние увеличивается. Гибель триплетных состояний происходит по двухэкспоненциальному закону. Константы скорости тушения триплетных состояний красителей в комплексе с ДНК кислородом оказались ниже ожидаемых значений для диффузионно-контролируемого тушения (с учетом спин-статистического фактора 1/9), что объясняется стерическими факторами комплексообразования.

🖋 Pronkin PG, Tatikolov AS. Photonics of meso-substituted carbocyanine dyes in solutions and in complexes with DNA. Spectrochimica Acta - Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, V. 263, 15 December 2021, 120171.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
​​👨‍🔬👨‍🔬

Сотрудниками НИТУ «МИСиС», ИБХФ РАН, МФТИ и ИФП СО РАН в рамках теории образования границ кристаллических зерен показано, что энергетически устойчивые замкнутые границы наноотверстий появляются с топологическими дефектами, определяющимися разориентированными графеновыми областями. Выявлена зависимость энергии формирования закрытых границ биграфенов для любого угла их закрутки и ориентации границ. Это позволило предсказать различные типы таких границ и объяснить наблюдающиеся в экспериментах формы «замкнутых» пор в биграфенах.

Результаты работы опубликованы в Journal of Physical Chemistry Letters и доступны по ссылке.

🖋 Erohin SV, Chernozatonskii LA, Sorokin PV. On the Edge of Bilayered Graphene: Unexpected Atomic Geometry and Specific Electronic Properties. J. Phys. Chem. Lett. 11, 15, 5871–5876. Epub 2020 Jul 10.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬👩‍🔬

В последние десятилетия состояние экологической ситуации привело к внедрению «зеленых» полимеров и композитов на их основе в различные отрасли промышленности. Пленочные и волокнистые материалы на основе биоразлагаемых полимеров находят все новые применения в медицине и агросекторе. Сотрудниками ИБХФ РАН и Федерального научного агроинженерного центра ВИМ проведено совместное исследование, в котором методом электроформования получены нетканые волокнистые материалы полилактид-натуральный каучук с содержанием каучука 5, 10 и 15 мас.%. Определены термические, динамические и механические свойства волокон. Показано, что средний диаметр волокна увеличивается с увеличением содержания натурального каучука в композициях, в то время как линейная и поверхностная плотности изменяются незначительно. С помощью дифференциальной сканирующей калориметрии получены теплофизические характеристики. Обнаружено, что температура стеклования полилактида увеличилась на 2-5 °C, а температура плавления увеличилась на 2-4 °C при наличии натурального каучука в образцах. Методом электронного парамагнитного резонанса при T = 50 и 70 °C определено, что подвижность аморфной фазы в полученных волокнах увеличивается с содержанием натурального каучука. Добавление натурального каучука в количестве 15 мас.% повысило величину относительного удлинения при разрыве в 3,5 раза по сравнению с чистым полилактидом.

Результаты работы опубликованы в Polymers и доступны по ссылке.

🖋 Tertyshnaya Y, Karpova S, Moskovskiy M, Dorokhov A. Electrospun Polylactide/Natural Rubber Fibers: Effect Natural Rubber Content on Fiber Morphology and Properties. Polymers 2021, 13(14), 2232; Published: 7 July 2021.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬

В 2021 году учёные МФТИ, ФГБУ ГНЦ ФМБЦ им. А.И. Бурназяна ФМБА России, ФИЦ ХФ РАН, ИБХФ РАН, ФГБУ «НМИЦ РК» Минздрава России, ИБК РАН опубликовали статью "Субпопуляция CD44high клеток НМРЛ, выжившая после мультифракционной лучевой терапии, проявляет признаки частичной активации ЭМП и ответ на повреждение ДНК в зависимости от их статуса p53" ("The CD44high Subpopulation of Multifraction Irradiation-Surviving NSCLC Cells Exhibits Partial EMT-Program Activation and DNA Damage Response Depending on Their p53 Status") в научном издании International Journal of Molecular Sciences.

Статья доступна по ссылке

Ионизирующее излучение (ИИ) используется для лечения пациентов, у которых диагностирован неоперабельный немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ). Однако, лучевая терапия остается в основном паллиативной из-за выживания внутри опухолей небольшой субпопуляции клеток, называемых опухолевыми стволовыми или «подобными стволовым» клетками (ОСК). В данной работе сублинии клеток НМРЛ, с присутствием р53 дикого типа - A549IR (p53wt) и дефицитные по р53 - H1299IR (p53null), выжившие после мультифракционной лучевой терапии (МЛТ) в общей дозе 60 Гр, исследовали через три недели после курса МЛТ. Мы сравнили радиочувствительность (способность к образованию колоний), экспрессию маркеров эпителиально-мезенхимального перехода (ЭMП), миграционную активность, аутофагию и репарацию двунитевых разрывов ДНК (ДР ДНК) по пути гомологической рекомбинации (ГР) во всех клетках и в популяциях ОСК-подобных клеток с высокой экспрессией CD44/CD166 (CD44high/CD166high), как в родительских, так и в клетках НМРЛ, выживших после МЛТ. Мы обнаружили, что p53 статус влияет на: уровень экспрессии N-кадгерина, E-кадгерина и виментина, что свидетельствует о появлении ЭМП-подобного фенотипа сублиний, выживших после МЛТ; миграционную активность в 1D плоскости (тест на заживление ран); способность облученной клетки продолжать делиться и образовывать колонию клеток НМРЛ до и после МЛТ. Наши данные дополнительно подчеркивают влияние статуса p53 на изменение числа фокусов γH2AX и связанную с этим эффективность репарации ДР ДНК в клетках НМРЛ после МЛТ. Выявлено, что белок Rad51 может играть основную роль в выживании p53null клеток НМРЛ и способствовать репарации ДР ДНК путем гомологичной рекомбинации (ГР). Мы обнаружили значительно более высокое содержание LC3+ клеток в популяциях CD44high / CD166high p53wt-выживших после МЛТ клеток, по сравнению с их p53null аналогами.

🖋 Pustovalova M, Alhaddad L, Blokhina T, Smetanina N, Chigasova A, Chuprov-Netochin R, Eremin P, Gilmutdinova I, Osipov AN, Leonov S. The CD44high Subpopulation of Multifraction Irradiation-Surviving NSCLC Cells Exhibits Partial EMT-Program Activation and DNA Damage Response Depending on Their p53 Status. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(5), 2369, Published: 27 February 2021.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👩‍🔬👨‍🔬👨‍🔬👨‍🔬

Коллективом ученых из ИБХФ РАН, ИНБИ РАН и МГУ была опубликована работа в журнале Talanta, в которой предложен метод одновременного экспресс-анализа четырех белков - кардиомаркеров (С-реактивный белок, цистатин-С, миоглобин и Д-димер) в плазме крови здоровых доноров и пациентов с кардиопаталогиями. Экспресс-анализ был основан на методе иммуномагнитной аффинной сепарации целевых белков из образцов крови с использованием флуоресцентной метки для каждого исследуемого белка. Предложенный метод был автоматизирован и оптимизирован для определения физиологических и патологических концентраций целевых маркеров крови. Была разработана автоматическая биоаналитическая платформа на основе предлагаемого метода, которая позволяет проводить экспресс-анализ кардиомаркеров в 17 мкл плазмы крови за 14 минут.

Статья доступна по ссылке

🖋 Nechaeva NL, Sorokina ON, Konstantinova TS, Vasilyeva AD, Yurina LV, Byzova NA, Bugrova AE, Yanovich SV, Eremenko AV, Kurochkin IN. Simultaneous express immunoassay of multiple cardiac biomarkers with an automatic platform in human plasma.Talanta, Vol. 224, 1 March 2021, 121860.

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
👨‍🔬

Сотрудниками ИБХФ РАН и Boise State University (США) изучается вклад стохастической термодиффузии в усиление диффузии. Термодиффузия частиц, взвешенных в жидкости, имеет место, когда происходят спонтанные экзо- и эндотермические события подобные элементарным актам ферментативных реакций как случайные последовательности в пространстве и времени. При этих событиях может происходить выделение или поглощение энергии в наномасштабах в течение пикосекунд -наносекунд. Это может вызывать локальные всплески температуры , быстро распространяющиеся в пространстве и затухающие со временем. Случайные всплески температуры создают локальные нестационарные градиенты температуры, где имеет место термодиффузия молекул и частиц, а также изменение физических свойств окружающей среды из-за нагрева. Эти термодиффузионные случайные блуждания могут проявляться как усиление обычной диффузии Стокса-Эйнштейна, когда выделение/поглощение энергии достаточно большое. Как показывают оценки относительного вклада рассмотренного эффекта в подвижность молекул, этот вклад соответствует ферментативным реакциям каталазы и уреазы, изучаемым в литературе.

Результаты работы опубликованы в The Journal of Physical Chemistry B и доступны по ссылке.

🖋 Semenov SN, Schimpf ME. Thermophoretic Random Walks and Enhancement of Diffusion. J. Phys. Chem. B 2021, 125 (27), 7427–7434. Publication Date: July 6, 2021

#наукаИБХФ #ПубликацииИБХФ #ИБХФ #ИБФХРАН
Дорогие коллеги, друзья❗️
Приглашаем Вас посетить День открытых дверей ИБХФ РАН 2022!

🗓 19 апреля 2022
19:00
🖥
онлайн

📃 Программа мероприятия:
🔸 Приветственное слово. Директор ИБХФ, проф. д.х.н. Илья Николаевич Курочкин
🔸 Выступление заместителя начальника Отдела подготовки научных кадров к.ф.-м.н. Тимохиной Елены Николаевны
Выступления-презентации о научной деятельности научных подразделений ИБХФ РАН:
🔹 Лаборатория Акустической микроскопии проф., д.ф.-м.н.Чернозатонский Л.А., к.ф.-м.н. Мороков Е.С.
🔹 Группа «Биомиметические наноматериалы» д.ф.-м.н. Квашнин Д.Г.
🔹 Лаборатория Физико-химии композиций синтетических и природных полимеров к.х.н. Тюбаева П.М.
🔹 Лаборатория Солнечных фотопреобразователей к.х.н. Алексеева О.В.
🔹 Лаборатория Функциональных свойств биополимеров к.х.н. Зеликина Д.В.
🔹 Лаборатория Физико-химических основ биологической регуляции д.б.н. Муранов К.О.
🔹 Лаборатория Количественной онкологии к.х.н. Никольская Е.Д.
🔹 Ответы на вопросы

📍 Если вам интересно узнать про направления работы института, найти коллаборации, а для студентов и аспирантов - найти лабораторию для прохождения практики и выполнения дипломных и диссертационных работ - добро пожаловать!

ℹ️ Вся подробная информация также отражена в буклете пдф (в комментариях к этой новости)

❗️Для участия необходимо пройти регистрацию по ссылке:
https://forms.gle/nvnFY95ZfCQUcSkq7

📩 Информация по подключению к мероприятию в zoom будет выслана на почту, указанную при регистрации

Будем рады видеть вас в числе гостей!

#ИБХФ #ИБФХРАН #ДОД #СМУИБХФРАН