ИБХ РАН
317 subscribers
115 photos
1 video
3 files
274 links
Официальный канал Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова
Download Telegram
ВНИМАНИЕ!

Минобрнауки России предупреждает о продолжающихся атаках телефонных мошенников на сотрудников научных и образовательных организаций. В зоне риска — старшее поколение. И хотя злоумышленникам практически не удается ввести людей в заблуждение, даже единичные случаи заставляют серьезно отнестись к данной проблеме.

Телефонные мошенники непрерывно меняют стратегию:

1. Отправляют вредоносные ссылки, звонят якобы из банка с просьбой назвать код из СМС.
2. Используют для звонков мессенджеры (Телеграм, WhatsApp и др.).
3. Применяют шантаж, давят на жертву от имени ректора, представителя ФСБ или МВД (могут применяться технологии подмены номеров и подделки голосов, упоминаться личные сведения о человеке, побуждающие снизить порог критического восприятия).

Что делать, если вам поступил звонок, в подлинности которого вы не уверены:

1. Незамедлительно завершите беседу.
2. Проинформируйте своего непосредственного руководителя о факте подозрительного обращения.
3. Посоветуйтесь с теми, кому доверяете, — родственниками, коллегами.
4. Проверьте личность контакта — если звонящий или пишущий с неизвестного номера представился вашим знакомым, свяжитесь с ним по актуальному номеру.

Будьте бдительны!
Сотрудники ИБХ с коллегами из ФНКЦ ФХМ им Ю.М. Лопухина разработали pH сенсор на основе i-мотива. Авторы синтезировали новый нефлуоресцентный аналог цитозина tC O Azo , который тушит флуоресценцию известного флуоресцентного миметика цитозина tC O . Включение пары в геномную iM-образующую последовательность C5T привело к созданию высококонтрастного pH сенсора с рабочим диапазоном, совместимым с физиологическими условиями. В отличие от известных сенсоров на основе C5T, которые содержат обычные метки FAM/BHQ или FAM/TAMRA, обеспечивают флуоресцентный сигнал в зеленом/красном каналах и накапливаются в ядрах клеток, предложенный сенсор локализуется преимущественно в цитоплазме и позволяет осуществлять отслеживание pH на основе сигнала tC O в синем канале. Таким образом, авторам удалось преодолеть общую для меченных нуклеиновых кислот (антисмысловые олигонуклеотиды, молекулярные биконы и т.д.) проблему преимущественного накопления в ядрах живых клеток. Работа опубликована в журнале Sensors and Actuators: B. Chemical.
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0925400524004763
Олигомеризация молекул в мембранах бактерий является ключевым этапом во многих предполагаемых механизмах антибиотического действия антимикробных пептидов (АМП). На примере пептида капителлацина морской полихеты Capitella teleta была изучена термодинамика процесса димеризации β-шпилечных АМП в мембраноподобной среде мицелл DPC. Методом ЯМР-спектроскопии были описаны переходы между состояниями мономера и димера при изменении температуры и концентрации детергента. Обе структурные формы капителлацина связываются с поверхностью мицеллы, что согласуется с “ковровым” механизмом действия на мембраны. Сравнительный анализ физико-химических свойств β-шпилечных АМП выявил положительную корреляцию между гидрофобностью пептида, стабильностью его димеров и гемолитической активностью. Результаты работы опубликованы в журнале Biomolecules.
https://www.ibch.ru/press/news/science/4858
Исследователи из ИБХ РАН, Гарвардского Университета, Сеченовского Университета, Института им. Пастера и других научных учреждений в России и за рубежом предложили новый способ контроля повышенного внутриглазного давления, являющегося основным повреждающим фактором при глаукоме. Они разработали новый вид контактных линз, которые интегрируют металлоорганические каркасы (МОК) для управляемого и продолжительного высвобождения бримонидина, лекарственного средства, применяемого для снижения внутриглазного давления. Это нововведение было представлено в высокорейтинговом научном журнале Aggregate, что подчеркивает его инновационный характер и потенциальное влияние на офтальмологическую практику.
https://www.ibch.ru/ru/press/news/science/4883
Наночастицы кремния широко использовались для доставки лекарств и визуализации опухолей в течение последних 30 лет. Интерес к использованию кремния в биомедицине был связан с возможностью его биоразложения в организме, а, следовательно, низкой долговременной токсичностью. Тем не менее, кристаллический кремний имеет очень низкую скорость деградации, и его выведение из организма может занимать месяцы и годы. Коллектив ученых из ИБХ РАН, НИЯУ МИФИ и Сеченовского Университета предложили новый материал с высокой скоростью деградации который имеет потенциал заменить кремний в биомедицине. Работа опубликована в журнале Advanced Science.
https://www.ibch.ru/press/news/science/4885
Исследователи из Лаборатории молекулярных основ эмбриогенеза ГНЦ ИБХ РАН выяснили основные факторы, сделавшие невозможной регенерацию конечностей у современных амниот (рептилии, птицы и млекопитающие). Авторы предположили, что после выхода предков амниот на сушу способность к регенерации конечностей у них оказалась подавленной побочными эффектами ряда возникших в это время инноваций, необходимых для успешной колонизации суши. Это, в свою очередь, стимулировало исчезновение многих генов, переставших с этого момента участвовать в регенерации. В результате. у современных амниот, в том числе у человека, неспособность к регенерации конечностей оказалась жестко зафиксированной на геномном уровне. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ 23-74-30005 и опубликована в журнале Biological Reviews.
https://www.ibch.ru/press/news/science/4903
Цикл «обнаружить-восхититься-исследовать-разочароваться и забыть» может быть довольно обычной рутиной в исследованиях. Тем не менее в некоторых областях он, кажется, может повторяться много раз. Свежая статья ученых из ИБХ РАН и Университета Бостона анализирует один из таких циклов в области блокады иммунной системы организма наночастицами. Исследование показывает, что прогресс в создании новых наноматериалов наконец может позволить разорвать замкнутый круг и ввести этот метод в клиническую практику для улучшения терапии рака. Работа опубликована в престижном журнале Nature Communications.
https://www.ibch.ru/ru/press/news/science/4911
Ионные каналы TRPV отличаются большим разнообразием функций в клетке, принимая участие в температурной и болевой чувствительности, делении клеток, усвоении кальция и т.д. Ученые из ИБХ РАН и Колумбийского университета проанализировали структуру ключевого домена TRPV – ион-проводящей поры. С помощью оригинального подхода – метода “динамического молекулярного портрета“ - удалось выделить три консервативных состояния поры, общие для всех TRPV: α- закрытое, π-закрытое и π-открытое. Показано, что α-закрытое состояние является наиболее гидрофобным и всегда непроводящим, тогда как π-закрытое менее стабильно и может переходить в открытое состояние с благоприятным для проведения ионов распределением гидрофобности. Работа опубликована в журнале Communications Chemistry.
https://www.ibch.ru/ru/press/news/science/4918
В отличие от экзосом, данные о гликоме микровезикул (МВ) практически отсутствуют. Сотрудники Лаборатории углеводов и Лаборатории молекулярной биофизики ИБХ РАН изучили гликановый состав МВ, полученных из эндотелиальных клеток, с использованием 21 растительного лектина. Полученные результаты показали, что в МВ доминируют олиголактозамины, частично α2-6-сиалилированные в виде N-гликанов. Наиболее ярким отличием МВ от материнских клеток является практически полное отсутствие α2-3-сиалилированных гликанов; показано, что это не результат действия внеклеточных гликозидаз. Кроме того, по сравнению с материнскими клетками, в МВ понижен уровень некоторых Man-содержащих гликанов. Полученные результаты свидетельствуют об избирательности переноса интегральных белков плазматической мембраны в МВ. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular sciences.
https://www.ibch.ru/press/news/science/4916
Папаин-подобная протеаза PLpro играет ключевую роль в жизненном цикле коронавируса SARS-CoV-2, что делает ее перспективной мишенью антивирусной терапии. В данной работе был создан генетически кодируемый флуоресцентный сенсор активности PLpro. Отличительной особенностью сенсора является дизайн, максимально приближенный к природной мишени. Высококонтрастный транслокационный ответ (14-кратное изменение отношения сигнала в ядре и цитоплазме) позволяет надежно детектировать активность PLpro в культурах клеток человека не только в модели сверхэкспрессии рекомбинантной протеазы, но и при заражении вирусом SARS-CoV-2, как было показано сотрудниками Лаборатории генетически кодируемых молекулярных инструментов ИБХ РАН в сотрудничестве с Институтом молекулярной биологии РАН и Центром эпидемиологии и микробиологии им. Гамалеи. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
https://www.mdpi.com/1422-0067/25/12/6635
Сотрудники отделов биотехнологии и структурной биологии (ИБХ РАН) совместно с коллегами из Института химии растительных веществ (Узбекистан) и Института вирусологии им. Д. И. Ивановского синтезировали серию аналогов нуклеозидов на основе 1,2,4-триазола-3-тиона и исследовали их противовирусную активность в отношении вируса простого герпеса. Производные 1,2,4-триазола обладают широким спектром биологической активности и поиск новых нуклеозидов на их основе является актуальной задачей. Из серии синтезированнных моно- и дизамещённых производных 1,2,4-триазол-3-тиона три соединения оказались субстратами для пуриннуклеозидфосфорилазы E. coli. Для рибозидов и дезоксирибозидов, полученных ферментативным синтезом, было показано, что присоединение углевода у моно- и дизамещённых 1,2,4-триазол-3-тионов происходит по разным атомам азота. Все синтезированные нуклеозиды и гетероциклические основания проверялись на цитотоксичность и активность в отношении вируса простого герпеса первого типа. Индекс селективности двух нуклеозидов оказался значительно выше, чем у противовирусного препарата рибавирина. Также было обнаружено, что с увеличением липофильности исследуемых соединений увеличивается как их активность, так и токсичность. Результаты исследования опубликованы в журнале Biomolecules (IF 4.8).
https://www.ibch.ru/press/news/science/4923
Идентификация высокоаффинных антител в сыворотке крови человека является нетривиальной задачей из-за чрезвычайно малого количества циркулирующих В-клеток с заданной специфичностью. Коллектив ученых из ИБХ РАН предложил эффективный подход, позволяющий идентифицировать высокоаффинные антитела против белков патогена с одновременным картированием эпитопов, даже при отсутствии информации о структуре иммуногенов данного патогенна. Для скрининга терапевтических антител в крови выздоровевших доноров достаточно только транскриптома патогена для создания полипептидной библиотеки антигенов, экспонированных на поверхности бактериофага. Работа опубликована в журнале Communications Biology.
https://www.ibch.ru/press/news/science/4926
Forwarded from Biomembranes 2024
📌Что: Международная конференция «Biomembranes 2024»
📌Когда: 7-11 октября 2024 года
📌Где: Долгопрудный, МФТИ (Институтский переулок, 9)
📌 Сайт
📌 Telegram канал
📌 Группа ВКонтакте

Центр исследований молекулярных механизмов старения и возрастных заболеваний МФТИ (Физтех) совместно с институтом iHuman (Шанхай, Китай) приглашают студентов, аспирантов, ученых и специалистов, чья деятельность связана со структурной и молекулярной биологией, биофизикой и смежными дисциплинами.

Ведущие учёные из России, Китая, Индии, Бразилии и других стран расскажут о передовых исследованиях в области биологических мембран, мембранных и водорастворимых белков и других биологических макромолекул, теоретической биофизики и компьютерного моделирования, роли биомембран и биологических макромолекул в нормальных и патологических процессах, старении и возрастных (в т.ч. онкологических, нейродегенеративных и сердечно-сосудистых) заболеваниях.

Рабочий язык мероприятия — английский 🇬🇧

📌 Регистрация открыта!
Подача тезисов до 29 августа
Фаг φ29 и родственные ему бактериофаги в настоящее время являются наименьшими известными хвостатыми вирусами, инфицирующими различных представителей как грамположительных, так и грамотрицательных бактерий. В новой работе команды ученых из ИБХ РАН и других российских институтов был проведен поиск по общедоступным геномным базам данных, выявивший более 2000 последовательностей, которые разделяют характерные черты генома фага φ29. Анализ главных капсидных белков (MCP) φ29-подобных фагов показал их отличие от последовательностей MCP почти всех других известных групп Caudoviricetes и возможную отдаленную связь с MCP фагов, T7-подобных. HMM-поиск позволил обнаружить родство между φ29-подобными фагами и необычным лактококковым фагом KSY1 (Chopinvirus KSY1), геном которого содержит два гена РНК-полимеразы. Сочетание уникальных особенностей и отличительного происхождения фагов, родственных φ29, предполагает отнесение этой обширной группы к новому отряду или таксону более высокого ранга. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
Фаг φ29 и родственные ему бактериофаги в настоящее время являются наименьшими известными хвостатыми вирусами, инфицирующими различных представителей как грамположительных, так и грамотрицательных бактерий. В новой работе команды ученых из ИБХ РАН и других российских институтов был проведен поиск по общедоступным геномным базам данных, выявивший более 2000 последовательностей, которые разделяют характерные черты генома фага φ29. Анализ главных капсидных белков (MCP) φ29-подобных фагов показал их отличие от последовательностей MCP почти всех других известных групп Caudoviricetes и возможную отдаленную связь с MCP фагов, T7-подобных. HMM-поиск позволил обнаружить родство между φ29-подобными фагами и необычным лактококковым фагом KSY1 (Chopinvirus KSY1), геном которого содержит два гена РНК-полимеразы. Сочетание уникальных особенностей и отличительного происхождения фагов, родственных φ29, предполагает отнесение этой обширной группы к новому отряду или таксону более высокого ранга. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
https://www.ibch.ru/press/news/science/4985
Около половины известных антибиотиков нацелены на аппарат трансляции клеток-мишеней и до сих пор представляют важнейшее значение для медицины. Проанализировав базы данных секвенированных геномов млекопитающих, коллектив ученых из ИБХ РАН обнаружил уникальное по структуре семейство пролин-богатых антимикробных пептидов (ПБ-АМП) у жвачных парнокопытных, способных эффективно блокировать работу бактериальных рибосом. Работа опубликована в престижном журнале Nature Communications.
https://www.ibch.ru/press/news/science/4996
Ферментативный синтез производных нуклеозидов является важной альтернативой многоступенчатым химическим методам, но его применение ограничено субстратной специфичностью ферментов, низкими рабочими концентрациями и плохой растворимостью субстратов. Сотрудники Лаборатории биофармацевтических технологий ГНЦ ИБХ РАН совместно с коллегами из ИМБ РАН провели исследование возможности использования ряда пуриновых нуклеозидфосфорилаз в синтезе модифицированных аналогов нуклеозидов. В ходе работе была изучена субстратная специфичность ферментов из различных бактериальных мезофильных и термофильных источников, а также исследовано влияние субстрата (природных нуклеозидов и модифицированными аналогами арабинофуранозидов), повышенной температуры и присутствия органических растворителей на скорость конверсии. Результаты опубликованы в журнале Biomolecules (IF 4.8).
https://www.mdpi.com/2218-273X/14/9/1069
Нейротрофины и их рецепторы являются важнейшей системой, ответственной за развитие и дифференцировку нервных клеток. Недавно было показано, что некоторые антидепрессанты связываются с трансмембранным доменом нейротрофинового рецептора TrkB, стимулируя его активность. Однако молекулярный механизм этого взаимодействия, как и структура трансмембранного домена TrkB, оставались неизвестны. Вместе с научными коллективами из нескольких стран, ученые из Лаборатории Биомолекулярной ЯМР-спектроскопии ГНЦ ИБХ РАН определили 3D-структуру трансмембранного домена TrkB, исследовали его взаимодействие с лекарствами и предложили модель действия антидепрессантов. Результаты исследования могут объяснить долговременный эффект от приема антидепрессантов и лечь в основу разработки новых высокоэффективных лекарств. Работа опубликована в журнале Nature Communications.
https://www.nature.com/articles/s41467-024-53710-7
Дупликация хромосомного участка 2q23.q23.2, несущего гены LYPD6 и LYPD6B, приводит к снижению умственных способностей и развитию аутистических черт. Сотрудники Лаборатории биоинженерии нейромодуляторов и нейрорецепторов ИБХ РАН совместно с коллегами из МГУ им. М.В. Ломоносова и ИМБП РАН исследовали в мышиной модели последствия повышенной экспрессии белков Lypd6 и Lypd6b (продуктов генов LYPD6 и LYPD6B) в мозге, характерной для пациентов с аутизмом и другими нейропсихиатрическими расстройствами. Двухнедельная внутримозговая инфузия рекомбинантных аналогов Lypd6 и Lypd6b ухудшила память и повысила острую тревожность у мышей, снизила плотность дендритных шипиков гиппокампа и миндалины, привела к гипоэкспрессии эндогенных Lypd6, Lypd6b и никотинового рецептора α7 в гиппокампе. Кроме того, в работе показано, что Lypd6b, как и Lypd6, является негативным аллостерическим модулятором никотиновых рецепторов. Работа поддержана РНФ и опубликована в журнале Cell Death Discovery (IF 6.1).

https://www.ibch.ru/press/news/science/5030
Иммунный ответ NK-клеток на вирус SARS-CoV-2 в контексте формирования иммунологической памяти малоизучен. Ученые из ИБХ РАН в сотрудничестве с коллегами из других институтов установили SARS-CoV-2-специфический характер реакций NK-клеток у лиц, перенесших COVID-19. При стимуляции пептидами SARS-CoV-2 у таких доноров был продемонстрирован повышенный уровень активации, дегрануляции, продукции IFNγ и пролиферации NK-клеток, а также выявлено усиление экспрессии генов, участвующих в транспорте белков, метаболизме и иммунном ответе. Увеличенный уровень экспрессии гена, кодирующего активирующий рецептор KIR2DS4, коррелировал с усиленным ответом NK-клеток на пептиды SARS-CoV-2, что указывает на возможную роль этого рецептора в распознавании SARS-CoV-2. Работа поддержана грантом РНФ 22-15-00503 и опубликована в журнале Journal of Medical Virology.
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.70057