Лагідна генетизація
214 subscribers
435 photos
12 videos
7 files
231 links
Your friendly neighborhood імперіалістична шльондра/сорося/донбаська бандерівка @reismitscheiss
Download Telegram
Выдуманный ребенок с тем же заболеванием. Надеюсь, в этот раз мне лучше удалось передать характерные признаки фенотипа.
Честно надёргала таких деток с Гугла. Но только давайте договоримся - если не утерпели и забили картинку в поиск, то не портите сюрприз другим)
Лагідна генетизація
Клинический случай: приходят родители с ребенком 3,5 лет. Жалобы на отставание в развитии: голову держит с 4 месяцев, переворачивается на живот с 6, сидит самостоятельно с 8, ползать начал в год, ходить, держась за две руки - около двух лет. Сейчас может ходить…
Ответ будет завтра утром. Последний шанс сыграть в угадай синдром 👻

А пока что хочу отметить, что любимый-дорогой Саша "Заведи наконец никнейм, чтоб я тебя тегала" Демяненко практически повторил путь учёных, впервые описавших это заболевание. Я в восхищении!
Синдром Кабуки (синдром грима кабуки, синдром Ниикава-Куроки) был впервые описан в начале 80х японскими исследователями. Изначально считалось, что это заболевание встречается только в азиатской популяции. Но оказалось, что и у всех остальных оно бывает, только фенотип отличается, в силу естественных причин.
Forwarded from Oleksandr Demianenko
Дети играют в театре Но?
Oleksandr Demianenko
Дети играют в театре Но?
Саша не генетик и ни разу не врач, но смог увидеть общее, выделить главное и прийти к оригинальному решению. Обожаю. Наверное, поэтому он такой замечательный капитан ЧГК 💚
А я всерьёз думаю, что навыки анализа и pattern recognition, полученные мной за 10 лет в этих наших брейнрингах, помогают мне в работе клинициста и синдромолога.
Диагностические критерии синдрома Кабуки, согласно международному консенсусу 2019 года. Важно, что можно поставить клинический диагноз на основании 1) задержки моторного и психического развития и гипотонии в анамнезе и 2) типичных дизморфий, среди которых самое главное - это характерные ГЛАЗА. То есть, молекулярно-генетическое подтверждение не обязательно для постановки диагноза.

На что лично я обращаю внимание у таких деток:
1) чаще всего доношенные; трудности вскармливания в первые месяцы; задержка физического развития и микроцефалия постнатального генеза, ближе к 1 году;
2) судороги в неонатальном периоде;
3) гиперинсулинизм, манифестирует гипогликемией;
4) иммунодефицитные состояния - часто болеющие дети (т.е. больше 10 раз в год);
5) уши - торчащие, крупные, диспластичные, глухота, частые отиты;
6) глаза - косоглазие, птоз;
7) рот - аномалии размещения и строения зубов, ямки и дермоидные синусы на губах;
8) руки - проверить на гипермобильность суставов, на пальцах часто фетальные подушечки (см фото)
2_5454064413822683309.pdf
1.2 MB
9) обязательно ЭхоКГ и УЗИ ОБП+почки - исключаем пороки;
10) чаще всего такие детки приходят с диагнозами "задержка психомоторного развития" и "расстройство спектра аутизма";
11) многие до трясучки любят музыку, зачастую - отдельных исполнителей (знаю маленького фаната Олега Винника, например).

Отностительно генов и чебурашек - ну не вижу я смысла их запоминать, сорян)) если вкратце - поломка chromatin modifying enzymes, а именно тех, что за метилирование отвечают. Я влюбилась в вычитанное где-то определение Мendelian epigenetic disorder. В любом случае, чаще всего идёт мутация de novo, и рекуррентный риск для сибсов стремится к нулю. Но если вдруг семейные случаи, то вот шпаргалка: KMT2D на 12 хромосоме, аутосомно-доминантный тип передачи; KDM6A - Х сцепленный.

Пейпер я вам дам.
(Опять пищу, потому что вторым автором там Sid Banka из Манчестера, прям горда и рада за него!)
Лагідна генетизація
Ух, ребят, я просто пока оставлю это здесь, а чуть позже соберусь с мыслями и прокомментирую. В лучших традициях жанра "врачи-палачи, белая халатность".
Итак, ситуация: 35-летняя женщина, 3-я беременность, 2-я закончилась спонтанным абортом на 6 неделе. Становится на учет к акушеру-гинекологу в частной клинике. Тот назначает ей УЗИ 1 триместра, там видна гипоплазия носовых костей (насколько выраженная?) как фактор повышенного риска хромосомной патологии. Это не диагноз, а указание более внимательно присмотреться к женщине и послать ее на скрининговое исследование. Уже по результатам которого мы узнаем, насколько высоки риски, и нужна ли инвазивная диагностика.

И тут нас ждет развилка:
1) сделать комбинированный скрининг 1 триместра. Он дешевый и с 80-90% чувствительностью определяет, попала ли женщина в, напоминаю, группу риска по трисомиям 13, 18, 21. То есть, 10-20% женщин, которых желательно проверить на анеуплоидии у плода, проходят мимо нас с ложно-отрицательными результатами; в то время как абсолютное большинство женщин с высокими рисками (а это и 1:2, и 1:249, и все что между), будут иметь здоровых детей.
2) сделать дорогущий НИПТ, который имеет очень высокую специфичность и negative predictive value по трисомиям 13, 18, 21 во всех возрастных группах. То есть, если НИПТ сказал, что риск низкий, то с 99% вероятностью заболевания нет. Другое дело, что чувствительность и positive predictive value не настолько хороши. Частота ложно-положительных результатов для трисомии 21 составляет в среднем 20%, в случае синдромов Патау и Эдвардса - 60% и 50%. Чем младше пациентка - тем меньше вероятность того, что высокий риск на НИПТ достоверно укажет на заболевание. В любом случае, если НИПТ (как и скрининги 1 и 2 триместра) показывает высокий риск, то нужно сделать амниоцентез/биопсию ворсин хориона, и только кариотип плода будет основанием для постановки диагноза.

Наша пациентка выбрала сделать НИПТ за 14 тысяч гривен (почему так дорого? она сделала расширенный скрининг на анеуплоидии половых хромосом и микроделеции? НИПТ не рекомендован для диагностики этих состояний ни в одной стране, потому что делает это плоховато, и исследований мало. Но в красивом буклете частной лаборатории вам этого не скажут, хехе). Окей, допустим, жадный доктор направил ее на этот анализ и получил неплохой откат от лаборатории. Получив результат с низким риском синдрома Эдвардса, он был на 99% уверен, что этого синдрома там нету (всего 1 процент погрешности, в который наш случай и попал, - это отличный результат). Соответственно, показаний для амниоцентеза (который тоже как бы достоверен на 99%) не было. Посылать женщину на второй раунд комбинированного скрининга, имея на руках НИПТ, бьющий его по всем фронтам? Ну такое. Хотя по нормативам МОЗ (2003-го года выпуска, господи помилуй) именно это и нужно было сделать.

Дальше - совсем безудержное веселье. В третьем триместре обнаружили многоводие, и правда, фактор риска. А смысл что-либо делать на этом сроке? Все равно рожать: 22-я неделя равно прошла, медаборт не сделают. Надо было сказать женщине что-то типа "рекомендую вам скатиться с лестницы, как Скарлетт О'Хара"? Еще какие-то претензии к сотрудникам роддома предъявляются, они-то точно ни при чем. Ребенка достали, кариотип сделали, Эдвардса поставили, даже в Охматдет направили.

Как комментировать манеру подачи материала, не срываясь на матный ор и пену изо рта, я не знаю. Прочитав этот высер, можно сделать вывод, что злобный гинеколог назначил то, что не надо, а что надо - не назначил; УЗИсты - слепые и тупые; лаборатория - криворукие буржуи, брехуны и вообще америкосы. И нигде, даже в частной медицине за бешеные бабки, наш сиротинушка-пациент не найдет нормальных врачей: таких, которые всегда, с вероятностью 100%, безошибочно ставят диагнозы (излечивают онко наложением рук; никогда не делают перерыв на обед; нужное подчеркнуть). Доколе?! и т.д., и т.п.

Резюмируя - в одном наш любимый министр охороны коронавируса таки прав. Очень скоро врачей в этой стране не останется.
На втором курсе у нас была информатика. Помню я оттуда только душные кабинеты, где мы сидели друг у друга на головах, допотопные кудахтеры и зубрежку бесполезных тестов. Невероятно, но именно на лекциях по информатике я впервые услышала (краем уха, т.к. аудиторией пубертатных студиозусов лекторы не владели абсолютно) об уровнях доказательности, Кохране, р-value и прочих двойных слепых. Почему этим реально важным и нужным вещам не уделили должного внимания, а вместо этого забивали нам бошки вопросами типа "сколько битов в мегабайте" - непонятно.

На пятом курсе был даже целый предмет - биостатистика. Там о доказательной медицине вообще ни слова сказано не было. По сути, нас учили работать в условиях системы Семашко, смердящий труп которой пытаются реанимировать до сих пор. На занятиях мы высчитывали занятость койкомест бороздящих просторы Большого театра в квартал, и заполняли жёлтые от ветхости статталоны. Удивительно, что в этом курсе молодого бойца не было семинаров на тему "как грамотно сказать пациенту, шоб дал денег" или "осваиваем средства, выделенные на ремонт отделения".

На эту тему я могу бурчать часами. Какое образование, такая и медицина, и vice versa; бесплатная медицина не может быть качественной; уравниловка убивает развитие; врач, который не знает английского, подобен... нувыпонели.

Это все была преамбула. А дальше будет пост про чувствительность и специфичность, и почему они существуют только в стране солнечных зайчиков.
И приз за самую амбивалентную пассивную агрессию получает........
Лагідна генетизація
На втором курсе у нас была информатика. Помню я оттуда только душные кабинеты, где мы сидели друг у друга на головах, допотопные кудахтеры и зубрежку бесполезных тестов. Невероятно, но именно на лекциях по информатике я впервые услышала (краем уха, т.к. аудиторией…
Чувство и чувствительность (а также специфичность и прочие гады морские)

Итак, чувствительность исследования показывает процент истинно положительных результатов среди всех больных (множество которых состоит из людей с истинно положительными и ложноотрицательными результатами). Тест с высокой чувствительностью позволяет сказать, что при негативном результате заболевания с большой вероятностью нет (т.к. ложноотрицательных результатов мало).

Специфичность же показывает, насколько велика часть негативных результатов среди людей, у которых заболевания нет. Чем меньше ложноположительных результатов, тем тест специфичней, и тем более мы уверены в том, что при положительном результате заболевание действительно есть.

Надо зарубить себе на носу, что чувствительность и специфичность - это характеристики диагностического теста, такие себе сферические кони в вакууме. В жизни и в клинике они не встречаются, потому что при трактовке результата теста нужно учитывать частоту заболевания в популяции. Даже самый чувствительный анализ на заболевание, встречающееся с частотой 1 на мильон, выявит значительно меньше больных, чем было положительных результатов. You're one in a million, you're once in a lifetime, поет нам Боссон, наверно потому, что шарит в байесианстве (в отличие от многих врачей; каюсь, такой тип мышления мне тоже не дарован от природы, поэтому, девочки, читаем @rastut и ГПМРМ).

И тут в тред врываются PPV (positive predictive value) и NPV (negative predictive value), и помогают нам оценивать результаты анализов живых людей. PPV говорит нам о вероятности того, что положительный результат теста реально укажет нам на болезнь; NPV предсказывает вероятность получить негативный результат, когда болезни и правда нет. Чем реже заболевание (а я в своей практике сталкиваюсь именно с такими), тем меньше PPV и тем больше NPV. Получается красиво, как ни погляди: если результат негативный, то можно пациенту сказать, что с наибольшей вероятностью заболевание мы исключили; и вдругорядь, даже положительный результат - это не приговор, и есть все шансы, что болезни там не окажется.

Возьмем тот же НИПТ на трисомии 13, 18 и 21. Все три заболевания встречаются достаточно редко для того, чтобы при любом возрасте пациентки иметь NPV более 99%. То есть, если получим Very low risk, то на 99% эти синдромы мы исключили, а точнее скажет только Боженька. A вот с PPV не все так однозначно: самый большой этот показатель у женщин старше 35-40, когда значительно повышается базовый риск анеуплоидий. Также есть нехилый разброс PPV между заболеваниями - синдром Дауна будет выявлен с наибольшей вероятностью (50-60% у женщин до 30 лет, 80% в 35 лет и т.д.). А вот синдромы Эдвардса и Патау встречаются, соответственно, в 5 и 10 раз реже, чем синдром Дауна, поэтому и вероятность истинно положительного результата гораздо ниже (10-20% в возрасте <30 лет). Зато в возрасте 45-50 лет PPV для всех трех заболеваний становится очень высоким, более 97-99%; но я бы в таком случае амниоцентез назначила, уже после 40 всем рекомендую.

Надеюсь, после моих выкладок никто не сомневается, что PPV и NPV - клевые ребята. Высчитать их можно, используя уравнение Байеса, ну еще надо все переменные там знать конкретно для вашего теста и заболевания, а я пошла кекеке
Конечно же, в гуголе найдете калькуляторы, - вот для НИПТ, например.
И еще статья хорошая по статистике, я туда много подглядывала, пока эту простыню писала. А в Британии про НИПТ консернятся и контроверсятся, тоже рекомендую ознакомиться.