Вениамин Фишман
1.23K subscribers
406 photos
73 videos
26 files
164 links
Генетика через призму AI, а также о науке (и в целом о жизни) в РФ и за рубежом
Download Telegram
Почитайте эту статью, посмотрите на примеры работы на этой картинке. Мне кажется, это ещё один шаг в будущее. Не потому, что chatNT умеет лучше решать задачи геномики, чем другие инструменты до него. А потому, что он может общаться с вами на английском и не требует никаких навыков биоинформатики для работы. Уверен, скоро все инструменты будут такими.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.30.591835v1.full
👍8🔥6
Коллеги попросили распространить информацию для студентов ФЕН НГУ:

Детский лагерь Альтаир ищет студентов (2-4 курса бакалавриата и магистрантов) на проведение небольших курсов для детей летом.

Возраст детей: 11-18 лет.
Количество детей на занятие: от 10 до 24 чел.
Занятия проходят в очном формате на базе Парка науки и технологий РЦ «Альтаир» (Технопарк, ул. Николаева 12, 4 этаж).
Занятия можно проводить с 10 до 17:00, понедельник-пятница.
Работа с самозанятыми, оплата почасовая, время проведение мастер-класса от 2 до 3.5 часов.

Подробности: https://vk.com/wall-70419166_329368
👍3
Пару минут рефлексии. Защита докторской диссертации - очень долгий процесс. Сегодня я прошёл очередной этап, выступив на ученом совете - и в очередной раз задумался, кому и зачем нужен текст, описывающий полученные десять лет назад результаты (которые к тому же опубликованы и находятся в свободном доступе). Многие результаты уже потеряли актуальность, некоторые успели даже оказаться неверными. Но главное - гораздо интереснее рассказывать о том, что делаешь прямо сейчас, о статьях, которые готовились последние год-два и которые, к сожалению, включить в диссертацию как раз нельзя. Потому что все результаты должны быть опубликованы - а сам процесс публикации занимает около года.

Думаю, что защита "по докладу" (которая, хотя и не требует написания полного текста, предполагает написание 100-страничного автореферата) - шаг в правильном направлении.

Утверждение темы
|
Лаб. семинар
|
Межлаб семинар
|
Доклад на учёном совете
|
--вы находитесь здесь
|
Комиссия диссовета
|
Семинар в ведущей организации
|
Защита
👍20💯131
Правительство новосибирской области наградило сотрудников ИЦиГ СО РАН премиями

Награду назначили за выдающиеся научные достижения и успешное научное руководство.

Среди победителей конкурса на предоставление именных премий Правительства Новосибирской области трое перспективных молодых ученых из Института цитологии и генетики СО РАН – Евгения Гарбузова, Вениамин Фишман и Олеся Шоева.

Научный сотрудник лаборатории клинических биохимических и гормональных исследований терапевтических заболеваний НИИТПМ-филиал ИЦиГ СО РАН, к.м.н. Евгения Витальевна Гарбузова руководит и участвует в ряде проектов в области высокотехнологичной медицины. При награждении особенно отметили ее работу по изучению роли абдоминального ожирения, биомолекул, ассоциированных с ним, и метаболических нарушений в развитии коронарного атеросклероза и нестабильной атеросклеротической бляшки.

Ведущий научный сотрудник сектора геномных механизмов онтогенеза геномных механизмов онтогенеза ИЦиГ СО РАН, к.б.н. Вениамин Семенович Фишман был награжден премией первой степени по направлению научного исследования «Фундаментальные научные исследования, направленные на оценку рисков и возможных опасностей для человечества, обеспечение возможности прогнозировать происходящие в российском обществе и в мире изменения, решение национальных и глобальных проблем и обеспечение устойчивого развития государства и человеческой цивилизации в целом»

•Премией второй степени в номинации «Лучший научный руководитель» также отмечена работа старшего научного сотрудника сектора функциональной генетики злаков ИЦиГ СО РАН, к.б.н. Олеси Юрьевны Шоевой по исследованию молекулярно-генетического контроля синтеза полифенольных соединений у злаков, как основы для селекции новых форм с улучшенными хозяйственно-ценными признаками.
🔥30👍8👏2
Интересные гранты планируют объявить в Израиле - для тех, кто уехал из страны и работает за рубежом или тех, кто имеет право получить гражданство (репатреироваться)

https://www.calcalist.co.il/local_news/article/h1dodw11va

NIS 1.5 million в год для завлабов. Это 37 млн руб. На удивление, сопоставимо (хотя и больше) с большими РНФ (25 млн в год на 5 лет). Где конкуренция выше не знаю.

Для посдоков/молодых груплидов где-то в два раза меньше, также сопоставимо с 8-миллионными гранатами РНФ.
👍9🤔3
Прилетел в Саратов для участия в конфереции "Съезд ВОГиС". В Саратов летает не так много рейсов, поэтому уже на трапе самолета начал встречать знакомых из разных институтов (в том числе - из ИЦиГ).

Впечатление дня - от аэропорта Саратова. Тут первое место за последние 5 лет, где я встретил вайфай без авторизации! Прямо как обратно в 2010-ые попал.
👍13😁1
Хочу обратить ваше внимание на мегагранты, объявленные университетом Сириус. Некоторые важные моменты:

1. Два вида грантов, для молодых ученых (до 39 лет) и ведущих ученых.

2. Размер гранта - 30 (для молодых) - 50 (ведущие) млн в год

3. Требования к руководителю: h-index >= 10 для молодых, >=25 для ведущих

4. Требования к реализации проекта:
- публикация 13 статей (для молодых) и 16 (для взрослых)
- устройство в Сириус по основному месту работы, привлечение коллектива (включая кбн), разработка образовательных курсов и некоторое другое.

Подробные условия: https://siriusnauka.ru/contests/fts-2024-2_3-01
👍41🔥1
Иногда самые захватывающие истории на конференции рассказывают не с трибуны, а в кулуарах. Сегодня я встретил коллег из одного центра ЭКО, с которым мы сотрудничаем. Они рассказали мне, как одна женщина сделала ряд косметических операций и подделала паспорт (sic!), чтобы убедить сотрудников, что она ещё достаточно молода, чтобы выносить донорского эмбриона (т.е. полученного из донорской яйцеклетки). В роддом женщина поехала с оригиналом паспорта. В итоге история о том, как 68-летняя женщина родила ребенка ожидаемо попала в топ новостей.

Кстати, из вышесказанного можно подумать, что на съезде не рассказывают ничего интересного в основное время докладов. Это совсем не так - я первый раз на ВОГиС и, оказывается, это очень масштабная конференция с работами по большому спектру направлений - от медицинской генетики до исследований микроорганизмов. Думаю, тут каждый может найти что-то интересное на докладах.
😱7🔥61😁1
Очень забавная история, которую написал профессор William T. Sullivan чтобы объяснять своим студентам, в чем смысл мутационных скринингов. Объяснение строится на аналогии с исследованием фукнционирования автомобиля двумя учеными - биохимиком и генетиком. Текст очень смешной, правда, доступен только на английском.

Приведу ниже короткий фрагмент перевода:
На следующий день генетик связал руки другому рабочему. В тот день он заметил, что машины были без пластиковых устройств. Кроме того, он заметил, что когда машины отгоняли на стоянку, они не делали первый поворот на дороге. Генетик пришел к выводу, что рули отвечают за поворот автомобиля, и, кроме того, что он опознал рабочего отвечает за установку рулевых колес.

Воодушевленный своими успехами, на следующее утро генетик связал руки человеку, одетому в костюм и с портфелем в одной руке и лазерной указкой в другой (он был вице-президентом). В тот вечер генетик, и биохимик Дуг (хотя он не стал бы открыто признаваться в этом), с нетерпением ждал эффекта...

https://sullivan.mcdb.ucsc.edu/pdf/07_Sullivan.pdf
🤣5👍2😁2
Съезд ВОГиС подошёл к концу. Я уже писал о своих впечатлениях от конгресса, к слову, очень позитивных - на мероприятие приехали больше 700 учёных-генетиков со всей страны, удалось встретить много знакомых, которых я давно не видел.
🔥4
Теперь пару слов о месте проведения - городе Саратов. Средних размеров (около 800 тыс. человек) и, судя по всему, не богатый, Саратов производит впечатление типичного южного городка. По улицам ездят заниженные "лады" советского образца, из окон которых громко играет попса. Краска на многих домах облупились от солнца, на дорогах то тут, то там попадаются ямы. Вечером в парке маргинального вида мужички спрашивают есть ли немного мелочи (впрочем, на моё вежливое - "с собой только карточки" - без вопросов уходят). Университ, симпатичный снаружи, явно много лет не ремонтировали внутри, а на кафедре генетики, как сказали на съезде, остался один преподаватель.

П.С. На фото - типичный Саратовский пейзаж
🔥9
Но есть в Саратове и красивые места! Через центр города тянется проспект Петра Столыпина - длинная пешеходная улица, по которой я каждый вечер возвращался в гостиницу. Проспект выходит на набережную. Набережная Волги в Саратове очень длинная - 13 км, а та ее часть, где жил я, хорошо обустроена. В выходные на набережной много людей, но никто не купается - для купания предназначен городской пляж на острове посреди реки. Добираться туда нужно через мост, ехать на общественном транспорте или идти панели - стоянки машин там нет.

Многие российские города имеют небольшой центральный район, в который вложено много средств, а все, что за его пределами выглядит куда менее презентабельно. В Саратове меня удивило "кусочно-аналитическое" облагораживание, когда симпатичный, ухоженный переулок длиной пару сотен метров окружён страшными, обшарпанными домами с торчащими из них газовыми трубами.

В общем, за неделю я достаточно познакомился с Саратовом и даже успел немного соскучиться по Новосибирску.
11🔥3👏1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Чем мне всегда нравился Новосибирский Академгородок - так это сочетанием высокой концентрации научных институтов с прекрасной природой сибирского леса.

Этот лось перебегал улицу, по которой я езжу из дома на работу.
👍21🔥15🤩2
Вениамин Фишман
Пару минут рефлексии. Защита докторской диссертации - очень долгий процесс. Сегодня я прошёл очередной этап, выступив на ученом совете - и в очередной раз задумался, кому и зачем нужен текст, описывающий полученные десять лет назад результаты (которые к тому…
Продолжаю вести хронику защиты докторской диссертации. За месяц мне удалось собрать все необходимые документы, и диссертация официально выставлена на сайт института, чтобы все желающие могли с ней ознакомиться. Тем временем, диссовет сформирует комиссию для ее рассмотрения и официального приема к защите.

Утверждение темы
|
Лаб. семинар
|
Межлаб семинар
|
Доклад на учёном совете
|
Комиссия диссовета
|
--вы находитесь здесь
|
Семинар в ведущей организации
|
Защита
🔥37👍42
Очень удивительно для текущей ситуации, но правительство Швейцарии объявило конкурс грантов на краткосрочные (до года) стажировки для молодых учёных из РФ. Размер стипендии, правда, очень скромный (около 2000 долларов, для Швейцарии, по моим представлениям, это впритык на дешёвое жильё и еду). Но как возможность пообщаться с интересной научной группой на протяжении нескольких месяцев кажется норм.
🔥10👍2
2_5197186006146633332.pdf
428 KB
2_5197186006146633332.pdf
1
Вчера стали известны результаты конкурса грантов федеральной территории Сириус. Заявка нашей группы вошла в число победителей!

Будем развивать коллаборацию с университетом Сириус, а в связи с этим - расширять наш коллектив.

Если кто-то из кандидатов наук с опытом анализа геномных данных, ML или с экспериментальным бэкграундом в области геномики хочет присоединиться к нашей группе - пишите!
🔥46👍41