Интересная история была вчера должена на конференции. Одна компания делает CRISPR-терапевтически препарат против b-талаземии. Во-первых, интересен сам подход: вместо исправлений мутаций в глобиновых генах, они ломают энхансер, переключая продукцию со взрослого b-глобина, в гене которого мутация, на эмбриональный. Таким образом, можно одним препаратом лечить всех больных, не зависимо от мутации в глобиновом гене. Что-то похожее я помню Саша Ян рассказывала на нашем семинаре в виде статьи с идеей, а сейчас у компании сейчас уже стадия клинических испытаний, есть пролеченные пациенты.
Но суть доклада была в другом. Когда люди делают CRISPR-препараты, они обычно проверяют наличие в геноме off-target сайтов, которые могут быть ошибочно модифицированы их системой. Но они делают эту проверку для референского генома. А в статье в Nat. genetics автор доклада показал, что для уже используемой компанией CRISPR-системы есть off-target в нереферносном полиморфизме, частота которого в популяции >5%. Более того, они нашли такого донора и показали что, по стечению обстоятельств, off-target находится на той же хромосоме, что и on-target, и применение CRISPR-редактирования на клетках этого донора приводит не только к точковым мутациям в незапланированном месте, но и гигантским инверсиям с границами соответственно в on- и off-target участках.

Сегодня единственный свободный день в Рио, и мы с друзьями провели его максимально активно. Пошли тропу Trilha Parque Lage to Corcovado, которая ведёт на гору со знаменитой статуей Иисуса, а потом так же пешком спустились с горы и дошли до пляжа Ипанема. По дороге видели обезьян, красивых птиц и большущих бабочек.