Forwarded from МФТИ — Физтех
С Днём Великой Победы, Физтехи 🕊🎖
9 Мая — дата, объединяющая поколения. Для МФТИ этот праздник имеет глубокий смысл: наш институт создавался в послевоенные годы людьми исключительного масштаба. Фронтовики, труженики тыла и великие учёные заложили сам характер Физтеха — честный, свободный в мысли и преданный своему делу.
Ректор МФТИ Дмитрий Ливанов в своём обращении отметил:
Мира, благополучия и веры в свои силы! С праздником! 🇷🇺
#МФТИ #Физтех #9Мая #ДеньПобеды #МыПомним #ЛицаПобеды #Минобрнауки #Долгопрудный
9 Мая — дата, объединяющая поколения. Для МФТИ этот праздник имеет глубокий смысл: наш институт создавался в послевоенные годы людьми исключительного масштаба. Фронтовики, труженики тыла и великие учёные заложили сам характер Физтеха — честный, свободный в мысли и преданный своему делу.
Ректор МФТИ Дмитрий Ливанов в своём обращении отметил:
«Для нас память — это не только слова благодарности, но и ежедневная работа, ответственность и стремление приносить пользу будущему российской науки. От всей души желаю вам здоровья, душевного тепла и новых свершений. С Днём Победы!»
Мира, благополучия и веры в свои силы! С праздником! 🇷🇺
#МФТИ #Физтех #9Мая #ДеньПобеды #МыПомним #ЛицаПобеды #Минобрнауки #Долгопрудный
❤13❤🔥4
Знакомимся с кафедрой БФК! 🔬
Кафедра инновационной фармацевтики, медицинской техники и биотехнологий готовит специалистов, которые работают на стыке науки, технологий и предпринимательства 🧪 Обучение строится в тесном сотрудничестве с индустриальными и научными партнёрами!
На кафедре можно защитить не только классическую научную работу, выполненную по заказу индустриального партнёра, но и собственный технологический стартап, созданный в процессе обучения.
Идеальный выбор для тех, кто готов стыковать технологии с реальными продуктами 🔥 Больше информации про программу: https://xn--80aadke2af9b7af.xn--p1ai/
Кафедра инновационной фармацевтики, медицинской техники и биотехнологий готовит специалистов, которые работают на стыке науки, технологий и предпринимательства 🧪 Обучение строится в тесном сотрудничестве с индустриальными и научными партнёрами!
✍️ Главная особенность программы — сочетание фундаментальной подготовки с реальной проектной работой. Студенты участвуют в научных исследованиях, работают над индустриальными задачами и получают опыт технологического предпринимательства ещё во время обучения.
На кафедре можно защитить не только классическую научную работу, выполненную по заказу индустриального партнёра, но и собственный технологический стартап, созданный в процессе обучения.
Идеальный выбор для тех, кто готов стыковать технологии с реальными продуктами 🔥 Больше информации про программу: https://xn--80aadke2af9b7af.xn--p1ai/
❤8
В МФТИ пройдёт День открытых дверей, посвящённый совместной магистратуре Физтеха и Университета «Сириус»
📆 18 мая
📍 107 БК
👥 Приглашаются все желающие
В программе:
14.00-14.20 — Основные научные направления лаборатории;
14.20-14.40 — Презентация магистерской программы (Яковцева Мария Николаевна, к.б.н, н.с.);
14.40-14.50 — Правила поступления в магистратуру ФБМФ (Дух Анна Сергеевна);
14:50-15:20 — Экскурсия по лаборатории нанобиотехнологий (Черкасов Владимир Рюрикович,к.х.н, с.н.с.)
❗️Зарегистрироваться на лекцию и экскурсию можно по ссылке: по https://forms.yandex.ru/u/69f079c96d2d73365a39e2dc
📎 Подробнее о магистерской программе на сайте: https://nikitinlab.ru/mastersprogramm-mipt-sirius/
📆 18 мая
📍 107 БК
👥 Приглашаются все желающие
В программе:
14.00-14.20 — Основные научные направления лаборатории;
14.20-14.40 — Презентация магистерской программы (Яковцева Мария Николаевна, к.б.н, н.с.);
14.40-14.50 — Правила поступления в магистратуру ФБМФ (Дух Анна Сергеевна);
14:50-15:20 — Экскурсия по лаборатории нанобиотехнологий (Черкасов Владимир Рюрикович,к.х.н, с.н.с.)
❗️Зарегистрироваться на лекцию и экскурсию можно по ссылке: по https://forms.yandex.ru/u/69f079c96d2d73365a39e2dc
📎 Подробнее о магистерской программе на сайте: https://nikitinlab.ru/mastersprogramm-mipt-sirius/
❤3❤🔥1
Forwarded from Алгоритмическая биология | ФБМФ МФТИ (Анна Дух)
👨🔬 Преподаватели курса «Анализ данных NGS» в МФТИ
Ведущие ученые из МФТИ, ИТМО и ИОГен РАН. Работают с реальными данными секвенирования.
Ключевые лекторы:
— Марианна Золотовская (лауреат премии губернатора МО)
— Дмитрий Буг (к.м.н., врач клинической диагностики)
— Алексей Ковтун (к.б.н., ИОГен РАН)
— Александр Ткаченко (ИТМО)
— Екатерина Олейникова (ФИЦ Биотехнологии РАН)
Студенты устанавливают программы, запускают скрипты, разбирают ошибки.
🚀 Новый поток стартует 25 мая
Онлайн, 2 месяца, удостоверение МФТИ (72 ак. часа).
Темы: Linux, R, RNA-Seq, ChIP-Seq, метагеномика, сборка геномов, поиск мутаций.
Для врачей, программистов, ученых, аспирантов, студентов.
Программистам — бонус: материал по основам молекулярной биологии.
Подробности и регистрация: https://biomed-mipt.ru/ngs
Старт 25 мая! 🧬
Ведущие ученые из МФТИ, ИТМО и ИОГен РАН. Работают с реальными данными секвенирования.
Ключевые лекторы:
— Марианна Золотовская (лауреат премии губернатора МО)
— Дмитрий Буг (к.м.н., врач клинической диагностики)
— Алексей Ковтун (к.б.н., ИОГен РАН)
— Александр Ткаченко (ИТМО)
— Екатерина Олейникова (ФИЦ Биотехнологии РАН)
Студенты устанавливают программы, запускают скрипты, разбирают ошибки.
🚀 Новый поток стартует 25 мая
Онлайн, 2 месяца, удостоверение МФТИ (72 ак. часа).
Темы: Linux, R, RNA-Seq, ChIP-Seq, метагеномика, сборка геномов, поиск мутаций.
Для врачей, программистов, ученых, аспирантов, студентов.
Программистам — бонус: материал по основам молекулярной биологии.
Подробности и регистрация: https://biomed-mipt.ru/ngs
Старт 25 мая! 🧬
🔥1
Что ждёт тех, кто собирается поступать в магистратуру ФБМФ? 😍 Начинаем рассказывать про проекты, которыми занимаются наши студенты!
Кафедра молекулярной и клеточной биологии👇
😊 Разработка и применение NGS-панели для секвенирования вируса гепатита С
Исследование носит фундаментальный характер для формирования базы данных геномов ВГС в российской популяции пациентов и прикладное применение. С помощью панели возможен поиск клинически значимых мутаций вируса. Основной метод исследования — NGS и биоинформатический анализ.
😊 Оценка тропности новых ААВ векторов к тканям сетчатки на различных моделях методом секвенирования РНК единичных клеток
Применение технологии РНК секвенирования единичных клеток для подбора оптимального вектора с необходимыми характеристиками тропизма при разработке генной терапии наследственных заболеваний сетчатки. Сравнительный анализ эффективности трансдукции и клеточного тропизма библиотеки химерных капсидов AAV проводился с использованием мышиной модели, эксплантов сетчатки человека (ЭСЧ) и органоидов сетчатки, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК).
😊 Анализ данных транскриптома и протеома для поиска молекулярных особенностей при индукции ферроптоза
Омиксный анализ данных для поиска молекулярных регуляторов ферроптоза. Ферроптоз — открытый в 2012 году тип клеточной гибели, который обусловлен перекисным окислением липидов и разрушением клеточной мембраны. Роль ферроптоза активно изучается как причина нейродегенераций, а также индукция ферроптоза рассматривается как перспективное направление в лечении опухолей. В работе производился поиск регуляторов ферроптоза на транскриптомном и протеомном уровнях при разных способах индукции ферроптоза.
😊 Идентификация аутореактивных CD4+ T-клеток у больных системной красной волчанкой и антифосфолипидным синдромом
Цель работы — идентифицировать аутореактивные CD4+ Т-клеточные клоны у больных СКВ носителей HLA-DRB1*15:01 и определить аутоантигенные пептиды, вовлеченные в их активацию. Был проведен анализ репертуара аутореактивных антиген-специфичных Т клеточных клонов и найдены последовательности TCR.
😊 Получение и изучение свойств прионов дрожжей в отсутствие шаперона Hsp104
Изучение свойств прионов дрожжей в отсутствие главного размножающего фактора, шаперона Hsp104, а именно: устойчивость к детергенту SDS при различных температурах, реакция на введение мутантов SSa1 и введение Hsp104 в штаммы с его делецией, поиск возможных альтернативных факторов дезагрегации, в присутствии которых продолжается стабильное наследование прионного статуса.
😊 Разработка генетического сенсора для индентификации инфекции HSV на основе вирус-специфического промотора
Разработка панели генетических сенсоров на основе вирус-специфических промоторов из вируса простого герписа первого типа, для индетефикации инфекции последнего в интактной культуре клеток. Основные методы в работе: основные методы генной инженении и клеточной биологии, проточная цитофлуометрия, флюоресцентная микроскопия.
Кафедра молекулярной и клеточной биологии
Исследование носит фундаментальный характер для формирования базы данных геномов ВГС в российской популяции пациентов и прикладное применение. С помощью панели возможен поиск клинически значимых мутаций вируса. Основной метод исследования — NGS и биоинформатический анализ.
Применение технологии РНК секвенирования единичных клеток для подбора оптимального вектора с необходимыми характеристиками тропизма при разработке генной терапии наследственных заболеваний сетчатки. Сравнительный анализ эффективности трансдукции и клеточного тропизма библиотеки химерных капсидов AAV проводился с использованием мышиной модели, эксплантов сетчатки человека (ЭСЧ) и органоидов сетчатки, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК).
Омиксный анализ данных для поиска молекулярных регуляторов ферроптоза. Ферроптоз — открытый в 2012 году тип клеточной гибели, который обусловлен перекисным окислением липидов и разрушением клеточной мембраны. Роль ферроптоза активно изучается как причина нейродегенераций, а также индукция ферроптоза рассматривается как перспективное направление в лечении опухолей. В работе производился поиск регуляторов ферроптоза на транскриптомном и протеомном уровнях при разных способах индукции ферроптоза.
Цель работы — идентифицировать аутореактивные CD4+ Т-клеточные клоны у больных СКВ носителей HLA-DRB1*15:01 и определить аутоантигенные пептиды, вовлеченные в их активацию. Был проведен анализ репертуара аутореактивных антиген-специфичных Т клеточных клонов и найдены последовательности TCR.
Изучение свойств прионов дрожжей в отсутствие главного размножающего фактора, шаперона Hsp104, а именно: устойчивость к детергенту SDS при различных температурах, реакция на введение мутантов SSa1 и введение Hsp104 в штаммы с его делецией, поиск возможных альтернативных факторов дезагрегации, в присутствии которых продолжается стабильное наследование прионного статуса.
Разработка панели генетических сенсоров на основе вирус-специфических промоторов из вируса простого герписа первого типа, для индетефикации инфекции последнего в интактной культуре клеток. Основные методы в работе: основные методы генной инженении и клеточной биологии, проточная цитофлуометрия, флюоресцентная микроскопия.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥7❤4
Знакомимся с магистрантами ФБМФ! Даниил Черкасов рассказывает про учёбу на кафедре системной и синтетической биологии ✍️
💬 Почему вы выбрали нашу кафедру?
Летом перед магистратурой мы с командой под руководством заведующего кафедры Вадима Марковича Говоруна начали прорабатывать его идею по созданию устройства для автоматизации биологического синтеза фрагментов ДНК. Проект выглядел очень интересным и амбициозным, так что поступление на кафедру виделось логичным продолжением.
💬 Какие дисциплины оказались самыми полезными и почему?
Для дальнейшего развития в области биологии самым полезным можно назвать курс "Инструментальные основы системной биологии и биостатистика", поскольку он ориентирован на освоение практических методик при проведении мультиомиксных исследований. Приводится множество примеров реальных экспериментов, объясняются принципы работы приборов и технологий. Также хочется отметить курс "Системная инженерия биомедицинского оборудования" — он позволил по-другому посмотреть на технику построения эксперимента.
💬 Над чем вы сейчас работаете в рамках НИР?
Моя работа способна стать частью программного модуля по разбиению последовательности ДНК на олигонуклеотиды, разрабатываемого в лаборатории. Я работаю над статической моделью предсказания результата сборки последовательности метом двух последовательных ПЦР. Технология поможет осуществлять сборку последовательностей с желаемыми признаками и высокой синтаксической сложностью.
💬 Удаётся ли совмещать магистратуру и работу?
В данный момент я работаю в лаборатории передовых решений в области биофизики и автоматизации. Совмещение никогда не бывает простым, но я благодарен своим коллегам — они помогают мне, в том числе создавая условия для выполнения части исследований в рамках диплома в рабочее время.
💬 Как магистратура изменила ваше понимание профессии?
Обучение в магистратуре помогло мне осознать важность распределения времени в условиях его нехватки, трезвой оценки своих возможностей при реализации поставленных задач, поиска компромиссов при необходимости.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥7
Forwarded from Алгоритмическая биология | ФБМФ МФТИ (Анна Дух)
🐧 Почему в биоинформатике Linux, а не Windows?
❌ Windows не умеет запускать 99% программ для анализа генома (bwa, samtools, GATK…)
❌ Терабайты данных через графический интерфейс — это боль и тормоза
❌ Даже WSL медленнее нативного Linux на реальных объёмах
✅ Кластеры любых центров — только Linux и командная строка
Что делать?
Ставить Ubuntu, использовать WSL2 или виртуалку.
На курсе «Анализ данных NGS»:
— даём основы командной строки Linux
- Вы с нуля научитесь устанавливать программы, запускать скрипты и обрабатывать секвенированные данные
🚀 Новый поток — 25 мая
👉 https://biomed-mipt.ru/ngs
Linux — ваш ключ к большим данным в биологии 🧬
❌ Windows не умеет запускать 99% программ для анализа генома (bwa, samtools, GATK…)
❌ Терабайты данных через графический интерфейс — это боль и тормоза
❌ Даже WSL медленнее нативного Linux на реальных объёмах
✅ Кластеры любых центров — только Linux и командная строка
Что делать?
Ставить Ubuntu, использовать WSL2 или виртуалку.
На курсе «Анализ данных NGS»:
— даём основы командной строки Linux
- Вы с нуля научитесь устанавливать программы, запускать скрипты и обрабатывать секвенированные данные
🚀 Новый поток — 25 мая
👉 https://biomed-mipt.ru/ngs
Linux — ваш ключ к большим данным в биологии 🧬
😁7💯2👏1
Forwarded from Алгоритмическая биология | ФБМФ МФТИ (Анна Дух)
🧬 День открытых дверей / Алгоритмическая биология
🗓 23 мая, 11:00
📍 Биотек кампус (Миклухо-Маклая, 16/10)
В программе:
1️⃣ Генетика в РФ, кампус и наши достижения
2️⃣ Магистерская программа «Алгоритмическая биология»
3️⃣ 🔬 Экскурсия по лабораториям
4️⃣ ☕️ Чай, фуршет, живое общение
Приходите увидеть лабораторию изнутри и узнать пути в биоинформатику.
🔗 Регистрация: https://forms.yandex.ru/u/69f346279029020401a8e8bb
Ждём вас! 🧬
🗓 23 мая, 11:00
📍 Биотек кампус (Миклухо-Маклая, 16/10)
В программе:
1️⃣ Генетика в РФ, кампус и наши достижения
2️⃣ Магистерская программа «Алгоритмическая биология»
3️⃣ 🔬 Экскурсия по лабораториям
4️⃣ ☕️ Чай, фуршет, живое общение
Приходите увидеть лабораторию изнутри и узнать пути в биоинформатику.
🔗 Регистрация: https://forms.yandex.ru/u/69f346279029020401a8e8bb
Ждём вас! 🧬
❤3✍1