Как воодушевляюще, это первый пост на моём канале. Всё не мог придумать о чём его написать, и как раз сегодня произошёл забавный случай: заходя в метро с большой коробкой в которой находился PCR амплификатор ДНК-технология ДТ-322, что привлекло внимание сотрудников метрополитена и меня вежливо попросили поместить коробку в камеру для рентгена, вот что получилось:
👾4🤣3❤1
Gagarin
Overloque
Дорогие друзья, поздравляю вас с днём космонавтики! Это особенный день который приурочен не просто к какому-то значимому событию внутри человечества, а к расширению границ самого человечества. Желаю вам вдохновения и сил для ваших достижений, что бы стремление не угасло и цели были достигнуты.
❤6💯1
Так бы выглядел герб моего тайного общества⚰️ На фото кримпер(обжимник) для флаконов, и флакон в котором я растворил 20 мг пептида Davunitide. Опробовал в работе кримпер, классная штука. Вот такая разница поколений: у бабушки кримпер для закатки варенья, у внука кримпер для закатки пептидов.
Эффект от Davunitide субъективно ощущается выражено, снижение "шума" в мыслях, становится меньше фоновых мыслей которые больше отвлекают, фокус внимания подрастает. Позже попробую посмотреть действие пептида на ЭЭГ. Всем хорошего вечера и отличных выходных👍
Эффект от Davunitide субъективно ощущается выражено, снижение "шума" в мыслях, становится меньше фоновых мыслей которые больше отвлекают, фокус внимания подрастает. Позже попробую посмотреть действие пептида на ЭЭГ. Всем хорошего вечера и отличных выходных
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
⚡4🤣2❤1
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🤣3👀2❤1
Я тут буду писать не только о всяких эпигенетических откатах, транскраниальных стимуляциях отделов мозга, микробиоме и прокогнитивных компаундах, но ещё о криобиологии - большом разделе который сложно переоценить. Настоятельно рекомендую прочитать эту увлекательнейшую статью на досуге, уверен это будет для вас открытием, а так же позволит рассмотреть широчайший спектр потенциалов этой области. Хорошего вам вечера! 😘
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-021-00976-8
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-021-00976-8
SpringerLink
Winter is coming: the future of cryopreservation
BMC Biology - The preservative effects of low temperature on biological materials have been long recognised, and cryopreservation is now widely used in biomedicine, including in organ...
👾4❤2⚡1
В предыдущем посте про криобиологию упоминал эпигенетический откат, вещи, на первый взгляд, не имеющие ничего общего. Как бы не так! Оказывается есть не мало исследований обнаруживающих связь между криосохранением клеток и изменению уровня экспрессии факторов Яманаки (Nanog, Oct-4 и Sox-2). К сожалению есть большая неоднозначность в полученных данных между исследованиями, например в этом
https://www.nature.com/articles/srep09596 было обнаружено увеличение более чем в 2 раза экспрессии факторов стволовости (эпигенетического отката), что видно на прикреплённом изображении. FRESH - контрольные клетки которые не крионировали, 1-6 клетки которые крионировали с использованием разнообразных криопротекторов (Трегалоза, DMSO, сыворотка плода крупного рогатого скота и их комбинации).
Может напрашиваться вывод что именно процесс крионирования и отогревания повышает экспрессию факторов Nanog, Oct-4 и Sox-2, что кажется вполне логичным, последовательным и взаимосвязанным. В других исследованиях я не обнаружил такого значительного повышения Nanog, Oct-4 и Sox-2, что вызывает сомнения в верности вывода о влиянии крионирования на повышение уровня этих факторов.
Самые внимательные из вас могут предположить что на экспрессию факторов стволовости повлияла сыворотка плода крупного рогатого скота которая может в себе содержать сигналинг к экспрессии этих факторов. Но нет, не все крионируемые клетки обрабатывались сывороткой плода КРС.
В других исследованиях уровень Oct-4 был без изменений или снижен. Буду продолжать собирать данные.
https://www.nature.com/articles/srep09596 было обнаружено увеличение более чем в 2 раза экспрессии факторов стволовости (эпигенетического отката), что видно на прикреплённом изображении. FRESH - контрольные клетки которые не крионировали, 1-6 клетки которые крионировали с использованием разнообразных криопротекторов (Трегалоза, DMSO, сыворотка плода крупного рогатого скота и их комбинации).
Может напрашиваться вывод что именно процесс крионирования и отогревания повышает экспрессию факторов Nanog, Oct-4 и Sox-2, что кажется вполне логичным, последовательным и взаимосвязанным. В других исследованиях я не обнаружил такого значительного повышения Nanog, Oct-4 и Sox-2, что вызывает сомнения в верности вывода о влиянии крионирования на повышение уровня этих факторов.
Самые внимательные из вас могут предположить что на экспрессию факторов стволовости повлияла сыворотка плода крупного рогатого скота которая может в себе содержать сигналинг к экспрессии этих факторов. Но нет, не все крионируемые клетки обрабатывались сывороткой плода КРС.
В других исследованиях уровень Oct-4 был без изменений или снижен. Буду продолжать собирать данные.
⚡3❤3💊2
Сегодня глубине моего разочарования не было предела. Лучший криопротектор открытый за 2024 год оказался ирритантом, то есть веществом аналогичным которые есть в перцовых баллончиках для самообороны. Что интересно, этот криопротектор был найден при помощи нейросети в рамках данного исследования.
Думаю в обозримые единицы лет при должной заинтересованности получится обнаружить наилучшие ингибиторы кристаллизации льда, у которых будет отсутствовать какой либо вред. Это откроет перед нами новые горизонты: обратимое крионирование донорских органов и человека.
Думаю в обозримые единицы лет при должной заинтересованности получится обнаружить наилучшие ингибиторы кристаллизации льда, у которых будет отсутствовать какой либо вред. Это откроет перед нами новые горизонты: обратимое крионирование донорских органов и человека.
❤6💊4
День сегодня хороший, хоть и не простой, продолжаю ресёрчить по криопротекторам, начал писать пост по сформировавшемуся представлению о комбинации химических и инженерных подходов к криопротекции, и, блин, 2/3 черновика исчезло. Пост будет несколько позже.
Вчера разбирался с софтом (RDKit, GROMACS, LAMMPS и т.п.) для моделирования криопротекторных свойств молекул, всё не просто, местами ощущал недостаток толщины своего неокортекса.
Пока я ломал голову напряга весь неокортекс что есть, где-то в Японии мыши уже наращивают себе новый слой неокортекса путём эпигенетического репрограммирования макрофагов в нейтральные клетки.
Главное не останавливаться и продолжать свой путь. Терминатор страшен не только своей силой и отказоустойчивостью, но и способностью продолжать двигаться к цели не смотря на неудачи, сколько бы их не приключилось. Сил вам друзья, и отказоустойчивости в достижении ваших целей, сохраняйте энтузиазм📈
Пост про комбинацию подходов к криопротекции будет попозже 😘
Есть гипотеза что подписка на этот канал увеличивает толщину неокортекса 😉
Вчера разбирался с софтом (RDKit, GROMACS, LAMMPS и т.п.) для моделирования криопротекторных свойств молекул, всё не просто, местами ощущал недостаток толщины своего неокортекса.
Пока я ломал голову напряга весь неокортекс что есть, где-то в Японии мыши уже наращивают себе новый слой неокортекса путём эпигенетического репрограммирования макрофагов в нейтральные клетки.
Главное не останавливаться и продолжать свой путь. Терминатор страшен не только своей силой и отказоустойчивостью, но и способностью продолжать двигаться к цели не смотря на неудачи, сколько бы их не приключилось. Сил вам друзья, и отказоустойчивости в достижении ваших целей, сохраняйте энтузиазм
Пост про комбинацию подходов к криопротекции будет попозже 😘
Есть гипотеза что подписка на этот канал увеличивает толщину неокортекса 😉
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
❤3⚡3
Несколько дней думал о инженерных подходах к ингибированию роста кристаллов льда, и встраивания их в оптимальную комбинацию из существующих методов криопротекции. Больше всего показался интересным подход с использованием магнитного поля для воздействия на ядра водорода в молекулах воды, которое препятствует росту кристаллов льда. Хотя есть мнение, что силы магнитных полей о которых я буду писать ниже недостаточно для управления молекулами воды, а криопротекторный эффект достигается за счёт иных магниточувствительных веществ, например соединений Железа. По началу мне попадались статьи с применением постоянного магнитного поля силой от 0,0005 до 0,004 Тесла. Если сравнивать с силой поля МРТ аппарата, то оно обычно в районе 1 Тесла, например для исследования межпозвоночных грыж. Для большей детализации, например визуализации тканей мозга, МРТ аппарат может иметь силу поля 3 Тесла. То есть 0,004 Тесла выглядит вполне посильным для реализации на медных катушках, например катушках Гельмгольца, между которыми создаётся равномерное магнитное поле, что выглядит вполне подходящим для исследований комбинированных методов криопротекции. Для таких катушек Гельмгольца не нужен блок питания размером с половину комнаты и заправка жидким Гелием для создания сверхпроводимости. Катушки Гельмгольца можно запитать от блока питания постоянного тока ~10А для радиуса катушек 20 см и расстояния между катушек в 20 см, а сами катушки намотать медным эмалированным проводом на подходящем по форме предмете. В первом приближении это выглядит весьма доступно, но требует более точных расчётов. Система получается простая, если цель получить постоянное магнитное поле. Далее у меня были идеи о пульсирующем режиме работы катушек, или попеременной смене их полярности для влияния на положение в пространстве молекул воды благодаря чему кристаллизация льда если и будет происходить, то не в виде длинных острых кристаллов, а в виде мелких конгломератов молекул воды, которые будут не способны повредить структуры клетки и нити хроматина. Таковы мои предположения и ожидания от такой системы. Идея меня захватила после после статьи где в условиях переохлаждения с магнитным полем -4°C в течение 24 часов и -8°C в течение 1 часа все дрозофилы выжили, в то время как все, наоборот, погибли в условиях переохлаждения без магнитного поля. Да-да, Дрозофилы, всего лишь. Далее меня увлекла статья о обратимом крионировании яичников мышей с применением постоянного магнитного поля для их отогревания (заметьте, только для отогревания, охлаждение производилось резким помещением яичников в жидкий азот) и последующей трансплантацией с оценкой множества показателей: повреждения ДНК, пролиферации, уровня реактивных форм кислорода, оценка васкуляризации после трансплантации и ещё несколькими. Яичники подвергались воздействию криопротектора 1 (10% ДМСО и 0,5 моль сахарозы) 5 минут, затем переносились в криопротектор 2 (20% ДМСО и 0,5 моль сахарозы) на 5 минут, после чего погружались в жидкий азот для быстрого замораживания. Не смотря на такой простой состав криопротектора, а так же отсутствие перфузии органа смесью криопротектора, авторы получили хорошие результаты. Постоянное магнитное поле силой 0,004 Тесла оказалось наилучшим между 0,003 и 0,005 Тесла. Все подробности можно узнать в статье, она стоит прочтения, я лишь суммирую общий результат:
1. показатели яичников которые не подвергались крионированию наилучшие.
2. Показатели контрольной группы яичников которые подвергались крионированию и отогреванию без магнитных полей наихудшие.
3. Группы яичников подвергавшиеся крионированию и отогреванию с воздействием постоянного магнитного поля 1, 2, 3, 4 и 5 mT (0,001 - 0,005 Тесла) показали результаты улучшающиеся по возрастающей от 1 к 4 mT, ухудшение наблюдалось при 5 mT. 4 mT имел наилучший результат среди отогреваемых в магнитном поле.
К посту прикреплены изображения, потому что все мы с детства любим картинки, но статью всё же прочитать стоит.
Я упёрся в ограничение максимально допустимой длинны поста. Значит продолжение следует👍
Подписка на этот канал снижает оксидативный стресс🧪
1. показатели яичников которые не подвергались крионированию наилучшие.
2. Показатели контрольной группы яичников которые подвергались крионированию и отогреванию без магнитных полей наихудшие.
3. Группы яичников подвергавшиеся крионированию и отогреванию с воздействием постоянного магнитного поля 1, 2, 3, 4 и 5 mT (0,001 - 0,005 Тесла) показали результаты улучшающиеся по возрастающей от 1 к 4 mT, ухудшение наблюдалось при 5 mT. 4 mT имел наилучший результат среди отогреваемых в магнитном поле.
К посту прикреплены изображения, потому что все мы с детства любим картинки, но статью всё же прочитать стоит.
Я упёрся в ограничение максимально допустимой длинны поста. Значит продолжение следует
Подписка на этот канал снижает оксидативный стресс
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
⚡5❤3
Продолжаем продолжать!♾️ В предыдущем посте начато рассмотрение инженерных подходов криопротекции. Преступно оставить их без внимания.
Меня увлекла тема применения магнитных полей на фоне других подходов (электромагнитная индукция, воздействия волнами света и/или звука) потому что магнитное поле может быть равномерным во всех точках объёма биообъекта в отличии от ЭМ индукции, света и звука, интенсивность воздействия которых будет затухать по мере прохождения в глубину тканей.
Приятной находкой для меня оказалось что существует в продаже устройства которые совмещают в себе функции программного замораживателя и камеры настраиваемого магнитного поля. Радует когда разработка выходит из лаборатории на рынок доказав свою эффективность. Японская компания ABI производит камеры в которых охлаждение производится потоком холодного воздуха в магнитном поле. CELLS ALIVE SYSTEM (CAS) Engine - так они именуют свою систему. Так сложилось, что изучением ингибирования ре/кристаллизации льда занимались не только криобиологи, но ещё физхимики и пищевики. Появление такого устройства как CAS engine freezer представляет собой конвергенцию направлений физхимии, криобиологии и пищевой промышленности.
Центральный тезис в критике механизмов описанных в патентах ABI CAS engine: слабые осциллирующие магнитные поля в районе 1 мТл недостаточны для управления молекулами воды, расхождение с базовой биофизикой. Присутствует неоднозначность из которой происходят две гипотезы почему слабое магнитное поле в тысячные доли Тесла улучшает криоконсервацию, при этом не оказывая достаточной силы влияния на атомы водорода и молекулы воды:
1. сильные электрические поля способны нарушать поверхностный пограничный слой инертного воздуха на поверхности материалов, способствуя более высоким скоростям переноса тепла. Катушка создающая магнитное поле так же создаёт электрическое.
2. В тканях содержится Fe3O4 и другие соединения восприимчивые к магнитной или электрической составляющей поля, при этом создавая акустические колебания.
1.1 Скорость охлаждения важна, так как влияет на разницу осмотического давления между цитоплазмой клетки и межклеточным пространством при их фазовом переходе из жидкого состояния в твёрдое. Ускорение охлаждения за счёт нарушение слоя инертного воздуха на поверхности охлаждаемого объекта воздействием ЭМ поля имеет пользу.
2.1 Соединения в тканях восприимчивые к ЭМ полю могут содержаться как внутри клетки, так и в межклеточном матриксе. Создаваемые ими акустические колебания при охлаждении и отогревании могут прямо влиять на кристаллизацию льда. Тут мы подходим к статьям Бишофа о применении ЭМ активных наночастиц в качестве агентов равномерного отогревания органов, в которых уже описан выраженный результат тут, тут и тут, а еще вот тут.
Как то так сводится что слабые магнитные поля и вода в криосохранении не имеют основной роли, и разные группы учённых разными путями с разных сторон подошли к ингибированию ре/кристаллизации льда путём воздействия на ЭМ чувствительные соединения вызывая в них колебания создающие акустические волны. Ну а что, разве это плохо? Инженерный подход к криопротекции теперь имеет более детальные очертания, а именно:
1. Даже в отсутствии насыщения ткани ЭМ чувствительными материалами в ней они и так есть, вопрос их количества и адаптации параметров ЭМ излучения.
2. ЭМ чувствительные соединения своими колебаниями создают акустические волны влияющие на ре/кристаллизацию льда.
3. Уровень насыщения внутреклеточной среды ЭМ чувствительными соединениями может быть альтернативой (если не заменой, то поводом снижения концентрации) токсичным проникающим криопротекторам такими как: DMSO, Глицерин, Этиленгликоль.
Оптимизировав сочетание инженерных и химических подходов к криопротекции, параллельно блокируя сигнальные пути апоптоза, считаю базой для более успешного и обратимого криосохранения. Выражаю огромную благодарность @daniildavydov10 за его новаторские идеи по подготовке органов, тканей и организмов к криосохранению.
Подписка на этот канал стимулирует генерацию новаторских идей🧠
Меня увлекла тема применения магнитных полей на фоне других подходов (электромагнитная индукция, воздействия волнами света и/или звука) потому что магнитное поле может быть равномерным во всех точках объёма биообъекта в отличии от ЭМ индукции, света и звука, интенсивность воздействия которых будет затухать по мере прохождения в глубину тканей.
Приятной находкой для меня оказалось что существует в продаже устройства которые совмещают в себе функции программного замораживателя и камеры настраиваемого магнитного поля. Радует когда разработка выходит из лаборатории на рынок доказав свою эффективность. Японская компания ABI производит камеры в которых охлаждение производится потоком холодного воздуха в магнитном поле. CELLS ALIVE SYSTEM (CAS) Engine - так они именуют свою систему. Так сложилось, что изучением ингибирования ре/кристаллизации льда занимались не только криобиологи, но ещё физхимики и пищевики. Появление такого устройства как CAS engine freezer представляет собой конвергенцию направлений физхимии, криобиологии и пищевой промышленности.
Центральный тезис в критике механизмов описанных в патентах ABI CAS engine: слабые осциллирующие магнитные поля в районе 1 мТл недостаточны для управления молекулами воды, расхождение с базовой биофизикой. Присутствует неоднозначность из которой происходят две гипотезы почему слабое магнитное поле в тысячные доли Тесла улучшает криоконсервацию, при этом не оказывая достаточной силы влияния на атомы водорода и молекулы воды:
1. сильные электрические поля способны нарушать поверхностный пограничный слой инертного воздуха на поверхности материалов, способствуя более высоким скоростям переноса тепла. Катушка создающая магнитное поле так же создаёт электрическое.
2. В тканях содержится Fe3O4 и другие соединения восприимчивые к магнитной или электрической составляющей поля, при этом создавая акустические колебания.
1.1 Скорость охлаждения важна, так как влияет на разницу осмотического давления между цитоплазмой клетки и межклеточным пространством при их фазовом переходе из жидкого состояния в твёрдое. Ускорение охлаждения за счёт нарушение слоя инертного воздуха на поверхности охлаждаемого объекта воздействием ЭМ поля имеет пользу.
2.1 Соединения в тканях восприимчивые к ЭМ полю могут содержаться как внутри клетки, так и в межклеточном матриксе. Создаваемые ими акустические колебания при охлаждении и отогревании могут прямо влиять на кристаллизацию льда. Тут мы подходим к статьям Бишофа о применении ЭМ активных наночастиц в качестве агентов равномерного отогревания органов, в которых уже описан выраженный результат тут, тут и тут, а еще вот тут.
Как то так сводится что слабые магнитные поля и вода в криосохранении не имеют основной роли, и разные группы учённых разными путями с разных сторон подошли к ингибированию ре/кристаллизации льда путём воздействия на ЭМ чувствительные соединения вызывая в них колебания создающие акустические волны. Ну а что, разве это плохо? Инженерный подход к криопротекции теперь имеет более детальные очертания, а именно:
1. Даже в отсутствии насыщения ткани ЭМ чувствительными материалами в ней они и так есть, вопрос их количества и адаптации параметров ЭМ излучения.
2. ЭМ чувствительные соединения своими колебаниями создают акустические волны влияющие на ре/кристаллизацию льда.
3. Уровень насыщения внутреклеточной среды ЭМ чувствительными соединениями может быть альтернативой (если не заменой, то поводом снижения концентрации) токсичным проникающим криопротекторам такими как: DMSO, Глицерин, Этиленгликоль.
Оптимизировав сочетание инженерных и химических подходов к криопротекции, параллельно блокируя сигнальные пути апоптоза, считаю базой для более успешного и обратимого криосохранения. Выражаю огромную благодарность @daniildavydov10 за его новаторские идеи по подготовке органов, тканей и организмов к криосохранению.
Подписка на этот канал стимулирует генерацию новаторских идей
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
❤8💯2💊2
Вероятно человек в гавайской рубашке и насосом от хроматографа выглядит подозрительно. Служба безопасности московского метрополитена исправно работает, вежливо пригласили меня на рентген снимок. В этот раз аппарат был более новой модели, изображение более детальное.
Помимо насоса от ВЭЖХ в рюкзаке так же можно разглядеть микроманипулятор для инъекций в ооциты.
Повезло что в рюкзаке был включенный дозиметр, его лог видно на скриншоте из приложения.
Помимо насоса от ВЭЖХ в рюкзаке так же можно разглядеть микроманипулятор для инъекций в ооциты.
Повезло что в рюкзаке был включенный дозиметр, его лог видно на скриншоте из приложения.
❤10⚡3🤣2💊1
Эпигенетика наглядно. С наступлением осенней погоды и снижением температуры воздуха у моих крыс сфинксов начала расти шерсть на мордочке в виде маски. У других особей есть ирокезы и бакенбарды. Ставьте сердечки ❤️ в реакциях к посту если хотите больше фото оволосевших сфинксов😄
Думаю что таким крысам не хватает генов биолюминисценции...
Думаю что таким крысам не хватает генов биолюминисценции...
❤16
Оказывается можно купить за недорого серверную карту AMD Instinct MI50 с 32 GB быстрой HBM2 памяти, прошить BIOS от другой карты этой же архитектуры (на MI50 нет драйверов под Windows), и подключить к ноуту по Thunderbolt 4 через PCI-e туннелирование и это будет работать! Есть ли минусы? Да, только один: коту не нравится шум серверных кулеров. Я учёл его возмущение и установил регулятор оборотов, теперь не так шумно. Перед покупкой MI50 важно понимать что в ней отсутствуют штатные кулеры, отсутствует возможность подключения кулеров к самой карте, соответственно регулировки оборотов тоже нет. Кулеры нужны кастомные, запитываются от блока питания. Регулятор оборотов, будет весьма не лишним.
К сожалению не удалось установить ROCm, запуск LLM производится через Vulkan.
GPT-OSS 20B выдаёт 35 токенов/сек на Vulkan llama.cpp v1.47.0 beta.
Кто-то скажет что это старый хлам, и частично будет прав. Основной аргумент в пользу MI50: это самый доступный GPU на вторичном рынке с 32 GB !HBM2! памяти, цены начинаются от 22 000 руб. На площадках Китая можно найти дешевле. NVidia Тesla V100 32 GB на Авито от 80 000 руб.
Забавный факт: электронные компоненты на плате карты в простое не издают звуков. При отправке промпта и начале работы LLM слышны часто повторяющиеся высокочастотные звуки. LLM между собой отличаются по звучанию.
Ставьте реакции если вам нравятся посты о сладострастной технонекрофилии. До наступления зимы точно будет пост о сборке эмбриологического блока из советского стереомикроскопа и китайских микролитровых шприцов от ВЭЖХ.
К сожалению не удалось установить ROCm, запуск LLM производится через Vulkan.
GPT-OSS 20B выдаёт 35 токенов/сек на Vulkan llama.cpp v1.47.0 beta.
Кто-то скажет что это старый хлам, и частично будет прав. Основной аргумент в пользу MI50: это самый доступный GPU на вторичном рынке с 32 GB !HBM2! памяти, цены начинаются от 22 000 руб. На площадках Китая можно найти дешевле. NVidia Тesla V100 32 GB на Авито от 80 000 руб.
Забавный факт: электронные компоненты на плате карты в простое не издают звуков. При отправке промпта и начале работы LLM слышны часто повторяющиеся высокочастотные звуки. LLM между собой отличаются по звучанию.
Ставьте реакции если вам нравятся посты о сладострастной технонекрофилии. До наступления зимы точно будет пост о сборке эмбриологического блока из советского стереомикроскопа и китайских микролитровых шприцов от ВЭЖХ.
❤9👾4⚡2💯2👀2💊1