中文圈程序员的碎碎念
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嘿!你也来看码农又在写啥BUG了吗
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内容输出的变化历程也是成长之路

其实不算是两“周年”,已经两年多了,之前一直很忙没怎么更新,但是想了想,这一篇还是要写。

via JiaoYuan's blog
2024 假期总结

现在在火车上,从敦煌往南走的这条路上网络信号一直不太好,总是会没网,所以通常我也会下点单机游戏或者电影之类的在路上打发时间,今天正好把这一篇一直想写的博客写了,不过依旧是,在构思的时候总会想到很多,但是手放在键盘上准备写的时候又似乎开始词穷。

via JiaoYuan's blog
Arch 下的应用方案

Arch 滚起来爽,一直滚一直爽!虽说现在 Linux 生态还是不如 Windows,不过只要不用某些特别的专有软件(点名 Adobe 和 Autodesk)和工业软件,想要日常使用还是可以的,下面分享下我的应用方案。

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Bionanoaccess 安装

之前帮一位老师安装了 bionano,过程还是比较繁琐的,根据官网的安装文档进行了一些补充。

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2024 Summary

每年到这个时候总会感叹时间过的是真的快,今天是我的 22 岁生日,已经到了法定结婚年龄,但是我感觉我还是跟个孩子一样担不起事,反观我哥,在这个年纪已经当爹了都 …

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苦逼打工人返工了

本来此文是在敦煌返回成都的列车上写的,但是回成都后一系列事情搞得人身心俱疲,所以一直在拖,今天下午六点睡到九点多,想着把这些拖延的事情收个尾。

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Alphafold3 Usage

AlphaFold3 是 DeepMind 推出的新一代结构预测工具,也是今年的诺贝尔化学奖的成果之一。AlphaFold3 不仅支持蛋白质,还能预测 RNA、DNA 和小分子配体的复合体结构。本文将详细介绍 Alphafold3 的安装与使用。

via JiaoYuan's blog
《哪吒之魔童闹海》观后感

《哪吒之魔童闹海》快下映了,我们才去看。看之前不可避免地受到了舆论的影响,这两个月关于它的评论真的是无孔不入。

看过之后,Jasmine意犹未尽地向我诉说,这部电影的故事讲得好,特效也好看。不知道她是受影评的影响,还是发自内心的感受。

个人觉得这部电影的情节完整,几乎没什么硬伤,围绕主线讲述了「过三关」和龙族大战,人物符合本身性格,最后的反转也凸显了矛盾,看到了男主的成长,也探讨了世道不公。这是一个合格电影应该具备的基本品质,故事讲得完整,情节符合逻辑,看着不会让人觉得出戏和尴尬。

电影的特效有很大的提升空间,背景不是满屏的火红就是焦土黑,人物愤怒起来不是变红就是变大,最后的双方大战,也只是看到乌泱泱的点点,几乎没有打斗的特写。哪吒的战斗力忽高忽低,他师傅却没怎么战斗力,炼丹炉突然就破了,大魔王也一下就被打败了,谁胜谁败看起来是导演决定的,而不是由客观决定的。

这部电影还算好看,但远没有吹得那么好。

via 静风说 (author: Hillway)
顺式作用元件分析

顺式作用元件 (cis-acting element) 存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列。

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使用 HMMER 查找基因的同源序列

使用 HMMER 查找同源基因比 blast 更加准确,速度也更快,但使用方法很少有文章讲清楚,本文记录我使用 HMMER 的操作。

via JiaoYuan's blog
物种内共线性分析

共线性分析可以用 MCScanX 软件进行分析,但是这个软件的官网已经 404 了,而且利用命令行来进行分析比较麻烦,这里建议大家使用 TBtools 上的工具,这个软件里面集成了共线性分析的相关插件,并可以进行可视化操作,分析起来很方便。

via JiaoYuan's blog
完整的基因家族鉴定流程,包含基因家族鉴定和基因家族的性质分析、基因分析、进化分析等。

via JiaoYuan's blog
蛋白互作网络美化

String 数据库默认的图片并不是太美观,使用 Cytoscape 软件可以对其数据进行一些简单修改并对图片进行美化。

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TBtools 制作基因表达热图详解

使用 TBtools 制作基因表达热图实在是方便,美化起来也很简单,本文以水稻的一组基因为例,讲述基因表达数据的获取、处理并使用 TBtools 出图。

via JiaoYuan's blog
基因进化树的制作及其美化

Mega 默认导出的图片比较枯燥,并且展示的信息不够,本文讲述基因进化树的美化以及图片所展示的信息的一些处理。

via JiaoYuan's blog
学习如何在任何项目中使用 Tailwind CSS,即使不使用流行框架。本文深入探讨 Tailwind CSS 的工作原理,解释如何利用其 CLI 在任何环境中生成 CSS,并涵盖 Tailwind 4.x 的配置、黑暗模式、CSS 层等高级主题。 适合前端开发者和希望提升 CSS 工作效率的任何人。

via Usubeni Fantasy
关于博客更新的三两事

写博客这么久了,还是挺有感触的,记录一下写博客的一些经历。

via JiaoYuan's blog
社交媒体真的这么重要吗

今天无意中读到一篇文章 《People Without Social Media: Why They Don’t Use It》 感觉有点启发。

via JiaoYuan's blog
月末成都散心

借着导游证面试的机会,在成都呆了三天,算是散散心吧,前段时间一直很压抑,也总是心神不宁的,到成都与一位老同学一起玩了两天(朋友第二天才来),释放一下压力。

via JiaoYuan's blog