🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷
1.24K subscribers
386 photos
63 videos
184 files
201 links
🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷

✔️لینک گروه: https://t.me/computational_science_group
✔️لینک کانال: @Computational_sceince

@ammar_mohseni:ادمین✔️
✔️این شبکه وابسته به مرکز زیست محاسبات پویا می باشد
Download Telegram
Forwarded from JP
#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی
Defining the membrane disruption mechanism of kalata B1 via coarse-grained molecular dynamics simulation

مطالعات نشان داده است که مولکول kalata b1 مولکولی است که باعث اختلال غشاء می شود. در این مطالعه برای به دست آوردن درک مناسب و مکانیسم پروتئین KB1 از شبیه سازی داینامیک مولکولی دانه درشت استفاده شده است. این شبیه سازی در غلظت های مختلف مولکول KB1 صورت گرفت. دو پیکربندی از الیگومر KB1 تشخیص داده شد که شامل پیکربندی برج مانند و پیکربندی خوشه دیوار مانند است. اتصالات بین الیگومر دیوار مانند منجر به شکل گیری یک فضای توخالی در داخل خوشه KB1 در غشاء می شود.
@computational_science
Forwarded from JP
#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی

شکل زیر و قسمت ها a و b به صورت شماتیک نشان می دهد که الیگومر برج مانند و دیوار مانند به غشاء متصل شده اند. و همچنین در قسمت های c و d نیز نمای جانبی و بالایی الیگومر حلقه مانند مولکول KB1 را نشان می دهد. در این شکل و قسمت e مکانیسم تخریب غشاء توسط مولکول KB1 نشان داده شده است. شبیه سازی برای ما نشان داد که لیپیدهای غشایی نزدیک الیگومر حلقه مانند مولکول KB1 از غشاء خارج می شوند و وارد ساختار حلقه مانند در داخل مولکول می شوند.
@computational_science
Forwarded from JP
#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی

فعالیت تخریب کننده غشای مولکول KB1 به تغییرات جزیی در خواص اتصالی این مولکول به غشاء سلولی بستگی دارد. برای اینکه تغییرات تخریب غشاء به وسیله مولکول KB1 مورد بررسی قرار گیرد فاصله بین سرهای لیپیدی با مولکول COM در داخل غشاء محاسبه می شود. با توجه به شکل زیر قسمت a نتایج نشان داد که تخریب غشاء حتی زمانی که مولکول KB1 وجود ندارد نیز مشاهده می شود. با این حال نتایج بعدی که در شکل زیر نیز مشخص است نشان داد که ارتباط مستقیمی بین غلظت مولکول KB1 و تخریب غشاء وجود دارد.
@computational_science
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
#خبر این هفته
💠مایکروسافت می‌خواهد تا ده‌سال آینده سرطان را "درمان" کند!💠 👇👇


مایکروسافت از برنامه‌ی بلندپروازانه‌ای برای «درمان سرطان با دانش کامپیوتر تا ده‌سال آینده» خبر داده‌است.

گفتنی است پروژه‌های بلندپروازانه‌ی بسیار دیگری نیز در دل این برنامه نهفته است، یکی از گیراترین آنها این است که ایشان می‌خواهند رایانه‌های «دی‌ان‌اِی» بسیاربسیارریزی را بسازند که بتواند در بدن انسان زندگی‌کرده، سلولهای سرطانی را پاییده و سپس آنها را دوباره برنامه‌نویسی کند، به گونه‌ای که بیدرنگ به سلول‌های سالم تبدیل شوند.

"کریس بیشِپ" از بخش پژوهش مایکروسافت چنین می‌گوید: بسیار طبیعی است که مایکروسافت به دنبال چنین چیزی است، چون ما کارشناسان بسیار فراوانی در زمینه‌ی دانش رایانه داریم و آنچه در سرطان می‌گذرد یک چالش رایانشی(محاسباتی) است.

این تنها یک تشبیه نیست! یک دیدگاه ژرفِ ریاضی است. به نظر می‌آید که سنجش دانش‌های «بیولوژی» و «رایانش» باهم، مانند سنجش پنیر با گچ باشد، ولی این دو دانش پیوندهای بسیار ژرفی در بسیاری از زیرساخت‌ها باهم دارند.

چون تا کنون دیده نشده که مایکروسافت پایش را از دایره‌ی فراورده‌های الکترونیکی فراتر گذاشته باشد، برای همین ایشان برای رسیدن به این هدف گروهی از دانشمندان بیولوژِی و رایانه را از سراسر جهان گردآورده‌اند تا در زمینه‌های گوناگون سرطان بپژوهند.

هنوز جزییات این برنامه زیاد نیست، ولی یکی از گروهها با به‌کارگیری "یادگیری ماشین" و "بینایی رایانه"- که در آن رایانه ها از روی عکس‌ها و فیلم‌ها داده‌هایی را استخراج می‌کنند- به رادیولوژیستها درک بهتری از چگونگی پیشرفت تک‌تک تومورهای سرطانی در بیماران می‌دهند.
این می‌تواند به بازکردن دریچه‌ی تازه‌ای برای گسترش "پزشکی شخصی- ویژه‌ی هر بیمار" بیانجامد.
@computational_science

گروهی دیگر در این پروژه بر روی روش‌هایی کار می‌کنند که بتوانند بهترین نقشه‌ی حمله برای هر گونه از تومورها را جداگانه پیش ‌بینی کند.

همچنین یک گروه نیز بر روی ایده‌ی "سفر به ماه" کار می‌کنند تا بتوانند از «دی‌ان‌اِی DNA» رایانه‌هایی بسازند که سلول‌های سرطانی را پایش کرده و بر روی آنها از نو برنامه‌نویسی بکنند؛برنامه‌نویسی بر روی سلول‌های سرطانی در "درون" بدن

دیدگاه این است که هر بار که سلول‌های سرطانی در بدن رشد می‌کنند، رایانه خبردار شده و "سیستم را از نو راه‌اندازی کرده و سلول‌های بیمار شده را پاکیزه کند".

با وجود به کارگیری این همه روش‌های گوناگون، مایکروسافت می‌گوید که همه این پروژه‌ها-هر چقدر هم باهم فرق داشته باشند- از دو روش همسان از دانش‌های رایانه پیروی می‌کنند:
〽️ پردازش داده‌ها، و ، یادگیری ماشین. @computational_science

یکی از روش‌ها از این دیدگاهِ مایکروسافت ریشه گرفته که: سرطان و دیگر فرایندهای بیولوژیکی همانند سامانه‌های پردازش داده هستند.

با این دیدگاه، ایشان ابزارهایی چون زبان برنامه‌نویسی، کامپایلرها و مدل‌یاب‌ها(model checkers) را که در مدل و نتیجه‌گیری در فرایندهای رایانشی به کار می‌رود را برای فرایندهای بیولوژیکی نیز به کار برده‌اند.

به گفته‌ی این گروه، پژوهشگران با کاربرد "یادگیری ماشین" می‌توانند میلیونها و میلیونها پوشه از داده‌های بیولوژیکی را آنالیز کرده و روش‌های درمان تازه‌ای را گسترش دهند- کاری که تا کنون با دست انجام شده است.

"یادگیری ماشین" توانایی این را دارد که به فرایند درمان شتاب بالایی ببخشد، شتابی حتی بسیار بیشتر از آنی که می‌پنداریم.

به گفته‌ی "دیدید هکرمن" سرپرست گروه ژنومیک مایکروسافت، انقلابی در زمینه‌ی درمان سرطان در راه است.
حتی ده‌سال پیش نیز مردم اینگونه می‌پنداشتند که شما بافتهای سرطانی را درمان می‌کنید: اگر سرطان مغز بگیرید، درمان سرطان مغز انجام می‌دهید. اگر سرطان روده بگیرید، درمانی برای سرطان روده می‌گیرید.
اکنون ما حداقل این را می‌دانیم که بسیار مهم است که ژنومیک سرطان را درمان کنیم؛ سلول‌هایی را که در ژنوم به راهِ بد رفته‌اند.

با اینکه برنامه زمانی ایشان برای "درمان سرطان تا ده سال آینده " بلندپروازانه می‌نماید، بسیاری از پژوهشگرانی که در این پروژه کار می‌کنند آسوده‌خاطرند که این هدف دست‌یافتنی است.

به گفته‌ی دکتر "یاسْمین فیشر"، یکی از پژوهشگران این پروژه: اگر ما بتوانیم سرطان را کنترل‌کرده و قانونمندش کنیم، آن‌زمان سرطان مانند بیماری‌های مزمن می‌شود و دیگر درمان‌شدنی است. شاید برخی گونه‌های سرطان تا ۵ سال آینده نیز درمان شوند، یا در بدترین حالت تا ده سال آینده.

منبع :سایت پزشکان و قانون
@computational_science
باسلام خدمت اساتید و دوستان گرامی🌺🌺
نکاتی در زمینه معرفی برنامه هایی که در پیش گویی ژن و پروموتور های پروکاریوتی و یوکاریوتی استفاده میشوند خدمت بزرگواران ارایه میشود.

🔶🔷برنامه های پیش گویی ژن در سه گروه اصلی قرار میگیرند🔷🔶
۱ - الگوریتم های ازابتدا @computational_science
۲- مبتنی بر همولوژی
۳مبتنی بر توافق
🔴هدف برنامه های پیش گویی ژن ازابتدا ، تشخیص اگزون ها از مناطق غیرکدکننده و سپس اتصال اگزون ها بطور صحیح میباشد.
که دارای روش های متفاوتی میباشد :
الف) پیش گویی با استفاده از شبکه های عصبی
ب) پیش گویی با استفاده از آنالیز تفکیک کننده خطی (LDA) یا مربعی (QDA)
برنامه FGENES برنامه تحت وب هست و از LDA برای تعیین اینکه آیا یک سیگنال اگزون هست یا نه، استفاده میکند.
@computational_science
ج).پیش گویی با استفاده از HMM

برنامه GENSCAN برنامه ای تحت وب هست که براساس HMM درجه پنج استفاده میکند این برنامه پیش گویی را با ترکیب بسامد هگزامرها و سیگنال های کدکننده ( کدوم های آغاز ،جعبه TATA, محل های کلاهک گذاری ،دنباله پلی آدنینی و...) انجام میدهد. و برنامه های دیگر ...

۲_ برنامه های پیش گویی ژن مبتی بر همولوژی
برنامه های مبتنی بر همولوژی بر مبنای این واقعیت هست که ساختار و توالی اگزون ها در گونه های نزذیک بهم بسیار حفاظت شده است. زمانی که قالب های بالقوه کدکننده توالی مورد جستجو ترجمه میشوند و جهت انطباق با نزدیکترین همولوگ های پروتئینی در پایگاه داده استفاده میگردند، نواحی که انطباق خوبی دارند نشاندهنده مرز اگزون های توالی مورد جستجو هستند. در این برنامه ها فرض میشود که همه توالی های پایگاه داده صحیح هستند .و این تصور هم معقولی هست چرا که بسیاری از توالی های هومولوگی که باهم مقایسه میشوند از cDNA ویا قطعات توالی بیان شدن (EST) گونه های مشابه بدست آمده اند .این روش در کنار شواهد آزمایشگاهی ، شیوه نسبتا مناسبی برای یافتن ژن ها، در DNA ژنومی ناشناخته هست. اشکال این روش در اینجاست که اگر همولوگی در پایگاه داده پیدا نشود نمی‌توان از این روش استفاده کرد. در این راستا برنامه های متنوعی میبای بر همولوژی وجود دارد :👇👇
برنامه GenomeScan برنامه ای تحت وب هست که نتایج پیش گویی GENSCAN رو با جستجوهای تشابه BLASTX ترکیب میکند . کاربر محترم باید DNAژنومی و توالی های پروتئین گونه مورد نظر خودش رو آماده داشته باشد.سپس DNA ژنومی به همه ی شش قالب ترجمه میشوند تا اینکه همه ی اگزون های ممکن را پوشش بدهد و بعد اگزون های ترجمه شده با توالی های پروتئینی کاربر مقایسه می گردند.
برنامه EST2Genome نیز برنامه ای تحت وب هست و برای تعیین مرز اینترون - اگزون ، از انطباق توالی ها استفاده میکند.
برنامه SGP-1 برنامه ای تحت وب هست و مبتنی بر تشابه هست و توالی های DNA ژنومی دو موجود نزدیک بهم رو انطباق میدهد
برنامه TwinScan نیز یک سرور یافتن ژن مبتنی بر تشابه هست . این برنامه نیز همانند GenomeScan برای پیش گویی همه اگزون های محتمل توالی ژنومی از GENSCAN استفاده میکند .

✔️کانال و گروه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی رو به دوستانتان معرفی کنید.
https://telegram.me/joinchat/BP7D2zyFRAJTZgcOxXJA9A

@computational_science
🔶🔷پیش گویی پروموتورهای باکتریایی و یوکاریوتی 🔷🔶
@computational_science
برنامه BPROM برنامه تحت وب است که پروموتورهای باکتریایی را پیش گویی میکند . این برنامه از یک تابع تفکیک کننده خطی بهمراه سیگنال و اطلاعاتی نظیر توالی های پروموتور و ترکیب الیگونوکلئوتیدی مناطق پروموتور استفاده میکند.
@computational_science

برنامه Find Terrm برنامه ای برای جستجوی سیگنال های پایان مستقل از P باکتریایی است که در انتهای اپران قرار دارند این برنامه در سایت BPROM و FGENES در دسترس هست. در این سایت پیش گوی ها بر اساس تطبیق پروفایل های شناخته شده سیگنال های پایانی همراه با محاسبه انرژی ساختارهای دوم RNA بعنوان ساختار حلقه -سنجاق سر انجام میگیرد .
🔴ولی پیش گویی پروموتور و عناصر تنظیمی در یوکاریوت ها بیشتر براساس روش ازابتدا و براساس جستجوی انطباق توالی ورودی با الگوهای توافقی عناصر تنظیمی و پروموتورهای شناخته شده ، عمل میکند.
برنامه CpGProD برنامه ای تخت وب است و پروموتورهای دارای تراکم بالای جزایر CpG را در توالی های ژنوم پستانداران پیش گویی میکند.
@computational_sciencs
برنامه Eponine برنامه ای تحت وب است که پیش گویی نقاط رونویسی را براساس یک سری PSSMهای از پیش ساخته شده مناطق تنظیمی مانند جعبه TATA , جعبه CCAAT ویا جزایر CpG انجام میدهد.
و برنامه های دیگری نیز هرکدام با ویژگی های متعدد در پیش گویی پروموتور عبارتند از :
Cluster- Buster
Fire EF
McPromoter
TSSW
CONPRO
✔️گروه و کانال بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی رو به دوستانتان معرفی کنید
https://telegram.me/joinchat/BP7D2zyFRAJTZgcOxXJA9A

@computational_science
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
MD simulation using schrodinger desmond package
♦️ارسالی از همکارمحترم دکتر وحید زارع

🔶شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی🔷
@computational_science
دانلود Prezi Pro v6.12.1.0 - نرم افزار پرزی، ساخت ارائه‌ های جالب و تحسین‌برانگیز

راهنمای نصب
1- نرم افزار را نصب کنید.
2- در سایت Prezi.com یک اکانت بسازید.
3- فایل PreziNext.Windows.Core.dll را از داخل پوشه Cracked File کپی و در محل نصب نرم افزار جایگزین فایل موجود کنید.
4- نرم افزار رو به صورت Run as Administrator اجرا کنید و نام کاربری و رمز عبور خود در سایت Prezi.com را وارد کنید.

توجه:
این نرم افزار از زبان فارسی پشتیبانی نمی کند بنابراین هر متن فارسی خود را در قالب فایل pdf ذخیره کرده و سپس این فایل را در پرزی درج (insert) کنید.

همچنین از روش زیر می توانید برای فارسی نویسی مستقیم در Prezi استفاده کنید:
1- در محیط Prezi کلید های Crtl+Shift+Alt+C را بزنید، تا پنجره تنظیمات فونت باز شود.
2- در هر جا عبارتی شبیه:

@font-face
{
src: url('NotoSans-Regular.keg');

دیدید، به جای عبارت NotoSans-Regular.keg که در واقع نوع فونت از پیش تعریف شده است.
عبارت Arial.keg و یا Tahoma.keg را بنویسید، سپس Apply را بزنید تا تغییرات اعمال شود.
(اگر فونت در سیستم Prezi موجود نباشد به شما خطا داده می شود.)
3- وارد این صفحه شوید و متن خود را وارد کنید و خروجی را در Prezi وارد کنید.

تنها اشکال این روش تنوع پایین فونت ها هست ولی سرعت کار نسبت به حالت وارد نمودن PDF به مراتب بالاتر است.

http://cdn.p30download.com/?b=p30dl-software&f=Prezi.v6.12.1.0_p30download.com.part1.rar
http://cdn.p30download.com/?b=p30dl-software&f=Prezi.v6.12.1.0_p30download.com.part2.rar
http://p30download.net/userfiles/p/Prezi.v6.12.1.0.Cracked.File.Only_pd.zip

www.p30download.com🔑

موفق باشید.
حمید مصدقی
🔶🔹شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران 🔹🔶

به نام خدا

عرض سلام و تسلیت به مناسبت ایام شهادت سالار شهیدان و یاران باوفایش خدمت اساتید و دانش پژوهان گرامی

توفیق خدا شامل حال بنده شده تا با معرفی نرم افزار نمدی وقت شما سروران بگیرم
@computational_science
1-نرم افزار نمدی یک نرم افزار تحت ویندوز و با کاربری بسیار راحته و تمامی اپشنهایی که گرومکس و لمپس رو در خود دارد اما بسیار ملموستر
2-نمدی با VMDکاملا ست شده و شما میتوانید هر کمپلکسی رو براساس میدان بار چارم بسازید
3- نمدی همچون هر شبیه ساز دیگر تمامی فورس فیلدها را ساپورت میکند اما با چارم و امبر برترین کارایی را دارد
4- افرادی که با گرومکس کار میکنند بایستی دانش برنامه نویسی و با کدها اشنایی داشته، در حالیکه در نمدی شما براحتی باکس اب یون سایر مواد مدنظر در باکس قرار میدهید و حتی به راحتی چندین کمپلکس رو در هم ادغام و استفاد میکنید
5- ساخت ترکیبات جدید مثل داروها، پلیمرها، قندها و چربی ها براحتی انجام میگیرد
6- در صورت نیاز به محاسبات کوانتومی برای بارها و پارامترهای LJ، Van der Waals و .... رابط کاربری برای گوسین داشته و شما به راحتی محاسبات رو در گوسین انجام داده و نتایج را به محاسبات نمدی می اورید.
7- نمدی می توانند کمپلکس های بسیار پیچیده مثل فتوسنتز، کپسیدهای ویروسی، کانالی و غشایی ، گلیکوپپتیدی ویا هایپرژنومیکسی را شبیه سازی و محاسبات ترموسنسی، pH متری و ولتامتری را بازسازی نمایید.
8-انترکشنهای پلیمری-دارویی، پلیمری-پلیمری، و آنتی بادی کاملا ساپورت نموده و میدانهای بار و پارامترهای آنها در اختیار محققین قراردارد.
9- انالیزها در VMDبرعکس گرومکس کاملا گرافیکی بوده و خروجی منوها، فایلهایی حاوی دیتاهاست. البته VMDتراجکتوری های گرومکس امبر و لمپس را هم ساپورت میکند.
10- محاسبه کلیه انالیزها قابل انجام بوده و محققین میتواند با اشراف به نحوه ای کار تراجکتوری ها خود را انالیز نمایند.

✔️در پایان از مدیر محترم، اساتید و دانش پژوهان گرامی کانال و گروه 🔸 شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران 🔸کمال تشکر را داشته و خاطر نشان میکنم امید به خدا بعد از پایان دوره مقدماتی کارگاه نمدی، دوره های پیشرفته نمدی با رویکردی غشایی و کانالی که در دوره دکتری توسط اساتید خود Prof. Tajkhorshid (از نویسندگان نمدی) و Dr.kalani اموخته ام در خدمت دانشجویان بزرگوار باشم.

محمود جوکار

🔶🔹شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران 🔹🔶
@computational_science
مهندسی ژنتیک در راه تولید داروی مسکن: 🔸🔹

🔻باکتری E.coli با قابلیت ترشح thebaine طراحی شده است.🔺

♦️ژن تبایین که یک پیشساز مورفین است و در شیره خشخاش وجود دارد، در این باکتری وارد شده است.🔸🔹
Forwarded from عکس نگار
🔶🔹شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔹🔶
@computational_science
#خبر علمی

✔️‌نرم‌افزار اکسل علت «۲۰ درصد» از اشتباهات مقاله‌های علم ژنتیک!
اکسل مسبب بیست درصد از اشتباهات مقالات علمی مرتبط با علم ژنتیک است.

♦️مقاله‌ای به تازگی در مجله علمی ژنوم بایولوژی منتشر شد است که فرمت پیش‌فرض شده برنامه اکسل (که یکی از برنامه‌های اداری شرکت مایکروسافت است) را مسئول حدود بیست درصد از خطاهای موجود در مقالات علمی در علم ژنتیک می‌داند.

🔶پژوهشگران دریافته‌اند که این خطاها از آنجا ناشی می‌شوند که برنامه تصحیح خودکار (auto correcting) اکسل،نام‌های متداول ژن‌ها را به تاریخ یا عدد تبدیل می‌کند. از آنجا که هیچ راهی برای خاموش کردن این گزینه اکسل وجود ندارد، دانشمندان باید این خطاهای خودکار را به طور دستی درست کنند؛ کاری که بسیاری از آنها فراموش می‌کنند و در نهایت، مقاله با همان خطای درست نشده،‌ منتشر می‌شود.

🔷یک گروه استرالیایی که به بررسی خطاهای موجود در صفحات اکسل مقالات ژنتیکی پرداخته می‌گوید اگر برای پردازش داده‌های ژنتیکی از اکسل در همان فرمت اولیه و خودکارش استفاده شود، آن وقت نام ژن‌ها به تاریخ و همینطور اعداد عوض می‌شود.
@computational_science

🔶این گروه تحقیقاتی بیش از سی و پنج هزار صفحه اکسل متعلق به بیش از سه هزار و پانصد مقاله علمی منتشر شده در ۱۹ مجله متفاوت در سال‌های بین ۲۰۰۵ و ۲۰۱۵ در حوزه علم ژنتیک را بررسی کرد و به این نتیجه رسید که تقریبا یک پنجم تمام مقالاتی که از اکسل در آنها استفاده شده است، دارای خطا هستند.
@computational_science

به گزارش واشینتگن پست، اگر محققی نام ژن MARCH1 را در اکسل وارد کند و دکمه Enter را بزند، اکسل به طور خودکار این نام را به تاریخ یکم مارچ یا 1-MAR عوض می‌کند. اگر محقق در همان زمان متوجه این اشتباه بشود و دکمه Undo را بزند، نام اولیه باز نمی‌گردد بلکه اکسل عدد 42430 را جایگزین می‌کند. چرا که این عدد معادل همان تاریخ یک مارس در برنامه‌ریزی داخلی اکسل است.

🔶🔹شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔹🔶

@computational_science
✔️با ارسال این پست شبکه محاسباتی رو به دوستانتان معرفی کنید.🔸🔹🔶🔷
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
مروری بر بیو انفورماتیک.pdf
3.6 MB
🔶شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران 🔶
کتاب پروفسور علی کرمی
@computational_science
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
Nukleotide.pdf
580.2 KB
#طریقه گرفتن توالی ژن از NCBI
🔶شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران 🔶
@computational_science
Forwarded from عکس نگار
🔷🔸شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔸🔷
@computational_science

♦️#نرم افزار R ، محیطی قدرتمند برای تحلیل آماری می باشد که در چندین سیستم عامل مختلف قابل اجرا است. 🔸🔹🔶🔷

نرم افزار R بصورت رایگان در دسترس بوده و تحت پروانه ی عمومی همگانی، گنو (GNU) از بنیاد نرم افزارهای آزاد (Free Software Foundation) توزیع می گردد.
شما می توانید این برنامه را از شبکه جامع آرشیو نرم افزار R در (CRAN) دانلود نمایید.
باینری های آماده اجرای نرم افزار R برای سیستم عامل های ویندوز (Windows)، مک او اس ایکس (Mac OS X) و لینوکس (Linux) در دسترس می باشد.
کد منبع (source code) نیز قابل دانلود بوده و می تواند برای سیستم عامل های دیگر کامپایل شود.
نرم افزار R برای اولین بار به عنوان یک پروژه تحقیقاتی توسط راس ایهاکا (Ross Ihaka) و رابرت جنتلمن (Robert Gentleman) نوشته شد،
و در حال حاضر توسط گروهی از متخصصان علم آمار به نام "تیم هسته نرم افزار R" با صفحه ای در آدرس www.r-project.org در حال توسعه ی فعال می باشد.
@computational_science

نرم افزار R به گونه‌ای طراحی شده، که بی شباهت به زباننرم افزار S که توسط جان چمبرز (John Chambers) و دیگر افراد در آزمایشگاه‌های بل توسعه یافته بود نباشد.
نسخه ی تجاری نرم افزار S با قابلیتهای بیشتر، توسط موسسه ی علوم آماری به عنوان نرم افزار SPlus توسعه یافته و به بازار عرضه شده؛
بعدها این نسخه نرم افزار SPlus، توسط شرکت Insightful خریداری شده و اکنون نیز متعلق به TIBCO Spotfire می باشد.
✔️نرم افزار R و نرم افزار SPlus را می توان به عنوان دو پیاده‌ سازی زبان نرم افزار S در نظر گرفت.
🔷🔸شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔸🔷
@computational_science
R Programming for Bioinformatics Gentleman.pdf
2 MB
🔶شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔶

@computational_science
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
🔶🔹شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔹🔶

@computational_science
♦️#بررسی اجمالی زبان برنامه نویسی پایتونpythone

زبان پایتون یک زبان برنامه نویسی اسکریپتی ، سطح بالا ، تفسیری ، تعاملی و شی گرا می باشد .

✔️زبان پایتون ، تفسیری است
✔️زبان پایتون ، تعاملی است
✔️زبان پایتون ، شی گرا است
✔️زبان پایتون ، زبانی برای مبتدیان است

زبان برنامه نویسی پایتون توسط " گیدو ون روسوم " در اواخر دهه هشتاد و اوایل دهه نود در موسسه ملی تحقیقات ریاضی و رایانه ( CWI ) در هلند توسعه یافت .

ویژگی های برجسته زبان برنامه نویسی پایتون عبارتند از

✔️یادگیری آسان
✔️خوانده شدن آسان
✔️نگهداری و تغییر آسان
✔️دارا بودن یک کتابخانه گسترده استاندارد
✔️حالت تعاملی
✔️قابل حمل بودن
✔️توسعه پذیری
✔️دارا بودن پایگاه های داده
✔️برنامه نویسی رابط گرافیکی کاربر - GUI
✔️مقیاس پذیری

دسترسی به زبان برنامه نویسی پایتون🌐

به روزترین و رایج ترین سورس کد ، باینری ها ، مستندات ، اخبار و غیره در وب سایت رسمی زبان پایتون در دسترس می باشد :

وب سایت رسمی زبان برنامه نویسی پایتون : http://www.python.org

شما می توانید مستندات زبان برنامه نویسی پایتون را از سایت زیر دانلود نمایید . اسناد در فرمت های HTML ، پی دی اف ، و پست اسکریپت موجود می باشند .

🔶🔹شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔹🔶
اولین شبکه محاسباتی ایران
@computational_science

وب سایت اسناد زبان پایتون : http://www.python.org/doc
Tim_J_Stevens,_Wayne_Boucher_Python.pdf
7.7 MB
🔶شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔶

@computational_science