🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷
1.24K subscribers
386 photos
63 videos
184 files
201 links
🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷

✔️لینک گروه: https://t.me/computational_science_group
✔️لینک کانال: @Computational_sceince

@ammar_mohseni:ادمین✔️
✔️این شبکه وابسته به مرکز زیست محاسبات پویا می باشد
Download Telegram
صفحه ورودی پایگاه PubMed Central Canada
Forwarded from Deleted Account
گزارش مجله‌ی #ساینس از بازار خرید و فروش مقالات و پایان‌نامه‌های دانشگاهی در ایران. sciencemag.org/news/2016/09/shady-market-scientific-papers-mars-iran-s-rise-science
« اگر پایان‌نامه‌ی شما کار آزمایشگاهی لازم نداشته باشد 1.8 میلیون تومان (600$) + 400$ هم اگر مقاله منتشر شده در ژورنال بخواهید»

«تخمین زده میشود که سالانه 5000 پایان نامه دانشگاهی در دوره فوق لیسانس و دکترا از چنین بازاری خریداری می‌شود»

« یکی از فروشندگان میگوید بهای هرمقاله‌ی ISI حداقل 5 میلیون تومان (1660$) است.دیتاها معتبرند و متخصص هر رشته مقاله را تایید میکند»

«رشد این بازاراصلا عجیب نیست. کار، کم است و به‌همین‌دلیل، فارغ التحصیلان جوان به سمت کسب‌و‌کار مقاله و پایان‌نامه روی می آورند»
«ساینس» به نقل از یکی از دانشگاهیان «مدرک‌گرایی مسئولان سیاسی و نیازشان به پایان‌نامه ومقاله» را عامل دیگر تقویت این بازار ذکر کرده است
Forwarded from JP
#طراحی پپتید
Peptide therapeutics: current status and future directions:
بیش از ۷۰۰۰ پپتید به طور طبیعی شناسایی شده اند که نقش های فیزیولوژیکی مهمی در بدن از جمله به عنوان هورمون ها، انتقال دهنده های عصبی ، عوامل رشد، کانال های یونی و لیگاند را دارند. استفاده از پپتیدها به عنوان دارو دارای یک سری مزیت ها و همچنین دارای یک سری معایب نیز است. از جمله نقاط ضعف پپتید ها پایداری شیمی-فیزیکی این مولکول ها و همچنین پایداری کم این مولکول ها در گردش خون است. با این حال امروزه با استفاده از اصول بیوشیمی و همچنین بیوانفورماتیک خیلی از معایب پپتیدهای دارویی برطرف شده است. شکل زیر به طور خلاصه ویژگی های پپتیدها را نشان می دهد.
@computational_science
Forwarded from JP
#طراحی_پپتید

در طول دهه گذشته پپتیدها طیف گسترده ای از برنامه های کاربردی پزشکی و بیوتکنولوژی را شامل شده اند. یک مثال بارز از پزشکی مبتنی بر پپتید استفاده از پپتیدها در درمان سرطان پروستات است. استفاده از داروهای پپتیدی برای کشور امریکا باعث مقدار زیادی صرفه جویی در هزینه داروها شده است.تازه ترین نمونه های کلاس دارهایی پپتیدی شامل پپتید گلوکاگون-۱ و آگونیست هایی برای درمان دیابت نوع ۲ است. همانطور که بیان شد پپتیدها که به عنوان دارو استفاده می شوند دارای یک سری نقاط ضعف هستند که باید برطرف شود. یکی ار این روش ها روش سنتی است که به صورت شماتیک در شکل زیر مشخص است. این شکل به صورت شماتیک نشان می دهد که برای تبدیل یک پپتید معمولی که در داخل بدن دارای عملکرد است به یک پپتید دارویی چه اقداماتی باید صورت گیرد.
@computational_science
Forwarded from JP
#طراحی_پپتید

با این حال تلاش ها برای بهبود و طرح روش هایی که به طراحی پپتید منجر می شد همچنان ادامه دارد. برای کسب اطلاعات بیشتر می توان مقاله مربوطه را مطالعه کرد.
@computational_science
📣دوستان لطفا صبور باشید
اعضا به 1.8k 😉برسه فیلم های اموزش اختصاصی نرم افزارهای بیوانفورماتیکی به زبان فارسی به صورت رایگان قرار داده میشه📣😊😊
پس لطفا شما هم مارو همراهی کنید و امار رو بالا ببرید
تا اون موقع کتاب های اموزشی میذارم
چون خیلی ها نیاز دارن....
دوستان ما به حمایت شما نیاز داریم. حمایت شما فقط با ارسال این پیام برای دوستان خود است. با همکاری صمیمانه خود دانشجویان و علاقمندان به حوزه بیوانفورماتیک رو مطلع کنید تا اونا هم از مطالب ما استفاده کنن و مجبور نباشن برای یادگیری یه سری مطالب کلی هزینه به افراد سودجو بدن
https://telegram.me/computational_science

باتشکر از همه دوستان
اینم از کانال ویدیویی ما
Www.aparat.com/rasouli453
Forwarded from Deleted Account
همه کاربران لینوکس میدونن که دستور vim و nano از بهترین و پرکاربردترین دستوراتی هستند که از طریق آنها می توان محتوای خط فرمان را ویرایش نمود. استفاده از این دو کامند بستگی به نظر کاربر دارد. بعضی از کاربران تمایل دارند با دستور vim کار کنند و بعضی دیگر nano را در ارجحیت قرار می دهند. توصیه ما به شما اینه که با توجه به ساده تر بودن دستور nano در مقایسه با vim برای شما که تازه میخواهید در محیط لینوکس کار کنید از این دستور استفاده کنید. مثلا اکر بخواهید در یک فایل متنی در خط 123 آن یک بخشی را ویرایش کنید با تایپ عبارت زیر در ترمینال می توانید به راختی به این بخش دسترسی پیدا نمایید و قسمت دلخواه را ویرایش کنید.
vim +123 filename.txt

دقت داشته باشید که گزینه filename نام فایل شماست که بایستی عبارت صحیح مربوط به آن را هنگام تایپ دستور در این قسمت وارد کنید. برای کسب مهارت در رابطه با دستورات ذکر شده اکنون سیستم عامل خود را باز کنید و با تایپ دستورات بالا در ترمینال خود دستورات مورد نظر را اجرا کنید تا به درستی مطالب موردنظر برای شما قاب تفهیم باشد. سایر دستورات در پست بعدی ذکر می شود.
🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪
انتشار این مطلب بدون ذکر منبع شرعا حرام است و پیگرد قانونی دارد
🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪🔪
Forwarded from JP
#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی
Molecular Dynamics Simulation - Peptide Surface Interactions
مطالعه تعامل ها و اینترکشن های سطح پروتئین یکی از موضوعات مهم در زمینه ایمپلنت( implants) و زیست مواد است. اطلاعات و داده های کمی در مورد جزئیات مولکولی در رابطه با کنترل رفتار در جذب پروتئین ها و پپتیدها است. درک اینکه پپتیدها و پروتئین ها چگونه با سطح ایمپلنت( implants) تعامل برقرار می کند در طراحی دستگاه های پزشکی بسیار هائز اهمیت است. همچنین این زمینه برای پیش بینی رفتار پروتئین ها در حلال ها بسیار مفید است. به منظور بررسی قابلیت جذب پپتیدها و پروتئین ها از شبیه سازی استفاده شده است و انرژی آزاد جذب (ΔGads) به دست می آید. شبیه سازی با استفاده از برنامه charmm و فورس فیلد host-guest peptide به همراه توالی TGTG-X-GTGT صورت گرفت.
@computational_science
Forwarded from JP
#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی
به طور خاص نتایج به دست آمده از شبیه سازی با استفاده از CHARMM نشان می دهد که قدرت جذب سطحی در پپتیدها و پروتئین ها بیشتر بستگی به قدرت سطوح آبگریز و بارمثبت دارد. این نتایج باعث تکامل و راه اندازی یک میدان نیرو برای شبیه سازی رفتار جذب پروتئین ها می شود. در حال حاضر با استفاده از نتایج حاصل از این تحقیق یک میدان نیروی سطحی همراه با CHARMM به وجود آمده است که میدان نیروی " dual force-field simulation engine نامیده می شود.
@computational_science
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
🔸🔹🔶🔷@computational_science 🔸🔹🔶🔷

یک مقاله جدید در روز گذشته (21 سپتامبر 2016) منتشر شد: بر روی امنیت محصولات تراریخته یا مهندسی شده (GMO)

بیولوژی محاسباتی بحث روز است، بخصوص در مواردی که به سلامت انسان کمک می کند.

با استفاده از شبیه سازی و بکارگیری الگوریتم های خاصی، پیش از اینکه هزینه های هنگفت آزمایشگاهی هدر شود، با کارایی بالا صحت مطالعات پیشبینی می شود.

این مقاله برای افرادی که در حیطه بیوتکنولوژی کار میکنند ، خصوصا بیوتکنولوژی صنایع غذایی می تواند ایده های نوینی بهمراه داشته باشد. لینک فایل پی دی اف در لینک زیر موجود است:

http://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-016-1256-6
🔸🔹🔶🔷@computational_science 🔸🔹🔶🔷
مقاله دانلود شده خدمت همراهان همیشگی ما 👇👇👇