🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷
1.24K subscribers
386 photos
63 videos
184 files
201 links
🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷

✔️لینک گروه: https://t.me/computational_science_group
✔️لینک کانال: @Computational_sceince

@ammar_mohseni:ادمین✔️
✔️این شبکه وابسته به مرکز زیست محاسبات پویا می باشد
Download Telegram
#بیوانفورماتیک
تشخیص تعامل های پروتئین-پروتئین با استفاده از استراتژی های جدید بیوانفورماتیکی

یکی از راه های تشخیص اساس مولکولی بیماری ها و ناهنجاری ها بررسی اینترکشن ها و تعاملات پروتئین-پروتئین است. برای مثال یک گام مهم و اساسی برای درک پیچیدگی عفونت های ویروسی درک فعل وانفعالات بین پروتئین های ویروسی است. ویروس هرپس انسانی پاتوژن گستره انسانی در سراسر جهان است. با وجود تلاش فراوان در دهه گذشته، همچنان جزئیات مولکولی این ویروس مشخص نیست. یکی از اقدامات جدیدی که صورت گرفته است این است که یک پایگاه جدید برای اینترکشن ها و تعاملات پروتئین-پروتئین برای پروتئین های درونی ویروس هرپس در نظر گرفته شده است.
@computational_science

در تحقیقی جدید که اخیرا صورت گرفته است پایگاه داده ی HVint معرفی شده است که یک پایگاه داده یکپارچه و منسجم برای داده تعاملات مولکولی برای ویروس HSV-1 است. این پایگاه داده شامل اینترکشن های تجربی تشخیص داده شده در گونه های مختلف HSV-1 است. در این پایگاه داده تعاملات با استفاده از امتیاز بندی تنظیم شده اند. به همین خاطر این پایگاه داده یک منبعی است که می توان اولویت تعاملات برای تست های تجربی انجام داد. شکل زیر تعاملات مولکولی پروتئین-پروتئین که با استفاده از این پایگاه داده به دست آمده است را نشان می دهد.
@computational_science

مزیت این نقشه اینترکشن های پروتئینی که اینترکتوم نامیده می شود این است که به راحتی می توان از روی آن ارتباط بین پروتئین های ویروس را مشاهده کرد و در صورت نیاز پروتئین هایی را که نیاز است مورد دستکار قرار داد. علاوه بر این پروتئین ها را بر اساس اهمیت اشان تقسیم بندی کرد که در این تصویر نیز پروتئین های مذکور به ۵ دسته مختلف تقسیم شده اند.
@computational_science
Forwarded from JP
#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی
A coarse grained molecular dynamics study on the structure and stability of small-sized liposomes

یکی از کاربردهایی شبیه سازی داینامیک مولکولی دارد، شبیه سازی سیستم هایی مثل لیپوزوم های زیستی هستند که به عنوان حامل برای داروهای زیستی مورد استفاده قرار می گیرند. لیپوزوم ها در محیط آبی تمایل دارند که به صورت خودتجمعی تشکیل ساختارهای کروی را می دهند که این ساختارهای کروی می توانند به عنوان حامل مواد دارویی استفاده شوند. از آنجایی که لیپوزوم ها از مولکول های زیست سازگار در داخل بدن مثل لیپیدها و دترجنت ها تشکیل می شود، زیست سازگار هستند. نکته ای که قابل ذکر است این است که ساختار هندسی و پایداری حرارتی لیپوزوم ها تحت تاثیر نوع مولکول های لیپید در ساختار خود است. به همین خاطر در این تحقیق ۸ نوع از لیپیدها برای بررسی تاثیر آنها در شکل گیری و پایداری لیپوزوم ها مورد استفاده قرار گرفتند. شکل زیر نمایی از لیپیدهایی که به صورت دانه درشت در این تحقیق مورد استفاده قرار گرفتند را نشان می دهد.
@computational_science
Forwarded from JP
#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی

سپس این لیپید های مذکور در محیط شبیه سازی با غلظت مناسب قرار گرفتند. این لیپیدها در دو دمای ۳۱۰ و ۳۶۰ درجه کلوین مورد شبیه سازی قرار گرفتند. که در شکل زیر نیز مشخص است. و در نهایت آنالیزها نشان داد که لیپوزومی که از لیپید DMPC تشکیل شده است تمایل مناسبی برای تشکیل ساختار کروی دارد. ونتیجه دیگری که به دست آمد به این صورت است که همه ی این لیپوزوم ها که از لیپیدهای نام برده شده ایجاد شده اند در دمای ۳۶۰ درجه کلوین پایداری دمایی مناسبی را دارند. برای مطالعه بیشتر می توانید مقاله مورد نظر، که عنوان آن در اینجا آمده است را مورد مطالعه قرار دهید.
@computational_science
Forwarded from Deleted Account
📣چگونه در یک مقاله عکس های فتوشاپی یا ویرایش شده را تشخیص دهیم؟📣
17 آگوست -2016
👌یکی از مهمترین مواردی که همواره دغدغه داوران و بسیاری از ویراستاران ژورنال های معتبر دنیا می باشد این است که ابزاری در اختیار داشته باشند که بتوانند به راحتی عکس های ادیت شده را از موارد اورجینال شناسایی نمایند. در این تاپیک نرم افزار izitru را به شما همراهان گرامی معرفی میکنیم. این نرم افزار که از محیط کاربری ساده برخوردار است شما را قادر می سازد به راحتی تمامی عکسهای تقلبی را از عکس های اورجینال تشخیص دهید. این نرم افزار تحت وب بوده و فقط کافی است عکس خود را در آن بارگذاری کنید. به راحتی می توانید در این نرم افزار مشخصات اخرین ویرایشی که بر روی عکس اپلود شده صورت گرفته است را مشاهده نمایید
برای دسترسی به این نرم افزار بر روی لینک زیر کلیک کنید
👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿👇🏿
https://www.izitru.com/
👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆
از طریق لینک زیر به این سایت علمی-ویدئویی بپیوندید. http://scivideos.com/#signup و لینک خود سایت: www.scivideos.com
Forwarded from Deleted Account
http://www.thesaurus.com/browse/suggest
📣وبسایتی جامع برای شناسایی انواع فعل ضمیر اسم و... از یک واژه انگلیسی. با یک جسجوی ساده واژه دلخواه خود را پیدا کنید. دانشجویانی که برای نگارش مقالات خود نیاز به استفاده مداوم از دیکشنری دارند، این وبسایت جایگزین مناسبی برای کارهای آنها خواهد بود و به راحتی می توانند از آن استفاده کنند.
💉🚑💊 🍀 🍀 🍀
👍مزایای این وبسایت👍
1- مشاهده مترادف ها و متضادها
2-شناسایی اقسام مختلف یک کلمه لاتین
3- شناسایی ریشه-های فعل و ضمایر
4-ارزیابی قسمت های مختلف کلمه
5-تعیین سطح پیچیدگی واژه های ارائه شده
6- ارائه تلفظ دقیق هر واژه
و....
متاژنوم و پزشکی فرد محور
هر فردی دارای توالی منحصربفرد DNA ژنومیک و همچنین توالی ژنی مربوط به ارگانیسم های مختلف(باکتری،قارچ،ویروس و ...) میباشدکه متاژنوم نام دارد. مطالعه فلور یعنی طیف گسترده ای از میکروارگانیسم های ساکن بخش های مختلف بدن انسان، نقش بسیار مهمی در تحقیقات متاژنومیک دارد. با مطالعه فلور روده بیماران ممکن است میکروارگانیسم های مرتبط با یک بیماری مثل دیابت یا استعداد ابتلا به یک بیماری خاص شناسایی گردد. متاژنوم می تواند اساس استفاده از تکنیک های پزشکی فردمحور و توسعه داروهای جدید در آینده باشد!!!
محققان دانشگاه ITMO یک برنامه نرم افزاری بنام MetaFast طراحی کرده اند که امکان مقایسه سریع DNA میکروارگانیسم های زنده در ریزمحیط های متفاوت را میدهد. بااین الگوریتم میتوان به آسانی میکروبیوم یک انسان سالم و یک بیمار را مقایسه کرد و جالبتر ازاین امکان شناسایی پاتوژن های ناشناخته نیز وجوددارد که این دستاورد میتواند کمک بزرگی برای پزشکی فردمحور باشد.
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2016/06/16/bioinformatics.btw312

@computational_science
برای یادگیری بهتر اجزای سلول های زیستی (اعم از باکتریایی و گیاهی و جانوری) می توانید به وبسایت
http://www.sheppardsoftware.com/health/anatomy/cell/index.htm
مراجعه کنید.
@agrobiotechnologist
ابزار مشاهده و انالیز ساختارهای پروتئینی:
💘👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇💘
Forwarded from Deleted Account
ابزار انالیز ساختمان پروتئین.rar
23.7 MB
ابزار مشاهده و انالیز ساختمان پروتئین
#رمز_فایل:1234
این نرم افزار رایگان است و در دو نسخه MAC و PC در این فایل فشرده قرار داده شده است
برای مشاهده فایل فشرده ابزار مشاهده و انالیز ساختمان پروتئین نرم افزار زیر را بر روی سیستم خود نصب نمایید
💘👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇💘
Forwarded from Deleted Account
rar.rar
4.1 MB
ابزار فشرده ساز Winrar
Forwarded from Deleted Account
Setup.exe
4 MB
نرم افزار برطرف کننده خطاهای dll در سیستم عامل ویندوز