#خبر_ویژه فیلم آموزشی نرم افزار GROMACS @computational_science لطفا کسانی که درخواست فیلم آموزشی دارند حتما تو سایت هم ثبت نام کنند.
www.zistpooya.com/index.php/shop

لطفا کسانی که درخواست فیلم آموزشی دارند حتما تو سایت هم ثبت نام کنند.

تبلیغ عالی و خلاقانه PCR توسط کمپانی Bio-Rad
http://www.cnpg.com/video/flatfiles/539/

دانلود کتاب:
پروتئومیکس گیاهی: تکنیک ها، استراتژی ها و کاربردها
Plant Proteomics. Technologies, Strategies, and Applications (Ganesh K. Agrawal; 2008) $200
این کتاب شما را با تکنیک ها و روش های مورد نیاز برای مطالعه پروتئومیکس گیاهی آشنا خواهد کرد. اطلاعاتی در مورد مطالعات پروتئومیکس در آرابیدوپسیس، برنج، حبوبات و اطلاعاتی در مورد فن آوری های رایج مانند طیف سنجی جرمی و الکتروفورز ژل، راه های بیان پروتئومیکس، پروتئومیکس کاربردی، پروتئومیکس ساختاری، بیوانفورماتیک، درک اینکه چگونه انجام مطالعات پروتئومیکس در کشورهای در حال توسعه و آزمایشگاه های با کمبود بودجه باید انجام بگیرد و دسترسی به دستورالعمل ها برای آماده سازی نمونه...👇👇👇
@comoutational_science

Databases and tools

🌐 A list of 10 major online Proteomics databases and tools

1⃣ ExPASy Proteomics Resources:
http://www.expasy.org/proteomics

2⃣ EMBL-EBI Protein Services:
http://www.ebi.ac.uk/services/proteins

3⃣ NCBI Protein Services:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/proteins/

4⃣ RCSB PDB:
http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

5⃣ The Human Protein Atlas:
http://www.proteinatlas.org/

6⃣ GeneBio:
http://www.genebio.com/

7⃣ PredictProtein:
https://www.predictprotein.org/

8⃣ PEDANT:
http://pedant.gsf.de/

9⃣ SCOP2:
http://scop2.mrc-lmb.cam.ac.uk/

🔟 ModEval Model Evaluation Server:
http://modbase.compbio.ucsf.edu/evaluation/

@computarional_science

نرم افزار SAS مخفف Statistical Analysis System و به‌معنی سامانه‌ی تجزیه و تحلیل آماری است. نرم‌افزار SAS یکی از تخصصی‌ترین برنامه‌های آماری است که سرعت و قدرت پردازش اطلاعات در آن به‌شکل محسوسی نسبت به نرم‌افزارهای آماری مشابه بالاتر است و از این رو بهترین گزینه برای کارهای تخصصی آماری که داده‌های پیچیده و گسترده‌ای دارند می‌باشد. از طریق واسط گرافیکی این نرم‌افزار، تمام کارها انجام نمی‌گیرد و برخی از اعمال، نیاز به برنامه‌نویسی دارند...
@computational_science

نرم افزار SAS JMP Statistical Discovery
نرم افزار JMP که نسخه تجاری نرم افزار SAS می باشد و دارای امکانات بسیاری می باشد اما مهمترین مزیت آن نسبت به SAS را میتوان راحتی کار با نرم افزار، یاد گیری راحت و خروجی بسیار زیبای آن نام برد به صورتی که می تواند بعد از تجزیه آماری، جداول و نمودارهای خروجی بسیاری را نشان دهد.
از جمله ویژگی های این نرم افزار:
تجزیه داده های آماری
رگرسیون
کلاسترینگ
تجزیه عامل و تجزیه فاکتور
سری زمانی
و غیره
تمامی کارهای آماری را به سادگی و در کمترین زمان ممکن انجام می دهد. با کمی حوصله و تمرین می توانید کار با این نرم افزار را فرا بگیرید.
لینک دانلود نرم افزار SAS JMP Statistical Discovery 11:
http://dl.downloadly.ir/Files/Software/SAS_JMP_Statistical_Discovery_11.0_Downloadly.ir.rar
@computational_science

🔻برای بدست آوردن خواص فیزیکو شیمیایی اسید های آمینه از دیتابیس های AAindex و APDbase
http://www.genome.jp/aaindex/
http://www.roskamps.com/bioinfo/APDbase/APDbase.php

همچنین از طریق دیتابیس Catalytic Site Atlas می توان به اطلاعات اکتیو سایت آنزیم ها دسترسی پیدا کرد.🔺
https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/

@computatinal_sciense

کتاب فوق العاده زیبا و کاربردی در مورد آنالیز بیوانفورماتیک مولکول RNA 🖕🖕🖕

مرکز زیست محاسبات پویا
آدرس کانال ߑ
@computational_sciencs

🇮🇷🇮🇷🇮🇷معرفی فناوری زیستی با حضور بزرگان صنعت زیستی در ایران 🇮🇷🇮🇷🇮🇷🇮🇷🇮🇷🖕🖕🖕

@computational_science

آموزش دریافت ژن از NCBI :
1- ورود به سایت http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2-تنظیم جستجوگر بر روی gene
3- ورود به صفحه نتایج
4- دریافت اطلاعات ژن
5- دریافت اطلاعات توالی
آموزش تصویری :
👇👇👇👇👇
@computational_science

#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی
Molecular dynamics simulation of nanoindentation of Fe3C and Fe4C
عناصر کمیاب در بدن نقش های مهم و حیاتی دارند. مثلا Iron carbides به عنوان سنسور، کاتالیست و تشخیص های مولکولی و هماهنگ کردن مسیرهای سلولی نقش دارند. لذا این اهمیت و ساختار کوچک این اتم های فلزی نیاز است به صورت تئوری مورد بررسی قرار گیرند. به همین خاطر یکی از کاربردهای شبیه سازی داینامیک مولکولی بررسی یون ها و فلزهای کمیاب در بدن است. با توجه به اینکه تشخیص در حد نانو در حالت تجربی و آزمایشگاهی بسیار هزینه بر و پیچیده است، استفاده از شبیه سازی داینامیک مولکولی در این حیطه اطلاعات قابل اعتمادی را در مقیاس زمانی کم والبته با هزینه کمتر ارائه می دهد. به طور معمول از نرم افزار LAMMPS برای شبیه سازی فلزها و ذرات نانویی در داخل بدن استفاده می شود و از نرم افزارهای VMD و OVITO برای مشاهده کردن ساختار سه بعدی این ذرات استفاده می شود.
@computational_science

#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی
برای مثال شکل زیر شبیه سازی اتم های فلزی را در کنار یک تشخیص دهنده (IDENTOR) نشان می دهد که با استفاده نرم افزار LAMMPS صورت گرفته است. در این شبیه سازی برای اینکه تاثیر تشخیص دهنده بر ری اتم ها مشخص شود اتم ها را در گروه های مختلفی تقسیم بندی شده اند. در واقع در این شبیه سازی اتم های فلزی که قرار است مورد بررسی قرار بگیرند در داخل جعبه شبیه سازی تثبیت می شوند.
@computational_science

#کاربردهای_شبیه_سازی_دینامیک_مولکولی
البته اتم های فلزی که در بخش های رویی جعبه قرار دارند امکان حرکت و جابجایی در جعبه را دارند. مولکول تشخیص دهنده در معرض این اتم های متحرک قرار می گیرد و با میانکنش و ارتباطی که با این اتم ها برقرار می کند در بررسی عملکرد و ویژگی اتم ها نقش دارد و اتم های فلزی که درر لایه های زیرین قرار دارند به صورت حالت تثبیت شده هستند و باعث ثابت شدن اتم های لایه ای بالاتر می شوند.
@computational_science