Forwarded from Pharmatech🌿
Forwarded from Pharmatech🌿
Jeremy_Ramsden_auth_Bioinformatics_.pdf
4.9 MB
#اخبار_علمی
طراحی غشاهای اسمز معکوس) (Reverse Osmosis Membranesبا استفاده از دینامیک مولکولی
به طور کلی غشاهای اسمز معکوس غشاهای هستند که نسبت به غشاهای معمولی نفوذپذیری آب در آن ها ده برابر بیشتر است.امروزه تحقیقات در زمینه طراحی غاشاهای با سیستم اسمزی معکوس در مقایسه با غشاهای طبیعی به یک بحث داغ در زمینه شبیه سازی داینامیک مولکولی تبدیل شده است. به طور کلی کاربرد اصلی که این سیستم می تواند برای نسل های آینده داشته باشد این است به صرف انرژی کمتری در زمان کوتاه می تواند برای ما آب تمیز تولید کند.لذا با استفاده از شبیه سازی داینامیک مولکولی و طراحی مولکولی در سطح نانو میتوان به راحتی غشاهای اسمز معکوس را مورد بررسی و مطالعه قرار داد.
@computational_science
طراحی غشاهای اسمز معکوس) (Reverse Osmosis Membranesبا استفاده از دینامیک مولکولی
به طور کلی غشاهای اسمز معکوس غشاهای هستند که نسبت به غشاهای معمولی نفوذپذیری آب در آن ها ده برابر بیشتر است.امروزه تحقیقات در زمینه طراحی غاشاهای با سیستم اسمزی معکوس در مقایسه با غشاهای طبیعی به یک بحث داغ در زمینه شبیه سازی داینامیک مولکولی تبدیل شده است. به طور کلی کاربرد اصلی که این سیستم می تواند برای نسل های آینده داشته باشد این است به صرف انرژی کمتری در زمان کوتاه می تواند برای ما آب تمیز تولید کند.لذا با استفاده از شبیه سازی داینامیک مولکولی و طراحی مولکولی در سطح نانو میتوان به راحتی غشاهای اسمز معکوس را مورد بررسی و مطالعه قرار داد.
@computational_science
#نرم_افزارهای_مفید
نرم افزار جدیدی که امکان شبیه سازی داینامیک مولکولی برای سیستم های بزرگ شبیه سازی را فراهم می کند:
در تحقیقی که در مجله WIREs Computational Molecular Science منتشر شده است، محققینی از دانشگاه RIKEN ، انستیتو Nagahama Bio و همچنین دانشگاه Michigan یک بسته نرم افزاری طراحی کرده اند که GENESIS (GENeralized Ensemble SImulation System) نامیده می شود. ویزگی بارزی که این نرم افزار دارد این است که در مطالعه سیستم های بیولوژی بسیار بزرگ که حاوی 10 میلیون و حتی تا 100 میلیون اتم هستند کاربرد دارد. این نرم افزار باعث ظهور یک دوره جدیدی در بیوفیزیک محاسباتی و بیوشیمی می شود و به دانشمندان اجازه می دهد که یک ارتباط و درک بهتری در سطح مولکولی و سلولی پدیده های زیستی داشته باشند.
@computational_science
نرم افزار جدیدی که امکان شبیه سازی داینامیک مولکولی برای سیستم های بزرگ شبیه سازی را فراهم می کند:
در تحقیقی که در مجله WIREs Computational Molecular Science منتشر شده است، محققینی از دانشگاه RIKEN ، انستیتو Nagahama Bio و همچنین دانشگاه Michigan یک بسته نرم افزاری طراحی کرده اند که GENESIS (GENeralized Ensemble SImulation System) نامیده می شود. ویزگی بارزی که این نرم افزار دارد این است که در مطالعه سیستم های بیولوژی بسیار بزرگ که حاوی 10 میلیون و حتی تا 100 میلیون اتم هستند کاربرد دارد. این نرم افزار باعث ظهور یک دوره جدیدی در بیوفیزیک محاسباتی و بیوشیمی می شود و به دانشمندان اجازه می دهد که یک ارتباط و درک بهتری در سطح مولکولی و سلولی پدیده های زیستی داشته باشند.
@computational_science
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
Bioinformatics Applied to Proteomics.pdf
441.7 KB
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
Biological Systems.pdf
3.2 MB
Forwarded from Pharmatech🌿
Methods_in_Molecular_Biology_1084.pdf
5.5 MB
Forwarded from Pharmatech🌿
طراحی غشاهای اسمز معکوس(Reverse Osmosis Membranes)
با استفاده از دینامیک مولکولی...
@computatinal_science
لینک کانال بیولوژی محاسباتی و بیوانفورماتیک به دوستانتان معرفی کنید...
#نرم_افزارهای_مفید
Acellera HTMD:
این نرم افزار یک نرم افزار کامل با فضای کاری مناسب برای شبیه سازی هدایت شده برای طراحی دارو است.انجام آزمایش های محاسباتی با استفاده از شبیه سازی داینامیک مولکولی هنوز هم بیش از اندازه دشوار و دچار مشکل است.
این نرم افزار یک فضای کاری برنامه ریزی شده مثل متلب ایجاد می کند که قدرت آماده سازی سیستم، داینامیک مولکولی، تجزیه و تحلیل مدل حالت مارکوف و ... را دارد. که دراین حالت یک اسکریپت کوتاه از ساختار PDB می تواند در فرایند های کمی مثل relaxation timescales ، equilibrium populations ، conformations و kinetic rates مفید باشد.
@computational_science
Acellera HTMD:
این نرم افزار یک نرم افزار کامل با فضای کاری مناسب برای شبیه سازی هدایت شده برای طراحی دارو است.انجام آزمایش های محاسباتی با استفاده از شبیه سازی داینامیک مولکولی هنوز هم بیش از اندازه دشوار و دچار مشکل است.
این نرم افزار یک فضای کاری برنامه ریزی شده مثل متلب ایجاد می کند که قدرت آماده سازی سیستم، داینامیک مولکولی، تجزیه و تحلیل مدل حالت مارکوف و ... را دارد. که دراین حالت یک اسکریپت کوتاه از ساختار PDB می تواند در فرایند های کمی مثل relaxation timescales ، equilibrium populations ، conformations و kinetic rates مفید باشد.
@computational_science
در لیست زیر بهترین ژورنالهای مربوط به drug discovery بر اساس رنکینگ آورده شده اند:
لیست ژورنال های مربوط به computational_biology بر حسب H-index در زیر رنک بنده شده اند: