#انرژی_آزاد_گیبس
انرژی آزاد گیبس کمیتی ترمودینامیکی است که میزان خودبهخود انجام شدن یک واکنش را نشان میدهد. این کمیت با G نمایش داده میشود. انجام یک فرایند از لحاظ ترمودینامیکی هنگامی امکانپذیر است که تغییرات انرژی آزاد گیبس منفی باشد.
انرژی آزاد گیبس چنین تعریف میشود:
G = U + PV - TS
یا بطور معادل:
G = H - TS
که در آن: U انرژی درونی
P : فشار
V : حجم
T : دما برحسب کلوین
S : آنتروپی
H : آنتالپی است
این فرمولها دربرگیرندهٔ دو عامل است که در انجامپذیری واکنشها در طبیعت مؤثرند: آنتالپی (انرژی سیستم) و آنتروپی (بینظمی سیستم).
انتالپی (H) تغییرات انرژی ضمن انجام واکنش را دربرمیگیرد. این تغییرات هم انرژی جنبشی راشامل میشود و هم انرژی پتانسیل را، به شرط آن که در حین انجام واکنش فشار وارد بر سیستم ثابت باشد.
یک واکنش زمانی از نظر انرژی انجامپذیر تلقی میشود که بر اثر انجام آن انرژی سیستم کمتر شود. به عبارت بهتر سیستم پایدارتر شود. در این صورت تغییرات انتالپی منفی خواهد بود.
اما در اطراف ما بسیاری از واکنشها اتفاق میافتند که در آنها سیستم گرما میگیرد و انرژی آن افزایش مییابد، یعنی تغییرات انتالپی در آنها مثبت است. این گونه واکنشها به علت عامل دوم رخ میدهند که آنتروپی نامیده میشود و با S نشان داده میشود. این عامل نشاندهندهٔ میزان بینظمی سیستم است و زمانی مساعد است که انجام واکنش سبب زیادشدن بینظمی در سیستم شود. در فرمول انرژی آزاد گیبس عامل S در T ضرب میشود که دمای مطلق (کلوین) گاز است، یعنی اثر عامل بینظمی در دمای بالا بیشتر است.
@computational_science
انرژی آزاد گیبس کمیتی ترمودینامیکی است که میزان خودبهخود انجام شدن یک واکنش را نشان میدهد. این کمیت با G نمایش داده میشود. انجام یک فرایند از لحاظ ترمودینامیکی هنگامی امکانپذیر است که تغییرات انرژی آزاد گیبس منفی باشد.
انرژی آزاد گیبس چنین تعریف میشود:
G = U + PV - TS
یا بطور معادل:
G = H - TS
که در آن: U انرژی درونی
P : فشار
V : حجم
T : دما برحسب کلوین
S : آنتروپی
H : آنتالپی است
این فرمولها دربرگیرندهٔ دو عامل است که در انجامپذیری واکنشها در طبیعت مؤثرند: آنتالپی (انرژی سیستم) و آنتروپی (بینظمی سیستم).
انتالپی (H) تغییرات انرژی ضمن انجام واکنش را دربرمیگیرد. این تغییرات هم انرژی جنبشی راشامل میشود و هم انرژی پتانسیل را، به شرط آن که در حین انجام واکنش فشار وارد بر سیستم ثابت باشد.
یک واکنش زمانی از نظر انرژی انجامپذیر تلقی میشود که بر اثر انجام آن انرژی سیستم کمتر شود. به عبارت بهتر سیستم پایدارتر شود. در این صورت تغییرات انتالپی منفی خواهد بود.
اما در اطراف ما بسیاری از واکنشها اتفاق میافتند که در آنها سیستم گرما میگیرد و انرژی آن افزایش مییابد، یعنی تغییرات انتالپی در آنها مثبت است. این گونه واکنشها به علت عامل دوم رخ میدهند که آنتروپی نامیده میشود و با S نشان داده میشود. این عامل نشاندهندهٔ میزان بینظمی سیستم است و زمانی مساعد است که انجام واکنش سبب زیادشدن بینظمی در سیستم شود. در فرمول انرژی آزاد گیبس عامل S در T ضرب میشود که دمای مطلق (کلوین) گاز است، یعنی اثر عامل بینظمی در دمای بالا بیشتر است.
@computational_science
Forwarded from Pharmatech🌿
Forwarded from Pharmatech🌿
Forwarded from Pharmatech🌿
Jeremy_Ramsden_auth_Bioinformatics_.pdf
4.9 MB
#اخبار_علمی
طراحی غشاهای اسمز معکوس) (Reverse Osmosis Membranesبا استفاده از دینامیک مولکولی
به طور کلی غشاهای اسمز معکوس غشاهای هستند که نسبت به غشاهای معمولی نفوذپذیری آب در آن ها ده برابر بیشتر است.امروزه تحقیقات در زمینه طراحی غاشاهای با سیستم اسمزی معکوس در مقایسه با غشاهای طبیعی به یک بحث داغ در زمینه شبیه سازی داینامیک مولکولی تبدیل شده است. به طور کلی کاربرد اصلی که این سیستم می تواند برای نسل های آینده داشته باشد این است به صرف انرژی کمتری در زمان کوتاه می تواند برای ما آب تمیز تولید کند.لذا با استفاده از شبیه سازی داینامیک مولکولی و طراحی مولکولی در سطح نانو میتوان به راحتی غشاهای اسمز معکوس را مورد بررسی و مطالعه قرار داد.
@computational_science
طراحی غشاهای اسمز معکوس) (Reverse Osmosis Membranesبا استفاده از دینامیک مولکولی
به طور کلی غشاهای اسمز معکوس غشاهای هستند که نسبت به غشاهای معمولی نفوذپذیری آب در آن ها ده برابر بیشتر است.امروزه تحقیقات در زمینه طراحی غاشاهای با سیستم اسمزی معکوس در مقایسه با غشاهای طبیعی به یک بحث داغ در زمینه شبیه سازی داینامیک مولکولی تبدیل شده است. به طور کلی کاربرد اصلی که این سیستم می تواند برای نسل های آینده داشته باشد این است به صرف انرژی کمتری در زمان کوتاه می تواند برای ما آب تمیز تولید کند.لذا با استفاده از شبیه سازی داینامیک مولکولی و طراحی مولکولی در سطح نانو میتوان به راحتی غشاهای اسمز معکوس را مورد بررسی و مطالعه قرار داد.
@computational_science
#نرم_افزارهای_مفید
نرم افزار جدیدی که امکان شبیه سازی داینامیک مولکولی برای سیستم های بزرگ شبیه سازی را فراهم می کند:
در تحقیقی که در مجله WIREs Computational Molecular Science منتشر شده است، محققینی از دانشگاه RIKEN ، انستیتو Nagahama Bio و همچنین دانشگاه Michigan یک بسته نرم افزاری طراحی کرده اند که GENESIS (GENeralized Ensemble SImulation System) نامیده می شود. ویزگی بارزی که این نرم افزار دارد این است که در مطالعه سیستم های بیولوژی بسیار بزرگ که حاوی 10 میلیون و حتی تا 100 میلیون اتم هستند کاربرد دارد. این نرم افزار باعث ظهور یک دوره جدیدی در بیوفیزیک محاسباتی و بیوشیمی می شود و به دانشمندان اجازه می دهد که یک ارتباط و درک بهتری در سطح مولکولی و سلولی پدیده های زیستی داشته باشند.
@computational_science
نرم افزار جدیدی که امکان شبیه سازی داینامیک مولکولی برای سیستم های بزرگ شبیه سازی را فراهم می کند:
در تحقیقی که در مجله WIREs Computational Molecular Science منتشر شده است، محققینی از دانشگاه RIKEN ، انستیتو Nagahama Bio و همچنین دانشگاه Michigan یک بسته نرم افزاری طراحی کرده اند که GENESIS (GENeralized Ensemble SImulation System) نامیده می شود. ویزگی بارزی که این نرم افزار دارد این است که در مطالعه سیستم های بیولوژی بسیار بزرگ که حاوی 10 میلیون و حتی تا 100 میلیون اتم هستند کاربرد دارد. این نرم افزار باعث ظهور یک دوره جدیدی در بیوفیزیک محاسباتی و بیوشیمی می شود و به دانشمندان اجازه می دهد که یک ارتباط و درک بهتری در سطح مولکولی و سلولی پدیده های زیستی داشته باشند.
@computational_science
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
Bioinformatics Applied to Proteomics.pdf
441.7 KB
Forwarded from Bioinformatics & Computational Biology
Biological Systems.pdf
3.2 MB
Forwarded from Pharmatech🌿
Methods_in_Molecular_Biology_1084.pdf
5.5 MB
Forwarded from Pharmatech🌿
طراحی غشاهای اسمز معکوس(Reverse Osmosis Membranes)
با استفاده از دینامیک مولکولی...
@computatinal_science
لینک کانال بیولوژی محاسباتی و بیوانفورماتیک به دوستانتان معرفی کنید...