A New Theory About the Structure of DNA: DNA is held together by hydrophobic forces
Link: https://www.eurekalert.org/pub_releases/2019-09/cuot-dih092019.php
Link: https://www.eurekalert.org/pub_releases/2019-09/cuot-dih092019.php
#فرهنگ_غلط
در ابتدای عرایضم یه خاطره ای رو خدمت دوستان میگم که مرتبط به مسئله ای هست که می خوام مطرح کنم. چند روز پیش یکی از دوستان با من تماس گرفتن گفتن که آقای فلانی ما ویدئوهاتونو دیدیم خیلی خوب بود. منم گفتم که شما از من ویدئویی نخریدین که، ایشون فرمودن که یکی از دوستاشون بهشون داده بودن. حالا بریم سر اصل مطلب: من کاری به خوب یا بد بودن کیفیت ویدئوها و مطالب ارائه شده تو این ویدئوها ندارم، بلکه بیشتر ناراحتیم از اینه که ما تو یه جامعه ای زندگی می کنیم که دزدی عادتمون شده و متاسفانه این امر به یه فرهنگ رایج تو کشور تبدیل شده. مثالش خیلی سادس، همین ویندوزی که رو سیستمامون نصبه، و خیلی از نرم افزارهای علمی و غیرعلمی دیگه ای که داریم استفاده می کنیم که تماما کرک شده هستش و خیلی هم سایت داخل کشور داریم که اینارو واسه دانلود گذاشتن و ما خیلی راحت داریم دانلود می کنیم و استفاده می کنیم و یکی از دوستان در توجیه این مسئله میگفتن که اشکال نداره چون مال کفاره😄😄😄 گناهی شامل ما نمیشه. حالا از بحث نرم افزار که بگذریم تو همه مسائل زندگیمون دچار این موضوع هستیم. مثلا استادی که باید 90 دقیقه سر کلاس باشه دیر میاد، زود میره، دانشجویی که تو کار پایان نامش کوتاهی می کنه، راننده ای که تو هوای بارونی میخواد ملتو تلکه کنه، نماینده ای که میشینه تو مجلس تخمه میشکونه و اونقد مثال هست که نمیشه همشو تو یه پست آورد و نه اینکه من نیستم شما هستین، خیر، هممون درگیریم و تو تمام ابعاد زندگیمون داریم به راحتی از کنارش رد می شیم و خیلی جاها از این فرهنگ غلط استفاده می کنیم. حالا کل حرفم به اون دوستانی بود که ویدئوهای مارو خریداری کردن تمام خواهشمون اینه که نذارید این اتفاق بیفته و حق کسی پایمال بشه و من چندتا از دوستان رو میشناسم که تا حالا چندین بار کپی کردن. بیایید نکنیم اینکارو.
در ابتدای عرایضم یه خاطره ای رو خدمت دوستان میگم که مرتبط به مسئله ای هست که می خوام مطرح کنم. چند روز پیش یکی از دوستان با من تماس گرفتن گفتن که آقای فلانی ما ویدئوهاتونو دیدیم خیلی خوب بود. منم گفتم که شما از من ویدئویی نخریدین که، ایشون فرمودن که یکی از دوستاشون بهشون داده بودن. حالا بریم سر اصل مطلب: من کاری به خوب یا بد بودن کیفیت ویدئوها و مطالب ارائه شده تو این ویدئوها ندارم، بلکه بیشتر ناراحتیم از اینه که ما تو یه جامعه ای زندگی می کنیم که دزدی عادتمون شده و متاسفانه این امر به یه فرهنگ رایج تو کشور تبدیل شده. مثالش خیلی سادس، همین ویندوزی که رو سیستمامون نصبه، و خیلی از نرم افزارهای علمی و غیرعلمی دیگه ای که داریم استفاده می کنیم که تماما کرک شده هستش و خیلی هم سایت داخل کشور داریم که اینارو واسه دانلود گذاشتن و ما خیلی راحت داریم دانلود می کنیم و استفاده می کنیم و یکی از دوستان در توجیه این مسئله میگفتن که اشکال نداره چون مال کفاره😄😄😄 گناهی شامل ما نمیشه. حالا از بحث نرم افزار که بگذریم تو همه مسائل زندگیمون دچار این موضوع هستیم. مثلا استادی که باید 90 دقیقه سر کلاس باشه دیر میاد، زود میره، دانشجویی که تو کار پایان نامش کوتاهی می کنه، راننده ای که تو هوای بارونی میخواد ملتو تلکه کنه، نماینده ای که میشینه تو مجلس تخمه میشکونه و اونقد مثال هست که نمیشه همشو تو یه پست آورد و نه اینکه من نیستم شما هستین، خیر، هممون درگیریم و تو تمام ابعاد زندگیمون داریم به راحتی از کنارش رد می شیم و خیلی جاها از این فرهنگ غلط استفاده می کنیم. حالا کل حرفم به اون دوستانی بود که ویدئوهای مارو خریداری کردن تمام خواهشمون اینه که نذارید این اتفاق بیفته و حق کسی پایمال بشه و من چندتا از دوستان رو میشناسم که تا حالا چندین بار کپی کردن. بیایید نکنیم اینکارو.
لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
Anonymous Poll
46%
1- کارگاه های فشرده و دو روزه
54%
2- کارگاه های دوره ای
🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷 pinned «لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟»
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟»
gromacs-2020-beta1.tar.gz
27.7 MB
#نرم_افزار ورژن 2020 گرومکس ریلیز شد. دوستان می تونن دانلود کرده و استفاده کنن.
Forwarded from 🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷 (ammar Mohseni)
لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
Anonymous Poll
46%
1- کارگاه های فشرده و دو روزه
54%
2- کارگاه های دوره ای
🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷
لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
از تمامی دوستانی که در نظرسنجی مربوطه شرکت کردند کمال تشکر و قدردانی را داریم. با توجه به نتیجه نظرسنجی اکثریت دوستان کارگاه های دوره ای را انتخاب کردند. به همین جهت دوره های آموزشی یک ماهه در مرکز تنظیم گردید که در لینک زیر جزئیات مربوط به دوره ها قرار داده شده است. در این دوره های یک ماهه کارگاه های زیر به صورت پیوسته و پشت سر هم برگزار خواهد گردید.
1- کارگاه مدلسازی پروتئین
2- کارگاه داکینگ مولکولی
3- کارگاه شبیه سازی دینامیک مولکولی کمپلکس پروتئین-لیگاند
همچنین در کنار این کارگاه ها سعی بر این می باشد که مهمترین نرم افزارهای جانبی نیز آموزش داده شود.
این کارگاه ها برای سه نرم افزار gromacs، amber و namd می باشد و نحوه پارامتریزه کردن لیگاند برای هر کدام از این نرم افزارها به طور کامل نیز آموزش داده خواهد شد. همچنین هزینه ثبت نام هر دوره آموزشی برای هر نفر 450 هزار تومان می باشد.
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
1- کارگاه مدلسازی پروتئین
2- کارگاه داکینگ مولکولی
3- کارگاه شبیه سازی دینامیک مولکولی کمپلکس پروتئین-لیگاند
همچنین در کنار این کارگاه ها سعی بر این می باشد که مهمترین نرم افزارهای جانبی نیز آموزش داده شود.
این کارگاه ها برای سه نرم افزار gromacs، amber و namd می باشد و نحوه پارامتریزه کردن لیگاند برای هر کدام از این نرم افزارها به طور کامل نیز آموزش داده خواهد شد. همچنین هزینه ثبت نام هر دوره آموزشی برای هر نفر 450 هزار تومان می باشد.
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
مرکز زیست محاسبات پویا
دوره ها - مرکز زیست محاسبات پویا
مرکز زیست محاسبات پویا در نظر دارد در جهت یادگیری بهتری کارآموزان عزیز کارگاه های دوره ای را در حوزه محاسبات بیوشیمی برگزار نماید. این کارگاه ها یک ماه می باشد و به طور مرتب هر هفته از 15 آبان برگزار خواهند شد. لازم به ذکر می باشد. کارگاه های که برای دور…
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#ویدئو
تو این ویدئو که با روش Equatorial Tracking و تنظیم کردن دوربین با ستارهها ضبط شده حرکت زمین را میبینید
تو این ویدئو که با روش Equatorial Tracking و تنظیم کردن دوربین با ستارهها ضبط شده حرکت زمین را میبینید
لینک ثبت نام👇👇👇
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
اجرای زنده موسیقی فیلم در بین ستارگان شاهکاری از هانس زیمر
فیلمی بی نظیر از کریستوفر نولان (نابغه فیلمسازی هالیوود)❤️❤️
فیلمی بی نظیر از کریستوفر نولان (نابغه فیلمسازی هالیوود)❤️❤️
#نرم_افزارهای_مفید
LOMETS (Local Meta-Threading-Server)-UNIVERSITY OF MICHIGAN
نر مافزار LOMETS یک نرم افزار آنلاین است که برای پیشگویی ساختار 3 بعدی پروتئین ها به کار می رود. این نرم افزار مدل های 3 بعدی با امتیاز بالا از آلاینمنت رشته الگو برای کاربر فراهم می کند. که برای این کار از 9 برنامه های تریدینگی که به صورت local در کامپیوتر نصب می شوند استفاده می کند. که این برنامه ها شامل (FFAS-3D, HHsearch, MUSTER, pGenTHREADER, PPAS, PRC, PROSPECT2, SP3, and SPARKS-X) است. نصب local این برنامه ها باعث می شود که سرعت مدل کردن ساختارها افزایش یابد و همچنین دقت کار بالا رود. پیشگویی ساختار 3 بعدی که وب سرور LOMETS انجام می دهد حداقل 7% دقیق تر از کامپیوترهای شخصی پیش بینی ساختار سوم است.
بعد از وارد کردن اطلاعات ورودی، این وب سرویس حدود 160 مدل را به ما ارائه می دهد که از بین این مدل ها 10 مدل برتر انتخاب می شوند و آنالیزها و مطالعات بر روی این 10 مدل ادامه می یابد. انتخاب مدل های برتر بر اساس امتیاز-z (z-score) می باشد و هر مدلی که امتیاز-z کمتری داشته باشد به عنوان مدل برتر انتخاب می شود. برای مطالعه بیشتر می توانید به لینک زیر مراجعه فرمایید.
http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/LOMETS/
@computational_science
LOMETS (Local Meta-Threading-Server)-UNIVERSITY OF MICHIGAN
نر مافزار LOMETS یک نرم افزار آنلاین است که برای پیشگویی ساختار 3 بعدی پروتئین ها به کار می رود. این نرم افزار مدل های 3 بعدی با امتیاز بالا از آلاینمنت رشته الگو برای کاربر فراهم می کند. که برای این کار از 9 برنامه های تریدینگی که به صورت local در کامپیوتر نصب می شوند استفاده می کند. که این برنامه ها شامل (FFAS-3D, HHsearch, MUSTER, pGenTHREADER, PPAS, PRC, PROSPECT2, SP3, and SPARKS-X) است. نصب local این برنامه ها باعث می شود که سرعت مدل کردن ساختارها افزایش یابد و همچنین دقت کار بالا رود. پیشگویی ساختار 3 بعدی که وب سرور LOMETS انجام می دهد حداقل 7% دقیق تر از کامپیوترهای شخصی پیش بینی ساختار سوم است.
بعد از وارد کردن اطلاعات ورودی، این وب سرویس حدود 160 مدل را به ما ارائه می دهد که از بین این مدل ها 10 مدل برتر انتخاب می شوند و آنالیزها و مطالعات بر روی این 10 مدل ادامه می یابد. انتخاب مدل های برتر بر اساس امتیاز-z (z-score) می باشد و هر مدلی که امتیاز-z کمتری داشته باشد به عنوان مدل برتر انتخاب می شود. برای مطالعه بیشتر می توانید به لینک زیر مراجعه فرمایید.
http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/LOMETS/
@computational_science
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
#ویدئو
آنزیم های چگونه کار می کنند؟
آنزیم های چگونه کار می کنند؟
"مگه از سرطان باهوشتر هم داریم. به امید روزی که سرطان مثل سرماخوردگی بشه"
گزارش جدیدی از مکانیسم عمل سلول های سرطانی و نحوه مقاومت زایی آن ها در مقابل داروها در مجله science ارائه شده است که توصیه می کنم حتما بخونید. جالبه.
جمله جالبی از یکی از محققان این مطالعه:
"Even in the best scenario when the right drug is given to the right patient, even after great clinical response, the disease inevitably comes back. Sometimes it’s even more aggressive than at the beginning,” says Mariangela Russo, a postdoc at the Candiolo Cancer Institute in Italy.
مطالعه بیشتر👇👇👇👇
Cancer Cells Increase DNA Mutations to Evade Treatment
گزارش جدیدی از مکانیسم عمل سلول های سرطانی و نحوه مقاومت زایی آن ها در مقابل داروها در مجله science ارائه شده است که توصیه می کنم حتما بخونید. جالبه.
جمله جالبی از یکی از محققان این مطالعه:
"Even in the best scenario when the right drug is given to the right patient, even after great clinical response, the disease inevitably comes back. Sometimes it’s even more aggressive than at the beginning,” says Mariangela Russo, a postdoc at the Candiolo Cancer Institute in Italy.
مطالعه بیشتر👇👇👇👇
Cancer Cells Increase DNA Mutations to Evade Treatment
The Scientist Magazine®
Cancer Cells Increase DNA Mutations to Evade Treatment
Colorectal tumor cells limit their DNA repair in response to a targeted therapy, giving them a greater chance to develop resistance to the drug.
#ایرانم_تسلیت
این دو هفته اونقدر پر از غم و اندوه بود که دیگه نایی نمیمونه واسه آدم.
به امید روزی که فقط خبر بد نشنویم (دیگه قید شنیدن خبر خوب رو زدیم)
✈️🚀🚌⚫️⚫️⚫️⚫️
این دو هفته اونقدر پر از غم و اندوه بود که دیگه نایی نمیمونه واسه آدم.
به امید روزی که فقط خبر بد نشنویم (دیگه قید شنیدن خبر خوب رو زدیم)
✈️🚀🚌⚫️⚫️⚫️⚫️
==> قبل از آنکه دروغی گفته بشه باید به بهای اون فکر کرد (دیالوگی از مینی سریال چرنوبیل)
قاعدتا همه ما در این چند روز شدیدا تحت تاثیر سقوط هواپیمای تهران-اکراین و از دست رفتن تعداد زیادی از نخبگان این مرز و بوم هستیم. نخبگانی که در این سرزمین آینده ای نداشتند و به امید فردایی بهتر پرواز ابدی کردند. هر چقدر که از غم این جریان بگیم کم گفتیم و مطمئنا هممون تو این چند روز به یاد این عزیزان اشک ریختیم. ولی نکته ای که این وسط هست اینه که ما تو این کشور چندین ساله که با این قضیه دروغ درگیر هستیم. ماشین های مضخرف، هوای مضخرف و آلوده، تغذیه نامناسبت، نداشتن امنیت شغلی و اگه بخواییم بشماریم اونقدر زیاد هست که از حوصله مبحث خارجه و همه این موارد هم توسط مسئولان بی وجدان خودمون به یه نحوی با دروغ توجیه شدن و مطمئنا اگر پای کشورهای خارجی به قضیه هواپیما باز نمی شد مسئولان ما بی وجدانتر از این بودن که بیان به این اشتباه مهلک اقرار بکنن. ولی کاش این مسائل را با یه جمله "حالا اشتباهی رخ داده" حل نکنیم و با خاطیان به شدیدترین شکل ممکن برخورد بشه.
ویدئوی زیر به احترام درگذشتگان سقوط هواپیما خدمتتون گذاشته میشه⚫️⚫️⚫️.
باز از مطالب غیرمرتبطی که تو این کانال گذاشته میشه عذر میخوام ولی واقعا نمیشه بی خیال بود و حرفی نزد چون عمق این فاجعه اونقدر زیاد بود که مطمنن روح و روان هممون رو به هم ریخته.
قاعدتا همه ما در این چند روز شدیدا تحت تاثیر سقوط هواپیمای تهران-اکراین و از دست رفتن تعداد زیادی از نخبگان این مرز و بوم هستیم. نخبگانی که در این سرزمین آینده ای نداشتند و به امید فردایی بهتر پرواز ابدی کردند. هر چقدر که از غم این جریان بگیم کم گفتیم و مطمئنا هممون تو این چند روز به یاد این عزیزان اشک ریختیم. ولی نکته ای که این وسط هست اینه که ما تو این کشور چندین ساله که با این قضیه دروغ درگیر هستیم. ماشین های مضخرف، هوای مضخرف و آلوده، تغذیه نامناسبت، نداشتن امنیت شغلی و اگه بخواییم بشماریم اونقدر زیاد هست که از حوصله مبحث خارجه و همه این موارد هم توسط مسئولان بی وجدان خودمون به یه نحوی با دروغ توجیه شدن و مطمئنا اگر پای کشورهای خارجی به قضیه هواپیما باز نمی شد مسئولان ما بی وجدانتر از این بودن که بیان به این اشتباه مهلک اقرار بکنن. ولی کاش این مسائل را با یه جمله "حالا اشتباهی رخ داده" حل نکنیم و با خاطیان به شدیدترین شکل ممکن برخورد بشه.
ویدئوی زیر به احترام درگذشتگان سقوط هواپیما خدمتتون گذاشته میشه⚫️⚫️⚫️.
باز از مطالب غیرمرتبطی که تو این کانال گذاشته میشه عذر میخوام ولی واقعا نمیشه بی خیال بود و حرفی نزد چون عمق این فاجعه اونقدر زیاد بود که مطمنن روح و روان هممون رو به هم ریخته.