#تخفیف_بسته_های_آموزشی
به مناسبت عید سعید قربان به کسانی که بسته های آموزشی را یک جا خریداری نمایند تخفیف 30 درصدی تعلق خواهد گرفت. 💥💥
به مناسبت عید سعید قربان به کسانی که بسته های آموزشی را یک جا خریداری نمایند تخفیف 30 درصدی تعلق خواهد گرفت. 💥💥
#دختر_آّبی
این روزا قاعدتا هممون قضیه مربوط به دختر آبی رو شنیدیم و حالا اینکه چرا خودسوزی کرده😔😔 و دلیل اصلیش چی بوده رو کار نداریم. ولی مسئله ای که این وسط بسیار جالب توجهه نحوه برخورد مسئولان کشوری با این موضوع هستش. هممونم میدونیم که اگر مردم در شبکه های اجتماعی مطالبه گر نبودن مسئولای عزیز و متعهد و باوجدانمون به این قضیه عکس العمل نشون نمیدادن و مسئله دوم این وسط نحوه برخوردشون با این قضیه هست. برای مثال یکی از مسئولان لطف کردن گفتن که با توجه به جو ورزشگاه ها در حال حاضر امکان حضور زنان وجود نداره. یکی دیگه گفتن که از لحاظ زیرساخت های امنیتی امکان حضور زنان وجود دارد.
"خداییش مگه کسایی که میرن ورزشگاه مگه همین مردای جامعه ما نیستن. مگه همونایی نیستن که تو جنگ هشت ساله غیرت ناموس پرستی خودشون رو به رخ دنیا کشیدن. مگه جوونای ما تو دنیا به عنوان جووون باغیرت و ناموس پرست شناخته نمیشن. پس این همه بحث دیگه سر چیه. امنیت خانوما نسبت به چی باید تامین بشه"
حالا بگذریم. بحث ما حضور یا عدم حضور خانما تو ورزشگاه نیست مسئله مهم بیشتر نحوه برخورد مسئولای ما با اتفاقات جامعه هست.
ببخشید که گاهی وقتا مطالب غیرمرتبط گذاشته میشه.
این روزا قاعدتا هممون قضیه مربوط به دختر آبی رو شنیدیم و حالا اینکه چرا خودسوزی کرده😔😔 و دلیل اصلیش چی بوده رو کار نداریم. ولی مسئله ای که این وسط بسیار جالب توجهه نحوه برخورد مسئولان کشوری با این موضوع هستش. هممونم میدونیم که اگر مردم در شبکه های اجتماعی مطالبه گر نبودن مسئولای عزیز و متعهد و باوجدانمون به این قضیه عکس العمل نشون نمیدادن و مسئله دوم این وسط نحوه برخوردشون با این قضیه هست. برای مثال یکی از مسئولان لطف کردن گفتن که با توجه به جو ورزشگاه ها در حال حاضر امکان حضور زنان وجود نداره. یکی دیگه گفتن که از لحاظ زیرساخت های امنیتی امکان حضور زنان وجود دارد.
"خداییش مگه کسایی که میرن ورزشگاه مگه همین مردای جامعه ما نیستن. مگه همونایی نیستن که تو جنگ هشت ساله غیرت ناموس پرستی خودشون رو به رخ دنیا کشیدن. مگه جوونای ما تو دنیا به عنوان جووون باغیرت و ناموس پرست شناخته نمیشن. پس این همه بحث دیگه سر چیه. امنیت خانوما نسبت به چی باید تامین بشه"
حالا بگذریم. بحث ما حضور یا عدم حضور خانما تو ورزشگاه نیست مسئله مهم بیشتر نحوه برخورد مسئولای ما با اتفاقات جامعه هست.
ببخشید که گاهی وقتا مطالب غیرمرتبط گذاشته میشه.
The Gromacs team is hard at work for next month's 2020 beta! Integrating more and faster CUDA support, python API, modular integrators, cryo-em density fitting, FEP speed buffs, and more... Powered by C++14 too! What are *you* going to simulate?
Link: https://twitter.com/GMX_TWEET/status/1166746787350269953?s=20
Link: https://twitter.com/GMX_TWEET/status/1166746787350269953?s=20
Twitter
GROMACS
The team is hard at work for next month's 2020 beta! Integrating more and faster CUDA support, python API, modular integrators, cryo-em density fitting, FEP speed buffs, and more... Powered by C++14 too! What are *you* going to simulate?
A New Theory About the Structure of DNA: DNA is held together by hydrophobic forces
Link: https://www.eurekalert.org/pub_releases/2019-09/cuot-dih092019.php
Link: https://www.eurekalert.org/pub_releases/2019-09/cuot-dih092019.php
#فرهنگ_غلط
در ابتدای عرایضم یه خاطره ای رو خدمت دوستان میگم که مرتبط به مسئله ای هست که می خوام مطرح کنم. چند روز پیش یکی از دوستان با من تماس گرفتن گفتن که آقای فلانی ما ویدئوهاتونو دیدیم خیلی خوب بود. منم گفتم که شما از من ویدئویی نخریدین که، ایشون فرمودن که یکی از دوستاشون بهشون داده بودن. حالا بریم سر اصل مطلب: من کاری به خوب یا بد بودن کیفیت ویدئوها و مطالب ارائه شده تو این ویدئوها ندارم، بلکه بیشتر ناراحتیم از اینه که ما تو یه جامعه ای زندگی می کنیم که دزدی عادتمون شده و متاسفانه این امر به یه فرهنگ رایج تو کشور تبدیل شده. مثالش خیلی سادس، همین ویندوزی که رو سیستمامون نصبه، و خیلی از نرم افزارهای علمی و غیرعلمی دیگه ای که داریم استفاده می کنیم که تماما کرک شده هستش و خیلی هم سایت داخل کشور داریم که اینارو واسه دانلود گذاشتن و ما خیلی راحت داریم دانلود می کنیم و استفاده می کنیم و یکی از دوستان در توجیه این مسئله میگفتن که اشکال نداره چون مال کفاره😄😄😄 گناهی شامل ما نمیشه. حالا از بحث نرم افزار که بگذریم تو همه مسائل زندگیمون دچار این موضوع هستیم. مثلا استادی که باید 90 دقیقه سر کلاس باشه دیر میاد، زود میره، دانشجویی که تو کار پایان نامش کوتاهی می کنه، راننده ای که تو هوای بارونی میخواد ملتو تلکه کنه، نماینده ای که میشینه تو مجلس تخمه میشکونه و اونقد مثال هست که نمیشه همشو تو یه پست آورد و نه اینکه من نیستم شما هستین، خیر، هممون درگیریم و تو تمام ابعاد زندگیمون داریم به راحتی از کنارش رد می شیم و خیلی جاها از این فرهنگ غلط استفاده می کنیم. حالا کل حرفم به اون دوستانی بود که ویدئوهای مارو خریداری کردن تمام خواهشمون اینه که نذارید این اتفاق بیفته و حق کسی پایمال بشه و من چندتا از دوستان رو میشناسم که تا حالا چندین بار کپی کردن. بیایید نکنیم اینکارو.
در ابتدای عرایضم یه خاطره ای رو خدمت دوستان میگم که مرتبط به مسئله ای هست که می خوام مطرح کنم. چند روز پیش یکی از دوستان با من تماس گرفتن گفتن که آقای فلانی ما ویدئوهاتونو دیدیم خیلی خوب بود. منم گفتم که شما از من ویدئویی نخریدین که، ایشون فرمودن که یکی از دوستاشون بهشون داده بودن. حالا بریم سر اصل مطلب: من کاری به خوب یا بد بودن کیفیت ویدئوها و مطالب ارائه شده تو این ویدئوها ندارم، بلکه بیشتر ناراحتیم از اینه که ما تو یه جامعه ای زندگی می کنیم که دزدی عادتمون شده و متاسفانه این امر به یه فرهنگ رایج تو کشور تبدیل شده. مثالش خیلی سادس، همین ویندوزی که رو سیستمامون نصبه، و خیلی از نرم افزارهای علمی و غیرعلمی دیگه ای که داریم استفاده می کنیم که تماما کرک شده هستش و خیلی هم سایت داخل کشور داریم که اینارو واسه دانلود گذاشتن و ما خیلی راحت داریم دانلود می کنیم و استفاده می کنیم و یکی از دوستان در توجیه این مسئله میگفتن که اشکال نداره چون مال کفاره😄😄😄 گناهی شامل ما نمیشه. حالا از بحث نرم افزار که بگذریم تو همه مسائل زندگیمون دچار این موضوع هستیم. مثلا استادی که باید 90 دقیقه سر کلاس باشه دیر میاد، زود میره، دانشجویی که تو کار پایان نامش کوتاهی می کنه، راننده ای که تو هوای بارونی میخواد ملتو تلکه کنه، نماینده ای که میشینه تو مجلس تخمه میشکونه و اونقد مثال هست که نمیشه همشو تو یه پست آورد و نه اینکه من نیستم شما هستین، خیر، هممون درگیریم و تو تمام ابعاد زندگیمون داریم به راحتی از کنارش رد می شیم و خیلی جاها از این فرهنگ غلط استفاده می کنیم. حالا کل حرفم به اون دوستانی بود که ویدئوهای مارو خریداری کردن تمام خواهشمون اینه که نذارید این اتفاق بیفته و حق کسی پایمال بشه و من چندتا از دوستان رو میشناسم که تا حالا چندین بار کپی کردن. بیایید نکنیم اینکارو.
لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
Anonymous Poll
46%
1- کارگاه های فشرده و دو روزه
54%
2- کارگاه های دوره ای
🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷 pinned «لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟»
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟»
gromacs-2020-beta1.tar.gz
27.7 MB
#نرم_افزار ورژن 2020 گرومکس ریلیز شد. دوستان می تونن دانلود کرده و استفاده کنن.
Forwarded from 🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷 (ammar Mohseni)
لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
Anonymous Poll
46%
1- کارگاه های فشرده و دو روزه
54%
2- کارگاه های دوره ای
🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷
لطفا دوستانی که تمایل به شرکت در کارگاه های محاسباتی دارند در نظر سنجی زیر شرکت کنند.
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
به نظر شما چه نوع کارگاه هایی بازده بیشتری را دارا می باشد؟
از تمامی دوستانی که در نظرسنجی مربوطه شرکت کردند کمال تشکر و قدردانی را داریم. با توجه به نتیجه نظرسنجی اکثریت دوستان کارگاه های دوره ای را انتخاب کردند. به همین جهت دوره های آموزشی یک ماهه در مرکز تنظیم گردید که در لینک زیر جزئیات مربوط به دوره ها قرار داده شده است. در این دوره های یک ماهه کارگاه های زیر به صورت پیوسته و پشت سر هم برگزار خواهد گردید.
1- کارگاه مدلسازی پروتئین
2- کارگاه داکینگ مولکولی
3- کارگاه شبیه سازی دینامیک مولکولی کمپلکس پروتئین-لیگاند
همچنین در کنار این کارگاه ها سعی بر این می باشد که مهمترین نرم افزارهای جانبی نیز آموزش داده شود.
این کارگاه ها برای سه نرم افزار gromacs، amber و namd می باشد و نحوه پارامتریزه کردن لیگاند برای هر کدام از این نرم افزارها به طور کامل نیز آموزش داده خواهد شد. همچنین هزینه ثبت نام هر دوره آموزشی برای هر نفر 450 هزار تومان می باشد.
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
1- کارگاه مدلسازی پروتئین
2- کارگاه داکینگ مولکولی
3- کارگاه شبیه سازی دینامیک مولکولی کمپلکس پروتئین-لیگاند
همچنین در کنار این کارگاه ها سعی بر این می باشد که مهمترین نرم افزارهای جانبی نیز آموزش داده شود.
این کارگاه ها برای سه نرم افزار gromacs، amber و namd می باشد و نحوه پارامتریزه کردن لیگاند برای هر کدام از این نرم افزارها به طور کامل نیز آموزش داده خواهد شد. همچنین هزینه ثبت نام هر دوره آموزشی برای هر نفر 450 هزار تومان می باشد.
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
مرکز زیست محاسبات پویا
دوره ها - مرکز زیست محاسبات پویا
مرکز زیست محاسبات پویا در نظر دارد در جهت یادگیری بهتری کارآموزان عزیز کارگاه های دوره ای را در حوزه محاسبات بیوشیمی برگزار نماید. این کارگاه ها یک ماه می باشد و به طور مرتب هر هفته از 15 آبان برگزار خواهند شد. لازم به ذکر می باشد. کارگاه های که برای دور…
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#ویدئو
تو این ویدئو که با روش Equatorial Tracking و تنظیم کردن دوربین با ستارهها ضبط شده حرکت زمین را میبینید
تو این ویدئو که با روش Equatorial Tracking و تنظیم کردن دوربین با ستارهها ضبط شده حرکت زمین را میبینید
لینک ثبت نام👇👇👇
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
http://zistpooya.com/index.php/workshopsss/
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
اجرای زنده موسیقی فیلم در بین ستارگان شاهکاری از هانس زیمر
فیلمی بی نظیر از کریستوفر نولان (نابغه فیلمسازی هالیوود)❤️❤️
فیلمی بی نظیر از کریستوفر نولان (نابغه فیلمسازی هالیوود)❤️❤️
#نرم_افزارهای_مفید
LOMETS (Local Meta-Threading-Server)-UNIVERSITY OF MICHIGAN
نر مافزار LOMETS یک نرم افزار آنلاین است که برای پیشگویی ساختار 3 بعدی پروتئین ها به کار می رود. این نرم افزار مدل های 3 بعدی با امتیاز بالا از آلاینمنت رشته الگو برای کاربر فراهم می کند. که برای این کار از 9 برنامه های تریدینگی که به صورت local در کامپیوتر نصب می شوند استفاده می کند. که این برنامه ها شامل (FFAS-3D, HHsearch, MUSTER, pGenTHREADER, PPAS, PRC, PROSPECT2, SP3, and SPARKS-X) است. نصب local این برنامه ها باعث می شود که سرعت مدل کردن ساختارها افزایش یابد و همچنین دقت کار بالا رود. پیشگویی ساختار 3 بعدی که وب سرور LOMETS انجام می دهد حداقل 7% دقیق تر از کامپیوترهای شخصی پیش بینی ساختار سوم است.
بعد از وارد کردن اطلاعات ورودی، این وب سرویس حدود 160 مدل را به ما ارائه می دهد که از بین این مدل ها 10 مدل برتر انتخاب می شوند و آنالیزها و مطالعات بر روی این 10 مدل ادامه می یابد. انتخاب مدل های برتر بر اساس امتیاز-z (z-score) می باشد و هر مدلی که امتیاز-z کمتری داشته باشد به عنوان مدل برتر انتخاب می شود. برای مطالعه بیشتر می توانید به لینک زیر مراجعه فرمایید.
http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/LOMETS/
@computational_science
LOMETS (Local Meta-Threading-Server)-UNIVERSITY OF MICHIGAN
نر مافزار LOMETS یک نرم افزار آنلاین است که برای پیشگویی ساختار 3 بعدی پروتئین ها به کار می رود. این نرم افزار مدل های 3 بعدی با امتیاز بالا از آلاینمنت رشته الگو برای کاربر فراهم می کند. که برای این کار از 9 برنامه های تریدینگی که به صورت local در کامپیوتر نصب می شوند استفاده می کند. که این برنامه ها شامل (FFAS-3D, HHsearch, MUSTER, pGenTHREADER, PPAS, PRC, PROSPECT2, SP3, and SPARKS-X) است. نصب local این برنامه ها باعث می شود که سرعت مدل کردن ساختارها افزایش یابد و همچنین دقت کار بالا رود. پیشگویی ساختار 3 بعدی که وب سرور LOMETS انجام می دهد حداقل 7% دقیق تر از کامپیوترهای شخصی پیش بینی ساختار سوم است.
بعد از وارد کردن اطلاعات ورودی، این وب سرویس حدود 160 مدل را به ما ارائه می دهد که از بین این مدل ها 10 مدل برتر انتخاب می شوند و آنالیزها و مطالعات بر روی این 10 مدل ادامه می یابد. انتخاب مدل های برتر بر اساس امتیاز-z (z-score) می باشد و هر مدلی که امتیاز-z کمتری داشته باشد به عنوان مدل برتر انتخاب می شود. برای مطالعه بیشتر می توانید به لینک زیر مراجعه فرمایید.
http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/LOMETS/
@computational_science
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
#ویدئو
آنزیم های چگونه کار می کنند؟
آنزیم های چگونه کار می کنند؟
"مگه از سرطان باهوشتر هم داریم. به امید روزی که سرطان مثل سرماخوردگی بشه"
گزارش جدیدی از مکانیسم عمل سلول های سرطانی و نحوه مقاومت زایی آن ها در مقابل داروها در مجله science ارائه شده است که توصیه می کنم حتما بخونید. جالبه.
جمله جالبی از یکی از محققان این مطالعه:
"Even in the best scenario when the right drug is given to the right patient, even after great clinical response, the disease inevitably comes back. Sometimes it’s even more aggressive than at the beginning,” says Mariangela Russo, a postdoc at the Candiolo Cancer Institute in Italy.
مطالعه بیشتر👇👇👇👇
Cancer Cells Increase DNA Mutations to Evade Treatment
گزارش جدیدی از مکانیسم عمل سلول های سرطانی و نحوه مقاومت زایی آن ها در مقابل داروها در مجله science ارائه شده است که توصیه می کنم حتما بخونید. جالبه.
جمله جالبی از یکی از محققان این مطالعه:
"Even in the best scenario when the right drug is given to the right patient, even after great clinical response, the disease inevitably comes back. Sometimes it’s even more aggressive than at the beginning,” says Mariangela Russo, a postdoc at the Candiolo Cancer Institute in Italy.
مطالعه بیشتر👇👇👇👇
Cancer Cells Increase DNA Mutations to Evade Treatment
The Scientist Magazine®
Cancer Cells Increase DNA Mutations to Evade Treatment
Colorectal tumor cells limit their DNA repair in response to a targeted therapy, giving them a greater chance to develop resistance to the drug.