Хотим поделиться замечательным ресурсом ChemPredictor, созданным учеными из ИХР РАН🏛

ChemPredictor позволяет использовать готовые, обученные модели как для предсказания физико-химических и биологических свойств индивидуальных соединений, так и для предсказания выходов и путей химического синтеза.

Все, что требуется — перейти по ссылке интересующей модели и загрузить молекулу или реакцию в виде SMILES. После небольшого ожидания модель предскажет выбранное свойство для интересующей исследователя молекулы или реакции.

Модели для ионных жидкостей:

— Прогнозирование электропроводности, вязкости, плотности, поверхностного натяжения и скорости звука
📎Ссылка

— Прогнозирования минимальной ингибирующей концентрации (МИК) ионных жидкостей против трех бактерий: Staphylococcus aureus, Escherichia coli и Pseudomonas aeruginosa
📎Ссылка

— Прогнозирование температуры плавления, разложения и стеклования.
📎Ссылка

Модели для химических реакций:

— Ретросинтетическое прогнозирование реагентов, необходимых для получения заданного олигопиролла.
📎Ссылка

— Прогнозирование выхода реакций конденсации пирролов и дипиррометанов с альдегидами.
📎Ссылка

Модели для индивидуальных молекул:

1) Прогнозирование максимума поглощения и значений IC50 для платиносодержащих BODIPY (совместно с ИГХТУ🏛).
📎Ссылка

2) Прогнозирование максимума поглощения замещенных порфиринов и металлопорфиринов.
📎Ссылка

3) Прогнозирование максимума поглощения и молярного коэффициента поглощения различных красителей (ксантены, акридины, диарилметаны, антрахиноны и дипиррометены).
📎Ссылка

4) Предсказание химического сдвига 11B ЯМР BODIPY.
📎Ссылка

5) Прогнозирование сенсорных способностей на основе химической формулы. Эту модель можно использовать для поиска сенсорной структуры, похожей на вашу молекулу (совместно с ИГХТУ🏛).
📎Ссылка

ChemPredictor находится в активном тестировании, поэтому разработчики заранее благодарят всех пользователей сайта за обратную связь.

Приглашаем всех химиков к использованию данного сервиса!

Делимся еженедельной подборкой свежих новостей из мира российской науки!🔬

📑У 0,37% мидий из Кольского залива - трансмиссивный рак двустворчатых моллюсков
Ученые из Санкт-Петербургского государственного университета🏛 исследовали популяции мидий в Кольском заливе Баренцева моря и обнаружили, что 0,37% из них болеют трансмиссивным раком двустворчатых моллюсков. Генетический анализ показал, что эта болезнь проникла в море из Тихого океана через Северный морской путь.
🖇Работа опубликована в журнале 📕Molecular Ecology (IF = 4.9)

📑Получена самособирающаяся система, которая усовершенствует доставку лекарств
Ученые из Университета ИТМО🏛 вместе с израильскими коллегами разработали шестиступенчатый каскад химических реакций, приводящий к самосборке капель жидкости, схожих с живыми клетками. Этот метод может быть использован для доставки лекарственных препаратов, позволяя перенести действующее вещество к нужным тканям.
🖇Работа опубликована в журнале 📕Chem (IF = 23.5)

📑Океанологи выяснили, куда пропадает речная вода из Карского моря
Из-за отсутствия морских исследований в холодный период в Арктике мало известно о происходящем в арктических морях зимой и весной. Однако ученые обнаружили подледное течение, переносящее опресненные воды из Карского моря в море Лаптевых, что имеет большое значение для прогнозирования прочности льда и изучения влияния климатических изменений на арктические экосистемы.
🖇Работа опубликована в журнале 📕Scientific Reports (IF = 4.6)

📑Устройство из двух лазеров измерит теплопроводность материалов для электроники
Ученые разработали новую методику измерения теплопроводности электронных устройств, которая позволяет быстро и без разрушения оценить и контролировать риск перегрева и выхода из строя устройства. Новое устройство для измерения теплопроводности оказалось дешевле аналогов, но не уступает им по характеристикам, и может найти применение в таких областях, как системы связи 6G, визуализация и медицинская диагностика.
🖇Работа опубликована в журнале 🏛Applied Physics Letters (IF = 4)

📑Новая подложка для мембран в 2 раза повысит скорость очистки природного газа
Ученые разработали новую подложку из полисульфона для газоразделительных мембран, повышающую их производительность и экономичность. Исследователи также работают над улучшением материалов селективных слоев для повышения эффективности мембран.
🖇Работа опубликована в журнале 📕Separation and Purification Technology (IF = 8.6)

#новости

Приветствуем лаборатории и научные группы, которые присоединились к платформе за последнюю неделю!🧑🏻‍🔬

Многофункциональные магнитные наноматериалы
📍НИТУ «МИСиС»🏛

Отдел модулярных вычислений и искусственного интеллекта (СКЦМИ)
📍Северо-Кавказский федеральный университет🏛

Лаборатория внутриклеточной сигнализации
📍Институт цитологии РАН🏛

Геостратегических исследований и пространственного развития
📍Байкальский Институт Природопользования СО РАН🏛

Лаборатория многоспиновых координационных соединений
📍Международный томографический центр СО РАН🏛

Присоединяйтесь к платформе и добавляйте свою лабораторию! 🔥

#лаборатории

#конференции

📌XXVII Всероссийская конференция молодых учёных-химиков (с международным участием)

🏛Место проведения — Нижний Новгород, ННГУ🏛;
🗓Даты проведения — 16-18 апреля 2024;
⏰Сроки подачи тезисов — до 1 декабря 2023;
👥Способ проведения — офлайн;
🔗Подробнее — по ссылке

Коллеги, добрый день!

Нам неожиданно сообщили, что Colab.ws был номинирован на премию «Сделано в России — 2023» в категории «Наука и технологии» от медиапроекта Сноб.

👨🏻‍💻Теперь мы находимся на этапе открытого голосования, и были бы очень благодарны вашей поддержке.

✅Голосование продлится до 27 ноября, проголосовать можно по ссылке

Мы искренне ценим ваше участие и поддержку!

Команда CoLab.ws 🔥

#HighQuartileResearch

Сегодня у нас на очереди шестая часть 📕Nature Communications (IF=16.6)

1. Topological nodal line in superfluid 3He and the Anderson theorem
Измеряя температурную зависимость энергетической щели в сверхтекучем 3He, экспериментально было показано, что ориентированные столбчатые немагнитные дефекты не изменяют энергетический спектр, подтверждая гипотезу о существовании устойчивых подсистем внутри системы, защищающих обычную сверхпроводимость от рассеяния и беспорядка. Среди авторов работы — Григорий Воловик, главный научный сотрудник ИТФ РАН.

2. Photoluminescence imaging of single photon emitters within nanoscale strain profiles in monolayer WSe2
Исследование деформации в атомных слоях ван-дер-ваальсовых материалов позволяет создавать управляемые однофотонные излучатели. Коллектив учёных, при участии сотрудников из ИТМО🏛, СПбПУ🏛, СПбАУ, МФТИ🏛 и РКЦ провёл прецизионное исследование однофотонных излучающих участков в монослое WSe2, которое позволило определить природу однофотонной эмиссии.

3. Activator-blocker model of transcriptional regulation by pioneer-like factors
Активация генома зависит от пионерских транскрипционных факторов. В работе исследовали мутантов активаторов генома Данио-рерио и моделировали его комбинаторные механизмы активации. Оказалось, некоторые активаторы синергично активируют гены, а другие блокируют их. Среди авторов исследования — Онищук Дарья из ИБР РАН🏛.

4. Magnetization reversal through an antiferromagnetic state
Открыт новый путь обращения намагниченности в ферромагнитных материалах через антиферромагнитное состояние, демонстрируется его реализация на материале Fe2Mo3O8. Этот процесс обусловлен внутрислоевым сопряжением, сильной осевой анизотропией и спиновыми флуктуациями. В исследовании принимал участие Васин Кирилл из КФУ🏛.

Делимся еженедельной подборкой свежих новостей из мира российской науки!🧪

📑Новый фотокатализатор разрушил загрязнителей сточных вод с помощью ультрафиолета
Ученые из ИФХЭ РАН🏛 разработали гибридный фотокатализатор, состоящий из порфиринов и наночастиц дисульфида молибдена, который позволяет очищать сточные воды. Этот материал синтезируется методом нековалентной самосборки, что делает процесс его производства дешевым и позволяет повторно использовать компоненты.
🖇Работа опубликована в журнале 📕ACS applied materials & interfaces (IF = 9.5)

📑Новый метод экстракции редкоземельных элементов, используя новые ионные жидкости
Химики ИОНХ РАН🏛 синтезировали бифункциональную ионную жидкость на основе промышленных экстрагентов для извлечения редкоземельных элементов из слабокислых нитратных растворов и добились количественного извлечения металлов всего за одну стадию. Планируется применить эту ионную жидкость для извлечения редкоземельных элементов из отработанных люминесцентных материалов.
🖇Работа опубликована в журнале 📕Journal of Molecular Liquids (IF = 6)

📑В геноме борщевика оказалось вдвое больше генов, чем в среднем у других растений
Ученые из Сколковского института🏛 и Института проблем передачи информации имени А.А. Харкевича РАН провели исследование генома борщевика Сосновского и обнаружили более 55 тысяч генов, включающих гены, отвечающие за синтез токсинов растения. Полученные данные помогут в разработке новых лекарственных препаратов для лечения кожных заболеваний и методов контроля и мониторинга распространения этого опасного растения.
🖇Работа опубликована в журнале 📕Plant Journal (IF = 7.2)

#новости

⚡️Мини-обновление⚡️

Коллеги, во вкладку «Статистика» было добавлено 2 новых графика:
— Визуализация Индекса Хирша
— Изменение Индекса Хирша по годам

Команда CoLab.ws 🔥

Приветствуем лаборатории и научные группы, которые присоединились к платформе за последнюю неделю!🧑🏻‍🔬

Лаборатория механизмов регуляции биосистем
📍Институт биофизики клетки РАН🏛

Информационно-аналитический центр
📍Санкт-Петербургский НИИ радиационной гигиены им. П.В. Рамзаева 🏛

НИИ биологической медицины
📍Алтайский государственный университет🏛

ORËL ResearchLab
📍Новосибирский Государственный Университет 🏛

Лаборатория машинного обучения в науках о Земле
📍МФТИ🏛

Присоединяйтесь к платформе и добавляйте свою лабораторию! 🔥

#лаборатории

Продолжаем рубрику #HighQuartileResearch, и сегодня мы делимся седьмой частью 📕Nature Communications (IF=16.6).

1. Spin-orbit driven superconducting proximity effects in Pt/Nb thin films
Международный коллектив при участии учёных из ВШЭ🏛, МФТИ🏛 и ИФТТ РАН🏛 исследовал генерацию спиновых токов без использования ферромагнитных элементов. Было установлено, что спин-триплетные корреляции обусловлены спином равноспиновых пар, а не их орбитальным движением.

2. High-energy photoemission final states beyond the free-electron approximation
3D структура электронной полосы влияет на физические явления в твердотельных системах, исследование которых осуществляется с помощью ARPES. Исследователи выяснили, что при высоких энергиях возбуждения конечные состояния могут быть сложными, включая несколько блоховских волн, что приводит к сложной структуре и уширению спектральных пиков. Эти результаты имеют значение для определения 3D структуры в широком диапазоне материалов и энергий возбуждения в ARPES. Среди авторов работы — Леонид Лев из МФТИ🏛.

3. Enhancing reactivity of SiO+ ions by controlled excitation to extreme rotational states
В работе изучается химическая реакция SiO+ + H2 → SiOH+ + H с экстремальным вращательным возбуждением реагента SiO+. Эти сверхроторные состояния SiO+ достигаются благодаря широкополосной оптической накачке и существенно ускоряют реакцию. Механизм ротационного усиления реакционной способности заключается в сильной связи моды вращения SiO+ с координатой реакции, что подтверждается теоретическими исследованиями. Исследование выполнено при участии Ивана Антонова из ФИАНа🏛.

4. Evolutionary history of the Arctic flora
Согласно исследованию, арктическая флора сформировалась в результате прогрессивных изменений в ландшафте и климате, а также колебаниях уровня моря, начиная примерно 10 млн лет назад. Эта информация является важной в контексте быстро меняющихся климатических условий в Арктике. Один из авторов исследования — Эрст Андрей из Центрального сибирского ботанического сада СО РАН.

#объявления

📑Приём статей в специальный выпуск журнала

Открыт прием статей в специальный выпуск «Thermodynamics and Kinetics of Complexation Reactions Involving Ligands with High Practical Relevance» журнала 📕Frontiers in Chemistry (IF = 5.5)

Один из редакторов выпуска — д.х.н. Гамов Георгий из ИГХТУ🏛

🧪Цель этого специального выпуска заключается в установлении стандартов качества для любых исследований, связанных с изучением химической реакции, при которой ее завершенность и скорость являются значимыми параметрами. В рамках этой темы обсуждаются различные наиболее надежные методы изучения химических равновесий и кинетики, а также обработки экспериментальных данных для получения необходимых термодинамических и кинетических параметров.

📈Кроме того, приветствуется получение количественных данных о различных соответствующих химических процессах, и приветствуются рекомендации относительно различных технологических процессов, позволяющих получать более высокие выходы ценных продуктов, более быстрое завершение реакций, более эффективное обнаружение различных аналитов и более сильное ингибирование целевых ферментов. Также интересны количественные соотношения между структурой и активностью, полученные в результате анализа термодинамических или кинетических результатов.

👉🏻Мы хотим охватить перспективные, новые исследовательские тенденции в термодинамике и кинетике реакций, участники которых могут найти применение в различных областях. Приветствуются оригинальные исследования, обзоры, мини-обзоры и перспективные статьи на темы, включая, но не ограничиваясь термодинамикой и кинетикой:

— Комплексообразования различных металлических ионов

— Молекулярного комплексообразования и молекулярного распознавания

— Ассоциации малых молекул и металлокомплексов с белками и нуклеиновыми кислотами

— Изомерных и таутомерных равновесий

а также вывод закономерностей в равновесии и кинетике различных химических реакций.

⏰Крайний срок подачи статей — 29 февраля 2024 года

💬Подробнее: https://colab.ws/ads/85

#объявления

Постдок в Институт химии СПбГУ🏛

👩🏻‍🔬В Институт химии Санкт-Петербургского государственного университета ищем постдока на кафедру аналитической химии. Лаборатория экстракционных методов и зеленой аналитической химии расширяется и открывает две вакансии пост доков для работы в лаборатории. Лаборатория активно развивается, имеет в своем распоряжении современное аналитическое оборудование и доступ к ресурсом парку СПбГУ.

В лаборатории реализуются гранты РНФ и Президентство гранты. Работы членов лаборатории отмечены медалями РАН и премией Президента Р.Ф. 2022. Сотрудники публикуются в высокорейтинговых журналах. 64 статьи Scopus за последние 5 лет. Большая часть в Q1. Сейчас подаем совместный грант с Индией. Готовы включить в качестве исполнителя.

Чем предстоит заниматься:

— Разработка новых способов пробоподготовки (жидкостная экстракция, сорбция)

— Работа на аналитическом оборудовании

— Написание научных статей

— Участие в образовательной работе

Что требуется:

— Степень кандидата наук, желательно по специальности аналитическая химия, но не обязательно

— Опыт работы с аналитическим оборудованием

— Опыт работы в аналитической лаборатории

💬Подробнее: https://colab.ws/ads/84

🧑🏻‍🔬Если вы хотите опубликовать объявление, переходите по ссылке, заполняйте форму и размещайте ваши запросы!