10X Genomics Visium产品的工作流程。
整个流程一共分为六步：
首先，将冷冻组织切片，然后把切片放到专门的芯片（一张很贵的载玻片）上。
然后，用HE或者IF对组织切片进行染色，这一步的内容类似于“质控“，用来检验切片和贴片是不是成功。
第三步，组织透化。在这一步中，向切片添加透化试剂，使得细胞的mRNA 垂直向下释放到spot中，并与连有空间barcode的捕获极进行绑定。然后通过被捕获mRNA反转录形成cDNA.
接下来，去除组织切片，释放cDNA，进入测序文库构建。
然后就是测序。测序目前都是用illumina二代测序。
最后是数据分析。
整个流程一共分为六步：
首先，将冷冻组织切片，然后把切片放到专门的芯片（一张很贵的载玻片）上。
然后，用HE或者IF对组织切片进行染色，这一步的内容类似于“质控“，用来检验切片和贴片是不是成功。
第三步，组织透化。在这一步中，向切片添加透化试剂，使得细胞的mRNA 垂直向下释放到spot中，并与连有空间barcode的捕获极进行绑定。然后通过被捕获mRNA反转录形成cDNA.
接下来，去除组织切片，释放cDNA，进入测序文库构建。
然后就是测序。测序目前都是用illumina二代测序。
最后是数据分析。
Pearson correlation coefficient: also referred to as Pearson's r, is a measure of linear correlation between two sets of data
In statistics, the Kolmogorov–Smirnov test (K–S test or KS test) is used to decide if a sample comes from a population with a specific distribution
离开lab
Lab mate: see you!
Me: see you! Have a good weekend!
Lab mate: no no no i will be here on Friday
Me: I will also be here on Friday
Lab mate and me: .....
Lab mate: see you!
Me: see you! Have a good weekend!
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Me: I will also be here on Friday
Lab mate and me: .....