На прошедшей неделе журнал Science опубликовал сенсационное расследование об одном из самых влиятельных нейробиологов мира, который был заподозрен в мошенничестве при подготовке данных для своих научных статей (в основном, речь идет о редактировании изображений, полученных экспериментальными методами, в частности конфокальной микроскопией) для создания более привлекательного впечатления от воздействия того или иного фармакологического препарата:

https://www.science.org/content/article/research-misconduct-finding-neuroscientist-eliezer-masliah-papers-under-suspicion

Добавляет остроты то, что подозреваемый ученый руководил секцией нейродегенеративных заболеваний в National Institute of Health – организации, которая финансирует большую долю биомедицинских исследований в США (бюджет этой секции – 2.6 млрд USD). Кроме того, в своей области он входил в пятерку наиболее известных и цитируемых ученых мира.

Автор статьи в Science пишет, что некоторые ученые заподозрили неладное уже некоторое время назад - после того, как ряд вопросов и комментариев появились на сайте PubPeer, который предназначен для обсуждения научным сообществом уже опубликованных статей. После этого все публикации данного автора были проверены и было составлено 300-страничное досье о многочисленных случаях мошенничества в иллюстрациях к 132 опубликованным статьям, опубликованным в период с 1997 по 2023 год.

Статья в Science содержит много оговорок, которые «по уму» надо бы прояснить перед обнародованием столь серьезных обвинений. Но автор обосновывает неотложность публикации тем, что на основе этих статей компанией Prothena разработано лекарство, применяемое при болезни Паркинсона, которое уже проходит испытания на людях (результаты этих испытаний противоречивы: некоторые не показывают какого-либо позитивного эффекта на развитие болезни, в других случаях имелся слабый положительный результат).

Должен сказать, что меня смущает именно это обстоятельство, но по другой причине. Когда речь идет о Big Pharma, особенно в области нейродегенеративных заболеваний, там задействованы гигантские деньги. Соответственно, возможна конкурентная борьба между компаниями, одним из способов ведения которой могут быть «заказные статьи».

Мы в России хорошо знакомы с этим явлением, но у нас обычно «заказные статьи» написаны столь топорно, что легко распознаются. А вот в данном случае, все выполнено намного тоньше и правдоподобнее. Впрочем, возможно, это я просто попал под влияние распространенного в наши дни недуга конспирологии. Так или иначе, авторам статей, допускающих редактирование микроскопических изображений для более правдоподобной иллюстрации выводов научной статьи, стоит задуматься – «все тайное становится явным».

Важное событие для мира российских научных журналов (нет, это не реклама и не партнёрский материал, пост в канале купить нельзя).

Сотрудники Russian Chemical Reviews (Успехи химии) вместе с командой CoLab сделали для журнала новую онлайн-платформу: теперь сайт и система подачи статей выглядят по-человечески удобно и современно. В частности, доступны полноценные веб-версии обзоров за 2024 год, которые можно читать без скачивания файла, выпуски за прошлые годы будут постепенно появляться на сайте. Система подачи и рецензирования присылает автоматические уведомления, отображает статус рукописи и тому подобное, как это обычно реализовано в хороших зарубежных издательствах.

К слову, Russian Chemical Reviews — один из лидеров среди всех отечественных журналов по различным метрикам (при всей осторожности отношения к ним), входит в первый квартиль WoS и Scopus. Хорошо и правильно, что у журнала будет нормальный сайт, соответствующий научному уровню.

В общем-то, это и есть важная часть необходимой (и срочной) работы по повышению уровня российских научных изданий. По идее, ей и нужно систематически заниматься вместо бесконечного составления и редактирования рекомендаций, списков, требований и запретов.

Само собой, для успеха журнала первична содержательная работа редколлегии и рецензентов. Но если публикации невозможно найти на сайте, а автор после отправки рукописи не получает отклик целый год (или дольше) и в это время не может даже узнать статус своей работы, то все интеллектуальные усилия редакции и рецензентов умножаются на ноль. Так что ждём перехода хороших российских журналов на современные и удобные платформы.


Ссылка на сайт: https://rcr.colab.ws/

Чем занимаются русские энтомологи? Русские энтомологи занимаются фигнёй. Точнее бабочкой Fignya melkaya, открытой энтомологом Алексеем Соловьевым из Ульяновского педагогического института и его немецким коллегой Томасом Виттом (они ещё описали несколько видов слизневидок, среди которых также была Barabashka). Фигня и правда мелкая: размах крыльев 18–19 мм. Поймали ее на горе Фаншипан на севере Вьетнама, а позже нашли и в провинции Сычуань на юго-западе Китая. Их исследование продолжили китайские учёные, которые открыли ещё три вида фигни, а также предложили перенести к фигне несколько ранее открытых бабрчек.

Исследователи из НИЦ «Курчатовский институт» - ПИЯФ и НИЦ «Курчатовский институт» открыли новую бета-галактозидазу с уникальными структурными характеристиками и биохимическими свойствами. Результаты работы опубликованы в престижном зарубежном журнале FEBS Journal, издаваемом Европейским биохимическим обществом. Более того, иллюстрация, анонсирующая статью, украшает обложку августовского номера журнала, что свидетельствует о высокой оценке работы русских учёных.

Новый фермент эффективно катализирует гидролиз лактозы при высоких температурах, остаётся стабильным и активным при 65°С и сохраняет активность при 95°С с периодом полураспада 73 мин. Эти свойства делает новую β-галактозидазу привлекательным кандидатом для использования в высокотемпературных биотехнологических процессах.

За что мы любим химию? Среди естественных наук химия занимает особое положение. Одна из её особенностей состоит в том, что она даёт нам ключи, с помощью которых мы проникаем в тайны атомного ядра или генетического кода. Мы говлрим, что XX век был веком физики, а XXI век будет веком биологии, но в основе открытий физиков и биологов часто лежат эксперименты химиков. Но и в гуманитарных науках химия может иногда перевернуть наши представления.

Что мы знаем о доколумбовых связях Нового и Старого Света? Сегодня историки допускают возможные контакты между жителями этих частей света в начале прошлого тысячелетия, этому имеются доказательства – ​как письменные, так и археологические. Но более древние контакты находятся под покровом тайны. Есть лишь предположения и беспочвенные утверждения, часто базирующиеся на фальсифицированном материале, что не идет на пользу вполне обоснованной гипотезе о возможном раннем проникновении на американское побережье финикийцев или других мореплавателей древности, например греков.

И вот химический анализ древних тканей немного может приоткрыть занавес. Русская исследовательница древних скифов археолог Наталья Полосьмак (первооткрывательница принцессы Укока) опубликовала статью о том, что ткани из могил алтайских скифов, датируемых V в. до н.э., окрашены красителем гематокселином, который добывался в древности только в Америке из эфирного экстракта кампешевого дерева Haematoxylon campechianum. Этоо растение и его родственники произрастают только в Америке. Сами ткани импортированы из Восточного Средиземноморья. По её мнению, это подтверждает то, что финикийцы плавали в Америку. Их бесспорные следы – ​монеты, датируемые IV в. до н. э., – ​нашли на Азорских островах. Таким образом, есть основания считать, что американский краситель стал появился в Восточном Средиземноморье в V в. до н. э..

Конечно, результаты химического анализа следует повторить и перепроверить. Гематоксилин является широко используемым в лабораторной практике реактивом, поэтому теоретически нельзя исключать, что при некорректно проведённом анализе в пробу просто попали образцы лабораторного реактива, с которым до этого работал исследователь. Но если дальнейшие исследования подтвердят наличие гематоксилина в древних тканях, это перевернёт представления о связях в древнем мире.

Такие вот тонкие нити доколумбовых связей можно найти.

Бактерии выживают в неблагоприятных условиях за счет перехода в особое состояние, при котором они сохраняют жизнеспособность, но не культивируются на питательных средах. Патогены в таком состоянии, например, листерий в продуктах питания, трудно обнаружить. Французские ученые показали, что листерии при таком переходе теряют клеточную стенку и приобретают форму кокков вместо палочек. Они также получили специфичные именно к этой форме антитела, что в дальнейшем может облегчить выявление покоящихся патогенов.

Тем временем, шпиль МГУ опять украли. Подозреваем сами знаете кого.

Русский исследоваиель Алексей Рузов, сотрудник ФИЦ Биотехнологии РАН, и его коллега, работающий в Кембридже, создали новую модель регуляции R-петель.

Статья с результатами их работы вышла в научном журнале Nature Genetics

В геномах всех живых существ образуются R-петли, состоящие из переплетенных двух цепей ДНК и одной цепи РНК.

В одних случаях эта структура имеет полезные функции, например, управляет включением и выключением генов, ремонтом «поломок» в ДНК и производством дубликатов этой молекулы при делении клетки, а в других — становится причиной генетических поломок, ведущих к развитию рака или нейродегенеративных заболеваний.

Ученые установили, что химическая модификация, заключающаяся в присоединении метильной группы к аденозину, в зависимости от контекста может по-разному решить судьбу R-петли: либо продлить ей жизнь, либо вызвать ее распад.

Модель, которую создали ученые, позволяет разрешить очевидные противоречия в обсуждениях роли метилированного аденина в регуляции R-петель.

В перспективе эти исследования позволят управлять стабильностью этих структур, и через нее, влиять на такие важные процессы как онкогенез (образование злокачественных опухолей) и старение организма.

Молекулярным биологам еще предстоит выяснить подробности того, как такие структуры могут стабилизироваться и разрушаться.

Просто вечер на Арбате.

Лауреатами Нобелевской премии по химии стали Демис Хассабис и Джон Джампер «за предсказание белковых структур» и Дэвид Бейкер — «за компьютерный дизайн белков». Их разработки дополняют друг друга — они позволяют как моделировать структуру белка по заданной последовательности аминокислот, так и генерировать эту последовательность, исходя из желаемой функции.

Их разработка удивительно точно предсказывает строение белков по последовательности, которой они закодированы в ДНК, — а это имеет самое непосредственное отношение к заветной проблеме биофизики: фолдингу белка.