🔺Часть 6
Хотя в то время на Земле не было людей, в привычном для нас с вами понимании, некоторые другие современные нам организмы тогда уже вполне появились. И для них такие постоянные эмоциональные климатические качели не прошли даром. О том, как в теории разрастание ледовой шапки могло повлиять на морских улитонек Дно уже писало. Но в том случае рассматривалось несколько гипотез и травма след, оставшийся от ледника – одна из них. Тогда в Арктике я нашёл необычное сообщество, состоящее из улиток встречающихся только на юге (Баренцева моря) и предположил что оно могло быть осколком большой и дружной экосистемы, которая когда-то занимала всё море. Потом пришёл ледник и всё покрыл собой, не оставив места для жизни.

Тогда чтобы проверить эту гипотезу нужно было смотреть не только улитонек, но и их гены. Если в какой-то отделённой популяции появляется мутация – ею улитоньки могут делиться только друг с другом, но не с теми, кто отделён от них непроходимой стеной льда. Чем больше таких мутаций – тем дольше улитоньки скрещивались только с кузинами жили в изоляции. Но тогда посчитать число мутаций так и не удалось 🥲

А совсем скоро я расскажу как всё-таки удалось увидеть влияние ледников на улитков, хоть и при других обстоятельствах
#длясправки@bottom_bottom

🔺Часть 7
То, что трудно провернуть с морскими улитоньками гораздо проще сделать с пресноводными (ну теми, которые живут в реках и озёрах), хотя бы потому что их удобнее собирать, и можно делать это прямо у дома с трубкой в зубах или в туристических походах с рюкзаком за плечами (и тоже трубкой в зубах). У этих улитонек мои коллеги выделили ДНК и прочитали фрагмент гена COI из митохондрий улитонек (о том, чем гены митохондрий прикольны Дно писало тут). В качестве маааленького довеска к нескольким найденным мной экземплярам, мы добавилм около семидесяти уже прочитанных другими исследователями последовательностей этого гена и начали их сравнивать.

Все изученные участки генов относились к одному виду (или группе видов) – Galba truncatula или малый прудовик. Этот вид улитоньки известен многим скуфам милленеалам по схеме из старого учебника биологии. Улитоньки живут прямо в траве или грунте у берега водоёмов. Коварные личинки паразитов, которые сидят в улитоньках пользуются этим и селятся в бедных улитоньках, чтобы в будущем переселиться в коров (и иногда в людей).
🔻#пресноводные@bottom_bottom

🔺Часть 9
Как только мы сделали первый вариант филогенетического дерева, то сразу стало понятно, что все малые прудовики делятся на две крупные генетические группы, одна из которых живёт в основном в западной Европе, а вторая – в восточной, а ещё в Сибири, Центральной Азии, на Кавказе и Гималаях. Сразу появилась гипотеза о том, что это как раз из-за того, что улитоньки были разделены ледником. Центр последнего оледенения был в горах Скандинавии и ледник разрастался на север, на встречу альпийскому оледенению. Это в совокупности отделило западную Европу от остальной Евразии и западноевропейских прудовиков от всех остальных.

Дело оставалось за малым: пересчитать все наши анализы ещё десяток раз, потому что с первого раза ведь нельзя всё хорошо сделать, да и со второго. С десятого тоже, но уже и так сойдёт 🙄
🔻#пресноводные@bottom_bottom

🔺Часть 10
Хороший Финальный результат вот он, на картинке. Синим на карте показано разрастание ледника во время последнего ледникового максимума (вот даже мем про него пилил), который, кстати, закончился недавно – около десяти тысяч лет назад.

О том, как читать деревья Дно немного писало здесь)
🔻#пресноводные@bottom_bottom

🔺Часть 11
А вот поглядите на ещё одну вундервафлю. Называется TCS haplotype network сетка гаплотипов. Гаплотип – это уникальная последовательность ДНК, которая может быть общей у нескольких организмов. Если она отличается хотя бы на одну букву мутацию, то это уже другой гаплотип.
На схеме каждый кружок — это один гаплотип. Размер кружка показывает, у скольких особей он найден: чем больше кружок, тем чаще этот вариант встречался.
Линии, которыми гаплотипы кружочки соединены – самое короткое расстояние между ними. Оно измеряется числом мутаций, которые показаны штрихами на связывающих кружочки линиях.
Цвет кружочка зависит от того, где этот гаплотип был найден. Ту же цветовую схему мы использовали на дереве и карте
🔻#пресноводные@bottom_bottom

🔺Часть 12
Такое разделение на условно западную и условно восточную популяции уже известно у разных других организмов: от деревьев (не филогенетических, а обычных, с листьями) до медведей, но проявляется у всех немного по-разному. Например, иногда генетических групп больше чем две, потому что изолированные популяции могли сохраняться где-то ещё, например в Карпатах или на Кавказе. Кто-то, наоборот, вымер на западной или восточной половине ареала, и по итогу осталась только одна популяция, которая вновь расселилась всюду или до сих пор расселяется. О разных вариантах послеледникового расселения Дно писало здесь и здесь.

После ухода ледника малые прудовики реколонизировали заселяли постледниковые пространства навстречу друг другу. А когда западная и восточная популяции наконец-то встретились то … они просто остановились на линии разграничения, так что на западе остались западные, а на востоке – восточные. И ни с места. И это совсем непонятно, почему так, ведь большинство популяций других видов всё-таки перемишиваются. То есть определённая генетическая группа чаще встречается (а ещё представленна бОльшим числом подгрупп) на территории, где возникла, но вполне может заходить и в места, от которых была раньше отрезана. Это, кстати, и у людей также. Китайцев больше в Китае, а индийцев – в Индии, но они обычно без особых проблем поселяются и в других районах.

Можно было бы предположить, что пресноводные моллюски вообще медленно расселяются, но только не малые прудовики. Эти пацанчики (или пацанески, кто их гермафродитов разберёт-то вообще 🤷‍♂️) заселяют новые территории одними из первых среди макробентосных крупных истинно водных беспозвоночных (тех у кого нет фазы, способной долгое время оставаться без воды). Они, например, одни из самых северных улитонек на Кольском полуострове и одними из немногих заселили Исландию, Фарерские острова и много-много других отдалённых мест.
🔻#пресноводные

🔺Часть 13
Здесь конечно можно возразить, что последний ледниковый максимум закончился буквально каких-то десять тысяч лет назад и может популяции ещё перемешаются, хотя и странно что до сих пор этого не произошло. Однако, их разделение произошло не во время последнего максимума, а гораздо раньше. Об этом говорит очень высокая доля генетических различий (около 4%), а ещё не вошедшее в статью датированное дерево. То есть предположительно генетическая изоляция возникла ещё во время самого первого плейстоценового оледенения (больше двух миллионов лет назад или около того) и с тех пор, несмотря на циклы потепления во время которых западные и восточные прудовики должны были сближаться, они не скрестились перемешались.

Почему так? Мы не знаем …. 🥲
🔻#пресноводные

🔺Часть 14
В общем, как обычно исследование дало вопросов больше чем ответов. К тому же кроме двух генетических групп: восточной и западной мы также нашли трёх совсем отклоняющихся экземпляров, которые видимо относятся к другому, неописанному виду. Проблема только в том, что мы не видели этих моллюсков вживую поскольку они были найдены только в Германии и Швеции, а фрагменты их генов прочитали немецкие исследователи. Это однозначно новый отдельный вид.

С другой стороны были любители считать малых прудовиков целой группой видов, часто эндемичных для отдельных районов Восточной Европы и Азии. Эти виды должны были различать по писку на рассвете пропорциям раковины. Мы не нашли этому никаких подтверждений, хотя специально искали.

Ну и наконец малые прудовики релоцировались были вселены в Южную Америку. Была даже гипотеза, что они сформировались как вид именно там, а в Евразию были завезены и расселились, как это сделали герои истории о двойном проникновении. Мы эту гипотезу отвергли, ведь тогда малые прудовики должны быть разнообразнее именно там, а не у нас. Зато мы выяснили, что в Южную Америку они вселялись минимум два раза: один раз туда вошли представители «восточной» популяции, а в другой раз – «западной» (или это было одновременно, кто же свечку-то держал 🤷‍♂️). То же самое с водоёмами Евразии, кстати сделали североамериканские улитоньки 🤭🫣

Ну в общем и все. Не забывайте кидать нашему обедневшему коллективу звёзды, голосовать за канал и делиться записями. Вы – единственная возможность продвинуть Дно в массы 🫶
Статью можно почитать тут

Я часто объясняю студентам как устроена анатомия улитонек или их отдельных частей при помощи пластилиновых изделий. Ну то есть леплю объект, похожий на то, что видно в микроскопе (обычно это пенис фрагменты половой системы), и на нём показываю где нужно сделать следующий надрез. Ну или как это могло выглядеть до того, как препарат оказался безнадежно испорчен 🙄

Вообще долгое время я думал что это моя фишка и даже немного этим гордился до тех пор, пока не увидел эту статью. Просто посмотрите, как классно тут слепили из пластилина фрагменты женской половой системы слизняка 👀

Уффф… я подал две большие статьи на что у меня ушло куча ресурса и времени, которые, конечно, пришлось забирать у Дна. А теперь, пока жду реджекты отлупы могу немного выдохнуть и рассказать очередную историю 🥹

До того как в моде у исследователей был k-pop микропластик, но уже после озоновых дыр (кто-то помнит вообще что это такое? 🤭) хайповые учёные любили изучать как катастрофически меняется распространение зверюшек из-за изменения климата. Проблема в том, что такие исследования нужно проводить долго: ведь климат и, вслед за ним, распространение живых организмов меняются очень медленно, а вот престижный посдок исследовательская программа, посвящённая его изучению, заканчивается очень быстро 🤷‍♂️

Чтобы как-то попиариться на красивой теме принести пользу обществу за максимально короткий срок очень помогает взять за основу для мониторинга или бэйслайн* результаты предшествующих исследований. Это нужно, чтобы можно было сравнить старые результаты с новыми и увидев разницу сказать с умным видом: «всё сильно поменялось из-за изменения климата».

Идея о том, что климат, а вместе с ним и состав зверюшек в Арктике, меняется не нова. Впервые об этом стали писать ещё в начале прошлого века, когда у берегов Мурмана показали поймали несколько тепловодных рыбов. А первые мониторинговые исследования начали делать уже в 1899-1900 годах 🤯 Тогда на встрече Международного совета по исследованию моря (International Council for the Exploration of the Sea, ICES) вообще была мега-идея о том, что в европейских морях нужно сделать программу постоянного мониторинга жизни и среды её обитания. Предполагалось, что это упростит показ оценку остатков промысловых рыбов, зверюшек, которыми они питаются, ну и заодно позволит понять как это всё зависит от изменений температуры, солёности, течений и других вещей, которые изучают гидрологи.

*я сам не то, чтобы люблю юзать англицизмы, но действительно не знаю годного аналога слову baseline на Языке Предельной Ясности
🔻#Морские #Арктика #климат

🔺Часть 2
Проводить исследования предполагалось на серии океанологических разрезов. Разрез - это когда на карте моря рисуют прямую линию, а затем по этому маршруту отправляют пароход, с борта которого собирают пробы. Вот посмотрите на карту разрезов, о которых договорились в 1899 году (источник кину в комментарии). Исследования должны были проводить те страны, рядом с которыми эти разрезы находяться.
🔻#Морские #Арктика #климат

🔺Часть 3
Один из разрезов, который начинался у выхода из Кольского залива Баренцева моря и шёл строго на север получил название «Кольский меридиан». Мурманска, который сейчас является самым известным городом на берегу залива тогда ещё не было, но уже был Александровск с биологической станцией (Дно тут писало как она там оказалась и тут выкладывало её фотоньки). Эта станция поначалу: вплоть до её ликвидации и занялась исследованиями на Кольском меридиане. С тех пор почти каждый год, а иногда даже несколько раз в год туда отправлялись морские экспедиции. В этих исследованиях, конечно были перерывы, связанные с двумя мировыми войнами и самый длинный – с брежневским застоем расцветом советской эпохи. Эти исследования ведутся и сейчас.

Обычно результаты научных исследований принято как-то публиковать. Это стали делать задолго до того, как публикации научных статей стали большой и хищной индустрией. Непосредственно данные о том какие виды обитателей дна найдены на разрезе были опубликованы лишь дважды – в 1924 и 1927 (!) годах. После этого в 1960-ом была опубликована ещё статья где постулировалось изменение в распространении морских зверюшек, но не было никаких исходных данных, а все доказательства были на примерах. Такие доказательства базируются не на анализе всего массива данных, а не отдельно выхваченных фактах и их генерализации: сегодня в шаверме мне попался плохо прожаренный кусок мяса, следовательно вся шаверма не годна больше к употреблению. При этом тысячи божественных свитков с нормально прожаренным и даже пережаренным мясом не учитывается. Это вполне ок на бытовом уровне, но не годно для научного исследования, претендующего на объективность.
🔻#Морские #Арктика #климат

🔺Часть 4
Вот, посмотрите на график числа статей найденных по словосочетанию “Kola Meridian” в базе данных Scopus. Тут, конечно, не все публикации, как минимум там не проиндексированы многие советские, хотя первая статья 1924 года всё же есть.
Важно, что на графике вообще любые публикации, включая посвящённые физике океана и даже ионосфере, что выходит за рамки нашей истории, посвящённой только морскому дну.
Интересно ещё, что за более чем вековой период наблюдений на разрезе, не было опубликовано ни одной работы уровня по-настоящему знаковых журналов (типа Science, Nature, TrEE, Естественные и Технические науки).
🔻#Морские #Арктика #климат