ФБК нарушает законодательство, не предоставляя отчетность в министерство юстиции. В октябре 2019 года фонд Навального был признан иностранным агентом. Данный статус обязывает НКО направлять в Минюст дополнительные сведения о своей деятельности.

Алексей Навальный 20 июля объявил о «ликвидации ФБК». По закону учредители НКО для ее ликвидации назначают специальную комиссию (ликвидатора). Публикуются сведения о ликвидации НКО, порядке и сроке заявления требований ее кредиторами. Полномочия директора переходят к ликвидатору. В ЕГРЮЛ вносится соответствующая запись. Ничего из этого до сих пор так и не было сделано. «Ликвидация» ФБК оказалась очередным фейком Навального.