Бластим: курсы и работа в биотехе
9.66K subscribers
2.46K photos
196 videos
1 file
1.96K links
❤️ Наши курсы: agency.blastim.ru

🥨 Свежие вакансии в биотехе: blastim.ru

🐧 Курс «Экспресс Linux для NGS »: vk.cc/d0dZQt

🤝 По сотрудничеству и рекламе: @edu_blastim

📚 По вопросам о курсах: @varvara_blastim
Download Telegram
Сделай сам: проекты на курсе по машинному обучению

На программе Бластим по ML прикинуться шлангом, тихонько отсидеться и улизнуть без знаний не выйдет. Участники непременно выполняют домашки, а все последние недели курса ботают и защищают свой первый взрослый машинленерский кейс. Самостоятельная активность под менторством преподавателей невероятно важна для закрепления материала и пополнения портфолио.

Именно такая практика побуждает мыслить творчески, применять пройденные методы и учиться принимать решения. Использовать классические алгоритмы или глубокие нейросети? Обучать с нуля или положиться на трансфер ленинг? Гнаться за качеством или за скоростью?

Какие же научные проекты можно взять? Смотрите примеры на карточках! А для тех, кто не ищет легких путей, мы предлагаем опцию «Bring Your Own Data». Осуществите полный цикл ML-разработки: от формулирования гипотезы, сбора данных и разведочного анализа до презентации готового продукта. Будет трудно, но нужно пережить эту одиссею, чтобы стать млщиком. Дерзайте!
❤‍🔥87😁5
Осталось 🔤 часов

До вебинара с новым преподавателем курса по ML — Василием Леоненко.

Поговорим про математические модели, статистику, ML и Deep learning. Чем отличаются подходы, когда что применять и как не сойти с ума от обилия сложных методов.

Записи не будет, так что готовьте свои вопросы, нас ждет живая дискуссия и немного математики 📃

🔤 Регистрация: t.me/BlastimML_bot?start=model

До встречи в 19:00 мск!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
😁10🥰64
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
9🥰7🤩6
Пацан сказал — пацан сделал. Вебинар по Claude Science!

В конце прошлого месяца вышел Claude Science с очевидным замахом повторить успех Claude Code. Хотя название тула не конкретизирует, о каких таких науках идет речь, заточен он преимущественно под биоинформатику, молекулярную биологию, драг-дизайн. В Anthropic вообще серьезно взялись за биотех. Недавно в команду перешел из Google сам Джон Джампер, нобелиат по химии за AlphaFold! А еще ИИ-компания объявила, что теперь сама займется разработкой новых препаратов — для редких и забытых болезней. Звучит очень амбициозно.

Почти сразу после релиза Бластим спросил подписчиков, не организовать ли нам встречу с разбором. 95% проголосовали за. Что ж, мы слов на ветер не бросаем. Фиксируйте: суббота, 25 июля, вебинар по Claude Science с Александром Деканом. Давайте вместе посмотрим, насколько хорош новый сервис!

Конечно, будем проверять на задачах фармацевтики. Известно, что инвесторам и фондам очень важно уметь вовремя разглядеть перспективный препарат. Однако многие молекулы удачно проходят испытания на животных, но потом сокрушительно проваливаются в клинических исследованиях. Спикер использует доступные внутри Claude Science скиллы, чтобы сравнить поведение нескольких потенциальных лекарств в организме человека и мыши. А также попросит ИИ спрогнозировать, сработают ли они на людях.

Попутно обсудим:
• почему ИИ-агенты в биологии — горячая тема
• отличается ли Claude Science от Claude Code с подключенными плагинами
• что можно еще делать с помощью флагманских ИИ-платформ в науках о жизни
• как получить доступ к этим сокровищам из РФ


📌 Записаться: https://t.me/BlastimML_bot?start=claude
Если тг не работает, то на сайте:
https://agency.blastim.ru/pythonandml#claude
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
13🥰95👍2
GPT для таблиц?

Если вы работаете с табличными данными, то наверняка уже слышали про TabFM от Google. А если нет — это один из тех релизов, на которые стоит обратить внимание.

Но первая реакция у многих примерно одинаковая:
🤔 Почему вокруг столько шума, если foundation-модели для табличек уже существовали?
🤔 Неужели теперь достаточно просто загрузить датасет, и TabFM сама сделает всё остальное?

Отвечаем на эти и другие вопросы в нашем чате @MLblastim

А еще там можно обсудить любимые LLMки и найти полезные материалы по машинному обучению
6😁3🐳2
🧬 Магистратура на стыке ИИ, биологии и медицины

Центральный университет запускает программу «ИИ в биотехе», где студенты научатся использовать искусственный интеллект для решения конкретных задач: предсказывать структуру белков, анализировать экспрессию генов и искать новые подходы к диагностике заболеваний. Учебный план разработан совместно с факультетом биоинженерии и биоинформатики МГУ, а также индустриальными партнерами — Genotek и BIOCAD.

Обучение длится 2 года, проходит в очном формате — абитуриентам доступны гранты до 75%.

Направления подготовки:
Прикладная биоинформатика × Genotek 
Фокусируется на анализе генетических последовательностей и эпигенетических модификаций с применением методов статистики и машинного обучения

Структурная биоинформатика × BIOCAD 
Сосредоточена на работе с трехмерными структурами белков, их предсказании, моделировании и анализе с помощью современных технологий и вычислительных методов


Упор сделан на практику: работа в лабораториях ЦУ, подготовка научных статей, стажировки и построение карьеры в индустрии.

Подробнее прочитать про программу и зарегистрироваться на участие в грантовом конкурсе можно по ссылке

Прием заявок открыт до 20 августа!

#бластим_рекомендует
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
13👍5🔥5🤯3🥴2🤨1😐1
🗿 Двое из ларца, одинаковых с лица

Представьте, что мы хотим научиться уменьшать размер данных. Это полезно для более эффективного хранения и быстрых вычислений. А еще было бы здорово превращать данные в вектора чисел так, чтобы похожие наборы чисел соответствовали похожим объектам. Их можно было бы использовать для анализа данных. Как решить обе задачи одновременно?

🖼 Давайте вообразим, что мы хотим сжимать изображения. Возьмем двух людей: одного назовем «кодировщиком», а второго — «декодировщиком». И посадим их в разные комнаты. Дальше мы достаем пакет картинок, которые хотим сжать, и будем по одной давать кодировщику. Его задача — записать набор чисел небольшой длины, как-то отражающий содержание картинки. Потом мы будем давать эти наборы чисел декодировщику. Он должен будет взглянуть на числа и нарисовать исходную картинку.

🥊 А затем мы посмотрим на результат, посмеемся и влепим обоим подзатыльники. Чем меньше нарисованная картинка похожа на исходную, тем сильнее подзатыльники. Чтобы не быть совсем жестокими, мы еще подскажем, что нужно улучшить, чтобы удар в следующий раз был слабее. Декодировщику — как нужно поправить картинку и что нужно было понять из чисел. Кодировщику — как составлять эти числа, чтобы их лучше воспринял декодировщик.

Сперва у них ничего не будет получаться, так что подзатыльники будут знатными. Но постепенно кодировщик научится сохранять в числах больше смысла, а декодировщик — их расшифровывать. Например, первое число будет положительным, если на картинке кот, и отрицательным, если там собака. Второе число будет кодировать размер животного, третье — цвет шерсти и так далее 🐶🐱

Именно так и функционируют автоэнкодеры! Только кодировщик и декодировщик — это разные нейросети. После их тренировки декодировщик обычно отбрасывают. А вот кодировщик можно использовать, чтобы сжимать картинки (и другие объекты) в меньшую размерность и работать с полученными векторами для анализа данных. Например, их кластеризации или даже задач классификации. Несмотря на то, что мы не говорим нейросетям, какие картинки содержат котиков, а какие песиков, они выучивают такую информацию самостоятельно из данных. Разве это не элегантно?

Для картинок эта архитектура уже не так популярна, зато из нее вырос мощный метод генерации изображений — диффузия. А вот в биологии автоэнкодеры всё еще процветают: они используются для снижения размерности и интеграции данных из разных экспериментов в области транскриптомики отдельных клеток 🧬

Об этом как раз будет один из проектов на курсе «ML для Python»: вам предстоит написать собственный автоэнкодер для анализа данных пациентов с COVID-19 и здоровых доноров, а для искушенных студентов — вариационный автоэнкодер. О других кейсах, которые будут выполнять участники можно прочитать в этом посте.


Благодарим Владимира Шитова, подготовившего материал эксклюзивно для Бластим
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
10❤‍🔥76
🏋️‍♂️ Claude Science это потому что у Амодеи зудит?

Друзья, а вы знали, что глава Anthropic Дарио Амодеи пришел в ИИ из... биофизики? В Принстоне он работал над статистической механической моделью нейронных цепей. Затем в Медицинской школе Стэнфорда занялся применением масс-спектрометрии к моделям сетей протеома и поиском биомаркеров рака. Позже Дарио признавался: биология оказалась настолько многослойной — сплайсинг, модификации белков и взаимодействия молекул, что он начал сомневаться, способны ли люди разобраться в ней без помощи ИИ.

Может, Claude Science стал возвращением к научным корням и ответам, которые Дарио Амодеи не смог получить? Кто знает. А мы уже сегодня в 19:00 мск проверим, как хороша его ИИ-система для лайфсайенс.

🔗 Регистрация на встречу: https://t.me/BlastimML_bot?start=claude

Записи не будет — ждем всех в прямом эфире!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
14❤‍🔥74😱2
26 июля 2009 года. Ровно 17 лет назад. Тоже воскресенье. Волнение зашкаливает: остается менее часа до дедлайна растянувшегося на три года конкурса по машинному обучению. В 18:18 команда BellKor сабмитит свое итоговое решение. Через 20 минут то же самое делает их главный соперник The Ensemble и вырывается вперед, оказавшись на 0,0001 точнее. В 18:42 прием заявок завершается. Но тут случается неожиданный поворот сюжета…

В начале нулевых Netflix занимался видеопрокатом. Пользователи заказывали DVD-диски через интернет и получали их по почте. В личном кабинете зрители могли ставить фильмам звездочки по пятибалльной шкале. У компании существовал собственный алгоритм Cinematch, который советовал контент под вкус конкретного подписчика. Однако директор Рид Хастингс был им недоволен и искал свежие идеи.

Бизнесы редко раскрывают внутреннюю кухню, а Netflix поступил иначе. В октябре 2006 года компания выложила колоссальный датасет публично. 100 млн оценок, более 17 тыс. фильмов, 480 тыс. юзеров. И объявила соревнование Netflix Prize, задача которого — улучшить качество текущей рекомендательной системы на 10% по метрике RMSE. Награда внушительная: $1 млн.

Контест вызвал ажиотаж и привлек десятки тысяч информатиков, математиков, аналитиков со всего света. Испытать свои силы из любопытства решили старшекурсники факультета компьютерных наук Принстона, собрав команду Dinosaur Planet. Приняли вызов и матерые статистики из телекоммуникационного конгломерата AT&T. Люди вообще обожают кино: многие бросили привычные занятия, засели копаться в интересных данных и погружаться в тогда еще малоизвестную область — машинное обучение.

В течение двух лет заветные проценты оставались недосягаемыми. Но прогресс шел. Например, в первые же месяцы участники внедрили матричные разложения — они до сих пор очень актуальны в мире рекомендательных систем. Не обошлось без подковерных интриг. Группы то и дело распадались и объединялись. Летом 2009 года вырисовались два фаворита — The Ensemble, сборная солянка команд, куда вошли и «динозавры» из Принстона, и BellKor's Pragmatic Chaos, костяк которого составили инженеры AT&T.

26 июня 2009 года коллектив BellKor загрузил решение, которое наконец-то преодолело 10%-ный барьер. Событие запустило обратный отсчет: по правилам у остальных игроков оставалось 30 суток, чтобы предложить что-то лучше. Страсти накалялись, конкурсанты судорожно допиливали свои методы, пытаясь обскакать друг друга. Ко времени крайнего срока произошло то, что мы описали в первом абзаце. The Ensemble на финише выбился в лидеры. Но это только на публичном наборе. Когда открылись результаты на приватной части, выяснилось, что показатели метрики качества обоих претендентов совпали с точностью до четырех знаков после запятой (RMSE = 0.8567)! Организаторы вручили венок триумфатора тем, кто отправил заявку раньше — BellKor. Второму месту не досталось ни цента. Поистине драматическая развязка.

Ирония в том, что алгоритмы топов лидерборда так и не были внедрены в продакшн, оказавшись чересчур сложными. К тому же произошел переход от DVD к стримингу, где предпочтения пользователей отслеживаются по-другому. Тем не менее соревнование фантастически повлияло на мир айти. Научное сообщество познакомилось с реальной биг-датой. Были протестированы нестандартные техники, в том числе нейросети. Под впечатлением от конкурса возник Kaggle.

Сегодня ИИ интегрирован в нашу повседневность. Машинное обучение нужно вам как воздух, и вы тоже нужны машинному обучению с новыми мыслями. Уже завтра стартует бластимовский курс по ML, который может стать для вас лично таким же поворотным, как когда-то был Netflix Prize для человечества. Не упустите возможность!

#выходные_у_бластим
1❤‍🔥1754
🤝 Нас много — цель одна

Представьте: вы записались на курс по машинному обучению, заходите в чат, предвкушая первое занятие — и встречаете там вирусолога, химика, биотехнолога, парочку любопытных бакалавров и даже врача. Все вокруг с совершенно непохожим бэкграундом и уровнем подготовки: кто-то никогда не писал ни строчки кода, а кто-то уже живет в VS Code и ставит расширения одно за другим.

💪 В этом и преимущество: вы учитесь среди увлеченных людей, и рядом всегда найдется тот, кто объяснит непонятное даже в тысячный раз. Ведь помимо преподавателей на связи всегда будут учебные ассистенты, которые подскажут и на лекции, и при разборе домашки.

Но спешите — сегодня в 19:00 мск будет Python-разминка с Александром Ильиным. А дальше больше: трансформеры и Hugging Face, разбор HyenaDNA и AlphaFold для работы с последовательностями и белками, вариационные автоэнкодеры для анализа изображений, а на десерт деплой собственной модели и итоговый проект на выбор.

🚨 Записывайтесь сейчас — agency.blastim.ru/pythonandml — чтобы этой уже этой осенью взяться за отложенные проекты. Другого потока в этом году уже не будет, а по любым вопросам и скидкам можете написать Варваре @varvara_blastim
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
😁105❤‍🔥2
Список литературы на лето 📚

Если хочется почитать что-то легкое, забавное, но при этом такое, после чего мозг начинает шевелиться, предлагаем... статистику! Именно про нее очень много по-настоящему увлекательных книг: с комиксами, иллюстрациями, жизненными историями и юмором. А заодно начинаешь лучше понимать мир вокруг (и, конечно, AI).

⚠️ Осторожно! Возможны побочные эффекты в виде легких приступов душноты, повышенной чувствительности к плохим графикам и фразы «correlation does not imply causation»

P.S. До завтра действует самая низкая цена на осенний поток курса «Статистика, R и анализ данных». Пора разобраться в статистике не только в теории, но и на практике — на своих данных, с поддержкой опытных преподавателей и в компании людей, которым тоже важно задавать правильные вопросы ❤️
14❤‍🔥6🏆31
🧬 Открыта летняя стажировка для биотехнологов!

Компания ЭФКО ищет стажеров-биотехнологов, готовых расти вместе с компанией и участвовать в реальных биотехнологических разработках.

Обязанности:
проводить лабораторные эксперименты с микроорганизмами и ферментными препаратами
разрабатывать новые и дорабатывать существующие методики проведения биотехнологических экспериментов — чтобы результаты были точнее и воспроизводимее
следить за лабораторным оборудованием: организовывать его техобслуживание и поддерживать в рабочем состоянии
участвовать в подборе всего необходимого для экспериментов — от микроорганизмов и образцов продукции до реактивов, материалов и оборудования


Требования:
🎓 высшее образование по направлению «Биотехнология»
🧠 знание основ цитологии и биотехнологии — чтобы уверенно стартовать в лабораторных задачах
💪 исполнительность и ответственность — в науке важна каждая деталь
🚀 готовность учиться и осваивать новые подходы — мы поможем прокачать навыки под реальные задачи


Условия:
💰 заработная плата — от 80 000 рублей
🏠 жилье: квартира в корпоративном доме либо компенсация аренды
👶 поддержка семьи: доступ к корпоративному детскому саду и школе
⚕️ забота о здоровье: льготное обслуживание в лечебно‑диагностическом центре компании


📈Не упустите свой шанс!
Подача заявок по ссылке: https://forms.yandex.ru/u/6a61e9e21f1eb557d3c0d035
Или по почте: sosedko.anna@inbox.ru

#бластим_рекомендует
🥴11🔥764🍌2