❓ 10 вопросов БИОИНФОРМАТИКУ

Почти три года минуло с прошлого интервью с преподавателем курса «Анализ NGS-данных» и просто очень крутым ученым Алексеем Зарубиным. Что с тех пор изменилось в карьере и жизни Алексея? Как повлияла на его повседневную работу ИИ-революция? Что помогает выдерживать много часов за компьютером и не выгорать? И даже: какое надо железо, чтобы делать серьезную науку?

Это и многое другое мы спросили у Алексея. Читайте эксклюзив на нашем сайте

А свои вопросы, особенно про ИИ, готовьтесь задавать на вебинаре — уже завтра в 19:00 мск

⚡⚡⚡ Очень трудно сделать точный прогноз, особенно в том, что касается будущего...

Друзья, чтобы скрасить ожидание вебинара с Алексеем Зарубиным и проверить себя, предлагаем ответить на несколько задачек

Голосуйте в опросах ниже, а подробный разбор, конечно же, будет сегодня в 19:00 мск

Ждем всех!

🔗 Зарегистрироваться на вебинар

🧐 Всё или ничего? Извольте дать ответ

Клетки постоянно получают поток информации из внешнего мира. Но как они решают — запустить в ответ сигнальный путь или оставить всё как есть? Это вопрос, который выходит за рамки простой схемы «стимул — реакция», превращаясь в запутанную молекулярную логику. Что ж, в ее тонкостях разберемся 19 января в 19:00 МСК вместе с Мариной Уткиной.

Марина — эксперт по CRISPR и single-cell, PhD по молекулярной генетике (Институт генетики РАН), автор в Frontiers, Nucleic Acids Research.

На лекции узнаем, как изучить и проследить путь от множества стимулов к клеточным решениям на конкретных примерах.

🔗 Регистрация по ссылке в боте: https://t.me/BioEventsBot

Митохондрии помнят все ⚡️

Когда говорят о геноме человека, чаще всего имеют в виду только ядерную ДНК. При этом о митохондриальной ДНК (мтДНК) длиной чуть более 16.5 тысяч пар оснований нередко забывают. Давайте восстановим справедливость!

❓ Что делает мтДНК особенной?
• В мтДНК есть множество полиморфизмов, связанных с гаплогруппами.
• Практически отсутствуют некодирующие области.
• Частота мутаций выше, чем в ядерной ДНК, из-за меньшей защищенности и слабых механизмов репарации.
• МтДНК наследуется по материнской линии, что делает ее удобным маркером для изучения родства и миграций.
• В одной клетке может присутствовать несколько вариантов мтДНК. Это явление называется гетероплазмией.
• Нарушения митофагии (утилизации поврежденных митохондрий) связаны с хроническими и нейродегенеративными заболеваниями.

❗️Основные области применения анализа мтДНК
• Медицина
• Популяционная генетика и антропология
• Криминалистика и судебная экспертиза
• Палеогенетика

Главное преимущество мтДНК при работе с древними образцами — ее количество. В каждой клетке содержатся тысячи копий митохондрий. Благодаря этому мтДНК можно анализировать даже тогда, когда ядерная ДНК сильно разрушена, плохо извлекается или присутствует в минимальных количествах.

👑 «Царская» гетероплазмия
МтДНК сыграла важную роль в идентификации останков императорской семьи Романовых. На первых этапах экспертизы у исследователей не было заведомо подлинных образцов ДНК Николая II для прямого сравнения. Однако при анализе мтДНК из костных останков была обнаружена редкая гетероплазмия — присутствие двух вариантов мтДНК, отличающихся одной мутацией (замена C→T в позиции 16169). Поскольку мтДНК наследуется строго по материнской линии, эта особенность должна была присутствовать и у его родственников по матери. После эксгумации останков брата Николая II, великого князя Георгия, было выявлено полное совпадение мтДНК, включая ту самую редкую «царскую» гетероплазмию. Позднее эта же мутация была обнаружена и у правнучки сестры Николая II. Таким образом, мтДНК стала одним из первых ключевых доказательств подлинности останков.

Кстати, прошлым летом у нас проходил вебинар «От ридов к интерпретации: анализ NGS-данных митохондриальной ДНК» с Дарией Бородко — биоинформатиком, сотрудником НИИ общей патологии и специалистом по эпигенетике и анализу древней ДНК.

✉️ Хотите получить конспект с пайплайном анализа NGS-данных и памяткой по полезным веб-сервисам? Просто напишите Варваре @varvara_blastim: «Хочу конспект по мтДНК»

✨ Ближневосточный Стэнфорд распахнул свои двери для бластимовцев

Первый в мире Университет Искусственного Интеллекта имени Мохаммеда бен Заида (MBZUAI) объявил о наборе талантливых иностранных кандидатов на полностью финансируемые магистерские и PhD-программы по вычислительной биологии. MBZUAI — это передовой ИИ-хаб, где ведут исследования и преподают топовые ученые, в том числе из России.

Если вы давно мечтали влиться в глобальный айти-движ, а от фразы «ИИ + Биология» ваше сердечко начинает биться быстрее, то приглашаем узнать подробности из первых уст на вебинаре «ИИ-революция в бионауках. Открой MBZUAI». Встреча пройдет 21 января, 20:00 мск онлайн на площадке Бластима.

🤩 Проведет ее Юлия Медведева, к.б.н., специалист в регуляторной геномике, транскриптомике и эпигеномике (scRNA-seq, ATAC-seq), эксперт в области lncRNA, автор в Nature, Nature Communications, PLoS, BMC genomics, Nucleic acids research (h-index = 28 по Google Scholar), профессор в MBZUAI

Программа:

📍 напоминалка об ИИ-революции в бионауках
📍 новая магистратура в MBZUAI: что, где, когда и сколько
📍 проекты под руководством Юлии Медведевой, к которым можно присоединиться
📍 сессия ответов на вопросы

✅ Зарегистрироваться тут: sbsite.pro//web210126_1

✅ Больше о маге и аспе в MBZUAI: blastim.ru/job/6467/

Подавайте заявку прямо сейчас — Бластим окажет помощь в подготовке документов и поступлении. Дедлайн: 10 февраля