Трудности перевода: почему у растений геном ≠ функция?

У «зеленых» всё не как у людей. Посудите сами. Растения могут спокойно пережить удвоение генома (но могут и умереть). Да и геном у них не один, а целый тройничок — ядро-пластиды-митохондрии. А энергетические станции в их клетках — вообще самые странные в биологии. Эти и другие фичи делают функциональную аннотацию генома растений затруднительной. Как быть? На помощь спешит транскриптомика!

Именно этим вопросам посвятим встречу 13 января в 19:00 МСК с Максимом Макаренко — ведущим научным сотрудником Университета «Сириус», PhD по генетике подсолнечника, автором 30+ статей в Plant J, Genes, BMC Biology.

Вы узнаете, что такое гибридная сила, почему single-cell ломается об растения, как найти полезные гены и применить их в агротехе.

Доступ на лекцию по ссылке: sbsite.pro//BioEvents_1

Присоединяйтесь🌻

P.S. Участвуйте в конкурсе БИОмечтателей: https://forms.yandex.ru/cloud/693c1a93e010db35fd797439/

Миллион, миллион, миллион алых VUS

Отсеквенировать быстро и много? Без проблем. Биоинформатически обработать? Пожалуйста. А вот клиническая интерпретация NGS-данных до сих пор остается бутылочным горлышком в воркфлоу. Эксперты денно и нощно фильтруют и анализируют тысячи найденных вариантов, сопоставляя информацию из баз данных и других источников. Это тяжкий труд, требующий высокой квалификации, опыта и смекалки. К тому же вердикты разных специалистов могут конфликтовать, да и профессионалов не всегда легко найти, когда приходит пул новых данных секвенирования. А пациенты ждут диагноза...

❗️ Но сейчас есть тот, кто готов пахать 24/7 и на кого можно свалить рутину. Поэтому — внимание: 15 января в 19:00 мск биоинформатик Алексей Зарубин покажет практикум ИИ-автоматизации в задачах геномики.

Мы потестим большие языковые модели (GPT, Gemini) и узнаем:

🧬 как запромтить задачу классификации генетических вариантов по критериям ACMG?
🧬 совпадут ли оценки патогенности ИИ с консенсусом живых экспертов?
🧬 где и почему нейросети ошибаются, а когда они хороши?

💡 Бонусом рассмотрим новый инструмент от Google, который релизнули в начале декабря

Онлайн-семинар будет полезен всем, кто занимается клинической интерпретацией, медицинской генетикой и интересуется БАМами и БЯМами

🔗 Регистрироваться по ссылке: https://sbsite.pro//web150126_1

Пропускать такой веб — не вариант

↗️ Маленький шаг сегодня, большие данные завтра

Участники курсов часто приходят к нам по совету коллег. Для нас это очень ценно. Но многие не останавливаются на одной программе, а продолжают обучение и дальше. А это, пожалуй, даже более показательный фидбэк для нас. Спасибо огромное за доверие!

Чаще всего выпускники остаются с Бластим из-за комьюнити, где все говорят на одном языке и с которым легче влиться в новую среду. Кроме того, преподаватели и ассистенты буквально вытягивают вас за руку на основную ступень понимания предмета. С нее уже яснее видно, куда двигаться дальше. В итоге слушатели частенько открывают для себя новые направления и нередко кардинально меняют взгляд на свою карьеру и возможности. Поэтому делимся тем, как прошел осенний поток курса: https://rutube.ru/plst/1414377

Самый же частый совет новичкам: не бояться пробовать и действовать. Даже если пугает объем информации или страх ошибок заставляет прокрастинировать. С каждым шагом путь становится понятнее, проще и даже веселее. А благодаря записям занятий можно пройти по одной и той же тропинке столько раз, сколько нужно для полного освоения.

Тем, кто все-таки не уверен в себе (или в нас?), мы советуем попробовать самый доступный мини-курс по Linux уже в эти выходные. На нем вы получите универсальные и востребованные навыки для любой сферы.

Пора почувствовать свободу и уверенность в том самом черном терминале. Кто знает, возможно, это станет вашим билетом в мир больших данных

❓ 10 вопросов БИОИНФОРМАТИКУ

Почти три года минуло с прошлого интервью с преподавателем курса «Анализ NGS-данных» и просто очень крутым ученым Алексеем Зарубиным. Что с тех пор изменилось в карьере и жизни Алексея? Как повлияла на его повседневную работу ИИ-революция? Что помогает выдерживать много часов за компьютером и не выгорать? И даже: какое надо железо, чтобы делать серьезную науку?

Это и многое другое мы спросили у Алексея. Читайте эксклюзив на нашем сайте

А свои вопросы, особенно про ИИ, готовьтесь задавать на вебинаре — уже завтра в 19:00 мск

⚡⚡⚡ Очень трудно сделать точный прогноз, особенно в том, что касается будущего...

Друзья, чтобы скрасить ожидание вебинара с Алексеем Зарубиным и проверить себя, предлагаем ответить на несколько задачек

Голосуйте в опросах ниже, а подробный разбор, конечно же, будет сегодня в 19:00 мск

Ждем всех!

🔗 Зарегистрироваться на вебинар

🧐 Всё или ничего? Извольте дать ответ

Клетки постоянно получают поток информации из внешнего мира. Но как они решают — запустить в ответ сигнальный путь или оставить всё как есть? Это вопрос, который выходит за рамки простой схемы «стимул — реакция», превращаясь в запутанную молекулярную логику. Что ж, в ее тонкостях разберемся 19 января в 19:00 МСК вместе с Мариной Уткиной.

Марина — эксперт по CRISPR и single-cell, PhD по молекулярной генетике (Институт генетики РАН), автор в Frontiers, Nucleic Acids Research.

На лекции узнаем, как изучить и проследить путь от множества стимулов к клеточным решениям на конкретных примерах.

🔗 Регистрация по ссылке в боте: https://t.me/BioEventsBot