Интервидение интервидением — а Бластим поет: новый поток курса по «Анализу NGS-данных» начнется

🔤🔤 🔤🔤🔤🔤🔤🔤

🔤🔤🔤🔤

Вчера же завершился 10-дневный осенний интенсив.

Участники переполнены знаниями по самую макушку, но это еще не конец истории. Впереди 2 недели практики на сервере и проекты от преподавателей. Например, такие:

Крысиные диеты 🐀

Макроэволюция генома 🧬

Vibrio cholerae 🦠

Изменение фенотипа иммунных клеток крови при системном ювенильном ревматоидном артрите🩸

Метилирование в онкологии 👻

Ого! Но сказать, что бластимовский NGS крут — ничего не сказать. А следующий зимний поток 2026, по секрету, будет совсем особенным, поскольку программу ждут важные обновления.

🔗 Заберите курс по теплой базовой цене и получите невероятный экспириенс: clck.ru/3PK6JW

💬 Для личной консультации обращайтесь к Варваре: @varvara_blastim

Зима близко — и только время решит, кто будет править данными, а кто останется под снегом

🐳 Однажды к берегам Норвегии приплыл кит-белуха, на теле которого обнаружили камеру GoPro. Местные жители окрестили его Хвалдимиром. А власти заявили: белуха — обученный российский разведчик...

Клан Сопрано
🧠 Поверить в кита-шпиона легко, ведь китообразные очень умны. Важный аспект интеллекта — это коммуникация. Например, другие зубатые киты, кашалоты, обладают самым большим мозгом в мире, крайне общительны и координируют поведение. Семьями они и нянчатся с телятами, и охотятся на кальмаров, погружаясь на глубину до 2 км. Для навигации в темноте они используют эхолокацию, издавая щелчки, похожие на стук клавиатуры. Прям как азбука Морзе. А на поверхности воды киты беседуют с сородичами. Тоже с помощью щелчков, но объединенных в серии (3–40 щелчков) — коды. Кашалоты могут калякать часами на расстоянии километров друг от друга. Их болтовню записывают ученые.

Всего известно 150+ типов код. Как в разных англоязычных странах говорят на диалектах, так и у каждой группы кашалотов — свой набор код, составляющий культурную идентичность. Скажем, визитная карточка карибских китов — кода 1+1+3 (щелк, пауза, щелк, три быстрых щелчка). Сотни и даже тысячи особей со своим рационом питания, поведением и щелканьем, отличным от китов из других мест океана, составляют вокальный клан.

Гиганты Карибского моря
Морской биолог Шейн Геро из Карлтонского университета Оттавы 20 лет провел у живописных берегов карибского острова Доминика, где изучал коммуникацию китов в рамках The Dominica Sperm Whale Project (DSWP). Да, по-английски кашалоты — sperm whales. Название происходит от спермацета — жировоска в головном мешке кашалота, который ошибочно считали спермой 🗿 В 18 веке из него делали свечи, в том числе ради этого китобои беспощадно истребляли кашалотов.

Сейчас Геро присоединился к мегапроекту Cetacean Translation Initiative (CETI), основанному микробиологом Дэвидом Грубером в 2020 году. Аббревиатура намекает на SETI — институт по поиску внеземных цивилизаций 👽 Инициатива объединяет айтишников, языковедов, криптографов, биоакустиков и привлекает передовой ИИ и роботов. С помощью датчиков на китах, гидрофонов и дронов ученые получают 30 ТБ данных в месяц. А также анализируют аудиозаписи проекта DSWP за предыдущие годы. Однако ручная аннотация щелчков — работа титаническая: 1 мин аудио = 10 мин труда.

ИИ спешит на помощь
Ситуацию изменил ИИ: ML-алгоритмы и нейросети ускорили анализ спектрограмм, детекцию и классификацию код, обнаружение новых акустических единиц. В 2023 году аспирантка MIT и член CETI Пратюша Шарма предложила новаторский способ визуализации код — в координатах время-время (exchange plot), что открыло любопытную картину. Оказывается, киты могут варьировать длину интервалов между щелчками (ритм) и длительность каждой коды (темп). И по ситуации — ускорять/замедлять темп (рубато) и добавлять дополнительные щелчки (орнаментация). Термины взяты из музыки 🎶 Эти четыре элемента создают комбинаторную сложность и позволяют передавать больше информации. А еще лингвист CETI Гашпер Бегуш нашел среди код подобие гласных и дифтонгов. Ученые говорят о «фонетическом алфавите кашалотов».

🤖 Сейчас цетологи идут вперед и тренируют китовые языковые модели. В отличие от обработки человеческого языка, в речи китов мы плохо знаем базовые элементы. Чтобы дойти до смысла, нейросети необходимо соотнести звуки с поведением. WhaleLM принимает на вход аудио бесед китов и предсказывает последующие сигналы, а также текущее и будущее поведение. До Google Translate пока не дошло, однако рисечеры уже связали ряд вокализаций с состояниями (погружение, всплытие) и установили, что информацию несут не коды, а структуры более высокого уровня.

Что дальше?
Привлекая компьютерные технологии, зоологи, этологи, экологи изучают голоса и других животных: 🐵🐤🐘 DeepMind обучили ллмку DolphinGemma на криках дельфинов. Предпринимаются попытки не только декодинга, но и генерации ответов зверям!

🐍 А как насчет змеиного языка? Сегодня Бластим запустил акцию: учим Python, учим машинное, сливаемся с природой. Щелкайте по ссылке 👇

Let’s have a whale of a time with Blastim