События, определившие образ статистики. То, без чего ее невозможно представить, еще труднее — понять

☕️ Начало XX века. Британский файф-о-клок представлял собой не просто чаепитие, а настоящий светский ивент. Однажды компания молодых людей наслаждалась послеобеденным чаем. Джентльмен с вандейковской бородкой налил чашечку и, как положено, сначала предложил откушать даме. Та вежливо отказалась, мол «it's not my cup of tea», уточнив, что она предпочитает сперва наливать молоко, а потом чай. Удивленный джентльмен возразил с улыбкой: «Чепуха, разницы никакой». Но дама настаивала, что чувствует порядок добавления ингредиентов по вкусу. Тогда еще один мужской голос произнес: «Давайте ее проверим!» Мужчины приготовили 8 чашек заварки с молоком: 4 одним способом, 4 другим. И поставили в случайном порядке. Задача — корректно выбрать 4 чашки «сначала-молоко». Леди приступила к дегустации...

Примерно так начинается II глава знаменитой книги «The Design of Experiments» Рональда Фишера, изданной в 1935 г. Далее по ходу повествования отец статистики (а еще немножечко расист и евгеник) объяснил математику «психофизического» эксперимента. Он выдвинул нулевую гипотезу: леди не различает порядок наливания. Фишер установил, что при условии верности H₀ распределение числа правильных ответов (из 4 возможных) — гипергеометрическое. А вероятность случайного угадывания всех 4 из 4 чашек равняется всего-то 1/70 ≈ 0.0143. Это и есть p-value, и оно < 0.05. Другими словами, отклонить H₀ можно в одном случае — если бы дама ни разу не ошиблась. Даже 3 из 4 недостаточно для отвержения нулевой гипотезы.

Вот так легкомысленный опыт побудил Фишера ввести важные инновации в статистике и методологии экспериментов: рандомизацию, уровень значимости и концепцию H₀. А описанная выше процедура проверки гипотез получила имя точный тест Фишера. Он и поныне используется для таблиц сопряженности, скажем, в анализе обогащения генов.

🎭 Любопытно, Фишер в своем трактате не привел ни конкретных результатов дегустации, ни имен участников. Наиболее убедительную версию событий рассказала в 1978 г. дочь статистика Джоан Фишер Бокс в биографии отца. Чаевничал гениальный ученый с коллегами на Ротамстедской сельхозстанции к северу от Лондона в начале 1920-х. Что весьма правдоподобно. Поскольку в 1919 г. Рональд переехал с женой и 3 детьми на агростанцию, где стал главным статистиком. В то же время там трудилась женщина, идентифицируемая как Мюриэль Бристоль. Она была альгологом, а на станции исследовала почвенные водоросли. В ее честь назван вид Chlamydomonas muriella. Вторым джентльменом был влюбленный в Мюриэль биохимик Уильям Роуч — в Ротамстеде он занимался инсектицидами. Именно Уильям осмелился предложить провести тест. Вероятно, после тех чайных посиделок он так впечатлился Мюриэль, что почти сразу женился на ней. Кстати, госпожа Бристоль не смогла распознать все чашки верно 🥲

📖 По другой версии, выдвинутой Дэвидом Салсбергом в научпоп книге, которая так и называется «The Lady Tasting Tea», чаепитие состоялось летом в Кембридже в конце 20-х. Поведал ее Салсбергу профессор Хью Смит, якобы очевидец событий. Однако к тому времени Фишер — давно выпускник, и неясно, что он забыл в своей альма матер. Зато согласно Салсбергу, леди угадывает всё!

🍒 Ну и вишенка на торте — статистик Морис Кендалл утверждал, что сам Фишер ему признавался: чайная церемония вообще не имела места, весь эксперимент — мысленный. Как бы то ни было, «леди, пробующая чай» — поворотный момент в статистике, да и жизни. Бостонское и безумное чаепития нервно курят в сторонке.

#выходные_у_бластим

🧬 Искусство NGS

16 сентября в 14:00 мск присоединяйтесь к эксклюзивному вебинару на платформе Blastim — «Технологии NGS 3-го поколения. Нанопоровое секвенирование: обзор и перспективы» 🤩

Спикеры:

👨‍⚕️ Александр Лавров, к.м.н., директор Ташкентского МГНЦ, ведущий научный сотрудник лаборатории редактирования генома (ФГБНУ «МГНЦ») — расскажет, куда ведут длинные риды

👨‍⚕️ Дмитрий Полев, к.б.н., с.н.с., руководитель группы метагеномных исследований НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера (Санкт-Петербург) — поделится опытом использования нанопорового секвенатора в микробиологической практике НИИ им. Пастера

Почему это ценно:

• Уникальный формат с участием ведущих экспертов и технологических поставщиков;
• Реальные кейсы и практические insights по применению нанопор в научных исследованиях;

🔗 Ссылка на регистрацию: clck.ru/3P5waz

Участие полностью бесплатно! Не упустите шанс узнать о новейших трендах в NGS, задать спикерам свои вопросы и получить доступ к технологически продвинутому контенту.

#бластим_рекомендует #бластим_технологии

— Сейчас статистику посчитаем, а потом гипотезу придумаем!
— Почему бы не убрать все выбросы? И p-value маленьким станет...
— Давай проведем побольше тестов и выберем тот, где результат значим?
— А что такого, что мы заменили все NA нулями?

🚩 Если вас не смущают такие фразы, то это красный флаг 🚩

И сигнал, что в пятницу 12 сентября в 18:30 (мск) однозначно стоит посетить встречу с преподавателем статистики на R и автором канала @stats_for_science Еленой Убогоевой.

Спикер расскажет про статистические манипуляции, ошибки и нелепицы, вызывающие мурашки по коже и фейспалм у профессионалов. Самое волнующее — разговор про НОРМАЛЬНОСТЬ. Что если ваши данные не нормально распределены: как дальше жить? какой тест брать? идти в непараметрику? как интерпретировать результат?

Вебинар подойдет тем, кто:

📌 стремится избегать p-хакинга, черри пикинга и прочего мошенничества
📌 готов впитывать практические советы от экспертов, которые набили шишки
📌 сам профессионал, но ищет место для дискуссий

🔗 Регистрируемся по ссылке https://clck.ru/3P89xk

Накидывайте свои вопросы или заблуждения в комментах к посту — Елена постарается на всё ответить на лекции

Встреча проходит в рамках лектория «Академия Статистики»

YES WE KAN: нейросети родом из СССР 🇷🇺

Крупные архитектурные прорывы в искусственном интеллекте случаются не так часто. Горячей темой последних лет стали так называемые сети Колмогорова–Арнольда (KAN). Они опираются на одноименную теорему 1957 года.

Многомерная непрерывная функция может быть представлена как композиция конечного числа функций одной переменной и операции сложения 😱

Фактически это позволяет выразить любую страшненькую функцию, описывающую наши данные, двухслойной нейросетью с простыми функциями. Удобно! Однако теорема советских математиков десятилетиями считалась теоретической конструкцией, невозможной для применения в ИИ из-за технических ограничений.

👀 И вот 30 апреля 2024 года на arXiv неожиданно вышла статья специалистов из MIT, Калтеха и других институтов, где они продемонстрировали работающую KAN и библиотеку для нее — pykan. Ученым удалось обойти проблемы с гладкостью функций и, главное, — сделать сеть глубокой. После чего за считанные месяцы расцвел целый сад различных KAN’ов. Оказалось, что новаторская архитектура работает не хуже, а где-то и лучше привычных нам нейросетей (на базе многослойного перцептрона). Например, KAN’ы показали мощь в научных задачках: решение диффуров в частных производных, извлечение признаков из МРТ-снимков, анализ данных на графах, молекулярная динамика. В KAN обучаемы сами функции активации, а архитектура более интерпретируема в отличие от классических сеток — «черных ящиков». С помощью KAN можно выводить уравнения физических законов прямо из данных!

Видеть имя Колмогорова в области ИИ неудивительно. Андрей Колмогоров — «советский фон Нейман», внес вклад в самые разные области математики, многие из которых крайне важны для компьютерных наук и ML: логика, теория алгоритмов и информации, теория вероятностей и статистика...

И здесь на ум еще приходит критерий Колмогорова–Смирнова, предложенный в 1933 году. Его используют для проверки гипотезы о соответствии эмпирического распределения теоретическому. Чаще всего — нормальному. Но что если ваша выборка провалила проверку на нормальность — «гудбай t-тест»? Или это неправда? 😈

Об этом мы завтра и порассуждаем вместе с Еленой Убогоевой: надо ли вообще проверяться на нормальность? в каких случаях применять непараметрику? как быть с «выбросами» и множественным тестированием? Острейшие вопросы — сам Колмогоров заглянул бы на вебинар 💪

Ждем и вас. Пятница в 18:30 мск

👽 «Нелегальные туристы» на МКС пойманы с поличным

Долгие годы мониторинг микробного разнообразия на борту Международной космической станции зависел от возврата образцов на Землю. Это, конечно, занимало много времени и вносило погрешности. Ситуацию радикально изменило появление портативного нанопорового секвенатора. Теперь «нелегалов» можно ловить прямо на орбите и без профильного экипажа.

Но мобильность и удобство — лишь «бонус» метода. Приглашаем обсудить плюсы и минусы длинных ридов на бесплатном вебинаре «Технологии NGS 3-го поколения. Нанопоровое секвенирование: обзор и перспективы»

🗓 Когда: 16 сентября, 14:00 (МКСК)

🎙Спикеры:
• Александр Лавров, к.м.н. — «Куда ведут длинные риды»
• Дмитрий Полев, к.б.н. — «Опыт использования нанопорового секвенатора в микробиологической практике»

🔗 Подробности и регистрация: clck.ru/3PAM8X

Вебинар будет интересен и тем, кто только начинает знакомство с NGS, и опытным специалистам. Вас ждут реальные кейсы, актуальные решения и живая дискуссия.

Опасаетесь ошибок в длинных ридах? Отлично! Приходите — разберемся в прямом эфире ⭐️

Крид vs. Мизулина, Дрейк vs. Ламар, Мэйби Бэйби vs. Инстасамка. Баттлы, конфликты, скандалы постоянны в хип-хопе. Но ученые же тут ни при чем...

😅 Хотя погодите-ка! Перенесемся в начало нулевых. Университет Пердью, США. Аспирант факультета компьютерных наук Арман Наваби под говорящим псевдонимом MC Plus+ выпускает два музыкальных альбома Algorhythms и Chip Hop и объявляет себя «Тупаком computer science». Потом у него начинается биф (=вражда) с другим рэпером. Конкурент записывает на него дисс (=оскорбительный трек) под названием So Much Drama in the PhD, где изящно насмехается:

By the time you’ve rhymed one line, I’ve already busted ten
You rap in exponential time and I’m big-O of log(n)

🎶 Присущие гангста-рэпу бахвальство, унижение — на месте. Но в придачу — компьютерный сленг, отсылки к алгоритмам и шутки, понятные только кодерам. Это нердкор, детка! Точнее гикста-рэп. Композиции тут сочиняют гики и хвастаются не своими криминальными связями и тачками, а математическими способностями и кодом. Нердкорщики живут двойной жизнью: днем сидят на парах, а в свободное время читают агрессивный айти-рэп. Один из прославившихся исполнителей — это как раз соперник MC Plus+, Monzy.

💿 Monzy (он же Дэн Майнес-Аминзаде) — уроженец Миннесоты, позже работавший в Google, Microsoft и NASA. Monzy получил степень бакалавра в университете Карнеги-Меллона, где изучал человеко-компьютерное взаимодействие и виртуальную реальность, затем окончил магистратуру в MIT. В 25 лет, во время пхд в Стэнфорде, парень стает гикста-рэпером. Его хит и, пожалуй, самая популярная песня всего направления — Kill Dash Nine.

👩‍💻 Грубо, вызывающе, но рифмы — гениальные. Текст изобилует жаргоном на темы микропроцессоров, компьютерных сетей, вычислительной сложности. А лейтмотивом песни выступает Linux-команда $ kill -9 PID. Это суровый SIGKILL, служащий для немедленного и безоговорочного завершения процесса. В треке команда — метафора, означающая «заваливание» оппонента в словесной схватке:

KILL DASH NINE
No more CPU time
I run KILL DASH NINE
And your process is mine

Теперь и вы знаете, какие строчки напевать, если в черном терминале что-то пошло не так. Кстати, конфликт Monzy и Plus+ завершился примирением: в 2006 году они выступили на одной сцене в Вегасе 🤝

P.S. Впервые о песне kill -9 мы услышали от Евгения Герасимова на курсе NGS, когда освежали азы Linux. Мы решили рассказать вам эту историю в связи с прошедшим вчера днем программиста 🎉

#выходные_у_бластим

Дарвин бы одобрил 🦎

Мы хотим, чтобы почтовая рассылка Бластим эволюционировала в нужном направлении. Для этого запускаем «естественный отбор» формата писем: какие выживут?

📩 Дайджесты — короткие, но регулярные апдейты
📚 Свежие вакансии мира науки
📰 Научные новости и исследования

Выберите то, что ближе именно вам — это займет не больше 5 минут. Всем, кто заполнит анкету, приготовили подарок 💝

👉 Пройти опрос: https://forms.yandex.ru/u/68849d48eb61460c371b4b46/

Так мы сможем сделать рассылку по-настоящему полезной и интересной. Спасибо, что помогаете нам расти и меняться!

Вебинар «Технологии NGS 3-го поколения. Нанопоровое секвенирование: обзор и перспективы» начинается уже через 2⃣ часа

На вебинаре эксперты расскажут:

• Чем длинные риды принципиально отличаются от коротких

• Где нанопоровое секвенирование уже используется в исследованиях

• Какие перспективы открываются перед исследователем

Регистрация доступна —
clck.ru/3PEXPL 👉