1️⃣Какое первое действие нужно совершить, прежде чем планировать переезд за рубеж?

Верно! Посмотреть вебинар Бластима с Олей Введенской на тему ментальное здоровье и иммиграция. Там мы подробно разбираем график кривой, которая иллюстрирует все фазы культурного приспособления: от подготовки к отъезду до обратного культурного шока. Зачем это нужно? Чтобы на каждом этапе ученые-иммигранты могли понять, где они находятся, какие проблемы у них могут быть и как их успешно решить, сохранив ментальное здоровье ✈️

❓Также из видео вы узнаете:

— возможно ли переехать с детьми?
— почему возвратиться домой это не слабость?
— где найти хорошего психотерапевта за границей?
— как влиться в комьюнити на новом месте?
— в каких странах студентам перекрывают стоимость антидепрессантов?

Мы выкладываем запись на ютубе с удобным таймкодом. В описании есть ссылки на упоминаемую литературу.

🔣 Советуем посмотреть, поделиться и подписаться на Бластим 🔣

⚡️Вместо тысячи отчетов. Мы разузнали, чем в декабре 2023 года заняты люди науки на самом деле

📣 Кого зовет биоинформатика? Из электронщика в вычислительного биолога

Исследователь родом из Турции Адиль Мардиноглу получил образование инженера по электронике и телекоммуникациям в Стамбульском Техническом университете. Но в 2010 году решил заняться биоинформатикой. И совершил, можно сказать, стремительный карьерный скачок: в 2015 получил должность ассистента, в 2018 — доцента, а спустя всего три месяца его взяли в знаменитый Королевский Колледж Лондона, где ученый стал одним из самых молодых профессоров.

Сегодня Мардиноглу — признанный эксперт в области системной медицины и вычислительной биологии. Он изучает метаболические заболевания, нейродегенерации, рак. У него около 100 статей в топовых научных журналах, а еще он учредитель 6 стартапов, разрабатывающих таргетные препараты с помощью мультиомиксных подходов и ИИ. Прямо сейчас ученый интегрирует метаболические модели (GEMs) разных клеточных типов и онкоклеток с сигнальными сетями и интерактомом для выявления молекулярных механизмов болезней, идентификации биомаркеров и новых лекарственных мишеней.

❓В чем секрет успеха? Недавно биоинформатик дал интервью Nature, где рассказал о развитии отрасли и своем треке. Важные поинты:

— наборы данных растут быстрее, чем ресурсы для их тщательного анализа, поэтому существует острая потребность в новых талантах. Мардиноглу признается, что ему всё сложнее удерживать своих постдоков, потому что они востребованы, особенно в биомедицине/биофарме
— карьерный рост достаточно быстрый: аспирант Мардиноглу к окончанию обучения имел за плечами более 30 статей и уже устроился в NIH
— у ученых есть возможность найти себя в самых разных направлениях: собственно биоинформатике/системной биологии/ИИ/Big Data
— биоинформатика открыта для всех: туда идут биологи, врачи, химики, доучивая программирование, или айтишники, осваивая молекулярную биологию

По мнению Мардиноглу, биоинформатика удовлетворяет гностические потребности и дает финансовую стабильность. Мы с ним совершенно согласны!💥

#бластим_технологии

А вот и выходные, кажется, можно отдохнуть…Но нет, опять надо быть на какой-нибудь конференции

Конференции — отличное место, где вы можете быстрее получить представление о последних тенденциях, чем читая 100500 мгновенно устаревающих публикаций. Там же можно делать нетворкинг с представителями компаний и коллегами или представить свою статью, которую будут чаще цитировать. Во время пандемии был переход на гибридный формат, но он не заменил полноценное личное общение: ученым в Zoom сложнее завязать связи.

Несмотря на огромную значимость, 73% процента людей из академии, опрошенных Nature, против конференций по выходным. А ученые-родители давно призывают перестать организаторов ивентов красть их викенды. Ведь так у них банально не остается времени восполнить силы, побыть с семьей, сделать домашние дела. Многие мамы признаются, что из-за невозможности посещать научные конгрессы они выпадают из комьюнити, у них проблемы с продвижением по карьерной лестнице.

Но почему же проводят конференции по выходным?

✅Большие международные симпозиумы часто планируются на выходные, так как именно в это время свободны залы и места в гостиницах.

✅Многие под завязку завалены делами в будни. Например, клиницисты заняты с пациентами с понедельника по пятницу. Преподаватели или журналисты, посещающие биомедицинские ивенты, вынуждены искать себе замену, когда они отсутствуют в рабочие часы.

Что предпринимается для улучшения ситуации?

Организаторы начинают идти навстречу родителям. Например, американская ассоциация иммунологов в 2023 г. предложила бесплатный уход за детьми на месте участникам своего ежегодного конгресса, а на следующий год обещала убрать дату с праздничного дня. Однако далеко не везде есть детские и пеленальные комнаты. А на выставки биофармы детей вообще не пускают из-за правил о рекламе лекарств. Не хватает и финансирования для семейного посещения 👨‍👩‍👦

Отменить субботние и воскресные встречи будет непросто, но сдвиги начинаются. А как вы считаете, когда лучше проводить конференции?

#про_карьеру_по_субботам

Всех с началом рабочей недели! Сегодня мы расскажем про три неочевидные плюшки от Бластим, о которых многие не знают 💥

📌Итак, что дает любой курс Бластима? Программистские, биоинформатические и аналитические навыки — безусловно. Но не только, а что еще?

💬 Чат выпускников и поддерживающее комьюнити на долгие годы. На каждом курсе есть чат, и в этот чат можно написать даже спустя два года, и тебе помогут с вопросами. Если наши выпускники или преподаватели затрудняются с ответом, мы всегда постараемся найти знающих экспертов, ведь мы знакомы почти со всеми в отрасли в России и со многими за рубежом.

📜 Удостоверение о повышении квалификации гособразца. По окончании курса и выполнении финального проекта вы получаете подтверждающий документ. Корочки от Бластим ценятся компаниями и вузами, их не придется вешать на стену или оборачивать в файлик и складывать в долгий ящик. Их нужно демонстрировать: указать в резюме, загрузить на страничку в линкедине. По ссылке можно посмотреть образец!

Кстати, все наши удостоверения о повышении квалификации проходят регистрацию в госреестрее, их можно пробивать и проверять подлинность, как на скриншоте выше 🔼

🔥Где я скорее могу всё это получить? Конечно, на ближайших курсах! И вот третий бонус: у нас можно присоединяться к курсам ДО их старта, и начинать изучать материалы по записям предыдущих потоков. Например, уже сейчас можно подключаться к нашей программе по машинному обучению на Python для решения биоинформатических задач и сразу же получить доступ к памятке в Notion, а во время и после обучения — все остальные бонусы 🤩

📎 Узнать больше о ML можно тут

⚡️ Нам стало известно, как может выглядеть самая богатая лаборатория в России по итогам 2023 года

❓Сколько стоит скилл? Ученые из Оксфорда всё посчитали

🚗 Когда появились автомобили, они вытеснили гужевой транспорт 🐎, а с ними исчезла и профессия извозчика. Многие в наши дни тоже боятся, что ИИ и роботы лишат их работы. На самом же деле автоматизация не столько уничтожает, сколько создает рабочие места. И меняет требования к скиллам людей. Но обычно почти никто из работников не переучивается с нуля, а дополняет уже имеющиеся умения. Чтобы реагировать на технологические изменения работодателям важно инвестировать в переквалификацию. Однако точные требования для новых профессий неизвестны, поэтому неясно, какие именно навыки сегодня стоит приобретать, чтобы оставаться на плаву. А какие получать невыгодно? Нетривиальный вопрос. Например, попытки привести программы обучения в вузах к соответствию современным запросам, обычно терпят фиаско из-за того, что прогресс опережает реформирование образования.

🏛 Ученые из Оксфорда, позаимствовав данные 25 тыс. работников с онлайн-платформы для фрилансеров, провели весьма любопытное исследование, где рассчитали рыночную стоимость отдельных навыков. Они использовали сетевой подход: построили граф с узлами-навыками и ребрами, отражающими частоту их совместной встречаемости. А также провели регрессионный анализ, определив, какую прибавку к зарплате дает каждый из навыков в зависимости от разных факторов. Всего изучили 962 навыка, которые кластеризовались в 7 групп, таких как «Дизайн», «ПО и технологии», «Маркетинг» и т.д.

🤝 Сеть показала реальную взаимосвязь навыков друг с другом: они никогда не встречаются изолировано, а входят в наборы родственных скиллов. Ценность навыка во многом определяется его рыночными спросом и предложением. Но не только: важна еще взаимодополняемость, то есть комбинируемость c другими скилами. Дающими существенную прибавку к зарплате оказываются те, у которых большое число сочетаний с другими навыками, тоже ценными и разнообразными.

💡И что это за навыки? Например, программирование. Python легко интегрируется с разными умениями и гораздо универсальнее, чем способность ретушировать фото. Особое внимание в статье ученые уделили навыкам разработки и поддержания технологий искусственного интеллекта (машинное обучение), а также инструментам для запуска алгоритмов (конечно, опять Python). Они оказались вообще самыми весомыми среди всех. А кто бы сомневался! Повсеместное проникновение больших языковых моделей, таких как ChatGPT, и генераторов изображений, показало, что ИИ-навыки могут пригодиться практически повсеместно, на них устойчивый спрос. Машинное обучение, Tensorflow, Deep Learning, NLP оказались даже более востребованы, чем датасайнс или C++. По надбавке машинлернинг безоговорочно лидирует, обеспечивая рост зарплаты на 40%! 💸 Интересна и динамика во времени: с 2015 по 2022 гг. ценность, скажем, Python увеличивалась, а Java падала, Tensorflow и Deep Learning поднабрали популярность по сравнению с умением проводить A/B-тесты.

🚀 Это исследование намечает путь для всех стремящихся эффективно адаптироваться под современные тренды. Важно, что «стоимость» навыка не абсолютна, а относительна: зависит от опыта, бэкграунда человека. Часто скилы становятся особо значимы, когда сочетаются с другими из далекой отрасли. Мы думаем, что специалисты лайфсайнс здесь просто идеальный случай. Именно поэтому Бластим сегодня учит биологов основам ИИ на питоне!

#бластим_технологии

🐙 Хотите поохотиться по-осьминожьи?

Осьминоги давно служат объектом восхищения ученых и инженеров. Наблюдение за охотой моллюсков вдохновило китайских робототехников на разработку робо-щупальца E-SOAM.

Когда осьминог в природе ловит жертву, его конечность изгибается около туловища, далее точка изгиба распространяется центробежно по направлению к добыче. После того, как присоски на щупальцах касаются объекта, запускается сильный обхват жертвы дистальной частью щупальца, в чем задействуется много присосок. Наконец, жертва подтягивается ко рту осьминога. Кушать подано! 🍽

Кинетика щупалец головоногого на первый взгляд проста. Но создать робота, воспроизводящего движения, трудно. У щупалец живого спрута бесконечное число степеней свободы, а в случае машины управлять такой системой архисложно. Кроме того, в робота нужно интегрировать сенсор, который должен быть устойчив к серьезному растяжению.

Китайские исследователи в статье в Science Robotics описывают, как они справились с челленджами и создали потрясающего мягкого робота, начиненного гибкой электроникой. Робо-щупальце состоит из шести сегментов: 5-членной рукоятки и дистальной части, куда встроена растяжимая электросхема на основе жидкого металла! Именно терминальный сегмент фиксирует, обрабатывает и передает сигналы по беспроводной связи оператору. Датчик функционирует в условиях высокой деформации, но воспринимает информацию нескольких модальностей: изгиб, температуру, присасывание. Дистальная часть служит и для крепкого обхвата предметов.

Человек управляет роботом дистанционно и всего одним пальцем посредством напальчника, передающего тактильные ощущения! Робот приводится в движение с помощью 16 пневмоприводов. В экспериментах робо-щупальце справилось с захватом различных предметов как в воде, так и на суше. Например, 🦈 игрушечной акулы или цветочного горшка 🪴

Робо-щупальце — яркий пример биомиметики. E-SOAM может пригодиться для проектирования роботов-хирургов, машин для обследования морского дна и бионических конечностей 💯

#выходные_у_бластим

🔔 Биотех-итоги года вместе с Бластимом

Друзья, уже в этот четверг в ламповом предновогоднем эфире основатели нашей компании Вита Степанова и Юрий Пеков:

⭐️ подведут итоги уходящего года
⭐️ анонсируют планы на год грядущий
⭐️ обсудят новости индустрии
⭐️ ответят на вопросы из зала
⭐️ зададут вопросы залу
⭐️ и, конечно, разыграют призы! 🎁

Приглашаем на стрим всех, а особенно студентов и выпускников курсов Бластима!

Прямой эфир пройдет 28 декабря в 19:30 по Москве

☃️ Не пропустите долгожданное событие, записывайтесь и оставляйте любые вопросы и пожелания на страничке: bit.ly/3TH7Wsr

Ближе к встрече мы пришлем ссылку для подключения! 🎩

🥶 P.S. Если вы вдруг осознали, что совершенно ничегошеньки не знаете о Бластиме, подписывайтесь на нашу рассылку, где мы рассказываем историю компании!

❓Какие научные источники используют ученые в биотехе?

Как и везде, ученые в биотехе ищут публикации. Первое, куда можно отправиться, чтобы собрать библиотеку статей по интересующей теме — это портал NCBI, на котором великое множество полезных БД для биоинформатиков и биологов. Например, литературная БД по биомедицине PubMed, где есть абстракты статей. Еще статьи можно искать в ScienceDirect, Google Scholar, ResearchGate (это вообще целая соцсеть для ученых). А препринты публикаций лежат здесь: bioRxiv, chemRxiv

Чтобы проверить цитирования и библиометрию стоит воспользоваться Web of Science, Scopus, elibrary.ru, ORCID или istina.msu.ru.

❓Что, кроме статей и монографий, нужно исследователям в биотехе? Дата-сеты, базы с химическими формулами?

В своей работе ученые из биотеха используют не только публикации, но еще и многочисленные базы данных и различные программы. К счастью, очень много информации доступно в открытом доступе и ее может изучать любой желающий. Такая традиция началась еще c The Human Genome Project, когда было решено выложить прочитанный геном человека в общий доступ, а не патентовать.

Например, сегодня востребованы БД: нуклеотидные последовательности хранятся в GenBank (архив, куда ученые загружают данные секвенирования перед публикациями статей), а также в курируемой БД Refseq, аннотации геномов лежат в Ensembl, белковые последовательности — UniProt, 3D структуры белков — PDB, мутации — dbSNP, эпигенетика — ENCODE, онкология — TCGA, химические соединения — PubChem, метаболические пути — KEGG, клинические исследования — clinical.trials.gov. Мы привели лишь малую толику самых известных баз данных, еще больше можно найти тут.

Помимо информации из баз данных нужны различные инструменты для их обработки. Это могут быть веб-приложения (например, биоинформатический калькулятор protpi.ch), десктопные программы (Jmol, VMD, Origin, clustal, gnuplot). Или пакеты на R (например, pagoda, deseq2, больше тут) или библиотеки Python (matplotlib, seaborn и еще примеры) и других языках, которые биоинформатики запускают из командной строки. Есть крутые вещи на основе ИИ — к примеру, автоматический анализатор изображений CellProfiler.

❓С какими сложностями при поиске научных публикаций и данных сталкиваются исследователи в биотехе?

Многие базы данных, например, генов или геномов, никак не курируются экспертами и туда попадает непроверенная информация. Другая проблема — нехватка данных: пропущенные значения в датасетах, наличие информации только для модельных организмов (допустим, есть FlyBase для дрозофилы, но она не годится для других насекомых), данные разношерстные — их трудно интегрировать. Кроме того, многие геномы до сих пор не полностью собраны и хранятся в виде контиг, что затрудняет их активное использование.

К тому же, в статьях часто плохо описаны и поэтому невоспроизводимы протоколы экспериментальных методов.

Еще проблема — отсутствие публикаций в свободном доступе, тогда их нужно искать. Для этого можно использовать Sci-hub (статьи до 2021 года), Nexus Search bot. Отдельный челлендж — систематизировать литературу у себя на компьютере, тут поможет Mendeley.

❓Если ли интересные интернет-сервисы для исследователей в биотехе, которые мы можете посоветовать студентам?

Многие простые тулы доступны в браузере и не требуют навыков программирования. Скажем, легендарный онлайн-инструмент в биоинформатике, тоже поддерживаемый NCBI, — выравниватель BLAST, или геномные браузеры для удобной визуализации и сравнения геномов — UCSC Genome Browser, IGV.

Для упрощения работы и автоматизации можно также применять чат боты, к примеру, Phind для отладки кода, нашумевшие ChatGPT, Bard для автоматизации повседневных задач, или superbio.ai — мощный инструмент для биологов, через который, положим, можно запустить AlphaFold2 и посмотреть на предсказанные компьютером пространственные структуры протеинов!

Еще классная вещь Biorender — для рисования биологической инфографики.

💜 Ответила на вопросы команда канала "Бластим: работа и курсы в биотехе".

👆Друзья, делимся полезным постом об основах поиска информации в биотехе.

На эти вопросы мы ответили в рамках анкеты замечательного канала «Какая-то библиотека». Надеемся, что ссылки пригодятся вам и вашим коллегам! 💜

Ну, а как применять все эти многочисленные базы данных и тулы, извлекать необходимые в вашем проекте данные из интернета, использовать языки программирования для автоматизации биоинформатической работы, Бластим учит на курсе по анализу NGS!

😍 КИБЕРНЕДЕЛЯ НА БЛАСТИМ

Хотите получить навыки, которые могут обеспечить прибавку к зарплате в 40%? 👀

Уже в середине февраля на Бластиме стартует новый поток курса «Машинное обучение на Питон для решения биоинформатических задач». Эта программа, где вы сможете прокачать те самые универсальные, но редкие на рынке скилы, которые сегодня очень хотят видеть работодатели: программирование на Python, разработка и поддержание моделей машинного и глубокого обучения.

Обучение на Бластиме — это максимально комфортное погружение в сферу ИИ в биологии, а также ценный опыт, который может изменить вашу жизнь. Но для достижения высокого результата нужно время. И сейчас прекрасный момент заранее распланировать свое обучение. Поэтому до 1️⃣ января у нас сохраняются цены на курс с праздничными скидками, есть и дополнительные бонусы студентам и аспирантам. После Нового года грядет повышение ✨

На оплату курса действует беспроцентная рассрочка, плюс мы наладили оплату Долями: подробности можно узнать из специальной инструкции в Notion. А если у вас остаются сомнения в том, подходит ли курс вам и хватит ли знаний, то мы рекомендуем пройти классный тест по Python: ссылка на тест Он ни к чему не обязывает, но поможет разобраться.

До 1 января у нас сохраняются выгодные цены и на другие программы из линейки Бластим: NGS, вводный Python, Статистика и R. Успейте записаться на этой чудесной неделе!

P.S. А еще мы изготавливаем подарочные сертификаты на курс. Напишите нам, и вы сможете порадовать друзей, родственников, любимых 💝

Подборка лучших эфиров 2023 года 🟥

У нас в телеграм-канале так много новых друзей, что мы не успеваем поприветствовать всех. Специально для недавно присоединившихся, мы подобрали 8 очень актуальных видео, которые проходили в этом году и передают уютную атмосферу Бластима.

💻 Ключевые навыки программирования для карьеры биолога // кодинг

🎨 Секвенирование единичных клеток: новые горизонты биологических исследований // мокрая биология

💊 Контроль качества по стандартам GxP: особенности нормативных документов // фарма

🥳 Как искать работу кому угодно и где угодно с Витой Степановой // карьера

🐍 Начни программировать на Python: возможности для биологов // кодинг

🧪 Метаболомика: от медицины до растениеводства // мокрая биология

🦠 Потенциал аденоассоциированных вирусов (AAV) // генная терапия

🎠 Виртуальная Ярмарка вакансий 2023 на Бластим // карьера

Да, у нас было много интересного, в 2024 будет еще больше! А завтра Юра и Вита подведут биотех-итоги года. Обязательно приходите на встречу познакомиться! Обещаем призы 🥂

#бластим_рекомендует