⚡️Cheminformatics Data Scientist Wanted!

We are looking for a motivated Cheminformatics Data Scientist with a background in computer science and chemistry.

Responsibilities:
●Develop and implement data transformation pipelines to process and enrich chemical data, utilizing programming languages such as Java, Python or C++
●Handle various file formats like molfile, RXN file, SMILES, SMARTS, RD Files, SD Files and InChIKey for data import, export, and conversion
●Apply a foundational understanding of chemical principles to influence the representation and identity of chemical substances and reactions within data sets
●Demonstrate a strong grasp of atom mapping in chemical reactions
●Utilize domain-specific chemical knowledge to assess and verify atom mappings for quality and accuracy
●Leverage cheminformatics software and tools for data analysis, chemical structure recognition, and property prediction
●Collaborate with cross-functional teams to integrate cheminformatics processes into broader data analysis workflows, and research initiatives
●Integrate chemical data into databases and information systems, ensuring efficient and accurate data retrieval

Requirements:
●4+ years of background in engineering or computer science
●Understanding in the field of Cheminformatics
●Programming experience in Java (preferred), Python or C++
●Robust skills in some of the following file formats: molfile, RXN file, SMILES, SMARTS, RD Files, SD Files and InChIKey
●Knowledge of the basic chemistry concepts (tautomer, mesomere, aromaticity, reaction centers etc.)
●Competency in computer science (ability to implement pipelines for data transformation and enrichments)
●Familiarity with atom mapping in chemical reactions
Nice to Have: Bachelor or PhD degree in chemistry, cheminformatics, computational chemistry, medicinal chemistry or related discipline
English level: Intermediate+

👉Apply

📺Заключительный вебинар по софт-скилам с Ольгой Введенской начинается!

Сегодня Оля будет говорить о том, как поддерживать ментальное здоровье ученым-иммигрантам, отвечать на ваши вопросы. А в конце мы подведем итоги акции «Друзья», так что обязательно присоединяйтесь в 🔵или на 🟥!

👉 Если вы вдруг не записывались, то самое время: bit.ly/3u7dz8w

✋Если вы регистрировались, но вам не пришла ссылка для подключения, срочно пишите в чат, мы всем ответим! А также рекомендуем проверить подписку, если письма приходят с опозданием или вообще не приходят. Это можно сделать тут: bit.ly/3QGrVo7 💌

⚡️Свежая подборка вакансий за рубежом!

📌Постдок: биоинформатика (США)
Лаборатория Цао Университета Кейс Вестерн Резерв приглашает сотрудников для изучения эпигенетических механизмов патогенеза заболеваний. Требуется PhD в области биоинформатики/биологии с опытом анализа NGS-данных, опыт сингл-селл приветствуется. Дедлайн: 26 ноября
Подробнее

📌PhD системная токсикология (Нидерланды)
Нужны аспиранты в изучение связи сетей коэкспрессии с травмами на факультет естественных наук в Лейденский университет. Предстоит разработка компьютерных моделей токсикологии, использование ИИ для прогнозирования исходов. Требования: магистерская степень, знание экспериментальной работы и биоинформатики, опыт в транскриптомике, владение R. ЗП до 3539 €/мес. Дедлайн: 29 ноября
Подробнее

📌Постдок в иммуногенетику (Нидерланды)
Приглашаются биоинформатики в междисциплинарные исследования по изучению генетических факторов и окружающей среды в развитии целиакии. Нужен опыт в GWAS, интеграция мультиомиксных данных, транскриптомики/эпигенетики единичных клеток. ЗП 3230 €/мес. Дедлайн: 3 декабря
Подробнее

📌PhD-проект по модификации растений в университет Уорик (Великобритания)
Приглашаются выпускники магистратуры для работы в проект по повышению урожайности кукурузы методами генной инженерии. Планируется добиться увеличения количества флоральных меристем. Предстоит использовать молекулярно-генетические и вычислительные методы. Требуется IELTS 6.5.
Дедлайн: 15 декабря
Подробнее

📌Аспирантура в Ирландском национальном университете
Принимаются заявки от кандидатов для работы по изучению механобиологии роста опухолей по нескольким направлениям. Полностью финансируемая стипендиальная программа на 4 года, выдается ноутбук. Требование: степень бакалавра.
Дедлайн: 23 декабря
Подробнее

#бластим_подборка

Если вы давно с Бластимом, то знаете, что мы всегда ценили юмор на своих страницах и никогда не строили из себя чопорный закрытый бренд. 🎩

Сейчас Бластим растет и ширится, и нам очень нужен человек, понимающий биологию и желающий создавать юмористический контент, всякие мемы, смешные рилсы.

👉 Готовы присоединиться к команде? Не стесняйтесь присылать свои резюме/портфолио/заявки в телеграм Виты!

#бластим_вакансии

⛰Кто не слышал об экономическом форуме в Давосе?! Оказывается, там не только бизнес и политика, но и наука. На форуме уже 11 лет подряд представляют доклад о флагманских технологиях, и часто он высвечивает те достижения, которые впоследствии становятся хайповыми. Именно там на мировом уровне обратили внимание на CRISPR, мРНК-вакцины, AlphaFold за несколько лет до их взрывной популярности. Доклад 2023 заслуживает обзора, ведь в нем можно нащупать карьерные возможности. Итак, первая пятерка самых перспективных технологий.

🔋 Эластичные аккумуляторы
Гнущиеся смартфоны, умная одежда со встроенным в ткань дисплеем для просмотра сериалов Netflix — реальность. Но для гибких дисплеев нужны гибкие источники питания. Такие аккумуляторы уже создаются и пригодятся для носимых медицинских устройств, биомедицинских датчиков, умных часов, которые будут мониторить состояние людей и передавать данные медицинским центрам. Ожидается рост рынка на $240 млн к 2027 г.

😊 Генеративный ИИ
Генеративный ИИ создает креативы, изучая закономерности данных с помощью сложных алгоритмов. GenAI уже применяется в дизайне лекарств, архитектуре, разработке персонализированных учебных программ. Еще дальше заходит AutoGPT — автономный ИИ, который может выполнить вообще всё за человека. Например, может сам заказать пиццу: выбрать, нажать кнопку «заказать» и оплатить. Правда, пока с вашего кошелька.

✈️ Экологичное авиатопливо
Авиация ответственна за 2-3% выбросов CO2 в мире. Чтобы добиться декарбонизации отрасли, требуется чистое авиатопливо. Его можно получать из синтез-газа, добытого из биомассы/отходов/ улавливаемого CO2 или же в результате переработки масел и жира. Преобразовывать липиды помогут ГМ-микроорганизмы.

🦠 Синтетические бактериофаги
Сегодня понятно, насколько важен для здоровья организма его микробиом, но мало изучать, нужно модифицировать! Для микробиомной инженерии идеально подходят фаги. Например, с помощью синтетических фагов можно заставить бактерии производить молекулы интереса или сделать их чувствительными к антибиотикам. Также вирусы применимы как кормовые добавки скоту и для лечения болезней растений.

⚫️ Метавселенная для психологического здоровья
Многие сегодня страдают от интернет-зависимости, соцсети негативно влияют на психику, особенно кризис усугубился в COVID. Однако виртуальное пространство может нести и пользу. Например, компания DeepWall разработала видеоигру с дополнительной реальностью для лечения депрессии.

☀️Вторую 5-ку мы опубликуем завтра!

#бластим_технологии

⚡️А вот и вторая пятерка из Давоса!🇨🇭

🌺 Низкоинвазивные датчики в растениеводстве
К 2050 г. производство еды должно вырасти на 70%. Сегодня благодаря БПЛА и портативным датчикам можно непрерывно мониторить температуру, уровень минерального питания, болезни отдельных растений, обрабатывать данные с помощью ИИ и корректировать потребление воды, внесение пестицидов и удобрений.

🌌Пространственная омика
Используя новые методы визуализации и NGS-секвенирования, мы можем получать информацию о локализации клеток внутри тканей и изучать, как в пространстве распределяются экспрессия генов, эпигенетические метки, белки или метаболиты. С помощью этих методов строят 3D-клеточные атласы. Также были идентифицированы нейроны спинного мозга, которые отвечают за восстановление после травмы, и их стимуляция ускорила выздоровление.

🧠 Интерфейсы мозг-компьютер
Нейроинтерфейсы — системы, позволяющие управлять машиной силой мысли. Сейчас их применяют для лечения эпилепсии, нейропротезирования, разрабатываются всё более гибкие и биосовместимые имплантаты.

🤖 Зеленые дата-центры
Центры обработки данных, которые облегчают нам ежедневный поиск в Google или отправку электронных писем, съедают около 1% энергии в мире. Чтобы выйти на нулевые затраты, подключают ИИ для оптимизации энергопотребления, размещения инфраструктуры датацентров, а также преобразуют отработанное тепло в обогрев помещений.

🤕 ИИ-здравоохранение
Очереди, перегруженный персонал, запись на прием за много месяцев постоянны в больницах. Внедрение ИИ в здравоохранение может решить многие проблемы: прогнозирования и мониторинга эпидемий, оптимизации запросов пациентов в лечении с нагрузкой учреждений, а также расширения доступа к медпомощи, особенно в развивающихся странах.

Этот список составили 90 экспертов из 20 стран при поддержке издательства Frontiers. Изначально рассматривалось 95 технологий, а из них было отобрано 10 самых многообещающих!🌞

#бластим_технологии

💥 Аттеншн: Бластим проводит открытый опрос среди читателей!

Друзья, вы знаете, что мы делаем много классных вещей: полезные посты, крутые вебинары, максимально релевантные курсы. Здорово, что вы репостите, комментируете, ставите лайки. 💕

И сейчас мы хотим, чтобы о нас узнало еще больше людей, которым тоже могут помочь наши продукты. Поэтому просим вас посоветовать сообщества/каналы в ВКонтакте, в Телеграме, да и вообще, где угодно, за которыми вы следите, чтобы Бластим мог с ними подружиться!🤝

Для примера приводим некоторые паблики наших добрых коллег, но будем рады любым вашим вариантам, причем, вовсе не обязательно про науку. Пишите их в комментариях! 👇

⚡️Недавно мы обсуждали список 20 лучших биофармацевтических компаний, а сегодня сделали небольшую подборку их вакансий!

🇩🇰 Специалист по данным в Novo Nordisk (Дания)
Предстоит изучать медицинские данные пациентов с редкими заболеваниями, используя методы статанализа, программирования, датавиза. Требования: магистерская степень, знание языков R, Python, SQL. Желателен опыт работы в фарме. Дедлайн: 3 декабря

🇹🇷 Стажировка (маркетинг) в AstraZeneca (Турция)
Приглашаются бакалавры и аспиранты. Нужен хороший английский. Предстоит работать в департаменте маркетинга в области онкологии, взаимодействовать с продакт-менеджером, осуществлять управление проектом.

🇩🇪 Сотрудник в Boehringer Ingelheim (Германия)
Вы займетесь внедрением искусственного интеллекта и машинного обучения в процессы разработки фармпрепаратов. Требования: степень PhD, знание языков R, Python, Matlab, Julia, опыт работы с программами для моделирования процессов ASPEN Plus, gPROMS. Полный рабочий день, гибридный формат. Дедлайн: 10 января

🇺🇸 Менеджер по биостатистике в Regeneron (США)
Предстоит работа в кросс-функциональных группах для разработки и анализа данных ранних клинических исследований. Также вы будете обучать коллег. Требования: PhD или M.S. по биостатистике, опыт работы в отрасли, знание R или SAS.

#бластим_подборка

🎙 Друзья, если вы не смотрели вебинар Бластима «Ментальное здоровье. Основы» или уже видели, но хотите пересмотреть, то это можно сделать на нашем ютуб-канале (кстати, подписывайтесь на него)!

Мы добавили таймкод для удобной навигации и собрали ссылки на ресурсы и литературу, которые упоминается в ролике. Из видео вы узнаете про выгорание и депрессию, психоз и злоупотребление психоактивными веществами, РАС и СДВГ, нейроразнообразие и микроагрессию.

🟥 Линк на запись: https://www.youtube.com/watch?v=fP97y2UvKjY

📚 Полезные ссылки:

📌 Dragonfly Mental Health
📌 Книга Кей Редфилд Джеймисон «Беспокойный разум» про биполярное расстройство
📌 Книга Элин Сакс «Не держит сердцевина. Записки о моей шизофрении»
📌 Inside Our Autistic Minds: BBC Documentary 2023 (2 episodes)
📌 Sci.STEPS
📌 Благотворительный фонд «Антон тут рядом»

А также напоминаем, что всем участникам, кто записывался на вебинар, до нового года мы пришлем письма с эксклюзивными материалами от Оли Введенской! 💌

#бластим_рекомендует

Стать биоинформатиком поможет... ChatGPT? Nature рассказывает, как можно организовать плавный переход: мокрая биология ➡️ ИИ ➡️ биоинформатика.

Фернанда Гарсиа Фосса — PhD-студентка-токсиколог из Бразилии, изучает эффекты наночастиц серебра на гепатоциты. Анализировать тысячи изображений клеток вручную было невыносимо трудно, и на форуме она прочитала про CellProfiler, онлайн-инструмент на основе ИИ от Массачусетского технологического института. Автоматический анализ картинок заменил монотонные операции и освободил кучу времени. К тому же, ее порадовало, что CellProfiler не требует навыков программирования. Именно с таких инструментов возможно начать знакомство с 🔤🔤.

🖥 Эксперты отмечают, что у многих ученых из области лайфсайнс не хватает биоинформатических навыков, скиллов по управлению данными. Если бы они были, дела пошли бы куда быстрее и веселее. Научившись программировать, можно создавать собственные тулы на основе ИИ. Для этого подходит Python, говорит Гаэль Варокво — один из создателей популярной библиотеки для машинного обучения scikit-learn:

«Python — универсальный язык. С ним можно делать обработку текста, научные вычисления, веб-серверы. Python полезен для науки, потому что чаще, чем мы ожидаем, нам приходится решать побочные задачи. Но также он пригодится, если вы будете искать работу за пределами академических кругов»

Варокво считает, что наука и ИИ стремительно эволюционируют, но все-таки не каждую неделю! Важно для развития карьеры не игнорировать обучение основам кодинга, математики и статистики. Не надо гнаться за новинками, лучше подождать и увидеть, что окажется самым полезным. Скажем, не осваивать нейросети, а для начала разобраться с классическим машинным обучением. И как раз тут опять отлично помогают чат-боты: они снижают требования к программистским навыкам, позволяют пользователям учиться настраивать среду, экспериментировать и задавать глупые вопросы.💬

По данным свежего опроса, каждый третий ученый-постдок уже использует чат-боты в повседневных задачах: чаще всего для правки текста на иностранном языке, но кто-то для отладки кода и в своей научной работе. ИИ преодолевает предубеждения нашего разума в анализе данных, ускоряет рабочий процесс. Тот же CellProfiler позволяет настраивать собственные конвейеры для автоматизации.

Искусственный интеллект открывает неизвестные закономерности, а также карьерные пути. Так, аспирантка Гарсиа Фосса отправила электронное письмо разработчикам CellProfiler, и те неожиданно пригласили ее в Массачусетс писать диссер и помогать улучшать приложение! 👍

⚡️Написали любопытный пост про науку на викенд специально для нашего друга — Колонии Вольвокс!

Советуем читать текст и следить за новостями на канале 👀

Всех началом рабочей недели! ✨📆🎉

Приглашаем поговорить о машинном обучении. Сейчас мы разрабатываем курс по ML и хотим создать программу, которая не только обучит новым навыкам, но и вдохновит🐙

Бластим предлагает поделиться своим мнением и профессиональными потребностями, что поможет нам сделать программу максимально релевантной и эффективной, а вам получить интересный опыт взаимодействия с современной EdTech-компанией и поучаствовать ни много ни мало в создании реального продукта по искусственному интеллекту!

✅ Записаться можно тут: bit.ly/3uAZ39t