🏅Сможет ли ИИ предсказать победителей Нобелевской премии?

На носу Нобелевская неделя, и энтузиасты попросили ChatGPT назвать тех, кто получит самый престижный научный приз в 2023. Однако тот отказался ванговать! Тогда они перефразировали вопрос и спросили чат-бот о трех наиболее значимых открытиях, которые сделаны учеными, не отмеченными наградой. ИИ отреагировал, но с ошибками, назвав среди прочего исследователей, которые умерли или уже нобелиаты (конечно, ИИ опять предложил CRISPR). Пока машины обучаются, человек действует своим умом. Например, анализ цитирований позволил компании Clarivate предугадать 70 лауреатов за последние 20 лет: >2 тыс. цитат — и ты нобелиат! Однако одного индекса цитирования явно недостаточно — нужно, чтобы все-таки открытие было новаторским. Но как это увидеть? По влиянию на человечество! А измерять его помогут большие языковые модели (LLM), которые обрабатывают гигантские массивы данных. Скажем, они в состоянии изучить многочисленные архивы, новости, сети научных контактов. Есть надежда, что скоро даже появятся альтернативные премии, которые будут присуждать не члены комитетов, а более объективные нейросети.

🪻Не только красивые цветки, но и ценный растительный белок!

Европа сегодня ищет новые источники белка на замену мясу и сое. И тут на арене появляется люпин! Своими эффектными соцветиями не только радует глаз цветоводов. Уже несколько тысячелетий он используется и как белковая добавка на корм скоту, а также в пищу человеку. Неприхотливый люпин пригоден для выращивания в холодном климате, переносит засуху и суровые почвы, а по протеину богаче сои. Однако перед употреблением семена нужно надолго замачивать, чтобы удалить горькие алкалоиды. Эти соединения — главный фактор, почему люпины не пользуются популярностью. В 1930-е были обнаружены мутантные растения с низким содержанием антипитательных веществ, но до конца понять (и потом сломать) пути биосинтеза алкалоидов не удавалось. Сегодня ученые приблизились к расшифровке метаболического пути. С помощью современных подходов скрининга на основе цифровой ПЦР обнаружили SNP, который приводил к нарушению работы фермента ацетилтрансферазы и обуславливал низкое содержание горечей. Ученые воспроизвели его химическим мутагенезом и создали сладкий люпин. Открытие, наконец, позволит ввести в селекционный процесс интересные дикие сорта!

🕸Бабочки плетут паутину?!

Волокна паутины эластичны и прочны, однако содержать вместе пауков невозможно — в уплотненных условиях производства они уничтожают друг друга. Шелк тутового шелкопряда легко рвется и годится только для текстиля, но зато гусеницы относительно просто разводятся. Биологи давно хотели совместить лучшие качества. К сожалению, ранее этого не удавалось: гены белков-спидроинов паучьего волокна слишком крупные и встроить их другим организмам не получалось. На этот раз китайские специалисты отыскали крестовика из Восточной Азии с относительно небольшим геном белка паутины. С помощью CRISPR, они отредактировали шелковичных червей, заменив собственные гены шелка на паучьи. Трансгенные шелкопряды продуцировали отличное волокно, которое было сопоставимо с натуральным и оказалось в шесть раз прочнее кевлара, используемого в бронежилетах. Крепкие и легкие нити можно будет применять в машиностроении, а также изготовлении шовных материалов для хирургии.

#выходные_у_бластим

От УЛЫБКИ станет всем светлей!

В учебниках химии органические вещества представляют в виде структурных формул. Это удобно для человека и используется с XIX в. Вообще, в печатной литературе накоплен огромный пласт информации в виде текста и графики, который до сих пор не включен в базы данных. Но почему? Сейчас же эра высоких технологий. Огромная проблема — превратить изображения молекул в машиночитаемый вид. Для алгоритмов рисунки формул не более, чем набор пикселей. Им нужен формат SMILES — упрощенное линейное представление. Скажем, кофеин для компьютера выглядит вот так: CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C

Немецкие химики из Вестфальского и Йенского университетов, вдохновившись историей, где ИИ обыграл человека в го, для извлечения ценных данных создали бесплатное приложение с открытым исходным кодом DECIMER.ai (Deep lEarning for Chemical ImagE Recognition). Разработка впитала последние достижения глубокого обучения, компьютерного зрения и обработки естественного языка. DECIMER — первая автоматизированная и комплексная платформа: туда загружается статья, далее инструмент сегментации находит изображение среди текста, а потом классификатор проверяет, есть ли на картинке химструктура. И, наконец, трансформер с высокой точностью преобразует визуальное преставление в SMILES. Всё благодаря тому, что ученые обучили глубокую нейросеть на 450 млн изображений из PubChem, арендуя вычислительные мощности Google Cloud. Decimer Image Transformer превзошел доступные инструменты оптического распознавания химических структур (OCSR), запрограммированные по жестким правилам.

Теперь можно сканировать старые печатные статьи и оцифровывать структуры, в том числе и нарисованные учеными от руки! А еще моментально распознавать молекулы, снятые на мобильный телефон во время конференций. Новинка должна улучшить доступность данных в химии, хемоинформатике и быть полезной для фармы, с/х и биотеха.

Веб-приложение уже ждет всех желающих. Вы можете загрузить pdf-файл, и ИИ начинает работать. Рекомендуем затестить!

#выходные_у_бластим

💊Дайджест профессий в фарме

Коллеги из проекта «Алло, это фарма?» собрали дайджест разных профессий в фарме, в каждом — интервью или один день из жизни специалиста, чтобы лучше понимать задачи и функционал. А кое-где в качестве бонуса инструкции о том, что изучить и прочитать, чтобы попасть в это направление.

Из того, что уже попало в дайджест:

▫️ медицинский писатель,
▫️ специалист по фармаконадзору,
▫️ специалист по регистрации лекарственных средств,
▫️ монитор клинических исследований и не только!

Дайджест пополняется на регулярной основе, а пока читайте уже вышедшие материалы по ссылке.

🔥Если вы работаете в фарме и хотите поделиться своим опытом, то пишите коллегам и, конечно, подписывайтесь на канал!

#бластим_рекомендует

На канале youth&career каждый день публикуются подборки конференций, конкурсов, лекций. Вам будут интересны не только естественнонаучные и технические подборки, но также all и бизнес✨

Сейчас ребята идут дальше и делают обзор стипендий, грантов и даже интервью с участниками. Круто взглянуть на полезное мероприятие с другого ракурса. Становится не так страшно пробовать, когда уже ясно, как это выглядит. А если ты хочешь поделится своим опытом участия, то они всегда будут рады его опубликовать.

По секрету скажем🧐, что скоро будет какая-то активность про стипендии и набор участников на стажировки.

Присоединяйся к youth&career💡