🫁Муковисцидоз — тяжелое генетическое заболевание, этиотропное лечение которого пока не найдено. Его патогенез связан с обезвоживанием поверхности эпителия, накоплением густой слизи и развитием непроходимости в различных органах. Причина недуга — мутации гена анионного хлоридного транспортера CFTR, который регулирует баланс ионов и вязкость жидкости. Больше всего при этом страдает дыхательная система.

🐠Вообще легкие — сложный орган: в них насчитывается около 40 клеточных типов. Научные группы Дэниэла Монторо и Линдси Плассхарт из Массачусетса решили изучить гетерогенность и составить клеточный атлас эпителия дыхательных путей. В августе 2018 года результаты их работы были опубликованы в Nature. Биологи кластеризовали клетки по экспрессии маркерных генов и обнаружили один любопытный кластер, клетки которого по транскриптомному профилю оказались похожи на ионоциты жабр рыбки Danio и кожи лягушки Xenopus. Зоологи давно знакомы с этими клетками: у водных позвоночных ионоциты активно задействованы в осморегуляции и поэтому всегда богаты митохондриями.

🐭По аналогии американские генетики решили назвать подобные клетки млекопитающих легочными ионоцитами. У мышей по количеству их было менее 1% от всех клеток легких, но зато экспрессировали они более половины уже знакомого нам транспортера CFTR. Эта закономерность подтвердилась и для легких человека. А позже такие клетки нашлись и в других органах, которые как раз чаще всего поражаются при муковисцидозе. Обнаружение ионоцитов, «напичканных» белком CFTR, вселило надежду на разработку генной или клеточной терапии болезни!

🧬Неожиданное открытие клинически важного клеточного типа, о котором раньше даже не подозревали, удалось благодаря одноклеточному RNA-seq. Метод секвенирования единичных клеток открыл огромные горизонты перед учеными и завоевал популярность в лабораториях по всему миру. Узнайте больше об этой потрясающей технологии на нашей сегодняшней встрече: bit.ly/3DXTvHB

💔Приходите, чтобы одиночные клетки не чувствовали себя «одинокими»!

#бластим_технологии

А почитать? Вот и новости на викенд!

🥩7 чудес света — 7 альтернатив мясу
С ростом благосостояния людей увеличивается потребление животного белка. Особенно бурно растет спрос в Китае. Между тем производство мяса — это нагрузка на животных, людей и планету, поэтому стоит искать ему замену. Что это может быть? Самый традиционный вариант — растительный белок: он дешев и распространен. Скажем, соей в колбасе уже никого не удивишь, хотя многих беспокоят содержащиеся в бобах аллергены и гормоноподобные вещества. Другой способ — разведение микроводорослей. Например, уже изготавливают протеиновый порошок из спирулины. Довольно выгодно культивировать на сельхоз отходах мицелиальные грибы и получать микопротеин. Или же выделять бактериальный белок из микроорганизмов, питающихся водородом или метаном. Но тестируют и более продвинутые подходы. Допустим, можно выращивать культуры животных клеток в биореакторах, получая «мясо в пробирке» — так меньше углеродный след и не требуется много антибиотиков. Еще подходят рекомбинантные белки в ГМ-микробах: уже нарабатывают казеин и яичный белок в дрожжах. Ну и, на закуску мучные черви, кузнечики, сверчки. Уже функционируют целые фермы по производству насекомых: их добавляют в бургеры и делают муку! По оценке экспертов, альтернативные белки полезнее для здоровья, а замена 20% красного мяса должна сократить ежегодную вырубку лесов вдвое.

🧫Поймай меня, если сможешь!
Ученые создали бактерий-биосенсоров колоректального рака. Известно, что опухоли выделяют внеклеточную ДНК, по которой можно их обнаружить. Однако вкДНК живет короткое время, быстро разрушаясь под действием ДНКаз. Поэтому так важно детектировать ее прямо на месте. Специалисты решили использовать естественную компетентность бактерий к поглощению случайных фрагментов из внешней среды и встраиванию их себе в геном. Ученые взяли непатогенных резидентов толстого кишечника человека Acinetobacter baylyi и разработали метод CATCH. Они сфокусировались на ДНК известного онкогена KRAS. В экспериментах микроорганизмы интегрировали опухолевую ДНК к себе в геном. Чтобы отобрать именно мутантную ее форму, биологи настроили естественную систему CRISPR бактерий на узнавание и уничтожение нормального варианта гена KRAS. Если бактерия встраивала себе мутантную форму ДНК, то она выживала, а если здоровую — то нет. Ученые протестировали метод на культурах клеток in vitro, а затем перешли к опытам на мышах. С помощью клизм им вводили живые сенсоры, после чего проводили посев фекальной микробиоты. Эксперименты оказались успешными, теперь метод планируют распространить на другие типы рака!

🌴«Содержит пальмовое масло»
Такая надпись встречается почти на каждой этикетке в супермаркете: растительный жир добавляют в пищевые продукты, косметику, корма для животных. Еще про него рассказывают страшилки, хотя по своим потребительским качествам пальмовое масло вовсе не так плохо. Куда больше вопросов вызывают экологические последствия промышленного выращивания монокультуры масличной пальмы Elaeis guineensis в Индонезии и Малайзии. Из-за высокой урожайности пальмы фермеры стараются расширять плантации и вырубают тропические леса, что грозит обезлесением и потерей биоразнообразия уникальных экосистем. Но и прекращение ее культивации равно упущенным выгодам для хозяйств и кризису мирового рынка растительных жиров. В поисках компромисса между экологией и экономикой ученые провели крупномасштабный пятилетний эксперимент. Они высаживали «островки» местных пород деревьев среди плантаций масличной пальмы, а спустя годы оценивали биоразнообразие. Вкрапление других видов деревьев способствовало восстановлению экосистем, увеличивало разнообразие организмов, при этом урожаи совершенно не ухудшались. Надеемся, аграрии возьмутся за ум и начнут применять эффективные подходы агролесоводства!

#выходные_у_бластим

🔥 Инновационная фармкомпания Генериум ищет сотрудника на вакантную позицию «Технолог» (хроматографическая очистка)!

📍Локация: п. Вольгинский (Владимирская область)

⭐️Предстоит:
— проводить процессы хроматографической очистки биологических ЛС, и вспомогательных операций, таких как стерилизующая фильтрация, автоклавирование;
— осуществлять асептические работы, заниматься производственным оборудованием и ПО (хроматографы GE - AKTA Pilot, AKTA Process, Unicorn);
— вести документацию.

🌟Требования:
— высшее профессиональное образование;
— знание основ технологии рекомбинантной ДНК и хроматографической очистки белков;
— понимание принципов выбора целевой молекулы, обоснования ее спецификации, разработки процесса хроматографии и подходов к его масштабированию;
— знание нормативов валидации противовирусной очистки, обеспечения вирусной безопасности биологического ЛС;
— представления о трансфере технологии, требованиях GMP к производству, асептическим процессам;
— понимание подхода к валидации процесса производства и др.

⚡️Условия и бонусы:
— ежегодное премирование и индексация оклада;
— жилье для иногородних сотрудников;
— медицинская страховка с первого рабочего дня;
— бесплатное посещение спортивного зала и бассейна.

🔗Узнать еще больше преимуществ трудоустройства в Генериуме и откликнуться на вакансию можно через сайт Бластима: bit.ly/45Di5sO

#бластим_вакансии

Внедрять науку и инновации в реальный сектор? Своей работой влиять на крупный бизнес и всю молочную индустрию? Увидеть просторы Удмуртии, поля Краснодара, лошадей Башкирии? 🐮🐷

KSITEST — первый в России сервис для геномной селекции животных: коров, овец и свиней. В команду мотивированных специалистов нужен бизнес-ассистент в московский офис.

Если вы — в том числе вчерашний студент Тимирязевки, Скрябинки, МГУ, ВШЭ, МФТИ и других, пока мало представляете, что происходит в профессии, но готовы с энтузиазмом погрузиться, то эта вакансия — отправная точка! За год работы вы сможете пристально посмотреть разные направления деятельности компании, и решить, что вам ближе.

📊Задачи будут разнообразные:
— позвонить партнеру и уточнить цену на генетический тест
— составить список образцов для передачи в лабораторию
— организовать командировку
— собрать первичные документы по поставщикам
— выбрать самую красивую лодку для корпоратива
— собрать мерч для сотрудников

🎯Требования:
— внимательность, умение писать тексты и быстро вникать
— опыт бизнес-ассистента приветствуется, если нет — можно компенсировать активностью и настроем
— опыт в био-/агротехе будет преимуществом, но необязательно, если готовы разбираться
— хороший английский
— самое важное — это ответственность, проактивность, постоянный улучшайзинг!

🚀Условия:
— позиция в уютном офисе в центре Москвы
— умные и приятные коллеги — биоинформатики, айтишники, аналитики и животноводы
— корпоративы то на яхте⛵️, то в горах⛰
— фултайм (с 10 до 19), но график гибкий
— зарплата в зависимости от опыта, по результатам собеседования

📝В отклике, пожалуйста, пришлите небольшой рассказ о себе: bit.ly/45oOvHY

#бластим_вакансии

Папа римский в белом пуховике — фейк, в который все поверили — вирусный пример работы ИИ. Теперь так же легко как реалистичные картинки, можно получать 3D-структуры прежде не существовавших белков! Научный мир обсуждает RFdiffusion — нейросеть, генерирующую трехмерные изображения протеинов по «хотелкам» ученых. В июле вышла статья о ее устройстве. А чуть раньше появился веб-сервис, где достаточно задать параметры, и через пару минут вариант вашего белка готов. Революция в белковом дизайне.

За прорывом — долгая история. Над фолдингом бились полвека, пытаясь по последовательности аминокислот предсказать пространственную укладку. Решения не было до AlphaFold. Эта модель ИИ, натренированная на данных из PDB, рисует структуры не хуже рентгеновской кристаллографии. Тогда ученые решили научить алгоритмы выдумывать белки, еще не рожденные эволюцией. Белки — это функционал, поэтому новые протеины перспективны для создания антител, вакцин, биоматериалов.

На основе AlphaFold разработали инструменты для проектирования белков de novo. Например, методы галлюцинации или inpainting. Но они были несовершенны: в клетках белки часто сворачивались неверно. RFdiffusion превзошел предшественников. Всё потому, что ученые обратились к диффузионным нейросетям. Именно на диффузии работают хайповые генераторы фото типа DELL-E или Midjourney. Сначала нейросеть учится распознавать реальный белок во всё более и более зашумленных данных, а потом наоборот: из полного шума ей нужно максимально вернуться к исходнику. Так идет обучение. Второй этап можно перенаправить — задать цель и получить новую структуру.

«Диффузия» крутая! Так, сконструированный ИИ аналог p53 наработали в бактерии: связывание с мишенью было в 1000 раз сильнее, чем у природного. Сегодня искусственные белки даже не успевают тестировать: один специалист в ML загружает работой на месяцы сотни биологов.

А еще разработчики трудятся над приложением, чтобы писать промпты словами: «Сделай-ка мне белок с таким-то доменом!». Вот она, сила машинного обучения.

#бластим_технологии

💊Обычно чуть ли не 70% расходов при выведении нового препарата на рынок у фармкомпаний уходит на маркетинг. А вот датский Novo Nordisk прекратил ТВ-рекламу своего лекарства, потому что не может удовлетворить растущий потребительский спрос. При этом капитализация компании за 2 года удвоилась, составив почти полтриллиона долларов, что вывело ее на второе место среди Big Pharma! 📈

🤔В чем секрет? Novo Nordisk разработал эффективное средство против ожирения. Лишний вес и широкая талия — это глобальный вызов. Переедание, гиподинамия, генетические причины ведут к росту отложения жира в адипоцитах. Сбросить вес непросто: приученное за долгую историю H. sapiens к голоду, наше тело сопротивляется, когда у него пытаются отнять запасенное на «черный день». С 1970-х число страдающих избыточным весом утроилось, эксперты говорят о мировой эпидемии. К 2035 году на Земле ожирением будут страдать до 4 млрд. человек, что неминуемо приведет к колоссальным последствиям для людей и экономики здравоохранения. Диабет, сердечно-сосудистые болезни, инсульты, повышенный риск ковида, подагра тесно ассоциированы с избыточным весом. Не надо забывать про буллинг и стигматизацию.

🧠Известно много пептидов, контролирующих аппетит. И ученые давно мечтали вмешаться в их регуляцию. Однако по-настоящему действенные лекарства обнаружились недавно и случайно. Проходили клинические исследования миметиков инкретинов — гормонов, вырабатываемых клетками кишечника и понижающих уровень глюкозы в крови, — по показанию диабет 2 типа. Их побочным эффектом неожиданно стало падение веса — оказалось, что рецепторы этих пептидов есть не только в ЖКТ (тут инкретины тормозят пищеварение), но и в головном мозге (создают ощущение сытости).

Сегодня препараты, имитирующие инкретины, превращаются в настоящие блокбастеры. Они снижают вес почти на 15% за 16 месяцев лечения. Раньше подобного лекарствами добиться было нельзя — только бариатрической хирургией. В основе препарата Novo Nordisk лежит семаглутид — аналог молекулы глюкагоноподобного пептида-1 (GLP-1). Семаглутид выходит в двух формах: Wegovy от ожирения и Ozempic, который предусматривает более низкие дозы и формально одобрен для диабета, но часто принимается не по назначению.

🥇Эксперты уверены, что новые препараты от ожирения станут золотым стандартом терапии и такими же распространенными, как ныне статины или бета-блокаторы. Но вызывают беспокойство побочные эффекты: рвота, диарея, кишечная непроходимость, потеря мышечной массы. В особой группе риска — подростки. Лонгитюдные исследования не проводились, а значит неизвестны долгосрочные последствия терапии. Правда, появляющиеся данные развеивают многие опасения. Буквально неделю назад Novo Nordisk огласил первые результаты 5-летних испытаний Wegovy от сердечно-сосудистых болезней у пациентов, не страдающих диабетом: еженедельный прием препарата снизил на 20% риск сердечных приступов или инсульта! 🫀

😱А еще пугает потенциально пожизненная зависимость от лекарств: те, кто перестает принимать очень быстро возвращают первоначальную массу. При этом стоимость инъекций гигантская — до $1300 в месяц. 💰Но здесь должны помочь механизмы рыночной конкуренции: уже есть аналог от Eli Lilly под названием Mounjaro. В его основе — тирзепатид, миметик сразу двух инкретинов — знакомого нам GLP-1 и глюкозозависимого инсулинотропного полипептида (GIP). Другие компании тестируют аналоги 3 гормонов.

Независимо от дальнейшего сценария, можно констатировать, что разработчикам удалось нащупать самую большую неудовлетворенную потребность в истории фармы! А сам факт возможности фармакологического лечения показывает, что ожирение — это болезнь. И хотя новейшие препараты впечатляющие, правильная диета и физические упражнения всегда будут частью терапии. 🥦

Читайте больше о здоровье и питании на Бластимчике: https://t.me/+g04QMEJnbi05YTIy

#выходные_у_бластим

👨‍🔬 Приглашаем на российский форум биотехнологий OpenBio, который состоится 26-29 сентября в наукограде Кольцово (Новосибирская область).

👉 Форматы участия: офлайн и онлайн.

Форум в юбилейный десятый раз соберет на своих площадках ключевых представителей науки, бизнеса и государства, осуществляющих разработки и внедрение инноваций в сфере биотехнологий.

В программе OpenBio-2023:
🔹 научная конференция вирусологов, биотехнологов, молекулярных биологов, биофизиков и биоинформатиков,
🔹 бизнес-форум,
🔹 выставка биотехнологических и биофармацевтических компаний,
🔹 презентация технологий и оборудования,
🔹 детский научный трек,
🔹 artscience и другие яркие события.

Регистрация на форум и научную конференцию — на сайте: https://openbio.ru/

Организатор OpenBio: АНО «Инновационный центр Кольцово» при поддержке Администрации наукограда Кольцово и Правительства Новосибирской области.

#бластим_рекомендует