Рассмотреть объекты с ангстремным разрешением? Различить две комплементарные цепочки ДНК в двойной спирали? Заниматься структурной биологией в живой клетке? И все это с помощью светового микроскопа?

Сегодня это стало реально! В новой статье от Бластим говорим о cutting-edge методе флуоресцентной микроскопии сверхразрешения — RESI.

#бластим_технологии

⚡20 июля заканчивается прием документов в магистратуру «Инновационный менеджмент» Экономического факультета МГУ!

⚙Программа включает 2 специализации: «Менеджмент инноваций: создание новых продуктов и бизнесов» и «Менеджмент биотехнологий».

📚В магистратуре 18 бюджетных мест, обучение проходит по будням преимущественно в вечернее время и иногда по субботам. Для поступления необходимо сдать два экзамена — специальность и английский. Экзамены в дистанционном формате!

📝Примеры тестов доступны онлайн, а также в учебно-методическом пособии, которое можно скачать с сайта. Для зачета экзамена по английскому языку также принимаются международные сертификаты!

🔗Все подробности о программе: bit.ly/3XE6B5N

#бластим_рекомендует

Выходные, полные неожиданных новостей из мира науки!

🍔В прошлую субботу меню ресторана Bar Crenn в Сан-Франциско пополнилось новым блюдом — курятиной из клеток, выращенных в биореакторе! Сама коммерческая история искусственного мяса началась в 2013 г. в Нидерландах с бургера из «фальшивой» говядины за 325 тыс. долларов. А сегодня в этом биоинженерном направлении работает уже более 150 компаний, и себестоимость производства падает. В июне 2023 г. первые стартапы из США Upside Foods и Good Meat добились разрешения на поставки своей продукции на рынок. Но как это работает и где точки роста? Для создания мяса в лаборатории берут биопсию у животных и размножают клетки на питательной среде. Главная цель — заставить их постоянно делиться и дифференцироваться в мышечные волокна. Другой подход — получение бессмертных (=мутантных) клеточных линий, но их безопасность вызывает сомнения. И вообще сделать искусственный стейк пока обходится дороже, чем обыкновенный: огромные суммы уходят на питательные субстраты, факторы роста и энергопотребление. Но биотехнологи продолжают экспериментировать, выращивая неприхотливые куриные фибробласты или клетки рыб. Эксперты надеются, что мясо из пробирки станет альтернативным источником белка для человечества и снизит нагрузку на экосистемы. А еще такая пища понравится вегетарианцам по экологическим убеждениям!

🐌 Если присмотреться к корзинке подсолнуха, розетке листьев алоэ или чешуйкам шишки, то можно заметить, что структуры органов расположены по спирали Фибоначчи. Золотая спираль — визуализация обычного числового ряда, когда следующий элемент равен сумме двух предыдущих. Однако примеры спирали обнаруживаются повсеместно: ее даже называют тайным кодом природы. Крайне редко находятся представители флоры, у которых закономерность не соблюдается. Ученые даже никогда не сомневались в ее раннем происхождении. Но палеоботаники из Эдинбургского университета решили всё проверить. Они изучили одно из первых облиственных растений — отлично сохранившегося ископаемого плауна Asteroxylon mackiei, найденного под знаменитой деревушкой Райни в Шотландии (оттуда риниофиты). С помощью цифровой 3D-реконструкции удалось установить, что листорасположение у плауна, жившего 400 млн лет назад, действительно спиральное, но это отнюдь не фибоначчиева спираль! Открытие портит стройную картину биологов и свидетельствует о том, что золотая спираль была не уж столь консервативна в эволюции. Почему нынешние организмы всецело положились на эту математическую последовательность, остается загадкой.

🌊Микропластик уже повсюду: в океанах, животных, растениях, продуктах. Даже банальный разогрев пищи в микроволновке может таить в себе серьезную опасность, выяснили в свежем токсикологическом исследовании американские ученые. В экспериментах оказалось, что при нагревании полипропиленового пищевого контейнера в течение трех минут в микроволновой печи с одного квадратного сантиметра упаковки выделялось более 4 млн частиц микропластика и 2 млрд частиц нанопластика! Еще больше высвобождалось из мягкой полиэтиленовой упаковки. Похожие результаты эмиссии частиц получались, когда еду хранили при комнатной температуре или в холодильнике, но только за полгода! Специалисты провели дополнительные испытания на культурах in vitro: воздействие микрочастиц приводило к гибели до 80% клеток линии HEK293T, полученных из эмбриональных почек человека. Но самое страшное здесь, что такие пластмассовые упаковки, очень удобные для разогрева в микроволновке, применяются для фасовки детского питания. Надеемся, что ученые убедят промышленность скорее перейти на эко-тару!

#выходные_у_бластим

Центр живых систем МФТИ — научно-трансляционный центр в области биотехнологий и биоинформатики, который занимается разработкой высокотехнологичных биологических лекарственных препаратов и методов диагностики генетических заболеваний. Центр вырос из Лаборатории геномной инженерии, а сейчас в его составе уже несколько подразделений.

В видео с Ярмарки Бластима эйчар ЦЖС Юрий Романовский рассказывает о лабораториях Центра, вакансиях и стажировках, а также развеивает мифы о том, что физтех — это только про физику.

Рекомендуем посмотреть актуальные вакансии:

📌Лаборант (МНС) — молекулярная, клеточная биология (Долгопрудный)
Требования: высшее образование, владение методами выделения нуклеиновых кислот, PCR, qPCR. Предстоит работа с культурами эукариот и участие в экспериментах, требующих использования методов молекулярной генетики. Для специалистов без опыта работы предлагается стажировка с наставником.
Подробнее: bit.ly/3pOvsHk

📌Научный сотрудник — молекулярная, клеточная биология (Долгопрудный)
Нужен мокрый биолог со степенью кандидата наук и опытом лабораторной работы от 5 лет, знанием CRISPR/Cas для руководства прикладными проектами в области молекулярной и клеточной биологии, генной инженерии.
Подробнее: bit.ly/3XNpZgO

📌Научный сотрудник — молекулярная, клеточная биология (Санкт-Петербург)
Требуется научный сотрудник с высшим биологическим или медицинским образованием и опытом в экспериментальной лаборатории для выполнения молекулярно-биологических и клеточных работ, а также экспериментов с животными на базе совместной лаборатории РНК-опосредованного генного таргетирования НМИЦ им. В.А. Алмазова.
Подробнее: bit.ly/3XIhmE2

Откликнуться на вакансии вы можете на сайте blastim.ru или написать на почту HR: romanovskii.ut@mipt.ru

#бластим_вакансии

За искусственным интеллектом будущее, и здорово в своем рабочем арсенале иметь самые современные технологии! Но обычно курсы по машинному обучению рассказывают сразу обо всем и только теорию.

📅29 августа стартует программа «Машинное обучение на Python для решения биоинформатических задач» от Бластим. Мы объясним только те методы, которые реально применяются в естественных науках, и научим использовать каждый из них на практике.

Главное о курсе:

— 18 распределенных занятий: вт - чт - сб
— Преподаватели-программисты с научным бэкграундом
— Полноценный онлайн-формат и чат
— Изучим инструменты в Python для продвинутого анализа
— Применим методы машинного обучения на биологических кейсах
— Напишем пайплайны для биоинформатических данных
— В конце — сертификат о повышении квалификации гособразца

⭐️Программа подходит для биологов, биоинформатиков и аналитиков данных в биологии, руководителей научных лабораторий. После курса вы сможете применять ML в своих исследованиях. Все подробности на сайте: bit.ly/3JSwc5o

⚡️Зарегистрируйтесь до завтра и забронируйте за собой выгодную стоимость!

Магистратура «Медицинские нейротехнологии» приглашает студентов!

🧠Федеральный Центр Мозга и Нейротехеологий ФМБА совместно с РНИМУ им. Н.И. Пирогова запускает новую магистерскую программу в рамках стратегического проекта «Нейрокампус 2030».

🎯 Цель программы — подготовка специалистов в области нейронаук, синтетической нейробиологии и нейропротезирования

🔬Студенты магистратуры будут изучать нейробиологию в контексте медицины, получать навыки в разработке и внедрении новых технологий, а также управлении исследовательской деятельностью

🥇Среди преподавателей ведущие ученые в области нейротехнологий, сотрудники ИВНДиНФ РАН, МГУ Ломоносова, ИБХ РАН, РНИМУ Пирогова и Федерального центра мозга

🌟Главная особенность магистратуры — возможность взаимодействия с действующими врачами, в том числе с нейрохирургами, напрямую!

❗️Дедлайн приема документов: 20 июля

⚡️Узнать больше о программе и подать заявку можно на сайте: bit.ly/3JQXp8k

#бластим_рекомендует

После вебинаров Бластима решили заняться CRISPR? Подобрали вакансии в этой области!

📌PhD-студент в Центр Белковых исследования Фонда Novo Nordisk (Копенгаген, Дания)
Лаборатория Чоудхари в университете Копенгагена приглашает в аспирантуру изучать регуляцию и эпигенетику клеток млекопитающих с помощью объединения подходов NGS с CRISPR. Нужны кандидаты, знающие мокрую часть/биоинформатику или всё сразу! Необходим опыт в анализе данных Chip-/RNA-/ATAC-seq, знание R и Python, статистики. Дедлайн: 1 августа.

📌Постдок в скрининг генома дрожжей (Лёвен, Бельгия)
Центр микробиологии VIB-KU приглашает кандидатов с PhD-степенью в проект по изучению необычных дрожжей. Предстоит определять, как генотип определяет фенотип с помощью геномного скрининга. Проект включает как экспериментальную часть, так и анализ данных. Требуются навыки программирования на Python, R и NGS. Дедлайн: 1 августа.

📌Постдок в редактирование КРС (Копенгаген, Дания)
Институт ветеринарии и животноводства Копенгагенского университета ищет постдока для изучения применимости и безопасности редактора CRISPR/Cas9 к крупному рогатому скоту. Предстоит оценивать оффтаргеты генетических ножниц путем внесения снипов в эмбрионы и клетки. Нужна степень PhD, опыт в редактировании, работы с ИПСК. Дедлайн: 20 августа.

📌Новатор в области редактирования в Crispr Therapeutics (Бостон, США)
Одна из ведущих компаний по разработке криспр-терапий заболеваний приглашает сотрудников для создания лекарств будущего. Предстоит выполнять и презентовать новые исследования. Нужна степень PhD, опыт конструирования нуклеиновых кислот, навыки в области белковой и РНК-инженерии.

📌CRISPR-ученый в Grittgene (Луизиана, США)
Требуется старший научный сотрудник в геномное редактирование. Цель компании — лечение миотонической дистрофии 2 типа. Предстоит проводить тесты на клетках, определять кандидатов для гидовой РНК, делать NGS-анализы. От соискателей ожидается: степень бакалавра или магистра, опыт в молекулярной биологии и NGS.

#бластим_подборка

Новости науки не дадут заскучать на выходных!

⛅️Биогаз без прикрас! Многие видят в биометане доступное и экологичное топливо, которое поможет в борьбе с изменениями климата. Метан выделяют из свалочного газа или производят в реакторах, перерабатывая навоз и агроотходы, а потом транспортируют по обычным газопроводам. Заметка в PNAS ставит под сомнение «чистоту» возобновляемого природного газа. Во-первых, в крупных странах, таких как США, биогаз способен покрыть лишь малую толику потребности в энергоносителях, даже если на его продукцию направить весь мусор, да еще и специально выращиваемые технические культуры. Во-вторых, строить метантенки дорого, а после бескислородного сбраживания остается осадок — дигестат, всё равно высвобождающий метан в атмосферу. Улетучивается газ и при транспортировке по трубам. При этом парниковый эффект от метана в 80 раз сильнее, чем от пресловутого CO2! Вредные продукты образуются и при его сгорании. Что делать? Экологи советуют не отказываться от биогаза, а сокращать его выбросы: снижать метаногенез у коров с помощью кормовых добавок, утилизировать навоз, не доводя до анаэробной ферментации, применять биотопливо неподалеку от места образования и не сжигать его, а окислять в топливных элементах.

🥖Целиакия — аутоиммунное генетическое заболевание тонкой кишки, когда люди не переносят продукты, содержащие глютен — запасной белок хлебных злаков. Что заставляет иммунитет разрушать собственную слизистую в ответ на не полностью перевариваемые пептиды зерновых, понятно не до конца. Свежая статья в Science Immunology чуточку проясняет картину. При потреблении хлеба у пациентов запускается иммунный ответ, опосредованный глютен-специфичными CD4+ Т-хелперами. Еще в патогенез вовлечена любопытная популяция иммуноцитов — интраэпителиальные Т-лимфоциты (T-IELs), имеющие и Т-клеточный рецептор, и рецептор натуральных киллеров. В норме Т-IEL защищают кишечник от инфекций, убивая ненормальные энтероциты, но при глютеновой болезни выходят из-под контроля. Интересно, что глютен для их Т-клеточных рецепторов не антиген: «включаются» они по-другому и позднее — уже в ответ на воспаление. Ряд специалистов считают, T-IELs на самом деле пытаются остановить болезнетворный процесс, запущенный Т-хелперами. В новой работе ученые брали биопсии и проводили мультиплексный одноклеточный анализ. Оказалось, глютен служит триггером не только для активации Т-хелперов, но и для параллельного и быстрого репрограммирования части интраэпителиальных клеток памяти. Последние превращаются в Т-киллеров и все-таки усугубляют воспаление, хотя и их регуляторную роль опровергнуть не удалось. Расшифровка запутанных иммунных механизмов позволит найти недиетическую терапию целиакии и других аутоиммунных патологий.

🌺Селекционеры за «непорочное зачатие»! Современная селекция во многом построена на гетерозисе — феномене, когда при скрещивании двух инбредных линий, гибридное потомство превосходит родителей по силе и урожайности. В следующих поколениях гетерозис теряется, поэтому семена надо получать заново. Легко поддерживать ценные гибриды может апомиксис — способ размножения с пропуском мейоза и оплодотворения, когда зародыш семени развивается из нередуцированной яйцеклетки или другой диплоидной клетки. То есть это клон! Существуют растения с естественным апомиксисом, но не сельскохозяйственные виды. И ученые добиваются его искусственно: они уже определили ключевые гены апомиксиса и применяют генетическое редактирование. Работают генетики с локусами с яркими названиями: выключают гены MiMe (mitosis instead of meiosis) и активируют Baby boom, который запускает рост зародышей. Таким способом уже получили рис с 95% клональных семян! Конструирование апомиктических гибридных сортов набирает обороты по всему миру: надеемся увидеть их на полях.

#выходные_у_бластим

Вы микробиолог или интересуетесь этой темой? Увлечены не только биоинформатикой, но и микробиологией? Бластим тоже!

🧫 Мы хотим нарастить количество полезного контента для всех, кто хочет развиваться в этой области. Чтобы точнее попасть с темами, приглашаем вас ответить на несколько вопросов. Очень вероятно, что именно ваш тематический запрос реализуется!

🔗 Ссылка для прохождения опроса: bit.ly/3rFBwCw

Всем заполнившим форму мы подарим лекцию по микробиомике человека «Сбор данных и биобанка: клинический этап». Спасибо вам, что помогаете нам стать лучше!

Хочешь научиться запускать самые актуальные технологии и оптимизировать процессы на биотехнологических производствах?

У тебя есть отличная возможность — магистерская образовательная программа ПИШ ИТМО х АГНИ х Татнефть «Индустриальная биотехнология».

⭐️ Преимущества программы:

— обучение в передовом биотехнологическом научно-образовательном центре АГНИ в Альметьевске
— часть модулей будут проходить в Университете ИТМО в Санкт-Петербурге (перелёты будут оплачиваться)
— стипендиальная поддержка студентов от 20 до 40 тыс. руб.
— возможность получения приглашения о трудоустройстве в компанию «Татнефть»

🧪 Студенты научатся применять биотехнологии в различных отраслях: от добычи газа и нефти до утилизации отходов, производства продуктов питания и биологически активных ферментов

Также магистранты будут работать над научными или ориентированными на продукт проектами под руководством ученых мирового уровня в инновационных лабораториях.

Количество бюджетных мест: 12

Варианты поступления:
❗️ конкурс портфолио без сдачи вступительных испытаний (закрывается 25 июля)
⚡️ дистанционный экзамен 8 августа в письменно-устной форме

🔗 Узнать больше о направлении и подать документы можно до 1 августа

#бластим_рекомендует

Радиационная биомедицина зовет на вебинар!

💡 Магистратура по программе «Радиационная биомедицина» — это ваш шанс стать экспертом в инновационной области, которая меняет мир!

🎓 Организаторы магистратуры приглашают всех интересующихся на бесплатный вебинар, где преподаватели расскажут о преимуществах и возможностях этой программы!

🚀 На вебинаре вас ждет:

— Подробный обзор программы «Радиационная биомедицина»
— Информация о карьерных перспективах для выпускников
— Живое общение с экспертами, которым можно задать свои вопросы

❗ Для талантливых студентов доступны гранты на обучение, а также предоставляется возможность бесплатного обучения и общежития.

📆 Дата и время: 25 июля 16.00 мск
🌐 Платформа: zoom (ссылка придет перед вебинаром)

🔗 Чтобы зарегистрироваться на вебинар, перейдите по ссылке на сайте или свяжитесь с организаторами для получения дополнительной информации: bit.ly/3XXopsL

#бластим_рекомендует

Получение рекомбинантных белков уже становится рутиной! Сегодня их используют не только ученые, но и фармотрасль, сельское хозяйство и пищевая индустрия. Но как нарабатывают такие белки? Ответим на этот вопрос на новом вебинаре Бластима!

27 июля в 19:00 МСК пройдет открытая встреча «Как получать рекомбинантные белки в Е. coli ?»
Спикером выступит Анастасия Тарабарова, выпускница МГУ, специалист в молекулярной биотехнологии.

⚙️ На занятии:
— обсудим ключевые моменты биотехнологического процесса получения рекомбинантных белков;
— поговорим о «рабочей лошадке» метода — кишечной палочке и разных ее штаммах;
— расскажем о Т7 системе экспрессии;
— узнаем о нюансах культивирования, питательных средах и оборудовании;
— погрузимся в «закулисье» современных лабораторных и промышленных методов.

🧫 Вебинар подойдет как для начинающих специалистов, так и для небиологов-энтузиастов, предпринимателей и всех, кто хочет узнать больше о биотехнологии, которая уже давно шагнула из области научных изысканий в реальную практику!

🔗Регистрируйтесь на онлайн-встречу на сайте: bit.ly/3q3xljx
И приходите на прямой эфир!

#бластим_рeкомендует

🔥Еще одна инновационная магистратура от Университета ИТМО приглашает студентов!

ПИШ ИТМО в партнерстве с АГНИ и компанией Татнефть представляют магистерскую программу «Искусственный интеллект в биотехнологических системах», студенты которой будут применять ИИ в передовых проектах по биотеху.

❗️На программу можно попасть без вступительных испытаний. Дедлайн конкурса портфолио: 25 июля

📚Обучение будет проходить на русском и английском языках, с упором не только на профессиональные навыки, но и на развитие soft skills, для подготовки не просто специалистов, а лидеров исследовательских команд уровня Middle+.

Другие преимущества программы:

— научные или ориентированные на продукт проекты под руководством ученых мирового уровня
— обучение в передовом биотехнологическом научно-образовательном центре АГНИ, г. Альметьевск
— часть модулей в Санкт-Петербурге (оплачиваемые перелеты)
— возможность получения приглашения на работу в компанию «Татнефть»
— стипендия от 20 до 40 тыс. руб.

Количество бюджетных мест: 20

🔗Узнать больше о направлении и подать документы:
https://aibiotech.itmo-agni.ru/

Жаркое лето и самые горячие новости науки!

🌡Препараты для желудка спасут от глобального потепления?! Океан наряду с лесами — важнейший нейтрализатор CO2. Своей огромной поверхностью он поглощает до четверти всех выбросов в год. В захоронении углерода на глубине особенно важны донные минералы, образующиеся в результате естественного «выветривания». С началом индустриальной эры океан уже не справляется с излишками диоксида углерода, и рост антропогенной эмиссии ведет не только к парниковому эффекту, но и закислению воды, что меняет экосистемы, угрожает кораллам. Экологи думают, как искусственно повысить щелочность океана, чтобы увеличить его улавливающую способность, нормализовать pH и охладить Землю. Стартапы предлагают использовать антациды. Так называют лекарства, которые прописывают гастроэнтерологи для снижения кислотности желудка. В качестве антацидов компания Vesta уже рассеивает частицы зеленоватого минерала оливина на пляжах Калифорнии. А Planetary Technologies хотят применять гидроксид магния, который можно найти в отходах горной добычи. Но, чтобы углекислый газ реально поглощался, щелочная морская вода должна контактировать с атмосферой, а не опускаться вниз. Ученые бьются над этой задачей. Но пока не решена другая проблема — научиться фиксировать действие антацидов в планетарном масштабе!

🌳В школе мы все собирали макулатуру, и нам говорили, что бумажные изделия экологичны, ведь исходное сырье — возобновляемое, биоразлагаемое и подходящее для вторичной переработки. Однако, чтобы получить белый лист нужна чистая древесная целлюлоза, тогда как в растениях она находится в тесной связке с лигнином. Лигнин приходится удалять: это грязный химический процесс, сопровождающийся сильными выбросами парниковых газов. Промышленность давно мечтает уменьшить содержание вещества в древесине, и сегодня благодаря CRISPR такой шанс представился. Лигнин витален, нужен для одревеснения клеточных стенок, а его биосинтез регулируется 21 геном. Ученые из Северной Каролины создали компьютерную модель на основе данных лесной биотехнологии и проанализировали почти 70 тыс. комбинаций изменений генома, из которых 99,5% были неудачными. До мокрой лаборатории добралось 174 варианта. С помощью CRISPR специалисты осуществили мультиплексное редактирование генома тополя, а затем вырастили растения в теплице. У лучших образцов с внесенными в ДНК правками содержание лигнина снизилось почти на 50%! Новые сорта сделают целлюлозно-бумажную отрасль более рентабельной и «зеленой».

🐠У рыбок — свой санскрин! Не только люди наносят крема против загара, другие организмы тоже как могут спасаются от ультрафиолета: в их арсенале есть механизмы репарации ДНК, ночной образ жизни и солнцезащитные вещества, рассеивающие энергию фотонов в тепло. У позвоночных — пигмент меланин, и вроде бы все… Но 40 лет назад в икринках рыб открыли гадусол. Это соединение продуцируется многими водорослями — ведь даже через толщу воды проникает опасный УФ. Считалось, что гадусол поступает к рыбам с пищей, но потом в геномах были обнаружены гены его биосинтеза. Статья биологов из университета Юты добавляет новые подробности. Экологические генетики экспериментировали с рыбкой данио. Выяснилось, что материнский гадусол накапливается в яйцеклетках и эффективно защищает рыбок в эмбриональный и личиночный период, предотвращая образование тиминовых димеров. Гадусол в отличие от меланина бесцветен и поэтому отлично пригоден для прозрачной маскировки в богатых не только пищей, но и хищниками фотической зоне океана. А вот многие глубоководные представители костистых рыб благополучно потеряли гены его биосинтеза.

#выходные_у_бластим

Биоинформатика на берегу моря!

Приходите решать сложные и интересные научные задачи в магистратуру «Биоинформатика» в Университете «Сириус» bit.ly/3MTtWeA
На программе 3 основных трека, соответствующие главным биоинформатическим направлениям:

— Анализ геномных данных
— Структурная биология и разработка лекарственных препаратов
— Системная биология и математическое моделирование в биологии и медицине

Какие бонусы у программы:

✔️ 25 бюджетных мест, стипендия от 20 до 40 тысяч рублей;
✔️ проживание в студенческих гостиницах на черноморском побережье;
✔️ преподаватели — ученые с мировым именем;
✔️ работа в лабораториях с самым высокотехнологичным оборудованием;
✔️ возможность найти работу прямо во время обучения в компаниях-партнерах, таких как BioCad, Generium, Биософт.Ру.

Как поступить:

🧬Поступить могут математики, физики, биологи, химики и программисты!
📝Экзамен состоит из 2 частей: письменная часть (100 баллов, проходной балл — 40) и собеседование (100 баллов).
🏆Также учитываются личные достижения — публикации, участие в олимпиадах!

Важные ссылки:

🔗Программа вступительных испытаний и примеры задач: bit.ly/3qnecJj
🔗Точное расписание экзаменов: bit.ly/43nVAY6

❗️Прием до 28 июля включительно — успейте подать заявление!

#бластим_рекомендует