Бластим зовет всех на конференцию МССМВ’23!

🧬3-6 августа 2023 будет проведена 11-я Московская конференция по вычислительной молекулярной биологии МССМВ’23!🧬

Организаторы приглашают к участию представителей ведущих российских групп в области биоинформатики, системной и структурной биологии, молекулярной эволюции, сравнительной геномики, а также смежных областей (молекулярной генетики, компьютерных наук, биофизики и т.д.).

📍Конференция пройдет в очном режиме, место проведения – Сколковский институт науки и технологий. Рабочим языком будет русский.

🔥Как и в прошлые годы, организаторы конференции надеются не только на сильный состав приглашенных участников, но и на интересные доклады и постеры.

❗️Крайний срок подачи заявок на устный доклад – 3 июня (23:59 МСК). Тезисы для постерных докладов принимаются до 30 июня (23:59 МСК). Формат тезисов и форма регистрации доступны по ссылке: https://www.mccmb.info/submission-registration-23

#бластим_рекомендует

Недавно праздновался День Химика, и мы решили сделать большую подборку вакансий, связанных с химией, биохимией, хемоинформатикой!

🚩Стажировка в R&D-химию в Henkel (Италия)
Требуется степень магистра химии. Стажеров ждет работа в лаборатории по приготовлению составов, синтезу полимеров, а также характеристике полученных продуктов.
Дедлайн: 9 июня
bit.ly/3N76H27

🚩Химик-лаборант в Клонинг Фасилити (Россия)
В компанию в области промышленной биотехнологии нужен коллега для технической работы, требующей базовых лабораторных навыков и аккуратности. Требуется биологическое или химическое образование, базовое знание органической и аналитической химии и биохимии, понимание работы в лаборатории и техники безопасности.
Дедлайн: 15 июня
bit.ly/3MPT5a0

🚩Постдок в Университет Небраски-Линкольн (США)
Лаборатория Чжана на кафедре биохимии и редокс-биологии приглашает кандидата, интересующегося структурной и RedOx-биологией, инфекционными заболеваниями для изучения металлопротеинов. Требуется PhD-степень, подтвержденный опыт в рентгеновской кристаллографии, крио-ЭМ, ЯМР или молекулярной биологии.
Дедлайн: 21 июня
bit.ly/3N919UN

🚩Стажировка по медхимии в Dewpoint (Германия)
Приглашаются стажеры по медицинской химии, которые присоединятся к RnD-команде. Требования: степень магистра в области химии, знания в области органической химии, начальный практический опыт. Стажеры узнают о параллельном синтезе, аналитических методах и методах очистки, будут проводить эксперименты и анализировать продукты реакции.
bit.ly/43IZZox

🚩Фултайм-стажировка по CADD в Роше (Китай)
China Innovation Center of Roche (CICoR) приглашает на стажировку мотивированного химика-вычислителя. Работа связана с молекулярным моделированием в драг-дизайне. Требования: PhD-степень в области вычислительной химии, хемоинформатики, опыт моделирования методом молекулярной динамики, SBDD, знание Linux и Python. А также навыки общения на китайском и английском языках!
bit.ly/42lv7Jm

#бластим_подборка

Новости большой науки в воскресной подборке Бластима!

💊Назревает большой прорыв в органической и медицинской химии: все сильнее развиваются методы редактирования каркаса молекул! В свежем материале Nature обсуждаются самые передовые разработки органиков в области «skeletal editing». Если раньше после серии сложных реакций синтеза можно было лишь как-то декорировать боковые группы полученных молекул, то теперь химики научились избирательно вставлять, удалять или заменять атомы в самом углеродном скелете органических соединений, не затрагивая функциональные группы. Инновационные подходы молекулярной хирургии, которые специалисты называют настоящим чудом, за один шаг позволяют превращать пирролы в пиридины, вводить азот в кольца, ставить кислород вместо углерода в гетероциклах и даже менять изотопы. Такие инструменты сулят небывалые перспективы для драг-дизайна и фарминдустрии.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01735-1

👀Глаз — пример неупрощаемой сложности среди аргументов креационистов. Поэтому сравнительные эволюционные исследования зрения крайне важны и любопытны. В Cell Genomics опубликована статья, где ученые составили клеточный атлас сетчатки глаза человека. Сетчатка — многослойная нейронная структура, в которой традиционно выделяют 6 основных типов нервных клеток. На этот раз генетики использовали мультимодальный подход: они интегрировали данные, полученные методами одноядерного RNA-seq и ATAC-seq. Так им удалось отыскать целых 68 типов нейронов! Кроме того, было проведено межвидовое сравнение сетчаток человека, обезьяны, мыши и курицы. Оказалось, что общие клеточные типы стабильно сохраняются у разных позвоночных. Причем внешний слой фоторецепторов наиболее консервативен, тогда как внутренние слои различаются, что, по-видимому, соответствует различным подходам к обработке информации.
https://www.cell.com/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(23)00064-2

🌳Многие слышали о необычной терапии заболеваний кишечника — трансплантации фекальной микробиоты. Оказывается, нечто подобное применимо и к растениям! Недавно в Science вышла работа, где американские биологи повысили устойчивость деревьев к климатическим изменениям с помощью пересадки почвенных микроорганизмов. Так, в ходе полевых экспериментов ученые инокулировали саженцы деревьев микробиотой из холодных или засушливых местообитаний и далее подвергали растения воздействию низких температур или засухи соответственно. Микробы, которые ранее жили в неблагоприятных условиях и адаптировались к ним, смягчали действие стрессовых факторов и способствовали лучшей выживаемости древесных пород. Например, было показано, что за компенсацию недостатка влаги отвечали разнообразные арбускулярные микоризные грибы. Специалисты надеются, что новая стратегия поможет сделать лесные экосистемы стабильнее.
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adf2027

#выходные_у_бластим

Бластим специально для ученых и всех интересующихся собрал подборку баз данных по геномике, молекулярной биологии, хемоинформатике и другим областям биологии.

Мы разместили список на сайте Бластима, чтобы он всегда был под рукой: bit.ly/3NazSRU

Забирайте полезный лист и расшаривайте друзьям!

Думаете, что анализировать данные секвенирования сложно? Возможно. Но лекторы Бластима умеют рассказывать об этом понятно — даже в формате shorts! Пока едете в лифте или пьете кофе, вы можете узнать для себя что-то полезное.

В новом видео смотрите о том, что вообще такое биоинформатика. А также рекомендуем статью в тему.

Бластим рекомендует магистратуру «Биоинформатика» в Университете «Сириус»: bit.ly/3MTtWeA

Программа подойдет для биологов, химиков, физиков, математиков и программистов, которые хотят решать интересные и сложные задачи современной биоинформатики по трем направлениям:

1. Анализ геномных данных
2. Структурная биология и разработка лекарственных препаратов
3. Системная биология и математическое моделирование в биологии и медицине

Что отличает Университет «Сириус»?

✔️бесплатное обучение для всех (25 мест) и стипендии от 20 до 40 тысяч рублей;
✔️проживание в студенческих гостиницах на побережье Черного моря;
✔️преподаватели — ученые с мировым именем;
✔️возможность найти работу в ведущих компаниях страны еще во время учебы;
✔️работа в лабораториях с самым высокотехнологичным оборудованием.

Экзамен состоит из 2 частей: письменная часть (100 баллов) и собеседование (100 баллов). Проходной балл — 40 баллов. Также учитываются личные достижения — публикации, участия в олимпиадах!🏆

🔥Индустриальные и академические партнеры магистратуры: BioCad, Generium, Биософт.Ру, МГУ, СПБГУ, КФУ, НГУ.

🔗Программа вступительных испытаний и примеры задач: bit.ly/3qnecJj
🔗Точное расписание экзаменов: bit.ly/43nVAY6

До встречи в Сириусе на берегу Черного моря!

#бластим_рекомендует

Много отличных вакансий компании Generium на сайте Бластима!

Публикуем выступление менеджера по подбору персонала АО «Генериум» Маргариты Прудниковой об особенностях работы в компании, научной, инновационной и социальной деятельности, открытых позициях, возможности защиты диссертаций и прохождения стажировок.

Видео на нашем канале: bit.ly/45PfkWo (кстати, подписывайтесь!)

Ниже мы даем список вакансий, которые обсуждались в видео. Откликнуться на них можно через сайт blastim.ru

Управление проектами (Москва)
📌Администратор проекта
bit.ly/3oRTqRD

Наука и разработка
— Локация: п. Вольгинский, Владимирская область
📌Научный сотрудник (клеточная биология)
bit.ly/3MMX8nq
📌Научный сотрудник (хроматографические методы очистки)
bit.ly/45Tax6o
📌Научный сотрудник (физико-химические методы)
bit.ly/3NgFAS9
📌Старший научный сотрудник (хромато-масс-спектрометрия)
bit.ly/3oLbcGm

— Локация: Москва
📌Менеджер по доклиническим исследованиям
bit.ly/3WWaqTn

— Локация обсуждается индивидуально
📌Эксперт-аналитик (аналитические методы)
bit.ly/3J0Xhmo

Производство (п. Вольгинский, Владимирская область)
📌Технолог (хроматографическая очистка)
bit.ly/3MQWXI1

Дирекция качества (п. Вольгинский, Владимирская область)
📌Химик (Лаборатория внутрицехового контроля) ОКК
bit.ly/3NidRRh
📌Химик (перенос и валидация аналитических методик)
bit.ly/3MYdZUD

⚡️Генериум ждет мотивированных и квалифицированных специалистов!

#бластим_вакансии

Большой резонанс получил кейс, в котором студент РГГУ защитил диплом, написанный с помощью ChatGPT. Мы решили собрать кейсы, как искусственный интеллект уже сейчас меняет сферу образования.

#бластим_технологии

Этот спор уходит в прошлое тысячелетие: Линукс или Виндовс? Что лучше? Однозначного ответа нет, но для анализа NGS-данных мы все же рекомендуем Линукс. Почему? Смотрите в ролике!

Новая большая подборка мероприятий в науке и индустрии от Бластима!

📌Международная конференция по микологии и ботанике ICBotMyco23 (София, Болгария и онлайн)
18 — 19 сентября
Дедлайн: 10 июня
bit.ly/3qAUSIL

📌Веб-семинар от Illumina про платформу NextSeq 1000/2000
13 июня
bit.ly/42wDjXp

📌Вебинар «Совершенствование клеточной и генной терапии с помощью проточной цитометрии» от Science
14 июня, 19:00 (МСК)
bit.ly/43PMO53

📌Вебинар про фармакологию и токсикологию психостимуляторов амфетаминового ряда
16 июня, 11:00 (МСК)
bit.ly/43QyObq

📌Вебинар по биоинформатике о методе HiFi для фазирования генотипов от PacBio
20 июня, 17:00 (МСК)
bit.ly/45MKIES

📌Онлайн-саммит по инновациям в растениеводстве от Bayer
20 июня, 20:00 (МСК)
bit.ly/43Sfj20

📌Вебинар по пространственной биологии в иммуноонкологии от Science
21 июня, 19:00 (МСК)
bit.ly/3Nl0zDq

📌Курс по анализу NGS-данных (Москва или онлайн)
26 — 30 июня, 3 — 7 июля
bit.ly/3CklLmJ

📌МССМВ'23 (Москва)
3 — 6 августа
Дедлайн (постерная сесcия): 30 июня
bit.ly/43uKot3

📌Симпозиум по структурной биологии от Cell (Хуаншань, Китай)
3 — 5 ноября
Дедлайн: 30 июня
bit.ly/3J0kQeP

📌Симпозиум по сингл селлу от Cell (Сан-Диего, США)
28 — 30 августа
Дедлайн: 16 июля
bit.ly/3NmLWzI

📌Встреча представителей сообщества Oxford Nanopore Technology (Техас, США и онлайн)
6 декабря
Дедлайн: 28 июля
bit.ly/3oVpNio

📌Курс «Машинное обучение на Python для решения биоинформатических задач» (онлайн)
29 августа — 7 октября
bit.ly/3N1FiNS

📌Конференция «Биоинженерия в глобальном здравоохранении» от Nature (Теннесси, США)
13 — 15 ноября
Дедлайн: 8 сентября
bit.ly/43yMbx6

📌Российский микробиологический конгресс (Томск)
24 — 29 сентября
Дедлайн: 23 сентября
bit.ly/42uOQGL

📌Международная конференция «ГМО: история, достижения, социальные и экономические риски» (Санкт-Петербург, смешанный формат)
3 — 5 октября
bit.ly/3WWx9i2

📌Международный ботанический конгресс IBC 2024 (Мадрид)
21 — 24 июля 2024
bit.ly/3NktfMV

Присоединяйтесь сами и шерьте друзьям и коллегам!

#бластим_подборка

Еще пара комментов про пользу Линукса и для внимательных акция!

Всем записавшимся на курс «Анализ NGS-данных» дарим 2 дня обучения Linux.

В обзоре Бластима новости, которые заставляют удивиться возможностям науки!

🧬Генетика помогла освободить невинно обвиненную женщину из тюрьмы! 20 лет назад австралийку Кэтлин Фолбигг осудили за серию убийств. Дело в том, что у женщины загадочным образом умерло четверо малолетних детей. Многие не верили в справедливость приговора и боролись за освобождение Фолбигг. Последние 5 лет к делу подключились клинические генетики. Ученые изучили образцы крови осужденной и ее умерших детей. Им удалось обнаружить у женщины необычную мутацию CALM2-G114R в гене кальмодулина. Неправильное функционирование этого белка может приводить к сердечным аритмиям и внезапной смерти у младенцев. Дочери Фолбигг унаследовали патологическую аллель. У сыновей же была обнаружена другая мутация, которая у мышей отвечала за летальную эпилепсию и могла вести к необъяснимой остановке дыхания. Результаты исследований были опубликованы. Суд, вняв доводам ученых, признал ошибку: недавно несчастная женщина была помилована.
https://www.science.org/content/article/how-geneticist-led-effort-free-mother-convicted-killing-her-kids

💊Существует гипотеза, что повышенное содержание уратов при подагре может иметь положительное влияние на интеллектуальные способности. Вот и другой продукт катаболизма — билирубин — похоже, тоже полезен! В учебниках биохимии обычно пишут о билирубине как о ненужном и токсичном продукте деградации гема, при избыточном накоплении которого развивается желтуха. Но сейчас взгляд ученых на молекулу меняется. Давно было замечено, что люди, имеющие умеренно повышенный уровень желчного пигмента вследствие мутаций (синдром Жильбера) или иных причин, реже страдают от онкологии, заболеваний сердца, кишечника. Свежие работы подтвердили, что билирубин — мощный антиоксидант, а еще он может выступать в роли гормона. Сегодня южнокорейские исследователи решили пойти дальше и создали терапевтические наночастицы с билирубином. Такая форма преодолевает проблемы нерастворимости молекулы в воде и ее подверженности легкой фотодеструкции. Скоро стартует I фаза клинических испытаний инновационной разработки по показанию рассеянный склероз и инсульт: будем ждать результатов!
https://www.science.org/content/article/can-toxic-bilirubin-treat-variety-illnesses

🍅Спасти кетчуп поможет искусственный интеллект! В журнале Time вышла любопытная статья о том, как с помощью самых передовых методов наука и индустрия пытаются улучшить потребительские качества выращиваемых растений и приспособить их к меняющемуся климату. Так, стартапы вовсю применяют технологию геномного редактирования CRISPR: например, чтобы получить зелень горчицы без горького вкуса или плоды вишни и ежевики без косточек! Но более насущный вопрос — спасение томатов. Сейчас плантации в Калифорнии, где выращивают 95% всех помидоров для изготовления консервированной продукции в США, страдают от жары и засухи, отчего урожаи снижаются. Компания Avalo предлагает для решения проблемы технологию управляемой эволюции (assisted evolution) на основе ИИ. Алгоритмы машинного обучения помогают выявить признаки устойчивости к жаре и засухе у культурных растений и их диких родственников, а потом рекомендуют оптимальную схему скрещиваний. По сути это ускоренная гибридная селекция, только без лишних проб и ошибок. Первые предсказанные компьютером жаростойкие томаты уже растут в теплице.
https://time.com/6283762/climate-change-tomatoes-ketchup-ai/

#выходные_у_бластим

Бластим расширяет команду сотрудников в центр дополнительного образования для специалистов биотеха!

⚡️Мы ищем менеджера продаж, в обязанности которого будут входить следующие аспекты:

— Вести теплую базу клиентов
— Выявлять потребности и отвечать на вопросы клиента
— Участвовать в формировании маркетинговых материалов
— Вести отчетность и считать метрики

⭐️Требования:
— Размещение предпочтительно в РФ
— Базовые знания биологии, программирования и отличные коммуникативные навыки
— Опыт продаж от полугода или образования/прохождения курсов по продажам
— Высокая обучаемость, креативность и дружба с табличками
— Опыт удаленной работы (наличие тихого места, компьютера, быстрого интернета и гарнитуры)
— Высокий уровень энергии, желание обучаться, хорошо зарабатывать и расти внутри уникального образовательного проекта

💎Условия:
— Доход в формате оклад + %, бонусы
— Фултайм, но можно начать с парт-тайма с доступом 5/2 с 10:00 до 19:00
— Полностью удаленная работа
— Дадим готовые конверсионные скрипты и проведем тренинг по особенностям продаж в нашем секторе
— Работаем в удобной и простой CRM-системе AmoCRM с использованием cовременных виджетов
— Дадим вспомогательные материалы для презентации программ и мероприятий клиенту
— По-настоящему интересная работа, где клиентами являются приятные люди из научного и индустриального сектора
— Постоянная поддержка и помощь от руководителя и команды, возможность роста до РОП

➡️Если это про вас, присоединяйтесь к команде Бластима: bit.ly/3qJe0nI

Как вы думаете, что служит центральным элементом любого NGS-эксперимента? Получение ридов? Контроль качества? Или может быть сборка генома? Ответ смотрите в новом видео — он может вас удивить!

НПО Петровакс Фарм — российская биофармацевтическая компания полного цикла с 25-летним опытом работы на фармацевтическом рынке.

Директор по исследованиям и разработкам Петровакса Антон Тихонов рассказывает об особенностях компании и открытых вакансиях, а также отвечает на вопросы и делится своим нетривиальным карьерным треком. Смотрите его выступление (есть таймкоды): bit.ly/3JemJVD

А также есть возможность откликнуться на актуальные вакансии, которые были в видео:

Биотех
• Проектный менеджер (Project manager)
• Менеджер по выводу препаратов на зарубежные рынки
(National access manager)
• Старший менеджер по работе с ключевыми клиентами (Senior KAM):
• Старший медсоветник (Senior medical advisor)

R&D
• Научный сотрудник с опытом клеточной работы
• Лаборант-исследователь
• Гематолог

Отклики можно отправлять на почту:
HR-Petrovax@petrovax.ru

Даже когда нет открытых вакансий, но вам нравится Петровакс и у вас есть необходимые навыки и интерес, пишите нанимающим менеджерам компании! Сайт: bit.ly/3Nu2iGC

#бластим_вакансии

Почему биоинформатических программ так много? Ведь многие из них выполняют одну и ту же функцию? Смотрите видео про мифы о работе биоинформатиков!

16 июня в 19:00 (мск) на базе экономического факультета МГУ состоится презентационная сессия и онлайн-дискуссия «Биотех в России: современные тренды и карьерные перспективы».

Одним из спикеров выступит Наталья Мнафки, партнер и руководитель образовательных проектов Бластима.

Узнать программу мероприятия, вопросы дискуссии и зарегистрироваться можно по ссылке: bit.ly/469igx5

К участию приглашаются все заинтересованные слушатели — тоже приходите!

#бластим_рекомендует

Клонирование — это уже давно не про овечку Долли! Сегодня ученые клонируют прежде всего отдельные клетки, которые имеют широчайшее применение в биотехнологии и медицине. В статье узнаем о методе выделения клеток с помощью суперпипетки и импедансного сенсора.

#бластим_технологии