В новой статье про современные технологии откроем для себя метод DISCOVER-Seq+. Он позволяет с высокой точностью искать офф-таргеты «генетических ножниц» CRISPR/Cas9!
#бластим_технологии
#бластим_технологии
Telegraph
Discover-Seq+
Технология CRISPR/Cas9 произвела революцию в геномном редактировании: в 2020 году за нее вручили Нобелевскую премию, а сегодня FDA уже готовится одобрить первую CRISPR-генную терапию для лечения гемоглобинопатий. Однако основной принцип системы CRISPR остается…
❤7👍3
🎓Подборка PhD-позиций за рубежом!
🇸🇪PhD-позиция в структурной биоинформатике (Швеция)
Линчепингский университет приглашает аспирантов для работы в области структурной биоинформатики и изучения биомолекулярных структур с помощью ИИ. Необходимо знание методов искусственного интеллекта и машинного обучения, а также опыт их применения в структурной биоинформатике или смежных областях, знакомство с AlphaFold, знание Python и/или C++, опыт работы с BASH и командной строкой.
Дедлайн: 26 мая
Подробнее: bit.ly/42LBJll
🇩🇪PhD-позиции в протеомику и масс-спектрометрию (Германия)
Приглашаются докторанты и постдоки в лабораторию Тензера в Университетский медицинский центр Майнцского университета для работы по клинической протеомике. Требуется опыт в ЖХ/МС, интерес к биомедицине и биомаркерам, приветствуются знания Python, R, матмоделирования.
Дедлайн: 29 мая
Подробнее: bit.ly/3Igpbu8
🇩🇰PhD-стипендиальная программа в биоинформатику и анализ данных (Дания)
На кафедру биотехнологии и биомедицины Технического университета в Копенгагене нужен PhD-студент для исследования механизмов клеточной дифференцировки. Предстоит заниматься геномикой одиночных клеток (scRNA-seq, scATAC-seq, пространственная транскриптомика) и массовых наборов данных (РНК-/ATAC-/ChIP-seq). Нужна магистерская степень в области биоинформатики, биостатистики, подтвержденный опыт анализа и интерпретации данных секвенирования отдельных клеток, настройки Nextflow, Snakemake, знание Python или R. Длительность 3 года.
Дедлайн: 2 июня
Подробнее: bit.ly/3pIUx69
🇩🇪PhD-студент в Институт физиологии (Германия)
Университетская клиника Карла Густава Каруса в Дрездене приглашает в аспирантуру в проект по изучению роли бета-клеток в гомеостазе глюкозы. Предстоит работать с животными и клеточными моделями, использовать гистологические, биохимические методы и визуализацию. От соискателей требуется степень магистра, опыт работы с животными моделями.
Дедлайн: 15 июня
Подробнее: bit.ly/3MbPzXq
🇧🇪PhD-студент в центр системной биологии растений (Бельгия)
Лаборатория Алена Гуссенса приглашает выпускников магистратуры изучать фосфопротеом при стресс-индуцируемом жасмонатном сигналинге растений. Предстоит применять передовые методы изучения белок-белковых взаимодействий, подходы метаболомики, редактирования генов и микроскопии.
Подробнее: bit.ly/3M5ZLR6
#бластим_вакансии
🇸🇪PhD-позиция в структурной биоинформатике (Швеция)
Линчепингский университет приглашает аспирантов для работы в области структурной биоинформатики и изучения биомолекулярных структур с помощью ИИ. Необходимо знание методов искусственного интеллекта и машинного обучения, а также опыт их применения в структурной биоинформатике или смежных областях, знакомство с AlphaFold, знание Python и/или C++, опыт работы с BASH и командной строкой.
Дедлайн: 26 мая
Подробнее: bit.ly/42LBJll
🇩🇪PhD-позиции в протеомику и масс-спектрометрию (Германия)
Приглашаются докторанты и постдоки в лабораторию Тензера в Университетский медицинский центр Майнцского университета для работы по клинической протеомике. Требуется опыт в ЖХ/МС, интерес к биомедицине и биомаркерам, приветствуются знания Python, R, матмоделирования.
Дедлайн: 29 мая
Подробнее: bit.ly/3Igpbu8
🇩🇰PhD-стипендиальная программа в биоинформатику и анализ данных (Дания)
На кафедру биотехнологии и биомедицины Технического университета в Копенгагене нужен PhD-студент для исследования механизмов клеточной дифференцировки. Предстоит заниматься геномикой одиночных клеток (scRNA-seq, scATAC-seq, пространственная транскриптомика) и массовых наборов данных (РНК-/ATAC-/ChIP-seq). Нужна магистерская степень в области биоинформатики, биостатистики, подтвержденный опыт анализа и интерпретации данных секвенирования отдельных клеток, настройки Nextflow, Snakemake, знание Python или R. Длительность 3 года.
Дедлайн: 2 июня
Подробнее: bit.ly/3pIUx69
🇩🇪PhD-студент в Институт физиологии (Германия)
Университетская клиника Карла Густава Каруса в Дрездене приглашает в аспирантуру в проект по изучению роли бета-клеток в гомеостазе глюкозы. Предстоит работать с животными и клеточными моделями, использовать гистологические, биохимические методы и визуализацию. От соискателей требуется степень магистра, опыт работы с животными моделями.
Дедлайн: 15 июня
Подробнее: bit.ly/3MbPzXq
🇧🇪PhD-студент в центр системной биологии растений (Бельгия)
Лаборатория Алена Гуссенса приглашает выпускников магистратуры изучать фосфопротеом при стресс-индуцируемом жасмонатном сигналинге растений. Предстоит применять передовые методы изучения белок-белковых взаимодействий, подходы метаболомики, редактирования генов и микроскопии.
Подробнее: bit.ly/3M5ZLR6
#бластим_вакансии
❤9
Удивительные новости науки этой недели в обзоре Бластима!
🦋Бабочки издавна привлекают внимание не только энтомологов-любителей, но и многочисленных ученых-натуралистов. Удивительно, что эволюционная история излюбленного объекта исследования и коллекционирования стала понятна буквально недавно. 15 мая в Nature Ecology & Evolution была опубликована статья по филогении чешуекрылых. Специалисты секвенировали 391 ген почти 2300 видов бабочек, охватывающих 92% современных родов, и получили крайне любопытные результаты. Подтвердилось, что чешуекрылые эволюционировали вместе с покрытосеменными растениями, хотя и возникли на 100 млн лет позже цветковых. Выяснилось также, что бабочки произошли от предков ночных травоядных мотыльков в верхнем мелу на территории современной Северной Америки. Позже, примерно 75 млн лет назад, бабочки заселили Евразию, а затем произошла их значительная диверсификация в тропических регионах. Кроме того, сопоставив многочисленные источники, ученые предположи, что гусеницы последнего общего предка бабочек питались бобовыми растениями. Сегодня также почти 70% чешуекрылых — «однолюбы», которые предпочитают только травы семейств бобовые или злаковые, с которыми они коэволюционируют вот уже миллионы лет!
https://www.nature.com/articles/s41559-023-02041-9
🧬Все-таки гребневики оказались сестринской группой по отношению ко всем остальным многоклеточным животным! К такому выводу пришли ученые в новой статье в Nature. Гребневики — организмы, внешне похожие на медуз, но отнюдь им не родственные. А еще есть губки, скажем, всем известная бадяга. Зоологи много лет дискутируют, кто дивергировал раньше всех из ветви Metazoa: примитивные губки или более продвинутые гребневики? Традиционные филогенетические подходы в этом вопросе себя исчерпали, поэтому было решено построить дерево по синтении — консервативному набору и порядку расположения генов на хромосоме. Ученые взяли геномы представителей стрекающих, губок, пластинчатых, билатерий и гребневиков, а в качестве аутгрупп добавили одноклеточных родственников животных (хоанофлагеллят и др.). Несмотря на миллионы лет независимой эволюции, губок, пластинчатых, стрекающих и билатерий объединяют уникальные хромосомные перестройки, которые отсутствуют у гребневиков. Это свидетельствует о том, что именно гребневики — самая первая группа, ответвившаяся от общего ствола животных. Результаты работы имеют принципиальное значение, особенно для понимания становления нервной системы.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05936-6
🧪Растворитель трихлорэтилен (ТХЭ) повысил риск развития паркинсонизма у группы американских ветеранов морской пехоты на 70%. Дело в том, что эти военные в 1970-80-е годы тренировались на базе Лежен в Северной Каролине, где вода была значительно загрязнена трихлорэтиленом. В литературе давно звучали подозрения об опасности молекулы, но сейчас, изучив 85 тыс. медкарт, эпидемиологи показали достаточно четкую связь между растворителем и болезнью Паркинсона. ТХЭ — легко летучая бесцветная жидкость, очень устойчивая в воде и почве. В прошлом вещество пользовалось популярностью в промышленности, применялось в химчистке, для приготовления кофе и даже анестезии. По-видимому, морпехи могли вдыхать соединение, получать его трансдермально или с пищей во время учений, ведь в воде на базе Лежен уровень ТХЭ превышал допустимый в 70 раз! Ранее нейротоксикологи на животных показали патомеханизм ТХЭ: химикат легко всасывается через кожу, проходит биомембраны и ингибирует митохондриальный комплекс I в дофаминовых нейронах мозга, что приводит к их гибели.
https://www.science.org/content/article/widely-used-chemical-strongly-linked-parkinson-s-disease
#выходные_у_бластим
🦋Бабочки издавна привлекают внимание не только энтомологов-любителей, но и многочисленных ученых-натуралистов. Удивительно, что эволюционная история излюбленного объекта исследования и коллекционирования стала понятна буквально недавно. 15 мая в Nature Ecology & Evolution была опубликована статья по филогении чешуекрылых. Специалисты секвенировали 391 ген почти 2300 видов бабочек, охватывающих 92% современных родов, и получили крайне любопытные результаты. Подтвердилось, что чешуекрылые эволюционировали вместе с покрытосеменными растениями, хотя и возникли на 100 млн лет позже цветковых. Выяснилось также, что бабочки произошли от предков ночных травоядных мотыльков в верхнем мелу на территории современной Северной Америки. Позже, примерно 75 млн лет назад, бабочки заселили Евразию, а затем произошла их значительная диверсификация в тропических регионах. Кроме того, сопоставив многочисленные источники, ученые предположи, что гусеницы последнего общего предка бабочек питались бобовыми растениями. Сегодня также почти 70% чешуекрылых — «однолюбы», которые предпочитают только травы семейств бобовые или злаковые, с которыми они коэволюционируют вот уже миллионы лет!
https://www.nature.com/articles/s41559-023-02041-9
🧬Все-таки гребневики оказались сестринской группой по отношению ко всем остальным многоклеточным животным! К такому выводу пришли ученые в новой статье в Nature. Гребневики — организмы, внешне похожие на медуз, но отнюдь им не родственные. А еще есть губки, скажем, всем известная бадяга. Зоологи много лет дискутируют, кто дивергировал раньше всех из ветви Metazoa: примитивные губки или более продвинутые гребневики? Традиционные филогенетические подходы в этом вопросе себя исчерпали, поэтому было решено построить дерево по синтении — консервативному набору и порядку расположения генов на хромосоме. Ученые взяли геномы представителей стрекающих, губок, пластинчатых, билатерий и гребневиков, а в качестве аутгрупп добавили одноклеточных родственников животных (хоанофлагеллят и др.). Несмотря на миллионы лет независимой эволюции, губок, пластинчатых, стрекающих и билатерий объединяют уникальные хромосомные перестройки, которые отсутствуют у гребневиков. Это свидетельствует о том, что именно гребневики — самая первая группа, ответвившаяся от общего ствола животных. Результаты работы имеют принципиальное значение, особенно для понимания становления нервной системы.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05936-6
🧪Растворитель трихлорэтилен (ТХЭ) повысил риск развития паркинсонизма у группы американских ветеранов морской пехоты на 70%. Дело в том, что эти военные в 1970-80-е годы тренировались на базе Лежен в Северной Каролине, где вода была значительно загрязнена трихлорэтиленом. В литературе давно звучали подозрения об опасности молекулы, но сейчас, изучив 85 тыс. медкарт, эпидемиологи показали достаточно четкую связь между растворителем и болезнью Паркинсона. ТХЭ — легко летучая бесцветная жидкость, очень устойчивая в воде и почве. В прошлом вещество пользовалось популярностью в промышленности, применялось в химчистке, для приготовления кофе и даже анестезии. По-видимому, морпехи могли вдыхать соединение, получать его трансдермально или с пищей во время учений, ведь в воде на базе Лежен уровень ТХЭ превышал допустимый в 70 раз! Ранее нейротоксикологи на животных показали патомеханизм ТХЭ: химикат легко всасывается через кожу, проходит биомембраны и ингибирует митохондриальный комплекс I в дофаминовых нейронах мозга, что приводит к их гибели.
https://www.science.org/content/article/widely-used-chemical-strongly-linked-parkinson-s-disease
#выходные_у_бластим
Nature
A global phylogeny of butterflies reveals their evolutionary history, ancestral hosts and biogeographic origins
Nature Ecology & Evolution - A new phylogenomic tree for butterflies is constructed using 391 genes from 2,300 species, representing 92% of genera. It suggests that butterflies originated...
👍13🔥3❤1
24 мая в 19:00 пройдет II вебинар «Обработка биобанка микробиоты: лабораторный этап» из мини-курса по анализу микробиома человека.
Спикером выступит Станислав Кошечкин, к.б.н., генеральный директор Knomx, Советник по науке Nobias Technologies, преподаватель курса «анализ NGS-данных» от Бластим
На занятии вы узнаете:
— Как работает метод 16S секвенирования и какие есть платформы
— Узкие места метода и зачем нужен контроль качества преаналитического и лабораторного этапов
— Практические рекомендации для обработки биобанка микробиоты
А также научитесь:
— Планировать лабораторный этап обработки биобанка микробиоты
— Теоретическим основам метода секвенирования 16S рРНК
— Оценивать техническое описание при изучении публикаций
✅Вход свободный. Записаться на вебинар можно по ссылке: bit.ly/45kjFAD
Спикером выступит Станислав Кошечкин, к.б.н., генеральный директор Knomx, Советник по науке Nobias Technologies, преподаватель курса «анализ NGS-данных» от Бластим
На занятии вы узнаете:
— Как работает метод 16S секвенирования и какие есть платформы
— Узкие места метода и зачем нужен контроль качества преаналитического и лабораторного этапов
— Практические рекомендации для обработки биобанка микробиоты
А также научитесь:
— Планировать лабораторный этап обработки биобанка микробиоты
— Теоретическим основам метода секвенирования 16S рРНК
— Оценивать техническое описание при изучении публикаций
✅Вход свободный. Записаться на вебинар можно по ссылке: bit.ly/45kjFAD
👍10❤2
Биология — увлекательная область с множеством карьерных возможностей. Предлагаем обсудить несколько вариантов траекторий в лайфсайнс. Рассмотрим плюсы/минусы позиций, места, где можно работать, среднюю зарплату в США и Европе.
#бластим_карьера
#бластим_карьера
Telegraph
Карьерные пути для биологов: возможности и вызовы
Научный сотрудник | Research Scientist Плюсы: возможность проводить фундаментальные и прикладные исследования, вносить вклад в научное знание, делать открытия, публиковаться в престижных журналах Минусы: конкурентная среда, нестабильность финансирования и…
❤7🔥2❤🔥1
Занятие «Обработка биобанка микробиоты: лабораторный этап» проведет Станислав Кошечкин, к.б.н.
генеральный директор Knomx, советник по науке Nobias Technologies, преподаватель курса Бластима по NGS.
До встречи на вебинаре!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍6
Открыта позиция химика-синтетика!
В динамично развивающуюся компанию ООО «Люмипроб Рус», ведущего производителя реагентов для молекулярной биологии и диагностики, требуются на работу научные сотрудники и сотрудники химического производства для работы в области органического синтеза.
📌Обязанности:
• проведение синтезов, очистки, анализа органических соединений (органические флуоресцентные красители, нуклеозиды, фармацевтические молекулы, реагенты для синтеза олигонуклеотидов и другие соединения) с масштабами реакций от граммовых количеств до килограммовых процессов, в зависимости от специализации и интересов сотрудника;
• воспроизведение известных процедур, совершенствование существующих методов синтеза и разработка новых;
• ведение электронного лабораторного журнала на английском языке;
• самостоятельная регистрация своих результатов на приборах ЯМР, ГХ и ВЭЖХ-МС (после обучения).
📌Требования:
• химическое образование со специализацией в области органического синтеза;
• знание современных методов органического синтеза;
• опыт практической работы в лаборатории в области органического синтеза, умение самостоятельно выполнять синтезы, контролировать прохождение реакций, выделять продукт (перегонкой, перекристаллизацией, колоночной хроматографией);
• умение анализировать полученные аналитические данные: ЯМР, ВЭЖХ-МС;
• умение находить и анализировать профильную научную литературу;
• работоспособность и самомотивация;
• владение английским языком на уровне чтения литературы и написания синтетических процедур;
• общая компьютерная грамотность.
📌Условия работы:
• официальное трудоустройство, полная занятость, график работы по согласованию
• 12 минут пешком от м. Кунцевская
• работа в современной хорошо оснащенной лаборатории (импортное стекло, хорошие роторные испарители, вакуумные станции, автоматическая хроматография и др.)
• большой парк аналитических приборов (спектрофотометры, газовые и жидкостные хроматографы, ЯМР, HRMS, MALDI и др.)
• красивая, интересная и разнообразная химия флуоресцентных красителей и других соединений, действительно нужных и полезных людям
• премия по результатам работы, начисляемая по заранее оговоренным правилам за выполнение синтезов, чистоту продукта, выполнение разработок (от 20000 руб. в месяц при эффективной работе).
✅Откликнуться на вакансию можно по ссылке: bit.ly/3q1N6qS
В отклике указать:
— ФИО и номер вакансии (832) в теме письма
— короткий сопроводительный текст о себе
— ответ в теле письма на тестовый вопрос:
❓Какие реакции и реагенты Вы будете использовать для того, чтобы из 3-хлор-4-бром-5-метоксианилина получить 2-бром-3-хлоранизол?
#бластим_вакансии
В динамично развивающуюся компанию ООО «Люмипроб Рус», ведущего производителя реагентов для молекулярной биологии и диагностики, требуются на работу научные сотрудники и сотрудники химического производства для работы в области органического синтеза.
📌Обязанности:
• проведение синтезов, очистки, анализа органических соединений (органические флуоресцентные красители, нуклеозиды, фармацевтические молекулы, реагенты для синтеза олигонуклеотидов и другие соединения) с масштабами реакций от граммовых количеств до килограммовых процессов, в зависимости от специализации и интересов сотрудника;
• воспроизведение известных процедур, совершенствование существующих методов синтеза и разработка новых;
• ведение электронного лабораторного журнала на английском языке;
• самостоятельная регистрация своих результатов на приборах ЯМР, ГХ и ВЭЖХ-МС (после обучения).
📌Требования:
• химическое образование со специализацией в области органического синтеза;
• знание современных методов органического синтеза;
• опыт практической работы в лаборатории в области органического синтеза, умение самостоятельно выполнять синтезы, контролировать прохождение реакций, выделять продукт (перегонкой, перекристаллизацией, колоночной хроматографией);
• умение анализировать полученные аналитические данные: ЯМР, ВЭЖХ-МС;
• умение находить и анализировать профильную научную литературу;
• работоспособность и самомотивация;
• владение английским языком на уровне чтения литературы и написания синтетических процедур;
• общая компьютерная грамотность.
📌Условия работы:
• официальное трудоустройство, полная занятость, график работы по согласованию
• 12 минут пешком от м. Кунцевская
• работа в современной хорошо оснащенной лаборатории (импортное стекло, хорошие роторные испарители, вакуумные станции, автоматическая хроматография и др.)
• большой парк аналитических приборов (спектрофотометры, газовые и жидкостные хроматографы, ЯМР, HRMS, MALDI и др.)
• красивая, интересная и разнообразная химия флуоресцентных красителей и других соединений, действительно нужных и полезных людям
• премия по результатам работы, начисляемая по заранее оговоренным правилам за выполнение синтезов, чистоту продукта, выполнение разработок (от 20000 руб. в месяц при эффективной работе).
✅Откликнуться на вакансию можно по ссылке: bit.ly/3q1N6qS
В отклике указать:
— ФИО и номер вакансии (832) в теме письма
— короткий сопроводительный текст о себе
— ответ в теле письма на тестовый вопрос:
❓Какие реакции и реагенты Вы будете использовать для того, чтобы из 3-хлор-4-бром-5-метоксианилина получить 2-бром-3-хлоранизол?
#бластим_вакансии
⚡3🔥1😢1
На Ярмарке выступят представители ведущих российских биотех-компаний: Нанолек, Генериум, BostonGene и других. Участники узнают о карьерных треках, открытых вакансиях, условиях работы в команде, стажировках и учебных программах, а также смогут задать вопросы потенциальным работодателям. У зарегистрировавшихся на платформе мероприятия также останутся презентации компаний-участниц со всеми контактными данными!
Регистрируйтесь. Ждем всех, кто хочет найти идеальную работу в биотехе!
#бластим_карьера
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
💯6👍2🔥2
После насыщенной Ярмарки вакансий Бластима можно немного отдохнуть и почитать новости из топовых научных журналов!
❤️Испанские ученые показали важность грудного вскармливания для развития здоровых детенышей млекопитающих. Результаты семи лет трудов, включающих даже ручное доение мышей (!), опубликованы в Nature. Оказалось, что компонент материнского молока ɣ-линоленовая кислота (GLA) критически необходима для нормального созревания клеток сердца. Незаменимая жирная кислота, получаемая новорожденными мышатами с молоком, действует через ретиноидный X-рецептор на кардиомиоцитах и переключает их метаболизм с сахаров на липиды в первые сутки после появления животных на свет. Это позволяет сформироваться нормальным клеткам, которые в состоянии обеспечить интенсивную работу миокарда в течение всей жизни. В контрольных экспериментах мышата, которых кормили матери на безжировой диете, имели аномалии развития сердца и умирали в раннем возрасте. GLA содержится и в грудном молоке женщин, однако ее роль пока неясна. Тем не менее результаты имеют серьезное значение для создания терапии неонатальных сердечных патологий.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01699-2
🐥Перья из чешуи можно получить с помощью манипуляций всего с одним геном! В Science Advances вышла статья, где швейцарские исследователи благодаря внутривенным инъекциями куриным эмбрионам особых молекул-агонистов переключили известный регулятор развития животных — sonic hedgehog. Усилив его сигнальный путь, ученые смогли добиться развития на куриных лапках, в норме покрытых чешуями, настоящих пуховых перьев. Биологи давно дискутируют на тему возможной гомологии волос млекопитающих, перьев птиц, чешуи рептилий: новое исследование однозначно подкрепляет эту точку зрения. Более того, эволюционный переход между покровными структурами, по-видимому, мог происходить даже без серьезных изменений в геноме.
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adg9619
🎯Паразитирующие на растениях нематоды ежегодно наносят ущерб мировому сельскому хозяйству на сотни миллиардов долларов. Имеющийся арсенал борьбы с червями ограничен из-за низкой селективности нематицидных соединений и их высокой токсичности для нецелевой фауны. На страницах Nature обсуждается новая стратегия борьбы с паразитами. Ученые из Университета Торонто на модельном C. elegans протестировали химические молекулы имидазотиазольной природы, названные селективинами, для избавления от фитонематод. Обнаружилось, что после поглощения неактивных селективинов круглые черви метаболизируют их с помощью цитохрома P450, превращая молекулы-предшественники в летальные продукты и убивая самих себя. В экспериментах селективины показали высокую эффективность и избирательность: специалисты надеются вывести перспективные пестициды на рынок.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06105-5
#выходные_у_бластим
❤️Испанские ученые показали важность грудного вскармливания для развития здоровых детенышей млекопитающих. Результаты семи лет трудов, включающих даже ручное доение мышей (!), опубликованы в Nature. Оказалось, что компонент материнского молока ɣ-линоленовая кислота (GLA) критически необходима для нормального созревания клеток сердца. Незаменимая жирная кислота, получаемая новорожденными мышатами с молоком, действует через ретиноидный X-рецептор на кардиомиоцитах и переключает их метаболизм с сахаров на липиды в первые сутки после появления животных на свет. Это позволяет сформироваться нормальным клеткам, которые в состоянии обеспечить интенсивную работу миокарда в течение всей жизни. В контрольных экспериментах мышата, которых кормили матери на безжировой диете, имели аномалии развития сердца и умирали в раннем возрасте. GLA содержится и в грудном молоке женщин, однако ее роль пока неясна. Тем не менее результаты имеют серьезное значение для создания терапии неонатальных сердечных патологий.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01699-2
🐥Перья из чешуи можно получить с помощью манипуляций всего с одним геном! В Science Advances вышла статья, где швейцарские исследователи благодаря внутривенным инъекциями куриным эмбрионам особых молекул-агонистов переключили известный регулятор развития животных — sonic hedgehog. Усилив его сигнальный путь, ученые смогли добиться развития на куриных лапках, в норме покрытых чешуями, настоящих пуховых перьев. Биологи давно дискутируют на тему возможной гомологии волос млекопитающих, перьев птиц, чешуи рептилий: новое исследование однозначно подкрепляет эту точку зрения. Более того, эволюционный переход между покровными структурами, по-видимому, мог происходить даже без серьезных изменений в геноме.
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adg9619
🎯Паразитирующие на растениях нематоды ежегодно наносят ущерб мировому сельскому хозяйству на сотни миллиардов долларов. Имеющийся арсенал борьбы с червями ограничен из-за низкой селективности нематицидных соединений и их высокой токсичности для нецелевой фауны. На страницах Nature обсуждается новая стратегия борьбы с паразитами. Ученые из Университета Торонто на модельном C. elegans протестировали химические молекулы имидазотиазольной природы, названные селективинами, для избавления от фитонематод. Обнаружилось, что после поглощения неактивных селективинов круглые черви метаболизируют их с помощью цитохрома P450, превращая молекулы-предшественники в летальные продукты и убивая самих себя. В экспериментах селективины показали высокую эффективность и избирательность: специалисты надеются вывести перспективные пестициды на рынок.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06105-5
#выходные_у_бластим
Nature
Mother’s milk helps baby mouse hearts to develop
Nature - A component of the milk consumed by newborn mice triggers a crucial shift in heart cells’ metabolism.
👍9🥰1
Заключительный практический вебинар «Обработка данных: биоинформатика и статистика» из мини-курса по микробиомике человека пройдет 31 мая в 19:00 по Москве.
Спикером будет Вера Одинцова, выпускница мехмата МГУ, руководительница отдела аналитики Knomx, преподавательница курса «анализ NGS-данных»!
На занятии вы узнаете:
— Основные этапы обработки данных от получения файла с секвенатора до оценки пропорций микробов в образцах
— Основные характеристики микробиоты (пропорции микробов, альфа- и бета- разнообразие, метаболический потенциал)
— Принципы выбора инструментов для статистического анализа данных
А также научитесь:
— Учитывать ограничения и возможности метода 16S рРНК секвенирования при планировании эксперимента
— Понимать результаты публикаций по микробиоте
— «Читать» основные виды визуализаций в публикациях
Стоимость: 2 500 руб
Записаться можно по ссылке: bit.ly/3MZkyaH
Спикером будет Вера Одинцова, выпускница мехмата МГУ, руководительница отдела аналитики Knomx, преподавательница курса «анализ NGS-данных»!
На занятии вы узнаете:
— Основные этапы обработки данных от получения файла с секвенатора до оценки пропорций микробов в образцах
— Основные характеристики микробиоты (пропорции микробов, альфа- и бета- разнообразие, метаболический потенциал)
— Принципы выбора инструментов для статистического анализа данных
А также научитесь:
— Учитывать ограничения и возможности метода 16S рРНК секвенирования при планировании эксперимента
— Понимать результаты публикаций по микробиоте
— «Читать» основные виды визуализаций в публикациях
Стоимость: 2 500 руб
Записаться можно по ссылке: bit.ly/3MZkyaH
❤3👍3🔥1
Клонинг Фасилити ищет в дружную команду младшего научного сотрудника с опытом работы в молекулярно-биологической лаборатории и желанием много работать и развиваться.
Требования к кандидатам:
— Обязателен опыт работы в молекулярно-биологической лаборатории
— Идеальный кандидат любит глубоко вникать в научную литературу, не боится пробовать новое, владеет основными методами молекулярной биологии и английским языком как минимум на уровне чтения
Условия:
— Рыночная зарплата, определяемая в зависимости от опыта и по результатам собеседования
— Работа в одной из самых сильных команд отрасли
— Место работы: Москва, территория ИБХ РАН (м. Беляево)
— Карьерный рост и увеличение зарплаты по мере профессионального роста
— Испытательный срок 3 месяца
— Оформление в штат по Трудовому Кодексу РФ
#бластим_вакансии
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
❤🔥3👍1🔥1
Бластим зовет всех на конференцию МССМВ’23!
🧬3-6 августа 2023 будет проведена 11-я Московская конференция по вычислительной молекулярной биологии МССМВ’23!🧬
Организаторы приглашают к участию представителей ведущих российских групп в области биоинформатики, системной и структурной биологии, молекулярной эволюции, сравнительной геномики, а также смежных областей (молекулярной генетики, компьютерных наук, биофизики и т.д.).
📍Конференция пройдет в очном режиме, место проведения – Сколковский институт науки и технологий. Рабочим языком будет русский.
🔥Как и в прошлые годы, организаторы конференции надеются не только на сильный состав приглашенных участников, но и на интересные доклады и постеры.
❗️Крайний срок подачи заявок на устный доклад – 3 июня (23:59 МСК). Тезисы для постерных докладов принимаются до 30 июня (23:59 МСК). Формат тезисов и форма регистрации доступны по ссылке: https://www.mccmb.info/submission-registration-23
#бластим_рекомендует
🧬3-6 августа 2023 будет проведена 11-я Московская конференция по вычислительной молекулярной биологии МССМВ’23!🧬
Организаторы приглашают к участию представителей ведущих российских групп в области биоинформатики, системной и структурной биологии, молекулярной эволюции, сравнительной геномики, а также смежных областей (молекулярной генетики, компьютерных наук, биофизики и т.д.).
📍Конференция пройдет в очном режиме, место проведения – Сколковский институт науки и технологий. Рабочим языком будет русский.
🔥Как и в прошлые годы, организаторы конференции надеются не только на сильный состав приглашенных участников, но и на интересные доклады и постеры.
❗️Крайний срок подачи заявок на устный доклад – 3 июня (23:59 МСК). Тезисы для постерных докладов принимаются до 30 июня (23:59 МСК). Формат тезисов и форма регистрации доступны по ссылке: https://www.mccmb.info/submission-registration-23
#бластим_рекомендует
👍5❤3
Syntelly — платформа искусственного интеллекта для решения задач органической и медицинской химии. Сейчас в команду компании нужен высокомотивированный и квалифицированный специалист-хемоинформатик!
Обязанности:
— Разработка и внедрение методов химинформатики для моделей ИИ для прогнозирования свойств малых молекул, извлечения данных из химической литературы, наполнения и управления химическими базами данных;
— Анализ и интерпретация больших наборов химических данных;
— Работа в коллаборации с командой специалистов в области обработки естественных языков для разработки метода извлечения и обработки неструктурированных химических данных из текстовых документов и оптических сканов.
Требования:
— Степень кандидата наук, или магистерская степень в области хемоинформатики, органической химии с уклоном в вычислительные методы, компьютерных наук или другой связанной области;
— Хорошие навыки программирования на Python;
— Опыт работы с хемоинформатическими фреймворками и базами данных (например, RDKit, PubChem);
— Знание методов машинного обучения и их применения в хемоинформатике;
— Опыт построения и развертывания моделей ИИ;
— Отличные навыки коммуникации и работы в команде.
Условия:
— Офис в БЦ Верейская Плаза-3;
— Гибридный формат/с возможностью удаленной работы;
— Оформление по ТК РФ с первого рабочего дня;
— Полностью официальная заработная плата: оклад по результатам собеседования;
— ДМС для сотрудников (включая бизнес стоматологию);
— Испытательный срок: 3 месяца;
— Соблюдение норм ТК РФ.
Что ждёт интересного:
— Отличный молодежный коллектив, интересная и динамичная работа;
— Возможности для профессионального и карьерного роста;
— Питание: в офисе своя кухня со всем необходимым оборудованием и фруктами!
— Различные кафе и столовые;
— Собственный тренажерный зал, оборудованный душевыми и раздевалками.
#бластим_вакансии
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍7🔥2🤔1😱1
Недавно праздновался День Химика, и мы решили сделать большую подборку вакансий, связанных с химией, биохимией, хемоинформатикой!
🚩Стажировка в R&D-химию в Henkel (Италия)
Требуется степень магистра химии. Стажеров ждет работа в лаборатории по приготовлению составов, синтезу полимеров, а также характеристике полученных продуктов.
Дедлайн: 9 июня
bit.ly/3N76H27
🚩Химик-лаборант в Клонинг Фасилити (Россия)
В компанию в области промышленной биотехнологии нужен коллега для технической работы, требующей базовых лабораторных навыков и аккуратности. Требуется биологическое или химическое образование, базовое знание органической и аналитической химии и биохимии, понимание работы в лаборатории и техники безопасности.
Дедлайн: 15 июня
bit.ly/3MPT5a0
🚩Постдок в Университет Небраски-Линкольн (США)
Лаборатория Чжана на кафедре биохимии и редокс-биологии приглашает кандидата, интересующегося структурной и RedOx-биологией, инфекционными заболеваниями для изучения металлопротеинов. Требуется PhD-степень, подтвержденный опыт в рентгеновской кристаллографии, крио-ЭМ, ЯМР или молекулярной биологии.
Дедлайн: 21 июня
bit.ly/3N919UN
🚩Стажировка по медхимии в Dewpoint (Германия)
Приглашаются стажеры по медицинской химии, которые присоединятся к RnD-команде. Требования: степень магистра в области химии, знания в области органической химии, начальный практический опыт. Стажеры узнают о параллельном синтезе, аналитических методах и методах очистки, будут проводить эксперименты и анализировать продукты реакции.
bit.ly/43IZZox
🚩Фултайм-стажировка по CADD в Роше (Китай)
China Innovation Center of Roche (CICoR) приглашает на стажировку мотивированного химика-вычислителя. Работа связана с молекулярным моделированием в драг-дизайне. Требования: PhD-степень в области вычислительной химии, хемоинформатики, опыт моделирования методом молекулярной динамики, SBDD, знание Linux и Python. А также навыки общения на китайском и английском языках!
bit.ly/42lv7Jm
#бластим_подборка
🚩Стажировка в R&D-химию в Henkel (Италия)
Требуется степень магистра химии. Стажеров ждет работа в лаборатории по приготовлению составов, синтезу полимеров, а также характеристике полученных продуктов.
Дедлайн: 9 июня
bit.ly/3N76H27
🚩Химик-лаборант в Клонинг Фасилити (Россия)
В компанию в области промышленной биотехнологии нужен коллега для технической работы, требующей базовых лабораторных навыков и аккуратности. Требуется биологическое или химическое образование, базовое знание органической и аналитической химии и биохимии, понимание работы в лаборатории и техники безопасности.
Дедлайн: 15 июня
bit.ly/3MPT5a0
🚩Постдок в Университет Небраски-Линкольн (США)
Лаборатория Чжана на кафедре биохимии и редокс-биологии приглашает кандидата, интересующегося структурной и RedOx-биологией, инфекционными заболеваниями для изучения металлопротеинов. Требуется PhD-степень, подтвержденный опыт в рентгеновской кристаллографии, крио-ЭМ, ЯМР или молекулярной биологии.
Дедлайн: 21 июня
bit.ly/3N919UN
🚩Стажировка по медхимии в Dewpoint (Германия)
Приглашаются стажеры по медицинской химии, которые присоединятся к RnD-команде. Требования: степень магистра в области химии, знания в области органической химии, начальный практический опыт. Стажеры узнают о параллельном синтезе, аналитических методах и методах очистки, будут проводить эксперименты и анализировать продукты реакции.
bit.ly/43IZZox
🚩Фултайм-стажировка по CADD в Роше (Китай)
China Innovation Center of Roche (CICoR) приглашает на стажировку мотивированного химика-вычислителя. Работа связана с молекулярным моделированием в драг-дизайне. Требования: PhD-степень в области вычислительной химии, хемоинформатики, опыт моделирования методом молекулярной динамики, SBDD, знание Linux и Python. А также навыки общения на китайском и английском языках!
bit.ly/42lv7Jm
#бластим_подборка
💔3❤2👍2🔥1🤯1
Новости большой науки в воскресной подборке Бластима!
💊Назревает большой прорыв в органической и медицинской химии: все сильнее развиваются методы редактирования каркаса молекул! В свежем материале Nature обсуждаются самые передовые разработки органиков в области «skeletal editing». Если раньше после серии сложных реакций синтеза можно было лишь как-то декорировать боковые группы полученных молекул, то теперь химики научились избирательно вставлять, удалять или заменять атомы в самом углеродном скелете органических соединений, не затрагивая функциональные группы. Инновационные подходы молекулярной хирургии, которые специалисты называют настоящим чудом, за один шаг позволяют превращать пирролы в пиридины, вводить азот в кольца, ставить кислород вместо углерода в гетероциклах и даже менять изотопы. Такие инструменты сулят небывалые перспективы для драг-дизайна и фарминдустрии.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01735-1
👀Глаз — пример неупрощаемой сложности среди аргументов креационистов. Поэтому сравнительные эволюционные исследования зрения крайне важны и любопытны. В Cell Genomics опубликована статья, где ученые составили клеточный атлас сетчатки глаза человека. Сетчатка — многослойная нейронная структура, в которой традиционно выделяют 6 основных типов нервных клеток. На этот раз генетики использовали мультимодальный подход: они интегрировали данные, полученные методами одноядерного RNA-seq и ATAC-seq. Так им удалось отыскать целых 68 типов нейронов! Кроме того, было проведено межвидовое сравнение сетчаток человека, обезьяны, мыши и курицы. Оказалось, что общие клеточные типы стабильно сохраняются у разных позвоночных. Причем внешний слой фоторецепторов наиболее консервативен, тогда как внутренние слои различаются, что, по-видимому, соответствует различным подходам к обработке информации.
https://www.cell.com/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(23)00064-2
🌳Многие слышали о необычной терапии заболеваний кишечника — трансплантации фекальной микробиоты. Оказывается, нечто подобное применимо и к растениям! Недавно в Science вышла работа, где американские биологи повысили устойчивость деревьев к климатическим изменениям с помощью пересадки почвенных микроорганизмов. Так, в ходе полевых экспериментов ученые инокулировали саженцы деревьев микробиотой из холодных или засушливых местообитаний и далее подвергали растения воздействию низких температур или засухи соответственно. Микробы, которые ранее жили в неблагоприятных условиях и адаптировались к ним, смягчали действие стрессовых факторов и способствовали лучшей выживаемости древесных пород. Например, было показано, что за компенсацию недостатка влаги отвечали разнообразные арбускулярные микоризные грибы. Специалисты надеются, что новая стратегия поможет сделать лесные экосистемы стабильнее.
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adf2027
#выходные_у_бластим
💊Назревает большой прорыв в органической и медицинской химии: все сильнее развиваются методы редактирования каркаса молекул! В свежем материале Nature обсуждаются самые передовые разработки органиков в области «skeletal editing». Если раньше после серии сложных реакций синтеза можно было лишь как-то декорировать боковые группы полученных молекул, то теперь химики научились избирательно вставлять, удалять или заменять атомы в самом углеродном скелете органических соединений, не затрагивая функциональные группы. Инновационные подходы молекулярной хирургии, которые специалисты называют настоящим чудом, за один шаг позволяют превращать пирролы в пиридины, вводить азот в кольца, ставить кислород вместо углерода в гетероциклах и даже менять изотопы. Такие инструменты сулят небывалые перспективы для драг-дизайна и фарминдустрии.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01735-1
👀Глаз — пример неупрощаемой сложности среди аргументов креационистов. Поэтому сравнительные эволюционные исследования зрения крайне важны и любопытны. В Cell Genomics опубликована статья, где ученые составили клеточный атлас сетчатки глаза человека. Сетчатка — многослойная нейронная структура, в которой традиционно выделяют 6 основных типов нервных клеток. На этот раз генетики использовали мультимодальный подход: они интегрировали данные, полученные методами одноядерного RNA-seq и ATAC-seq. Так им удалось отыскать целых 68 типов нейронов! Кроме того, было проведено межвидовое сравнение сетчаток человека, обезьяны, мыши и курицы. Оказалось, что общие клеточные типы стабильно сохраняются у разных позвоночных. Причем внешний слой фоторецепторов наиболее консервативен, тогда как внутренние слои различаются, что, по-видимому, соответствует различным подходам к обработке информации.
https://www.cell.com/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(23)00064-2
🌳Многие слышали о необычной терапии заболеваний кишечника — трансплантации фекальной микробиоты. Оказывается, нечто подобное применимо и к растениям! Недавно в Science вышла работа, где американские биологи повысили устойчивость деревьев к климатическим изменениям с помощью пересадки почвенных микроорганизмов. Так, в ходе полевых экспериментов ученые инокулировали саженцы деревьев микробиотой из холодных или засушливых местообитаний и далее подвергали растения воздействию низких температур или засухи соответственно. Микробы, которые ранее жили в неблагоприятных условиях и адаптировались к ним, смягчали действие стрессовых факторов и способствовали лучшей выживаемости древесных пород. Например, было показано, что за компенсацию недостатка влаги отвечали разнообразные арбускулярные микоризные грибы. Специалисты надеются, что новая стратегия поможет сделать лесные экосистемы стабильнее.
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adf2027
#выходные_у_бластим
Nature
‘Almost magical’: chemists can now move single atoms in and out of a molecule’s core
Nature - An explosion of skeletal editing methods to insert, delete or swap individual atoms in molecular backbones could accelerate drug discovery.
🔥12❤5👍4🤯3⚡1
Бластим специально для ученых и всех интересующихся собрал подборку баз данных по геномике, молекулярной биологии, хемоинформатике и другим областям биологии.
Мы разместили список на сайте Бластима, чтобы он всегда был под рукой: bit.ly/3NazSRU
Забирайте полезный лист и расшаривайте друзьям!
Мы разместили список на сайте Бластима, чтобы он всегда был под рукой: bit.ly/3NazSRU
Забирайте полезный лист и расшаривайте друзьям!
❤22👍7🌚1
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Думаете, что анализировать данные секвенирования сложно? Возможно. Но лекторы Бластима умеют рассказывать об этом понятно — даже в формате shorts! Пока едете в лифте или пьете кофе, вы можете узнать для себя что-то полезное.
В новом видео смотрите о том, что вообще такое биоинформатика. А также рекомендуем статью в тему.
В новом видео смотрите о том, что вообще такое биоинформатика. А также рекомендуем статью в тему.
👍10🔥3❤1
Бластим рекомендует магистратуру «Биоинформатика» в Университете «Сириус»: bit.ly/3MTtWeA
Программа подойдет для биологов, химиков, физиков, математиков и программистов, которые хотят решать интересные и сложные задачи современной биоинформатики по трем направлениям:
1. Анализ геномных данных
2. Структурная биология и разработка лекарственных препаратов
3. Системная биология и математическое моделирование в биологии и медицине
Что отличает Университет «Сириус»?
✔️бесплатное обучение для всех (25 мест) и стипендии от 20 до 40 тысяч рублей;
✔️проживание в студенческих гостиницах на побережье Черного моря;
✔️преподаватели — ученые с мировым именем;
✔️возможность найти работу в ведущих компаниях страны еще во время учебы;
✔️работа в лабораториях с самым высокотехнологичным оборудованием.
Экзамен состоит из 2 частей: письменная часть (100 баллов) и собеседование (100 баллов). Проходной балл — 40 баллов. Также учитываются личные достижения — публикации, участия в олимпиадах!🏆
🔥Индустриальные и академические партнеры магистратуры: BioCad, Generium, Биософт.Ру, МГУ, СПБГУ, КФУ, НГУ.
🔗Программа вступительных испытаний и примеры задач: bit.ly/3qnecJj
🔗Точное расписание экзаменов: bit.ly/43nVAY6
До встречи в Сириусе на берегу Черного моря!
#бластим_рекомендует
Программа подойдет для биологов, химиков, физиков, математиков и программистов, которые хотят решать интересные и сложные задачи современной биоинформатики по трем направлениям:
1. Анализ геномных данных
2. Структурная биология и разработка лекарственных препаратов
3. Системная биология и математическое моделирование в биологии и медицине
Что отличает Университет «Сириус»?
✔️бесплатное обучение для всех (25 мест) и стипендии от 20 до 40 тысяч рублей;
✔️проживание в студенческих гостиницах на побережье Черного моря;
✔️преподаватели — ученые с мировым именем;
✔️возможность найти работу в ведущих компаниях страны еще во время учебы;
✔️работа в лабораториях с самым высокотехнологичным оборудованием.
Экзамен состоит из 2 частей: письменная часть (100 баллов) и собеседование (100 баллов). Проходной балл — 40 баллов. Также учитываются личные достижения — публикации, участия в олимпиадах!🏆
🔥Индустриальные и академические партнеры магистратуры: BioCad, Generium, Биософт.Ру, МГУ, СПБГУ, КФУ, НГУ.
🔗Программа вступительных испытаний и примеры задач: bit.ly/3qnecJj
🔗Точное расписание экзаменов: bit.ly/43nVAY6
До встречи в Сириусе на берегу Черного моря!
#бластим_рекомендует
🔥10❤3👍1