Метод РНК-секвенирования позволяет изучать различия экспрессии генов в течение времени и/или в разных тканях организма, находить места альтернативного сплайсинга, диагностировать патологии и много чего ещё. На сегодняшний день это один самых перспективных методов секвенирования.
Мы сделали онлайн курс «Анализ данных RNA-seq», чтобы помочь вам разобраться со всеми этапами работы с результатами РНК-секвенирования.
На курсе поговорим про источники данных, обсудим нюансы «мокрых» экспериментов, расскажем как качать данные с SRA, картировать с Hisat2 и STAR и другими тулами, какими метриками оценивать качество картирования и т.д. Вас ждут данные разных организмов и прикладные задачи — это сделает полученные знания более универсальными.
Помимо насыщенной программы, вы получите:
— спокойный темп обучения и помощь с освоением лично вам;
— место на сервере BlastimCloud и полное программное обеспечение на время курса;
— сертификат. Это программа считается курсами повышения квалификации, и в дальнейшем вы сможете получить налоговый вычет;
— хакатон! Командное соревнование с призами и яркими эмоциями.
Подать заявку
#бластим_курсы
Мы сделали онлайн курс «Анализ данных RNA-seq», чтобы помочь вам разобраться со всеми этапами работы с результатами РНК-секвенирования.
На курсе поговорим про источники данных, обсудим нюансы «мокрых» экспериментов, расскажем как качать данные с SRA, картировать с Hisat2 и STAR и другими тулами, какими метриками оценивать качество картирования и т.д. Вас ждут данные разных организмов и прикладные задачи — это сделает полученные знания более универсальными.
Помимо насыщенной программы, вы получите:
— спокойный темп обучения и помощь с освоением лично вам;
— место на сервере BlastimCloud и полное программное обеспечение на время курса;
— сертификат. Это программа считается курсами повышения квалификации, и в дальнейшем вы сможете получить налоговый вычет;
— хакатон! Командное соревнование с призами и яркими эмоциями.
Подать заявку
#бластим_курсы
👍5
#бластим_рекомендации
Life Sciences, биотехнологии и аналитическая химия в современных условиях. Взгляд на Восток?
Мультиконференция-выставка Диаэм пройдет 9 ноября 2022 г. по адресу Холидей Инн, Москва, Лесная 15. На повестке дня вопросы оснащения лабораторий в условиях санкций:
— Что сохранилось из старых и проверенных брендов?
— Оборудование и реактивы, призванные заменить ушедшие марки.
— Уникальная возможность протестировать новые приборы.
В программе научные доклады, выставка оборудования, презентации и мастер-классы в специализированных рабочих секциях:
— Химический синтез и анализ.
— Биотехнология и Микробиология.
— Белки и Клетки.
— Геномика и Молекулярная биология.
Увидеть новинки не на картинке, а своими глазами — это решающий критерий выбора!
Успейте зарегистрироваться, количество мест ограничено. Участие бесплатное: http://amp.gs/jGXTw
Life Sciences, биотехнологии и аналитическая химия в современных условиях. Взгляд на Восток?
Мультиконференция-выставка Диаэм пройдет 9 ноября 2022 г. по адресу Холидей Инн, Москва, Лесная 15. На повестке дня вопросы оснащения лабораторий в условиях санкций:
— Что сохранилось из старых и проверенных брендов?
— Оборудование и реактивы, призванные заменить ушедшие марки.
— Уникальная возможность протестировать новые приборы.
В программе научные доклады, выставка оборудования, презентации и мастер-классы в специализированных рабочих секциях:
— Химический синтез и анализ.
— Биотехнология и Микробиология.
— Белки и Клетки.
— Геномика и Молекулярная биология.
Увидеть новинки не на картинке, а своими глазами — это решающий критерий выбора!
Успейте зарегистрироваться, количество мест ограничено. Участие бесплатное: http://amp.gs/jGXTw
👍7
Сделали подборку лекций, конференций и программ в науке и индустрии:
NYU Langone Health Scholar Support Program.
Стипендиальная программа поддержки для PhD и постдоков.
Лекция представителей компании YADRO «Система хранения данных для программистов — Data Path».
Дата проведения: 8 ноября.
Формат: очно (Санкт-Петербург).
МедтехМитап «Как выстроить партнерство с ОАЭ российским медтех-стартапам».
Дата проведения: 8 ноября.
Формат: очно (Москва).
Презентация новой магистерской программы МГУ «Искусственный интеллект в биологии».
Дата проведения: 6 ноября.
Формат: онлайн.
Школа молодых ученых «Редокс регуляция в биологических системах».
Дата проведения: 8 ноября.
Формат: онлайн.
VI Сеченовский Международный Биомедицинский саммит (SIBS-2022).
Даты проведения: 8 — 9 ноября.
Формат: очно (Сеченовский Университет, Москва), участие бесплатное.
Мультиконференция-выставка «LifeScience, биотехнологии и аналитическая химия в современных условиях. Взгляд на Восток?».
Дата проведения: 9 ноября.
Формат: очно (Москва)
The Wiley Analytical Science Conference.
Даты проведения: 9 — 17 ноября.
Формат: онлайн.
Конференция молодых ученых «Геномика, матегеномика и молекулярная биология микроорганизмов».
Регистрация: до 10 ноября.
Даты проведения: 19 — 20 ноября.
Формат: очно (Москва, Сколково).
Образовательный проект для врачей «Школа профессионального роста».
Дедлайн: до 11 ноября.
Всероссийская конференция по естественным и гуманитарным наукам с международным участием «Наука СПбГУ — 2022».
Регистрация: до 11 ноября.
Дата проведения: 21 ноября.
Формат: онлайн.
Зимние стажировки в BIOCAD 2023.
Регистрация: до 14 ноября
Формат: очно и онлайн.
Nano-architectures for Chemical, Biological and Therapeutic Applications.
Регистрация: до 15 ноября.
Даты проведения: 25 — 27 ноября.
Формат: очно-заочно (Индия).
Семинар «Регистрация медицинских изделий: пошаговая инструкция для стартапа».
Дата проведения: 15 ноября.
Формат: очно и онлайн (Москва).
XIII Молодежная школа-конференция «Актуальные аспекты современной микробиологии».
Даты проведения: 16 — 18 ноября.
Формат: очно и онлайн (Москва).
The 16th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies.
Дедлайн: 17 ноября.
Формат: очно и онлайн (Лиссабон).
Научная школа для молодых ученых «Структурная биология: основные проблемы и подходы к их решению».
Регистрация: до 18 ноября, участие бесплатное
Дата проведения: 22 ноября.
Формат: очно (Москва).
Премия Nanomaterials 2022 Young Investigator.
Дедлайн: до 30 ноября.
#бластим_подборка
NYU Langone Health Scholar Support Program.
Стипендиальная программа поддержки для PhD и постдоков.
Лекция представителей компании YADRO «Система хранения данных для программистов — Data Path».
Дата проведения: 8 ноября.
Формат: очно (Санкт-Петербург).
МедтехМитап «Как выстроить партнерство с ОАЭ российским медтех-стартапам».
Дата проведения: 8 ноября.
Формат: очно (Москва).
Презентация новой магистерской программы МГУ «Искусственный интеллект в биологии».
Дата проведения: 6 ноября.
Формат: онлайн.
Школа молодых ученых «Редокс регуляция в биологических системах».
Дата проведения: 8 ноября.
Формат: онлайн.
VI Сеченовский Международный Биомедицинский саммит (SIBS-2022).
Даты проведения: 8 — 9 ноября.
Формат: очно (Сеченовский Университет, Москва), участие бесплатное.
Мультиконференция-выставка «LifeScience, биотехнологии и аналитическая химия в современных условиях. Взгляд на Восток?».
Дата проведения: 9 ноября.
Формат: очно (Москва)
The Wiley Analytical Science Conference.
Даты проведения: 9 — 17 ноября.
Формат: онлайн.
Конференция молодых ученых «Геномика, матегеномика и молекулярная биология микроорганизмов».
Регистрация: до 10 ноября.
Даты проведения: 19 — 20 ноября.
Формат: очно (Москва, Сколково).
Образовательный проект для врачей «Школа профессионального роста».
Дедлайн: до 11 ноября.
Всероссийская конференция по естественным и гуманитарным наукам с международным участием «Наука СПбГУ — 2022».
Регистрация: до 11 ноября.
Дата проведения: 21 ноября.
Формат: онлайн.
Зимние стажировки в BIOCAD 2023.
Регистрация: до 14 ноября
Формат: очно и онлайн.
Nano-architectures for Chemical, Biological and Therapeutic Applications.
Регистрация: до 15 ноября.
Даты проведения: 25 — 27 ноября.
Формат: очно-заочно (Индия).
Семинар «Регистрация медицинских изделий: пошаговая инструкция для стартапа».
Дата проведения: 15 ноября.
Формат: очно и онлайн (Москва).
XIII Молодежная школа-конференция «Актуальные аспекты современной микробиологии».
Даты проведения: 16 — 18 ноября.
Формат: очно и онлайн (Москва).
The 16th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies.
Дедлайн: 17 ноября.
Формат: очно и онлайн (Лиссабон).
Научная школа для молодых ученых «Структурная биология: основные проблемы и подходы к их решению».
Регистрация: до 18 ноября, участие бесплатное
Дата проведения: 22 ноября.
Формат: очно (Москва).
Премия Nanomaterials 2022 Young Investigator.
Дедлайн: до 30 ноября.
#бластим_подборка
🔥8❤1👍1🐳1
Расскажем историю одного популярного препарата. О том, как случайность стала закономерностью, принесла фармкомпании-разработчику миллиарды долларов и совершила настоящую социальную революцию.
Ссылка на лекции: https://clck.ru/32bYWx
#бластим_выходные
#бластим_курсы
Ссылка на лекции: https://clck.ru/32bYWx
#бластим_выходные
#бластим_курсы
🔥5❤3😁2🤩1
Новости и события Бластим в одном месте!
Открыты записи на курсы:
16 ноября — 14 декабря (даты сдвинулись на неделю!)
Анализ данных RNA-seq.
Онлайн курс по анализу транскриптомов для всех, кто занимается обработкой NGS-данных по экспрессии генов.
11 ноября завершение нашей хэллоуинской истории и новые скидки!
23 — 27 января, 30 января — 3 февраля 2023 года
Анализ NGS-данных.
Наш классический большой курс по NGS. Вы научитесь всем основным видам обработки данных секвенирования. Самая низкая стоимость места до 11 ноября.
Предварительные анонсы:
В начале декабря хотим провести конференцию вместе с экспертами фармы и биотеха. Пишите в комментариях, если вам интересен такой формат.
Думаем над новым потоков экспресс-курса по подготовке CV и мотивационного письма для работы за рубежом в декабре. Предзапись по ссылке
Ближайший курс по Python в новом формате запланирован на февраль.
Новости компании:
Теперь мы можем выдавать сертификаты государственного образца, а наши курсы засчитываются как повышение квалификации!
#бластим_курсы
Открыты записи на курсы:
16 ноября — 14 декабря (даты сдвинулись на неделю!)
Анализ данных RNA-seq.
Онлайн курс по анализу транскриптомов для всех, кто занимается обработкой NGS-данных по экспрессии генов.
11 ноября завершение нашей хэллоуинской истории и новые скидки!
23 — 27 января, 30 января — 3 февраля 2023 года
Анализ NGS-данных.
Наш классический большой курс по NGS. Вы научитесь всем основным видам обработки данных секвенирования. Самая низкая стоимость места до 11 ноября.
Предварительные анонсы:
В начале декабря хотим провести конференцию вместе с экспертами фармы и биотеха. Пишите в комментариях, если вам интересен такой формат.
Думаем над новым потоков экспресс-курса по подготовке CV и мотивационного письма для работы за рубежом в декабре. Предзапись по ссылке
Ближайший курс по Python в новом формате запланирован на февраль.
Новости компании:
Теперь мы можем выдавать сертификаты государственного образца, а наши курсы засчитываются как повышение квалификации!
#бластим_курсы
👍13❤🔥2❤1
Forwarded from (sci)Berloga Всех Наук и Технологий
❗️❗️❗️ Внимание, коллеги ! Если Вы знаете Питон/R и/или молекулярную биологию, хотите "спасти мир", получить фан от нетворкинга, поупражняться в Дата Сайнс и/или Биоинформатике по сингл-селл данным, написать научную статью, то есть отличная возможность:
Присоединяйтесь к нашей активности вокруг Каггл соревнования по мультимодальным данным !
Требования достаточно минимальны - Питон/R или мол.био (одно из двух - и то и другое - НЕ обязательно) и некоторое свободное время.
Наша цель - провести некоторый дата-сайнс анализ этих данных и вместе с биологами проинтерпретировать его и написать статью. Занимать топ места в сореве - не обязательно, (но не помешает). Это НЕ "приват шаринг" - все что делается - вначале выкладывается в публичный доступ на Каггл, только потом обсуждается. Часть задач/вопросов - описано там же на Каггл: линк.
Присоединяйтесь !
Пишите @zabis13 (Юрий Барамыков - ДС, Питон, R) , @alexander_v_c (Александр Червов - биологи) или отметьтесь в голосовалке: https://t.me/sberlogacompete/2548
Предлагаем начать с такого:
https://t.me/sberlogacompete/2805
https://t.me/sberlogacompete/2806
Присоединяйтесь к нашей активности вокруг Каггл соревнования по мультимодальным данным !
Требования достаточно минимальны - Питон/R или мол.био (одно из двух - и то и другое - НЕ обязательно) и некоторое свободное время.
Наша цель - провести некоторый дата-сайнс анализ этих данных и вместе с биологами проинтерпретировать его и написать статью. Занимать топ места в сореве - не обязательно, (но не помешает). Это НЕ "приват шаринг" - все что делается - вначале выкладывается в публичный доступ на Каггл, только потом обсуждается. Часть задач/вопросов - описано там же на Каггл: линк.
Присоединяйтесь !
Пишите @zabis13 (Юрий Барамыков - ДС, Питон, R) , @alexander_v_c (Александр Червов - биологи) или отметьтесь в голосовалке: https://t.me/sberlogacompete/2548
Предлагаем начать с такого:
https://t.me/sberlogacompete/2805
https://t.me/sberlogacompete/2806
🔥9👍1
Восполним дефицит рассказов о спикерах наших курсов и их профессиональном пути. Бластим приглашает людей с академическим бэкграундом, самой релевантной информацией, солидным багажом знаний и международным опытом. Светлана Закирова — один из лучших тому примеров.
Светлана Анатольевна биолог по образованию: закончив аспирантуру по молекулярке, она успешно защитила кандидатскую, прошла стажировки в Италии и США. А после ушла в фарминдустрию. Поначалу работала в AVVA Pharmaceuticals, что стало для нее ценной международной практикой. Затем в течение 5 лет Закирова возглавляла департамент разработки SPLAT, постигая специфику FMCG.
Сегодня Светлана Анатольевна — заместитель генерального директора по исследованиям и разработке компании «Нанолек». «Нанолек» — один из немногих представителей российской биофармы, который планирует создавать новые препараты и уже налаживает производство полного цикла. Компания стремится стать лидером в создании вакцин и вкладывает миллионные инвестиции в свой RnD-департамент.
Еще Закирова — лектор интенсива «Из исследований в разработку фармпрепаратов». В рамках курса она прочитала вводную лекцию, где рассказала о трендах в фармбизнесе, специфике российских компаний, управленческих моментах, а также поделилась личными прогнозами и инсайтами.
Подписывайтесь на Светлану Закирову в линкедине, а также следите за нашими новостями в соцсетях — совсем скоро мы проведем вебинар с ее участием.
#бластим_курсы
Светлана Анатольевна биолог по образованию: закончив аспирантуру по молекулярке, она успешно защитила кандидатскую, прошла стажировки в Италии и США. А после ушла в фарминдустрию. Поначалу работала в AVVA Pharmaceuticals, что стало для нее ценной международной практикой. Затем в течение 5 лет Закирова возглавляла департамент разработки SPLAT, постигая специфику FMCG.
Сегодня Светлана Анатольевна — заместитель генерального директора по исследованиям и разработке компании «Нанолек». «Нанолек» — один из немногих представителей российской биофармы, который планирует создавать новые препараты и уже налаживает производство полного цикла. Компания стремится стать лидером в создании вакцин и вкладывает миллионные инвестиции в свой RnD-департамент.
Еще Закирова — лектор интенсива «Из исследований в разработку фармпрепаратов». В рамках курса она прочитала вводную лекцию, где рассказала о трендах в фармбизнесе, специфике российских компаний, управленческих моментах, а также поделилась личными прогнозами и инсайтами.
Подписывайтесь на Светлану Закирову в линкедине, а также следите за нашими новостями в соцсетях — совсем скоро мы проведем вебинар с ее участием.
#бластим_курсы
👍4
Бластим: курсы и работа в биотехе pinned «Новости и события Бластим в одном месте! Открыты записи на курсы: 16 ноября — 14 декабря (даты сдвинулись на неделю!) Анализ данных RNA-seq. Онлайн курс по анализу транскриптомов для всех, кто занимается обработкой NGS-данных по экспрессии генов. 11 ноября…»
Кто расскажет про RNA-seq?
Евгений Герасимов больше 8 лет занимается анализом данных в биологии и специализируется на сравнительной геномике. Закончив биофак МГУ и защитив кандидатскую, он стал заниматься биоинформатикой и сейчас является старшим научным сотрудником лаборатории геномики простейших кафедры молекулярной биологии биофака МГУ.
А ещё Евгений регулярно преподает на курсах Бластим и проведет два первых занятия на программе «Анализ данных RNA-seq». Рассказываем, о чем они будут.
16 ноября в 19:00.
Вводная лекция про планирование эксперимента и проведение РНК секвенирования. Обсудим источники данных и рассмотрим этапы планирования эксперимента по транскриптомике. После занятия вы:
— разберетесь со специфическими терминами — парноконцевые чтения, плотность кластера, fastq, индекс и т.д.;
— узнаете особенности технологий Illumina, связанных с РНК секвенированием;
— будете знать о нюансах планирования эксперимента по секвенированию.
23 ноября в 19:00.
На этом занятии вы научитесь использовать Hisat2 и STAR для выравнивания сырых ридов на референсный транскриптом. Обсудим суть этих программ и как они соотносятся с другими методами выравнивания. По итогу вы научитесь:
— картировать данные на референсную сборку, используя картировщики Hisat2 и STAR;
— работать с выравниваниями;
— считать покрытие на генах
— оценивать корреляцию между репликами.
Записаться на курс можно по ссылке
Посмотреть вебинар по введению в анализ NGS-данных с участием Евгения можно на нашем ютуб-канале.
#бластим_курсы
Евгений Герасимов больше 8 лет занимается анализом данных в биологии и специализируется на сравнительной геномике. Закончив биофак МГУ и защитив кандидатскую, он стал заниматься биоинформатикой и сейчас является старшим научным сотрудником лаборатории геномики простейших кафедры молекулярной биологии биофака МГУ.
А ещё Евгений регулярно преподает на курсах Бластим и проведет два первых занятия на программе «Анализ данных RNA-seq». Рассказываем, о чем они будут.
16 ноября в 19:00.
Вводная лекция про планирование эксперимента и проведение РНК секвенирования. Обсудим источники данных и рассмотрим этапы планирования эксперимента по транскриптомике. После занятия вы:
— разберетесь со специфическими терминами — парноконцевые чтения, плотность кластера, fastq, индекс и т.д.;
— узнаете особенности технологий Illumina, связанных с РНК секвенированием;
— будете знать о нюансах планирования эксперимента по секвенированию.
23 ноября в 19:00.
На этом занятии вы научитесь использовать Hisat2 и STAR для выравнивания сырых ридов на референсный транскриптом. Обсудим суть этих программ и как они соотносятся с другими методами выравнивания. По итогу вы научитесь:
— картировать данные на референсную сборку, используя картировщики Hisat2 и STAR;
— работать с выравниваниями;
— считать покрытие на генах
— оценивать корреляцию между репликами.
Записаться на курс можно по ссылке
Посмотреть вебинар по введению в анализ NGS-данных с участием Евгения можно на нашем ютуб-канале.
#бластим_курсы
⚡4